EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000015878 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR3A
Alias: -
Full Name: RNA polymerase III subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35552 bases
Position: chrKB742808.1:3536593-3572144
Accession: 101802238
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000015825	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	1.5e-88	1	1
ENSAPLP00000015825	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	1.8e-32	1	1
ENSAPLP00000015825	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	4.5e-75	1	1
ENSAPLP00000015825	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	4.7e-42	1	1
ENSAPLP00000015825	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	2.2e-95	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000016630	POLR3A-201	4595	XM_005015784	ENSAPLP00000015825	1387 (aa)	XP_012951478	U3J8J7

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000015878's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03020	RNA polymerase	KEGG
apla04623	Cytosolic DNA-sensing pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000015878's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPLG00000015878	POLR3A	68	33.333	ENSAPLG00000013871	POLR1A	74	32.678

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.145	ENSG00000148606	POLR3A	99	96.145	Homo_sapiens
ENSAPLG00000015878	POLR3A	61	86.761	ENSAPOG00000022727	polr3a	97	86.761	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.864	ENSAMEG00000017801	POLR3A	99	95.864	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000015878	POLR3A	92	91.108	ENSACIG00000024504	polr3a	96	91.108	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	87.418	ENSAOCG00000003949	-	99	87.418	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.764	ENSAOCG00000002071	polr3a	99	90.764	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.618	ENSAPEG00000001966	-	99	90.618	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.764	ENSAPEG00000013351	polr3a	100	90.723	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.836	ENSATEG00000023277	polr3a	99	90.836	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	92	94.977	ENSACAG00000007985	POLR3A	98	94.977	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	93.111	ENSANAG00000028922	POLR3A	96	97.452	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.182	ENSACLG00000005914	polr3a	100	90.139	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	88.000	ENSAMXG00000018852	polr3a	99	88.000	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.218	ENSBTAG00000013259	POLR3A	99	96.218	Bos_taurus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	98	57.536	WBGene00004411	rpc-1	98	57.536	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.000	ENSCJAG00000001015	POLR3A	99	96.000	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.073	ENSCAFG00000015546	POLR3A	99	96.073	Canis_familiaris
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.073	ENSCAFG00020014711	POLR3A	99	96.073	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.782	ENSCHIG00000000352	POLR3A	99	95.782	Capra_hircus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.709	ENSTSYG00000006671	POLR3A	99	95.709	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.564	ENSCAPG00000016031	POLR3A	100	95.564	Cavia_aperea
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.564	ENSCPOG00000022387	POLR3A	99	95.564	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	93.818	ENSCCAG00000032995	POLR3A	96	96.835	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.927	ENSCATG00000035842	POLR3A	99	95.927	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.491	ENSCLAG00000009629	POLR3A	99	95.491	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.073	ENSCSAG00000009292	POLR3A	99	96.073	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	85	80.828	ENSCHOG00000008368	POLR3A	100	80.828	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	97.671	ENSCPBG00000002079	POLR3A	99	97.671	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	69.701	ENSCSAVG00000009925	-	99	69.701	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000015878	POLR3A	86	93.069	ENSCANG00000041071	POLR3A	98	96.203	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	77	96.827	ENSCGRG00001015599	-	91	96.827	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000015878	POLR3A	87	96.032	ENSCGRG00000001019	Polr3a	99	96.032	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.618	ENSCSEG00000016653	polr3a	99	90.618	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.036	ENSCVAG00000023049	polr3a	99	90.036	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	91.042	ENSDARG00000102569	polr3a	99	91.042	Danio_rerio
