EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000016380 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TRMU
Alias: -
Full Name: tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10557 bases
Position: chrKB742471.1:1973200-1983756
Accession: 101802835
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000016287	tRNA_Me_trans	PF03054.16	6.6e-129	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000017101	TRMU-201	1506	XM_005010282	ENSAPLP00000016287	392 (aa)	-	U3J9V9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.961	ENSG00000100416	TRMU	100	80.060	Homo_sapiens
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	71.282	ENSAPOG00000014458	trmu	94	71.282	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	78.811	ENSAMEG00000003319	TRMU	93	78.811	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	71.059	ENSACIG00000002101	trmu	93	71.059	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	71.282	ENSAOCG00000013155	trmu	94	71.282	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	71.026	ENSAPEG00000013350	trmu	94	71.026	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000016380	TRMU	95	73.656	ENSATEG00000007814	trmu	91	73.656	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	80.256	ENSACAG00000007720	TRMU	94	80.256	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.442	ENSANAG00000038053	TRMU	91	78.442	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	71.835	ENSACLG00000005395	trmu	93	71.835	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000016380	TRMU	94	72.011	ENSAMXG00000005282	trmu	89	72.011	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.068	ENSBTAG00000005595	TRMU	92	78.068	Bos_taurus
ENSAPLG00000016380	TRMU	92	39.782	WBGene00007114	mttu-1	93	39.782	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	76.364	ENSCJAG00000000198	TRMU	91	76.364	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	78.796	ENSCAFG00000000779	TRMU	90	78.796	Canis_familiaris
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	78.796	ENSCAFG00020009184	TRMU	90	78.796	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	77.807	ENSCHIG00000017074	TRMU	92	77.807	Capra_hircus
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	78.723	ENSTSYG00000003853	TRMU	89	78.723	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	75.309	ENSCAPG00000013034	TRMU	96	75.309	Cavia_aperea
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.851	ENSCPOG00000020780	TRMU	91	78.851	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.182	ENSCCAG00000021641	TRMU	91	78.182	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000016380	TRMU	95	79.839	ENSCATG00000032800	TRMU	88	79.839	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	79.319	ENSCLAG00000017269	TRMU	91	79.319	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.182	ENSCSAG00000005279	TRMU	91	78.182	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	81.726	ENSCPBG00000011621	TRMU	99	81.726	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000016380	TRMU	94	44.414	ENSCING00000019371	-	90	44.414	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	78.989	ENSCANG00000041645	TRMU	89	78.989	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.329	ENSCGRG00001001739	Trmu	91	78.329	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	73.629	ENSCGRG00000002781	Trmu	91	73.629	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	69.767	ENSCSEG00000012382	trmu	93	69.767	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	71.465	ENSCVAG00000001366	trmu	94	71.465	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	68.930	ENSDARG00000043734	trmu	92	68.930	Danio_rerio
ENSAPLG00000016380	TRMU	58	73.568	ENSDNOG00000047245	-	80	73.568	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000016380	TRMU	95	81.183	ENSDORG00000007455	Trmu	91	81.183	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000016380	TRMU	92	44.321	FBgn0040337	CG3021	89	44.321	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000016380	TRMU	95	53.175	ENSEBUG00000007454	trmu	94	53.175	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	79.058	ENSEASG00005021725	TRMU	91	79.058	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	79.058	ENSECAG00000000467	TRMU	95	75.831	Equus_caballus
ENSAPLG00000016380	TRMU	74	59.794	ENSEEUG00000000074	-	69	59.794	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	68.380	ENSELUG00000009464	trmu	94	68.380	Esox_lucius
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	78.272	ENSFCAG00000006533	TRMU	91	78.272	Felis_catus
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	89.141	ENSFALG00000010035	TRMU	100	89.141	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	78.215	ENSFDAG00000017472	TRMU	97	78.215	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	73.265	ENSFHEG00000003162	trmu	94	73.265	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	63.802	ENSGMOG00000001323	trmu	95	63.802	Gadus_morhua
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	91.162	ENSGALG00000031922	TRMU	93	91.162	Gallus_gallus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	74.151	ENSGAFG00000013331	trmu	92	74.151	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	68.782	ENSGACG00000019024	trmu	93	68.782	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.961	ENSGGOG00000000203	TRMU	91	78.961	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	71.318	ENSHBUG00000023421	trmu	93	71.318	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	77.546	ENSHGLG00000009278	TRMU	91	77.546	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	77.546	ENSHGLG00100018863	TRMU	91	77.546	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	71.762	ENSHCOG00000013459	trmu	93	71.762	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	70.106	ENSIPUG00000009785	trmu	93	70.106	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	79.787	ENSSTOG00000010993	TRMU	89	79.787	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	78.272	ENSJJAG00000000667	Trmu	92	78.272	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	70.437	ENSKMAG00000008516	trmu	94	70.437	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	69.152	ENSLBEG00000018831	trmu	94	69.152	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	76.982	ENSLACG00000013713	TRMU	93	76.982	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000016380	TRMU	95	75.269	ENSLOCG00000016066	trmu	89	75.269	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	