EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000001240 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 915 bases
Position: chrMVNR01000243.1:113112-114026
Accession: 110952437
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000000104	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	9.4e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000017469	-	840	XM_022195978	ENSAPOP00000000104	279 (aa)	XP_022051670	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.086	ENSG00000152464	RPP38	99	46.988	Homo_sapiens
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.369	ENSAMEG00000018832	RPP38	94	43.011	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	69.708	ENSACIG00000011592	rpp38	97	70.803	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	85.663	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	85.663	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	88.346	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	88.346	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000001240	rpp38	98	68.100	ENSATEG00000000731	rpp38	97	68.266	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000001240	rpp38	90	42.164	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	44.574	Anas_platyrhynchos
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	67.897	ENSACLG00000016958	rpp38	96	69.485	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	67.897	ENSACLG00000016962	rpp38	96	69.485	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	43.066	ENSAMXG00000025023	rpp38	93	43.066	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	41.786	ENSBTAG00000007702	RPP38	94	42.652	Bos_taurus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.444	ENSCAFG00000024373	RPP38	94	44.000	Canis_familiaris
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.444	ENSCAFG00020008008	RPP38	94	44.000	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	41.429	ENSCHIG00000012484	RPP38	94	42.294	Capra_hircus
ENSAPOG00000001240	rpp38	97	43.885	ENSCPOG00000003981	RPP38	87	45.098	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.206	ENSCLAG00000010194	RPP38	94	42.908	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000001240	rpp38	94	43.704	ENSCSAG00000019055	RPP38	94	43.956	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	45.000	ENSCHOG00000004335	RPP38	94	44.727	Choloepus_hoffmanni
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	42.657	ENSCGRG00001001395	Rpp38	94	43.262	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	42.657	ENSCGRG00000017441	Rpp38	94	43.262	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	58.519	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	58.519	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	61.255	ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.255	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	47.872	ENSDARG00000040350	rpp38	94	48.201	Danio_rerio
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	42.806	ENSDNOG00000040314	RPP38	94	41.489	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.015	ENSDORG00000009783	Rpp38	93	42.910	Dipodomys_ordii
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	42.754	ENSETEG00000002839	RPP38	94	42.435	Echinops_telfairi
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.056	ENSEASG00005019783	RPP38	93	42.756	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	41.786	ENSEEUG00000014677	RPP38	89	42.642	Erinaceus_europaeus
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	52.542	ENSELUG00000010160	rpp38	96	52.542	Esox_lucius
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.165	ENSFCAG00000022449	RPP38	94	43.011	Felis_catus
ENSAPOG00000001240	rpp38	90	43.969	ENSFALG00000014804	RPP38	88	43.359	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	41.935	ENSFDAG00000018669	RPP38	94	41.606	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	64.493	ENSFHEG00000013741	rpp38	96	64.130	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000001240	rpp38	90	44.106	ENSGALG00000008794	RPP38	86	44.106	Gallus_gallus
ENSAPOG00000001240	rpp38	57	76.250	ENSGACG00000009258	rpp38	99	76.250	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	67.897	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	69.485	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	45.161	ENSHGLG00000012144	RPP38	94	44.891	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	43.123	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	45.693	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.369	ENSSTOG00000025699	RPP38	92	43.796	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.448	ENSJJAG00000007523	Rpp38	94	43.007	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	64.388	ENSKMAG00000003986	rpp38	90	63.019	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000001240	rpp38	98	65.724	ENSLBEG00000006853	rpp38	96	65.693	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	40.000	ENSLACG00000006502	RPP38	95	40.000	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000001240	rpp38	100	45.424	ENSLOCG00000018347	rpp38	93	46.429	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000001240	rpp38	90	45.946	ENSLAFG00000000509	RPP38	88	45.669	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000001240	rpp38	94	43.333	ENSMMUG00000007679	RPP38	94	43.590	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000001240	rpp38	97	68.364	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	68.889	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	67.897	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	69.485	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	68.635	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	70.221	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000001240	rpp38	90	45.914	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	45.914	Meleagris_gallopavo
