EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000001174 (Gene tree)
Gene ID: 110950054
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6278 bases
Position: chrMVNR01000133.1:332528-338805
Accession: 110950054
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000000034	SYF2	PF08231.12	5.9e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000017567	-	760	XM_022192442	ENSAPOP00000000034	238 (aa)	XP_022048134	UPI000B8F52E5

Gene Model

Click here to download ENSAPOG00000001174's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPOG00000001174's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	ENSG00000117614	SYF2	90	84.475	Homo_sapiens
ENSAPOG00000001174	syf2	94	82.960	ENSAMEG00000010115	-	91	82.960	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000001174	syf2	82	84.615	ENSAMEG00000010134	-	100	84.615	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000001174	syf2	99	91.489	ENSACIG00000023688	syf2	94	91.489	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	99.160	ENSAOCG00000022046	syf2	100	97.899	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000001174	syf2	93	99.095	ENSAOCG00000010912	syf2	69	99.095	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000001174	syf2	100	99.160	ENSAPEG00000018858	syf2	92	99.160	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000001174	syf2	100	94.118	ENSATEG00000007745	syf2	100	94.118	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000001174	syf2	84	85.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	Anas_platyrhynchos
ENSAPOG00000001174	syf2	86	84.314	ENSACAG00000013653	-	100	84.314	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000001174	syf2	70	71.257	ENSACAG00000026777	-	100	71.257	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000001174	syf2	91	85.185	ENSANAG00000032473	SYF2	91	84.545	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.597	ENSACLG00000019916	syf2	100	91.597	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000001174	syf2	100	87.395	ENSAMXG00000004051	syf2	100	87.395	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000001174	syf2	97	81.545	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	84.234	Bos_taurus
ENSAPOG00000001174	syf2	87	52.857	WBGene00019402	syf-2	90	52.133	Caenorhabditis_elegans
ENSAPOG00000001174	syf2	91	85.185	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	84.932	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000001174	syf2	91	83.796	ENSCAFG00000012895	-	90	82.960	Canis_familiaris
ENSAPOG00000001174	syf2	91	79.167	ENSCAFG00000030331	-	93	78.440	Canis_familiaris
ENSAPOG00000001174	syf2	91	83.796	ENSCAFG00020021091	-	90	82.960	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000001174	syf2	76	76.374	ENSCAFG00020021094	-	95	76.374	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000001174	syf2	99	79.583	ENSCHIG00000020874	SYF2	92	83.784	Capra_hircus
ENSAPOG00000001174	syf2	99	79.583	ENSTSYG00000005114	SYF2	91	82.883	Carlito_syrichta
ENSAPOG00000001174	syf2	83	84.343	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.343	Cavia_aperea
ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.252	ENSCPOG00000005326	SYF2	90	84.932	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000001174	syf2	91	85.185	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	84.932	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.085	ENSCATG00000026917	SYF2	90	83.562	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000001174	syf2	98	82.833	ENSCLAG00000008474	SYF2	91	84.685	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.085	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	83.562	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000001174	syf2	72	65.517	ENSCHOG00000005273	-	91	66.867	Choloepus_hoffmanni
ENSAPOG00000001174	syf2	94	84.889	ENSCPBG00000025073	SYF2	91	84.889	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000001174	syf2	89	55.399	ENSCING00000003017	-	89	55.869	Ciona_intestinalis
ENSAPOG00000001174	syf2	89	51.643	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.643	Ciona_savignyi
ENSAPOG00000001174	syf2	99	70.339	ENSCANG00000037322	SYF2	89	73.059	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.753	ENSCGRG00001020733	Syf2	92	84.234	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000001174	syf2	82	85.204	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	84.925	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPOG00000001174	syf2	92	89.450	ENSCSEG00000000117	syf2	93	88.739	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.213	ENSCVAG00000019543	syf2	100	91.213	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	86.555	ENSDARG00000004706	syf2	100	86.555	Danio_rerio
ENSAPOG00000001174	syf2	99	79.752	ENSDNOG00000047605	SYF2	91	83.784	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.328	ENSDORG00000001274	Syf2	91	84.685	Dipodomys_ordii
ENSAPOG00000001174	syf2	92	55.909	FBgn0033556	CG12343	97	55.909	Drosophila_melanogaster
ENSAPOG00000001174	syf2	87	70.048	ENSETEG00000015729	SYF2	90	70.048	Echinops_telfairi
ENSAPOG00000001174	syf2	83	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSAPOG00000001174	syf2	100	79.184	ENSEASG00005004224	-	89	85.388	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000001174	syf2	99	70.833	ENSEASG00005004232	-	92	74.324	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000001174	syf2	96	82.684	ENSECAG00000012023	-	91	84.234	Equus_caballus
ENSAPOG00000001174	syf2	97	81.974	ENSECAG00000010440	-	92	85.388	Equus_caballus
ENSAPOG00000001174	syf2	71	71.345	ENSEEUG00000015084	SYF2	88	72.671	Erinaceus_europaeus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	87.395	ENSELUG00000003465	syf2	93	90.991	Esox_lucius
