EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000000608 (Gene tree)
Gene ID: 110950786
Gene Symbol: urb2
Alias: fc13e02|si:dkey-162b3.2|wu:fc13e02
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17383 bases
Position: chrMVNR01000161.1:267235-284617
Accession: 110950786
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000033017	Urb2	PF10441.9	9.2e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000027462	-	5822	XM_022193560	ENSAPOP00000033017	1504 (aa)	XP_022049252	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.161	ENSG00000135763	URB2	99	61.628	Homo_sapiens
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.105	ENSAMEG00000009206	URB2	89	35.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000000608	urb2	100	92.517	ENSAOCG00000019961	urb2	91	92.517	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000000608	urb2	100	92.715	ENSAPEG00000005263	urb2	91	92.715	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000000608	urb2	100	70.396	ENSATEG00000020930	urb2	91	70.524	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	38.207	ENSAPLG00000002998	URB2	91	38.138	Anas_platyrhynchos
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.792	ENSACAG00000001285	URB2	89	36.724	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.399	ENSANAG00000033963	URB2	89	35.331	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000000608	urb2	100	71.847	ENSACLG00000009254	urb2	100	71.847	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000000608	urb2	94	42.412	ENSAMXG00000003474	urb2	89	42.273	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	34.958	ENSBTAG00000010180	URB2	89	34.680	Bos_taurus
ENSAPOG00000000608	urb2	89	61.702	ENSCJAG00000010968	URB2	88	61.702	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.197	ENSCAFG00000012118	URB2	89	35.128	Canis_familiaris
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.180	ENSCAFG00020027217	URB2	94	35.111	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.221	ENSCHIG00000014513	URB2	89	34.945	Capra_hircus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.818	ENSTSYG00000006924	URB2	89	35.931	Carlito_syrichta
ENSAPOG00000000608	urb2	55	40.449	ENSCPOG00000020777	-	83	41.718	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.813	ENSCCAG00000023932	URB2	89	35.744	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.577	ENSCATG00000043366	URB2	89	35.758	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.157	ENSCLAG00000006268	URB2	90	36.157	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.234	ENSCSAG00000010599	URB2	89	35.415	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000000608	urb2	63	42.810	ENSCHOG00000010163	URB2	61	42.810	Choloepus_hoffmanni
ENSAPOG00000000608	urb2	95	38.472	ENSCPBG00000006191	URB2	89	38.404	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.330	ENSCANG00000023711	URB2	90	35.510	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.596	ENSCGRG00001009591	Urb2	89	35.457	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.596	ENSCGRG00000011259	Urb2	89	35.457	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPOG00000000608	urb2	100	54.675	ENSCSEG00000000299	urb2	91	54.675	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000000608	urb2	100	61.861	ENSCVAG00000011011	urb2	91	62.254	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	43.885	ENSDARG00000003217	urb2	71	63.913	Danio_rerio
ENSAPOG00000000608	urb2	95	34.692	ENSDNOG00000043064	URB2	91	34.599	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	34.666	ENSDORG00000014975	Urb2	90	34.597	Dipodomys_ordii
ENSAPOG00000000608	urb2	90	40.141	ENSETEG00000002869	URB2	85	40.141	Echinops_telfairi
ENSAPOG00000000608	urb2	94	36.049	ENSEASG00005012060	URB2	89	35.981	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000000608	urb2	87	62.937	ENSECAG00000012338	URB2	88	62.937	Equus_caballus
ENSAPOG00000000608	urb2	86	56.643	ENSEEUG00000002669	URB2	81	56.643	Erinaceus_europaeus
ENSAPOG00000000608	urb2	100	48.427	ENSELUG00000014647	urb2	96	48.427	Esox_lucius
