EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000001094 (Gene tree)
Gene ID: 110960443
Gene Symbol: si:dkey-93h22.8
Alias: fc32h05|fi41c08|im:7140483|wu:fc32h05|wu:fi41c08
Full Name: peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11876 bases
Position: chrMVNR01000027.1:210979-222854
Accession: 110960443
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000026598	RRM_1	PF00076.22	6.1e-10	1	1
ENSAPOP00000026609	RRM_1	PF00076.22	7.3e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000003305	-	4407	XM_022207689	ENSAPOP00000026609	1161 (aa)	XP_022063381	UPI000B8F56EB
ENSAPOT00000003319	-	4567	-	ENSAPOP00000026598	1024 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	77	90.290	ENSAOCG00000008140	si:dkey-93h22.8	77	90.290	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	100	90.267	ENSAPEG00000014568	si:dkey-93h22.8	77	90.179	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	77	69.697	ENSAMXG00000020783	si:dkey-93h22.8	51	69.388	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	57	36.574	ENSAMXG00000042630	pprc1	53	32.258	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	57	80.864	ENSCVAG00000019596	si:dkey-93h22.8	87	82.166	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	53	31.013	ENSDARG00000098666	si:dkey-93h22.8	51	31.788	Danio_rerio
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	51	52.874	ENSDARG00000090337	pprc1	81	63.077	Danio_rerio
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	70	33.235	ENSELUG00000018785	-	73	34.055	Esox_lucius
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	77	50.103	ENSLBEG00000024075	-	79	50.259	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	73	77.707	ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	81	77.564	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	73	78.344	ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	81	78.205	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	76	78.750	ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	84	78.205	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	78	79.747	ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	87	80.128	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	84	85.443	ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	84	86.928	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	84	85.443	ENSPLAG00000001769	si:dkey-93h22.8	84	86.928	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	84	85.443	ENSPMEG00000014605	si:dkey-93h22.8	84	86.928	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	70	39.315	ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	69	39.623	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	50	36.643	ENSPREG00000020657	pprc1	57	65.385	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	83	63.057	ENSPNAG00000023094	si:dkey-93h22.8	52	68.702	Pygocentrus_nattereri
ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	77	74.527	ENSSPAG00000010602	si:dkey-93h22.8	77	74.584	Stegastes_partitus