ENSAPOG00000001174	syf2	97	82.174	ENSFCAG00000043095	-	89	84.475	Felis_catus
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.913	ENSFCAG00000010324	-	76	85.388	Felis_catus
ENSAPOG00000001174	syf2	86	81.863	ENSFALG00000000460	SYF2	89	81.193	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000001174	syf2	100	79.012	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	84.475	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000001174	syf2	95	76.991	ENSFHEG00000007238	syf2	99	77.130	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000001174	syf2	90	91.628	ENSGMOG00000019138	syf2	96	91.628	Gadus_morhua
ENSAPOG00000001174	syf2	93	83.784	ENSGALG00000013639	SYF2	88	83.784	Gallus_gallus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.076	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.076	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000001174	syf2	93	90.090	ENSGACG00000007305	syf2	93	90.090	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000001174	syf2	94	85.333	ENSGAGG00000010670	SYF2	91	85.333	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	84.475	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.176	ENSHBUG00000020477	syf2	100	91.176	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000001174	syf2	93	83.784	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	83.784	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000001174	syf2	93	72.851	ENSHGLG00000004304	-	93	72.973	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000001174	syf2	93	83.784	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	83.784	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.076	ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.076	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000001174	syf2	100	87.029	ENSIPUG00000019859	syf2	93	89.686	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000001174	syf2	61	79.452	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	79.452	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000001174	syf2	84	84.925	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.925	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.597	ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.597	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	93.697	ENSLBEG00000014425	syf2	100	93.697	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000001174	syf2	97	79.221	ENSLACG00000012064	SYF2	93	82.805	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000001174	syf2	100	85.294	ENSLOCG00000002728	syf2	95	85.294	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	79.592	ENSLAFG00000023150	-	91	84.685	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000001174	syf2	77	55.978	ENSLAFG00000030814	-	100	55.978	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.085	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	83.562	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000001174	syf2	91	83.796	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	83.562	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.085	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	83.562	Macaca_nemestrina
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.085	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	83.562	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	92.437	ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.437	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.176	ENSMZEG00005006429	syf2	100	91.176	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000001174	syf2	84	84.925	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	Meleagris_gallopavo
ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.165	ENSMAUG00000018974	Syf2	92	84.685	Mesocricetus_auratus
ENSAPOG00000001174	syf2	84	84.925	ENSMICG00000016191	SYF2	100	84.925	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.579	ENSMOCG00000022938	Syf2	92	85.135	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000001174	syf2	95	91.189	ENSMMOG00000002396	syf2	93	91.892	Mola_mola
ENSAPOG00000001174	syf2	93	80.357	ENSMODG00000013951	-	98	80.357	Monodelphis_domestica
ENSAPOG00000001174	syf2	100	90.871	ENSMALG00000010706	syf2	100	90.456	Monopterus_albus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.992	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	85.586	Mus_caroli
ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.992	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	85.586	Mus_musculus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.992	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	85.586	Mus_pahari
ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.992	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	85.586	Mus_spretus
ENSAPOG00000001174	syf2	91	83.796	ENSMPUG00000015802	-	89	83.562	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000001174	syf2	92	84.475	ENSMPUG00000015801	-	89	84.475	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000001174	syf2	97	79.915	ENSMLUG00000001885	SYF2	91	82.883	Myotis_lucifugus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	77.642	ENSNGAG00000007912	Syf2	90	83.784	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000001174	syf2	100	82.231	ENSNBRG00000010720	syf2	99	82.231	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	84.475	Nomascus_leucogenys
ENSAPOG00000001174	syf2	100	78.601	ENSOPRG00000012870	SYF2	91	82.883	Ochotona_princeps
ENSAPOG00000001174	syf2	97	80.952	ENSODEG00000017664	-	93	82.883	Octodon_degus