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.704	ENSFCAG00000007662	URB2	89	35.670	Felis_catus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.493	ENSFALG00000003385	URB2	89	36.290	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.251	ENSFDAG00000021079	URB2	90	36.182	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000000608	urb2	100	62.231	ENSFHEG00000010357	urb2	91	62.680	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	56.745	ENSGMOG00000012459	urb2	89	56.676	Gadus_morhua
ENSAPOG00000000608	urb2	95	37.696	ENSGALG00000011101	URB2	89	37.705	Gallus_gallus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	69.391	ENSGACG00000016179	urb2	89	69.321	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	38.930	ENSGAGG00000021879	URB2	89	38.863	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.037	ENSGGOG00000025643	URB2	90	34.969	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000000608	urb2	100	71.912	ENSHBUG00000018469	urb2	91	71.912	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.063	ENSHGLG00000016561	URB2	91	36.314	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.950	ENSHGLG00100001838	URB2	90	35.950	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000000608	urb2	95	43.095	ENSIPUG00000020315	urb2	89	42.956	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.290	ENSSTOG00000025323	URB2	89	35.220	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.113	ENSJJAG00000011998	Urb2	90	35.044	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000000608	urb2	99	65.282	ENSKMAG00000020129	urb2	91	65.931	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	37.310	ENSLACG00000002038	URB2	89	37.354	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000000608	urb2	95	44.513	ENSLOCG00000015462	urb2	89	44.483	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.375	ENSLAFG00000012484	URB2	89	35.306	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.508	ENSMFAG00000039905	URB2	89	35.690	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.440	ENSMMUG00000009509	URB2	89	35.621	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000000608	urb2	89	41.803	ENSMNEG00000038762	URB2	88	41.803	Macaca_nemestrina
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.508	ENSMLEG00000043252	URB2	89	35.690	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPOG00000000608	urb2	100	67.335	ENSMAMG00000020365	urb2	91	67.335	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000000608	urb2	100	71.717	ENSMZEG00005011027	urb2	91	71.717	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.683	ENSMGAG00000012073	URB2	94	36.538	Meleagris_gallopavo
ENSAPOG00000000608	urb2	90	59.574	ENSMAUG00000017980	Urb2	89	59.574	Mesocricetus_auratus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.221	ENSMICG00000033302	URB2	89	35.335	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.562	ENSMOCG00000020369	Urb2	90	35.464	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000000608	urb2	100	70.637	ENSMALG00000006529	urb2	91	70.637	Monopterus_albus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.294	ENSMUSG00000031976	Urb2	90	35.408	Mus_musculus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.887	ENSMPUG00000012438	URB2	89	35.818	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.227	ENSNGAG00000016524	Urb2	90	35.525	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000000608	urb2	94	34.798	ENSNLEG00000014450	URB2	89	34.979	Nomascus_leucogenys
ENSAPOG00000000608	urb2	89	45.495	ENSMEUG00000016434	URB2	86	45.495	Notamacropus_eugenii
ENSAPOG00000000608	urb2	86	39.914	ENSOPRG00000009906	URB2	80	39.769	Ochotona_princeps
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.130	ENSODEG00000005593	URB2	90	36.061	Octodon_degus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	72.087	ENSONIG00000017078	urb2	89	72.156	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000000608	urb2	93	33.475	ENSOANG00000013732	URB2	88	33.520	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.357	ENSOCUG00000010700	URB2	90	36.538	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000000608	urb2	100	61.803	ENSORLG00000010915	urb2	93	61.868	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000000608	urb2	100	61.738	ENSORLG00020003361	urb2	91	61.803	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000000608	urb2	100	61.219	ENSORLG00015001534	urb2	91	61.219	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000000608	urb2	100	61.498	ENSOMEG00000010076	urb2	91	61.679	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000000608	urb2	95	34.859	ENSOGAG00000003021	URB2	89	35.139	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000000608	urb2	95	34.900	ENSOARG00000003102	URB2	89	34.692	Ovis_aries
