EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000016435 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1805 bases
Position: chrKB744345.1:147242-149046
Accession: 101794828
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000016337	SYF2	PF08231.12	1.2e-56	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000017153	SYF2-201	858	XM_005028156	ENSAPLP00000016337	201 (aa)	XP_005028213	U3JA09

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000016435's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000016435's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	ENSG00000117614	SYF2	82	89.500	Homo_sapiens
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	ENSAPOG00000001174	syf2	84	85.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000016435	SYF2	97	88.205	ENSAMEG00000010134	-	100	88.205	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSAMEG00000010115	-	82	87.940	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.417	ENSACIG00000023688	syf2	80	83.417	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000016435	SYF2	91	84.066	ENSAOCG00000010912	syf2	57	84.066	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	ENSAOCG00000022046	syf2	85	85.000	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	ENSAPEG00000018858	syf2	77	85.000	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.500	ENSATEG00000007745	syf2	84	84.500	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000016435	SYF2	83	77.246	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	ENSACAG00000013653	-	98	89.500	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSANAG00000032473	SYF2	82	89.000	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	ENSACLG00000019916	syf2	84	83.000	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	ENSAMXG00000004051	syf2	84	82.000	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	ENSBTAG00000001651	SYF2	84	88.945	Bos_taurus
ENSAPLG00000016435	SYF2	98	53.266	WBGene00019402	syf-2	85	53.266	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSCJAG00000046570	SYF2	82	89.000	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.000	ENSCAFG00000030331	-	87	84.422	Canis_familiaris
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSCAFG00000012895	-	81	87.500	Canis_familiaris
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSCAFG00020021091	-	81	87.500	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000016435	SYF2	90	79.670	ENSCAFG00020021094	-	83	87.179	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	ENSCHIG00000020874	SYF2	83	88.945	Capra_hircus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSTSYG00000005114	SYF2	82	87.500	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.889	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	88.889	Cavia_aperea
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	ENSCPOG00000005326	SYF2	82	88.500	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSCCAG00000022459	SYF2	82	89.000	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSCATG00000026917	SYF2	82	88.000	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSCLAG00000008474	SYF2	82	89.000	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSCSAG00000000948	SYF2	82	88.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000016435	SYF2	64	78.295	ENSCHOG00000005273	-	79	78.295	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	91.500	ENSCPBG00000025073	SYF2	81	91.500	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	55.446	ENSCING00000003017	-	84	54.950	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	53.465	ENSCSAVG00000006627	-	92	53.465	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	76.500	ENSCANG00000037322	SYF2	80	76.500	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.000	ENSCGRG00001020733	Syf2	82	87.437	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000016435	SYF2	98	87.755	ENSCGRG00000005095	Syf2	97	86.567	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	78.500	ENSCSEG00000000117	syf2	84	78.500	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	ENSCVAG00000019543	syf2	83	83.417	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.500	ENSDARG00000004706	syf2	84	83.920	Danio_rerio
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSDNOG00000047605	SYF2	82	87.500	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSDORG00000001274	Syf2	82	89.000	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	60.500	FBgn0033556	CG12343	88	60.500	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000016435	SYF2	93	72.581	ENSETEG00000015729	SYF2	81	72.581	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000016435	SYF2	98	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	78.000	ENSEASG00005004232	-	82	78.392	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	ENSEASG00005004224	-	82	89.500	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	ENSECAG00000010440	-	84	89.500	Equus_caballus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSECAG00000012023	-	81	89.447	Equus_caballus
ENSAPLG00000016435	SYF2	69	74.820	ENSEEUG00000015084	SYF2	76	74.820	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	ENSELUG00000003465	syf2	84	85.000	Esox_lucius
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSFCAG00000043095	-	81	88.000	Felis_catus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	ENSFCAG00000010324	-	69	89.500	Felis_catus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	94.949	ENSFALG00000000460	SYF2	80	94.949	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSFDAG00000008310	SYF2	82	89.000	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	67.662	ENSFHEG00000007238	syf2	89	67.662	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.000	ENSGMOG00000019138	syf2	89	81.000	Gadus_morhua
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	99.000	ENSGALG00000013639	SYF2	79	99.000	Gallus_gallus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.910	ENSGAFG00000019435	syf2	84	81.910	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	ENSGACG00000007305	syf2	84	83.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	92.000	ENSGAGG00000010670	SYF2	81	92.000	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSGGOG00000012796	SYF2	82	89.000	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	ENSHBUG00000020477	syf2	86	83.000	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	ENSHGLG00000014393	SYF2	82	89.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	76.500	ENSHGLG00000004304	-	83	74.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	ENSHGLG00100014722	SYF2	82	89.500	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	ENSHCOG00000012904	syf2	65	82.000	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	ENSIPUG00000019859	syf2	84	83.000	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000016435	SYF2	73	84.932	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	84.932	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.945	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	88.945	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.500	ENSKMAG00000013856	syf2	84	83.500	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.500	ENSLBEG00000014425	syf2	84	85.500	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.427	ENSLACG00000012064	SYF2	84	85.427	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.500	ENSLOCG00000002728	syf2	80	85.500	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000016435	SYF2	87	61.798	ENSLAFG00000030814	-	95	61.798	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSLAFG00000023150	-	82	87.500	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSMFAG00000041831	SYF2	82	88.000	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSMMUG00000002968	SYF2	82	88.000	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSMNEG00000030180	SYF2	82	88.000	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSMLEG00000030248	SYF2	82	88.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	ENSMAMG00000010403	syf2	83	82.000	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	ENSMZEG00005006429	syf2	84	83.000	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	99.497	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	99.497	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSMAUG00000018974	Syf2	83	88.000	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.447	ENSMICG00000016191	SYF2	100	89.447	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSMOCG00000022938	Syf2	83	88.000	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.000	ENSMMOG00000002396	syf2	83	81.407	Mola_mola