ENSAPOG00000001174	syf2	99	72.340	ENSODEG00000014338	-	92	74.775	Octodon_degus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	92.017	ENSONIG00000008213	syf2	100	92.017	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000001174	syf2	85	84.653	ENSOANG00000009552	SYF2	100	84.653	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPOG00000001174	syf2	91	85.185	ENSOCUG00000013050	SYF2	91	84.234	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000001174	syf2	98	90.129	ENSORLG00000028820	syf2	95	92.793	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.076	ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.076	ENSORLG00015014665	syf2	100	89.076	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000001174	syf2	100	90.756	ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.756	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000001174	syf2	99	81.702	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	84.685	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000001174	syf2	96	81.116	ENSOARG00000006348	-	91	83.036	Ovis_aries
ENSAPOG00000001174	syf2	82	56.923	ENSOARG00000006269	-	100	56.923	Ovis_aries
ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	84.475	Pan_paniscus
ENSAPOG00000001174	syf2	97	82.174	ENSPPRG00000001651	-	89	84.475	Panthera_pardus
ENSAPOG00000001174	syf2	99	81.172	ENSPPRG00000001638	-	89	85.388	Panthera_pardus
ENSAPOG00000001174	syf2	97	82.174	ENSPTIG00000007036	-	89	84.475	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000001174	syf2	91	85.648	ENSPTIG00000005711	-	80	85.321	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	84.475	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.085	ENSPANG00000008139	SYF2	90	83.562	Papio_anubis
ENSAPOG00000001174	syf2	100	85.714	ENSPKIG00000008130	syf2	94	90.045	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000001174	syf2	97	80.851	ENSPSIG00000011816	SYF2	86	83.784	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000001174	syf2	97	89.177	ENSPMGG00000008755	syf2	86	92.308	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.165	ENSPEMG00000008283	Syf2	92	84.685	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPOG00000001174	syf2	93	83.784	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	83.784	Phascolarctos_cinereus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	87.866	ENSPFOG00000004116	syf2	92	91.031	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000001174	syf2	98	89.270	ENSPLAG00000006691	syf2	96	90.583	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000001174	syf2	100	86.555	ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.555	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.076	ENSPREG00000003009	syf2	100	89.076	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.508	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	84.475	Pongo_abelii
ENSAPOG00000001174	syf2	100	55.556	ENSPCOG00000027011	SYF2	88	58.108	Propithecus_coquereli
ENSAPOG00000001174	syf2	93	73.874	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	73.874	Pteropus_vampyrus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.176	ENSPNYG00000004979	syf2	100	91.176	Pundamilia_nyererei
ENSAPOG00000001174	syf2	100	86.975	ENSPNAG00000015570	syf2	100	86.975	Pygocentrus_nattereri
ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.992	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	85.586	Rattus_norvegicus
ENSAPOG00000001174	syf2	99	77.966	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	81.279	Rhinopithecus_bieti
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.085	ENSRROG00000001347	SYF2	90	83.562	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	84.475	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPOG00000001174	syf2	93	83.333	ENSSHAG00000015630	-	89	83.333	Sarcophilus_harrisii
ENSAPOG00000001174	syf2	86	84.466	ENSSHAG00000007152	-	100	84.466	Sarcophilus_harrisii
ENSAPOG00000001174	syf2	93	89.140	ENSSFOG00015023647	syf2	93	89.140	Scleropages_formosus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.916	ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	Scophthalmus_maximus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	92.857	ENSSDUG00000013072	syf2	100	92.857	Seriola_dumerili
ENSAPOG00000001174	syf2	100	92.857	ENSSLDG00000012677	syf2	100	92.857	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPOG00000001174	syf2	99	62.656	ENSSARG00000012889	SYF2	91	65.315	Sorex_araneus
ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.579	ENSSPUG00000005251	SYF2	88	84.685	Sphenodon_punctatus
ENSAPOG00000001174	syf2	100	94.958	ENSSPAG00000009626	syf2	100	94.958	Stegastes_partitus
ENSAPOG00000001174	syf2	96	81.818	ENSSSCG00000037481	SYF2	90	84.163	Sus_scrofa
ENSAPOG00000001174	syf2	63	54.967	ENSTGUG00000001126	SYF2	81	56.364	Taeniopygia_guttata
ENSAPOG00000001174	syf2	100	85.833	ENSTRUG00000001499	syf2	90	88.789	Takifugu_rubripes
ENSAPOG00000001174	syf2	93	87.838	ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.838	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPOG00000001174	syf2	100	59.259	ENSTBEG00000017370	SYF2	89	62.162	Tupaia_belangeri
ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	ENSTTRG00000003550	SYF2	91	83.784	Tursiops_truncatus
ENSAPOG00000001174	syf2	98	80.342	ENSUAMG00000002897	SYF2	90	82.960	Ursus_americanus
ENSAPOG00000001174	syf2	91	83.333	ENSUMAG00000013108	SYF2	90	82.511	Ursus_maritimus
ENSAPOG00000001174	syf2	98	80.769	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	83.333	Vicugna_pacos
ENSAPOG00000001174	syf2	91	83.796	ENSVVUG00000027175	-	90	82.960	Vulpes_vulpes
ENSAPOG00000001174	syf2	86	83.902	ENSVVUG00000027181	-	90	82.960	Vulpes_vulpes
ENSAPOG00000001174	syf2	99	78.481	ENSXETG00000022797	syf2	89	81.982	Xenopus_tropicalis
ENSAPOG00000001174	syf2	100	88.655	ENSXMAG00000022698	syf2	100	88.655	Xiphophorus_maculatus