ENSAPOG00000000608	urb2	94	34.959	ENSPPAG00000040629	URB2	89	34.890	Pan_paniscus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.482	ENSPPRG00000012767	URB2	89	35.448	Panthera_pardus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.828	ENSPTIG00000012577	URB2	93	35.793	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000000608	urb2	94	34.959	ENSPTRG00000002092	URB2	89	34.890	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000000608	urb2	89	41.803	ENSPANG00000002245	URB2	88	41.803	Papio_anubis
ENSAPOG00000000608	urb2	94	44.704	ENSPKIG00000005787	urb2	89	44.529	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000000608	urb2	94	37.440	ENSPSIG00000002690	URB2	89	37.372	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000000608	urb2	91	34.220	ENSPEMG00000019551	Urb2	89	34.076	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.961	ENSPCIG00000030071	URB2	89	36.206	Phascolarctos_cinereus
ENSAPOG00000000608	urb2	100	62.269	ENSPFOG00000014330	urb2	90	63.858	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000000608	urb2	100	62.533	ENSPLAG00000014654	urb2	91	62.533	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000000608	urb2	100	62.599	ENSPMEG00000012356	urb2	91	62.665	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000000608	urb2	100	62.665	ENSPREG00000010268	urb2	91	62.731	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000000608	urb2	95	34.552	ENSPPYG00000000123	URB2	89	34.735	Pongo_abelii
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.242	ENSPCOG00000023537	URB2	90	35.354	Propithecus_coquereli
ENSAPOG00000000608	urb2	95	32.598	ENSPVAG00000002108	URB2	89	32.853	Pteropus_vampyrus
ENSAPOG00000000608	urb2	100	72.042	ENSPNYG00000016840	urb2	100	72.042	Pundamilia_nyererei
ENSAPOG00000000608	urb2	94	43.850	ENSPNAG00000013684	urb2	88	43.641	Pygocentrus_nattereri
ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.601	ENSRNOG00000026853	Urb2	87	35.464	Rattus_norvegicus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.709	ENSRBIG00000037937	URB2	89	35.890	Rhinopithecus_bieti
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.504	ENSRROG00000039854	URB2	89	35.685	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.152	ENSSBOG00000023055	URB2	89	35.083	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.640	ENSSHAG00000014735	URB2	89	35.424	Sarcophilus_harrisii
ENSAPOG00000000608	urb2	95	44.575	ENSSFOG00015015432	urb2	90	44.575	Scleropages_formosus
ENSAPOG00000000608	urb2	100	70.686	ENSSMAG00000004984	urb2	100	70.686	Scophthalmus_maximus
ENSAPOG00000000608	urb2	100	74.377	ENSSDUG00000000902	urb2	91	74.441	Seriola_dumerili
ENSAPOG00000000608	urb2	95	37.568	ENSSPUG00000018549	URB2	89	37.534	Sphenodon_punctatus
ENSAPOG00000000608	urb2	100	85.648	ENSSPAG00000013632	urb2	91	85.648	Stegastes_partitus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.922	ENSSSCG00000010186	URB2	100	34.876	Sus_scrofa
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.039	ENSTGUG00000009990	URB2	89	35.970	Taeniopygia_guttata
ENSAPOG00000000608	urb2	100	59.614	ENSTRUG00000008173	urb2	92	59.614	Takifugu_rubripes
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ENSAPOG00000000608	urb2	88	52.692	ENSTTRG00000014864	URB2	84	52.692	Tursiops_truncatus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.338	ENSUAMG00000015022	URB2	89	36.200	Ursus_americanus
ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.269	ENSUMAG00000004728	URB2	89	36.130	Ursus_maritimus
ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.323	ENSVVUG00000006747	URB2	91	35.253	Vulpes_vulpes
ENSAPOG00000000608	urb2	94	33.469	ENSXETG00000023331	urb2	89	33.469	Xenopus_tropicalis
ENSAPOG00000000608	urb2	100	62.533	ENSXMAG00000015059	urb2	91	62.665	Xiphophorus_maculatus