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Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000002641 (Gene tree)
Gene ID: 110951801
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: probable global transcription activator SNF2L2
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 72559 bases
Position: chrMVNR01000213.1:312169-384727
Accession: 110951801
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000001280	ResIII	PF04851.15	1.4e-07	1	1
ENSAPOP00000001295	ResIII	PF04851.15	1.6e-07	1	1
ENSAPOP00000001280	BRK	PF07533.16	1.8e-17	1	1
ENSAPOP00000001295	BRK	PF07533.16	2.1e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000015385	SMARCA2-201	8218	XM_022195043	ENSAPOP00000001295	1583 (aa)	XP_022050735	UPI000B9080EE
ENSAPOT00000015421	SMARCA2-202	4092	-	ENSAPOP00000001280	1363 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	77	79.393	ENSAPOG00000003509	smarca4a	98	78.226
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	72.562	ENSAPOG00000004542	SMARCA4	99	72.943

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.284	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	76.939	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.379	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.023	ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	90.670	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	98.738	ENSAOCG00000009647	-	100	98.738	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	98.926	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	100	98.926	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	99	94.569	ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	94.505	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	77.794	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.747	Anas_platyrhynchos
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.665	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.674	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.026	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	80.339	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.486	ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	91.798	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	86.310	ENSAMXG00000012404	smarca2	100	85.643	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.051	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	80.088	Bos_taurus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.519	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	80.929	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	81.416	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	80.214	Canis_familiaris
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	77	86.862	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	86.352	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.115	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	80.088	Capra_hircus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	78.917	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	79.268	Carlito_syrichta
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.133	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	78.508	Cavia_aperea
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.508	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	80.779	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.219	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	80.528	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.203	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	80.238	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.208	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.653	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.840	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.544	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	88	82.169	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	87	80.124	Choloepus_hoffmanni
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.643	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	82.650	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.412	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	80.653	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	73.063	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	74.890	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	88.576	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	98	85.806	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	95	89.023	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	89.116	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	85.266	ENSDARG00000008904	smarca2	100	84.577	Danio_rerio
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.681	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	79.478	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.090	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	80.465	Dipodomys_ordii
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	80	62.791	FBgn0000212	brm	76	59.719	Drosophila_melanogaster
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	87	62.390	ENSEBUG00000002449	-	93	63.442	Eptatretus_burgeri
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	99	72.820	ENSEBUG00000011442	-	97	68.528	Eptatretus_burgeri
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.482	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	80.025	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	61	85.294	ENSEEUG00000015540	-	69	77.027	Erinaceus_europaeus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	83.892	ENSELUG00000010318	smarca2	99	83.108	Esox_lucius
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	81.342	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	80.214	Felis_catus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.064	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	82.027	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.315	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	78.470	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	91.812	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	92.308	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	83.643	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.122	Gadus_morhua
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.257	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.502	Gallus_gallus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	95	88.070	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	83.432	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	99	89.701	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	89.002	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.450	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	80.125	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.065	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	80.662	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	93.392	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	93.392	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.625	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	79.987	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.619	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	80.214	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	84.813	ENSHCOG00000015348	-	100	84.311	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	84.931	ENSIPUG00000011060	smarca2	100	82.641	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.348	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	80.528	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.704	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	79.887	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.509	ENSKMAG00000015844	-	100	92.630	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	52	63.899	ENSLACG00000000270	SMARCA2	99	69.359	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	83.386	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	82.989	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.706	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.900	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.103	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	79.585	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.348	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	80.465	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.588	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	80.113	Macaca_nemestrina
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	91	85.862	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	80.303	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.951	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	92.701	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	93.695	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	100	93.695	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	82	65.918	ENSMGAG00000005160	-	100	67.810	Meleagris_gallopavo
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.348	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	80.716	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.180	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	80.113	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	90.883	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	87.004	Mola_mola
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	96	80.782	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	80.615	Monodelphis_domestica
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.998	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	90.874	Monopterus_albus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	78.423	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	79.675	Mus_caroli
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	78.694	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.206	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	79.812	Mus_pahari
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	78.495	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	90.909	Mus_spretus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	78	86.538	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	85.179	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	76.309	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	76.508	Myotis_lucifugus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.470	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	78.576	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	94	81.977	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	88.869	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	78.400	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.159	Nomascus_leucogenys
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	75.650	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	73.106	Notamacropus_eugenii
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	73.703	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.499	Ochotona_princeps
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.023	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	80.253	Octodon_degus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	99	93.232	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	93.295	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	54	84.980	ENSOANG00000008299	-	95	88.814	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	79	86.234	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	79.663	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.569	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	92.691	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.628	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	92.749	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.172	ENSOMEG00000009736	-	100	92.361	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	79	85.851	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.156	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	78.540	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	79.261	Ovis_aries
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.728	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	81.327	Pan_paniscus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	81.416	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	80.276	Panthera_pardus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.090	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	80.263	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	77.210	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	76.223	Papio_anubis
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	85.116	ENSPKIG00000018469	-	100	84.310	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.295	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	80.038	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	87.257	ENSPMGG00000013696	-	98	83.748	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.665	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.423	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	99	68.151	ENSPMAG00000005337	-	97	70.038	Petromyzon_marinus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	50	76.709	ENSPMAG00000001030	-	100	80.056	Petromyzon_marinus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.786	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	80.615	Phascolarctos_cinereus
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	91.777	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	92.085	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	99	91.214	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	96	91.461	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	99	91.145	ENSPMEG00000001815	-	99	91.391	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	90.966	ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	91.209	Poecilia_reticulata
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ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	88.825	ENSXCOG00000011073	SMARCA2	99	88.785	Xiphophorus_couchianus
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