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.273	ENSDNOG00000010194	POLR3A	99	95.273	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.000	ENSDORG00000000184	Polr3a	99	96.000	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000015878	POLR3A	98	57.498	FBgn0030687	CG17209	98	57.498	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000015878	POLR3A	88	94.737	ENSETEG00000007477	POLR3A	89	94.737	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000015878	POLR3A	59	77.049	ENSEBUG00000013761	polr3a	98	77.049	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.291	ENSEASG00005023053	POLR3A	99	96.291	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	96	96.458	ENSECAG00000019416	POLR3A	100	96.106	Equus_caballus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	96	91.026	ENSEEUG00000001774	POLR3A	99	91.026	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	88.824	ENSELUG00000014016	polr3a	99	88.824	Esox_lucius
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.364	ENSFCAG00000000843	POLR3A	99	96.364	Felis_catus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	98.837	ENSFALG00000006913	POLR3A	99	98.837	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.491	ENSFDAG00000007813	POLR3A	99	95.491	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	94	90.526	ENSFHEG00000011922	polr3a	98	90.526	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	85.500	ENSGMOG00000000291	polr3a	99	85.500	Gadus_morhua
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	99.709	ENSGALG00000004947	POLR3A	99	99.709	Gallus_gallus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.400	ENSGAFG00000005112	polr3a	99	90.400	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	89.745	ENSGACG00000002304	polr3a	99	89.745	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	95	97.350	ENSGAGG00000010386	POLR3A	98	97.350	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.349	ENSGGOG00000027729	POLR3A	100	96.511	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.327	ENSHBUG00000018098	polr3a	99	90.327	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.345	ENSHGLG00000017899	POLR3A	99	95.345	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.345	ENSHGLG00100008483	POLR3A	99	95.345	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	89.455	ENSHCOG00000001075	polr3a	99	89.455	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.782	ENSSTOG00000012983	POLR3A	99	95.782	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.109	ENSKMAG00000015290	polr3a	99	90.109	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	89.083	ENSLBEG00000017214	polr3a	99	89.083	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000015878	POLR3A	96	90.451	ENSLACG00000018557	POLR3A	98	90.451	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	92.671	ENSLOCG00000004942	polr3a	99	92.671	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	94.331	ENSLAFG00000016719	POLR3A	99	94.331	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.000	ENSMFAG00000032218	POLR3A	99	96.000	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.000	ENSMMUG00000005514	POLR3A	99	96.000	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	89.640	ENSMNEG00000035163	POLR3A	99	96.085	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	91.721	ENSMLEG00000030014	POLR3A	98	96.835	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.618	ENSMAMG00000017497	polr3a	99	90.618	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.182	ENSMZEG00005000576	polr3a	99	90.182	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	80.578	ENSMGAG00000005713	-	99	80.578	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	93.818	ENSMAUG00000016247	Polr3a	99	93.818	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.218	ENSMICG00000005937	POLR3A	100	96.699	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.927	ENSMOCG00000012185	Polr3a	99	95.927	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	89.527	ENSMMOG00000013822	polr3a	99	89.527	Mola_mola
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.145	ENSMODG00000001036	POLR3A	99	96.145	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.182	ENSMALG00000001249	polr3a	99	90.182	Monopterus_albus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.855	MGP_CAROLIEiJ_G0019016	Polr3a	99	95.855	Mus_caroli
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.782	ENSMUSG00000025280	Polr3a	99	95.782	Mus_musculus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.709	MGP_PahariEiJ_G0030029	Polr3a	99	95.709	Mus_pahari
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	93.236	MGP_SPRETEiJ_G0019894	Polr3a	97	98.020	Mus_spretus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.386	ENSMPUG00000003790	POLR3A	99	95.386	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	94.836	ENSMLUG00000011522	POLR3A	99	94.836	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	93.745	ENSNGAG00000015863	Polr3a	99	93.745	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	88.727	ENSNBRG00000014262	polr3a	99	88.727	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000015878	POLR3A	87	88.454	ENSNLEG00000010501	POLR3A	91	88.454	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	83.418	ENSMEUG00000012446	POLR3A	100	83.418	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000015878	POLR3A	96	94.060	ENSOPRG00000001880	-	96	94.060	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	94.327	ENSODEG00000015146	POLR3A	99	94.327	Octodon_degus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.618	