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	41.971	ENSMAUG00000003644	Rpp38	94	42.007	Mesocricetus_auratus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	41.455	ENSMOCG00000007020	Rpp38	94	41.111	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000001240	rpp38	97	61.818	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	63.004	Mola_mola
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	47.584	ENSMODG00000024091	RPP38	88	48.413	Monodelphis_domestica
ENSAPOG00000001240	rpp38	97	64.014	ENSMALG00000002356	rpp38	96	63.604	Monopterus_albus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.000	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	44.280	Mus_caroli
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.565	ENSMUSG00000049950	Rpp38	94	44.853	Mus_musculus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	45.091	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	44.649	Mus_pahari
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.203	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	43.750	Mus_spretus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.728	ENSMPUG00000018523	RPP38	94	43.431	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000001240	rpp38	94	42.435	ENSMLUG00000002153	RPP38	94	43.956	Myotis_lucifugus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.571	ENSNGAG00000011066	Rpp38	94	44.000	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	68.382	ENSNBRG00000006994	rpp38	97	69.963	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	68.889	ENSONIG00000020467	rpp38	95	69.373	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000001240	rpp38	94	42.701	ENSOCUG00000024367	-	94	42.908	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000001240	rpp38	94	43.116	ENSOCUG00000022768	-	94	42.908	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	61.624	ENSORLG00000009219	rpp38	95	62.319	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	62.132	ENSORLG00020011503	rpp38	92	62.094	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	62.132	ENSORLG00015017702	rpp38	92	62.774	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000001240	rpp38	89	62.992	ENSOMEG00000005414	rpp38	95	62.500	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000001240	rpp38	97	43.929	ENSOGAG00000008059	RPP38	95	43.478	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	41.786	ENSOARG00000004534	RPP38	94	42.294	Ovis_aries
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.803	ENSPPAG00000041577	RPP38	86	44.526	Pan_paniscus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	42.806	ENSPPRG00000015329	RPP38	94	41.935	Panthera_pardus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.165	ENSPTIG00000007188	RPP38	94	42.294	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.803	ENSPTRG00000002318	RPP38	86	44.526	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000001240	rpp38	93	46.324	ENSPKIG00000025652	rpp38	93	45.848	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000001240	rpp38	90	43.726	ENSPSIG00000001527	RPP38	88	43.411	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.321	ENSPEMG00000008375	Rpp38	94	43.382	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPOG00000001240	rpp38	90	49.416	ENSPCIG00000009096	RPP38	83	49.012	Phascolarctos_cinereus
ENSAPOG00000001240	rpp38	76	59.361	ENSPFOG00000016823	rpp38	95	58.654	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000001240	rpp38	99	61.268	ENSPLAG00000007626	rpp38	96	60.440	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	55.762	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	55.762	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000001240	rpp38	93	63.296	ENSPREG00000017744	rpp38	92	62.891	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.086	ENSPPYG00000002113	RPP38	94	43.636	Pongo_abelii
ENSAPOG00000001240	rpp38	94	42.066	ENSPVAG00000007155	RPP38	94	42.336	Pteropus_vampyrus
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	68.266	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	69.853	Pundamilia_nyererei
ENSAPOG00000001240	rpp38	90	45.882	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	45.756	Pygocentrus_nattereri
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	46.182	ENSRNOG00000038025	Rpp38	94	45.756	Rattus_norvegicus
ENSAPOG00000001240	rpp38	90	46.693	ENSSHAG00000015529	RPP38	88	46.825	Sarcophilus_harrisii
ENSAPOG00000001240	rpp38	94	65.152	ENSSMAG00000018276	rpp38	91	65.234	Scophthalmus_maximus
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	67.897	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	69.004	Seriola_dumerili
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	68.266	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	69.373	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	39.130	ENSSARG00000012099	RPP38	93	38.745	Sorex_araneus
ENSAPOG00000001240	rpp38	92	46.992	ENSSPUG00000005237	-	89	46.743	Sphenodon_punctatus
ENSAPOG00000001240	rpp38	92	42.857	ENSSPUG00000008560	-	90	42.529	Sphenodon_punctatus
ENSAPOG00000001240	rpp38	97	45.390	ENSSPUG00000018363	-	95	45.126	Sphenodon_punctatus
ENSAPOG00000001240	rpp38	95	74.721	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	74.444	Stegastes_partitus
ENSAPOG00000001240	rpp38	99	43.390	ENSSSCG00000027110	RPP38	94	43.262	Sus_scrofa
ENSAPOG00000001240	rpp38	90	44.141	ENSTGUG00000001366	RPP38	90	44.358	Taeniopygia_guttata
ENSAPOG00000001240	rpp38	98	62.057	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	62.774	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	42.958	ENSTTRG00000004420	RPP38	94	42.652	Tursiops_truncatus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.728	ENSUAMG00000002618	RPP38	94	43.431	Ursus_americanus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.060	ENSUMAG00000012382	RPP38	94	43.841	Ursus_maritimus
ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.086	ENSVVUG00000005272	RPP38	94	44.161	Vulpes_vulpes
ENSAPOG00000001240	rpp38	89	38.550	ENSXETG00000003419	rpp38	89	38.550	Xenopus_tropicalis