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.653	ENSMODG00000013951	-	88	84.653	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.095	ENSMALG00000010706	syf2	83	81.592	Monopterus_albus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	83	87.500	Mus_caroli
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSMUSG00000028821	Syf2	83	87.500	Mus_musculus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	83	87.500	Mus_pahari
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	83	87.500	Mus_spretus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSMPUG00000015802	-	81	87.500	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	ENSMPUG00000015801	-	81	88.500	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSMLUG00000001885	SYF2	82	88.442	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	ENSNGAG00000007912	Syf2	81	88.500	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	75.000	ENSNBRG00000010720	syf2	85	75.000	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSNLEG00000035185	SYF2	82	89.000	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.000	ENSOPRG00000012870	SYF2	82	87.437	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	78.000	ENSODEG00000014338	-	82	78.000	Octodon_degus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSODEG00000017664	-	84	88.000	Octodon_degus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.500	ENSONIG00000008213	syf2	84	82.915	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	90.000	ENSOANG00000009552	SYF2	99	90.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSOCUG00000013050	SYF2	82	89.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.500	ENSORLG00000028820	syf2	86	85.500	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.500	ENSORLG00020018333	syf2	84	85.500	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.500	ENSORLG00015014665	syf2	84	85.500	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	ENSOMEG00000013911	syf2	84	85.000	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	ENSOGAG00000009962	SYF2	82	88.500	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000016435	SYF2	97	62.051	ENSOARG00000006269	-	100	62.051	Ovis_aries
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.624	ENSOARG00000006348	-	81	88.060	Ovis_aries
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSPPAG00000036579	SYF2	82	89.000	Pan_paniscus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSPPRG00000001651	-	81	88.000	Panthera_pardus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	ENSPPRG00000001638	-	81	89.500	Panthera_pardus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSPTIG00000007036	-	81	88.000	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.500	ENSPTIG00000005711	-	73	89.500	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSPTRG00000000352	SYF2	82	89.000	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSPANG00000008139	SYF2	82	88.000	Papio_anubis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.500	ENSPKIG00000008130	syf2	85	84.500	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	91.000	ENSPSIG00000011816	SYF2	78	91.000	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	ENSPMGG00000008755	syf2	78	82.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSPEMG00000008283	Syf2	83	87.500	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	91.000	ENSPCIG00000014235	SYF2	80	91.000	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	ENSPFOG00000004116	syf2	83	82.000	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	ENSPLAG00000006691	syf2	86	82.000	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	78.500	ENSPMEG00000011684	syf2	85	78.500	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	ENSPREG00000003009	syf2	84	82.000	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	ENSPPYG00000001713	SYF2	82	89.000	Pongo_abelii
ENSAPLG00000016435	SYF2	79	72.956	ENSPCOG00000027011	SYF2	73	73.077	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	77.500	ENSPVAG00000005841	SYF2	82	77.500	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	ENSPNYG00000004979	syf2	84	83.000	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.000	ENSPNAG00000015570	syf2	84	84.422	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSRNOG00000060597	Syf2	83	87.500	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	ENSRBIG00000042970	SYF2	82	85.427	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSRROG00000001347	SYF2	82	88.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	ENSSBOG00000020184	SYF2	82	88.500	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	90.000	ENSSHAG00000015630	-	80	90.000	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	91.457	ENSSHAG00000007152	-	97	91.457	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.412	ENSSFOG00015023647	syf2	84	82.412	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.910	ENSSMAG00000009867	syf2	84	81.910	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.000	ENSSDUG00000013072	syf2	84	84.000	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.000	ENSSLDG00000012677	syf2	84	84.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000016435	SYF2	78	86.624	ENSSARG00000012889	SYF2	64	86.538	Sorex_araneus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.447	ENSSPUG00000005251	SYF2	79	89.447	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	ENSSPAG00000009626	syf2	84	83.000	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	ENSSSCG00000037481	SYF2	81	88.945	Sus_scrofa
ENSAPLG00000016435	SYF2	55	82.727	ENSTGUG00000001126	SYF2	51	89.109	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.500	ENSTRUG00000001499	syf2	80	81.500	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	80.500	ENSTNIG00000016912	syf2	90	80.500	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	63.000	ENSTBEG00000017370	SYF2	79	62.500	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	ENSTTRG00000003550	SYF2	82	88.945	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.000	ENSUAMG00000002897	SYF2	81	87.000	Ursus_americanus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.000	ENSUMAG00000013108	SYF2	81	87.000	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	ENSVPAG00000005705	SYF2	82	88.000	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSVVUG00000027175	-	81	87.500	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	ENSVVUG00000027181	-	81	87.500	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	86.935	ENSXETG00000022797	syf2	80	86.935	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	ENSXMAG00000022698	syf2	84	82.000	Xiphophorus_maculatus