ENSONIG00000016129	polr3a	99	90.618	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.129	ENSOANG00000007013	POLR3A	100	96.129	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.636	ENSOCUG00000012450	POLR3A	99	95.636	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.545	ENSORLG00000008958	polr3a	99	90.545	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	88.218	ENSORLG00020007525	polr3a	97	90.882	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.400	ENSORLG00015006633	polr3a	99	90.400	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	89.745	ENSOMEG00000012865	polr3a	99	89.745	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.709	ENSOGAG00000010995	POLR3A	99	95.709	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.861	ENSOARG00000009656	POLR3A	99	95.861	Ovis_aries
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.364	ENSPPRG00000002128	POLR3A	99	96.364	Panthera_pardus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.364	ENSPTIG00000020916	POLR3A	99	96.364	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.073	ENSPTRG00000002664	POLR3A	99	96.073	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.927	ENSPANG00000022508	POLR3A	99	95.927	Papio_anubis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	92.218	ENSPKIG00000008140	polr3a	99	92.218	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	97.297	ENSPSIG00000002092	POLR3A	100	97.297	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.855	ENSPEMG00000006768	Polr3a	99	95.855	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.000	ENSPCIG00000015842	POLR3A	99	96.000	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	54	92.215	ENSPFOG00000006458	polr3a	100	92.215	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.698	ENSPLAG00000000997	polr3a	99	90.698	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.625	ENSPMEG00000006821	polr3a	99	90.625	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.407	ENSPREG00000002385	polr3a	99	90.407	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000015878	POLR3A	93	95.972	ENSPPYG00000002305	POLR3A	99	95.972	Pongo_abelii
ENSAPLG00000015878	POLR3A	79	93.598	ENSPCAG00000005690	POLR3A	82	93.598	Procavia_capensis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.000	ENSPCOG00000028311	POLR3A	99	96.000	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	94.764	ENSPVAG00000015553	POLR3A	99	94.764	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.182	ENSPNYG00000020987	polr3a	99	90.182	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	86.754	ENSPNAG00000006629	polr3a	99	86.754	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.709	ENSRNOG00000010008	Polr3a	99	95.709	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	91.855	ENSRBIG00000034967	POLR3A	98	96.835	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.000	ENSRROG00000025527	POLR3A	99	96.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000015878	POLR3A	98	50.488	YOR116C	RPO31	98	50.488	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.073	ENSSBOG00000022199	POLR3A	99	96.073	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.855	ENSSHAG00000007588	POLR3A	93	95.855	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	92.800	ENSSFOG00015014357	polr3a	99	92.800	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.109	ENSSMAG00000001780	polr3a	99	90.109	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.836	ENSSDUG00000019840	polr3a	99	90.836	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.836	ENSSLDG00000023908	polr3a	99	90.836	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	69	95.611	ENSSARG00000009916	POLR3A	89	95.611	Sorex_araneus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	95.636	ENSSPUG00000013209	POLR3A	99	95.636	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.618	ENSSPAG00000017712	polr3a	99	90.618	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.000	ENSSSCG00000010327	POLR3A	99	96.000	Sus_scrofa
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	98.836	ENSTGUG00000006423	-	99	98.836	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	89.891	ENSTRUG00000013488	polr3a	99	89.891	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.051	ENSTNIG00000013151	polr3a	99	90.051	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	71	94.681	ENSTBEG00000015288	POLR3A	75	94.681	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000015878	POLR3A	95	95.421	ENSTTRG00000007817	POLR3A	99	95.421	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	93.745	ENSUAMG00000011283	POLR3A	99	93.745	Ursus_americanus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.145	ENSUMAG00000013913	POLR3A	99	96.145	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	87.709	ENSVPAG00000003285	POLR3A	100	87.709	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	96.000	ENSVVUG00000025523	POLR3A	99	96.000	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000015878	POLR3A	85	93.068	ENSXETG00000018101	polr3a	99	93.068	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000015878	POLR3A	99	90.400	ENSXMAG00000015213	polr3a	99	90.473	Xiphophorus_maculatus