68.312	ENSLAFG00000005129	TRMU	91	68.312	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.182	ENSMFAG00000039767	TRMU	91	78.182	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.182	ENSMMUG00000000807	TRMU	91	78.182	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.182	ENSMNEG00000028164	TRMU	91	78.182	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000016380	TRMU	95	79.839	ENSMLEG00000033884	TRMU	88	79.839	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	71.465	ENSMAMG00000004717	trmu	94	71.465	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	71.835	ENSMZEG00005015797	trmu	93	71.835	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000016380	TRMU	85	89.474	ENSMGAG00000007550	TRMU	100	89.474	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.068	ENSMAUG00000022282	Trmu	92	78.068	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	79.521	ENSMICG00000029046	TRMU	91	79.521	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.068	ENSMOCG00000014641	Trmu	92	78.068	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	72.340	ENSMMOG00000007229	trmu	90	72.340	Mola_mola
ENSAPLG00000016380	TRMU	95	75.668	ENSMODG00000007433	TRMU	87	75.668	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	69.409	ENSMALG00000007721	trmu	94	69.409	Monopterus_albus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.068	MGP_CAROLIEiJ_G0020134	Trmu	88	84.000	Mus_caroli
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.329	ENSMUSG00000022386	Trmu	92	78.329	Mus_musculus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	77.807	MGP_PahariEiJ_G0020139	Trmu	88	82.000	Mus_pahari
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.329	MGP_SPRETEiJ_G0021031	Trmu	88	84.000	Mus_spretus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.329	ENSMPUG00000002523	TRMU	91	78.329	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	77.720	ENSNGAG00000005132	Trmu	93	77.720	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	71.835	ENSNBRG00000022690	trmu	93	72.944	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	79.156	ENSNLEG00000015773	TRMU	90	79.156	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000016380	TRMU	77	64.686	ENSMEUG00000000216	TRMU	92	64.686	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	77.865	ENSODEG00000014745	TRMU	93	77.320	Octodon_degus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	72.093	ENSONIG00000009821	trmu	93	72.093	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	75.584	ENSOANG00000001891	TRMU	97	75.584	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	81.117	ENSOCUG00000003664	TRMU	90	81.117	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	70.449	ENSORLG00000019015	trmu	92	70.449	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	70.185	ENSORLG00020006830	trmu	92	70.185	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	70.185	ENSORLG00015003907	trmu	92	70.185	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000016380	TRMU	58	72.124	ENSOMEG00000015541	trmu	82	72.124	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	78.042	ENSOGAG00000008096	TRMU	91	78.042	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000016380	TRMU	90	75.071	ENSOARG00000019475	TRMU	86	75.071	Ovis_aries
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.701	ENSPPAG00000033944	TRMU	91	78.701	Pan_paniscus
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	79.521	ENSPPRG00000004197	TRMU	91	78.534	Panthera_pardus
ENSAPLG00000016380	TRMU	68	77.985	ENSPTIG00000014122	TRMU	97	78.030	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.701	ENSPTRG00000014510	TRMU	91	78.701	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000016380	TRMU	94	80.163	ENSPANG00000023074	TRMU	90	79.722	Papio_anubis
ENSAPLG00000016380	TRMU	100	70.153	ENSPKIG00000002849	trmu	94	70.153	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	82.507	ENSPSIG00000013020	TRMU	100	82.507	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	70.619	ENSPMGG00000004083	trmu	93	70.619	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	77.807	ENSPEMG00000014007	Trmu	92	77.807	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	74.468	ENSPCIG00000009923	TRMU	91	71.907	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	73.879	ENSPFOG00000008197	trmu	85	73.879	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	73.947	ENSPLAG00000008414	trmu	91	73.947	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000016380	TRMU	97	74.211	ENSPMEG00000004326	trmu	91	74.211	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	72.680	ENSPREG00000007980	trmu	93	72.680	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	79.221	ENSPPYG00000011949	TRMU	91	79.221	Pongo_abelii
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	71.762	ENSPCAG00000013462	TRMU	99	71.762	Procavia_capensis
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	78.989	ENSPCOG00000016539	TRMU	90	78.989	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000016380	TRMU	96	72.606	ENSPVAG00000013202	TRMU	92	71.728	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	71.318	ENSPNYG00000005629	trmu	93	71.318	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000016380	TRMU	94	72.283	ENSPNAG00000006339	trmu	86	72.283	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	78.590	ENSRNOG00000016465	Trmu	92	78.590	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	76.883	ENSRBIG00000038973	TRMU	91	76.883	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	77.143	ENSRROG00000004267	TRMU	91	77.143	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000016380	TRMU	90	32.533	YDL033C	SLM3	85	32.533	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	77.662	ENSSBOG00000030184	TRMU	91	77.662	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSAPLG00000016380	TRMU	96	70.899	ENSSMAG00000019450	trmu	91	70.899	Scophthalmus_maximus
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ENSAPLG00000016380	TRMU	99	69.054	ENSSPUG00000017123	TRMU	92	69.054	Sphenodon_punctatus
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ENSAPLG00000016380	TRMU	96	79.521	ENSVVUG00000024963	TRMU	89	79.521	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000016380	TRMU	99	76.031	ENSXETG00000023304	trmu	91	76.031	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000016380	TRMU	98	72.610	ENSXCOG00000015105	trmu	92	72.610	Xiphophorus_couchianus
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