EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000003191 (Gene tree)
Gene ID: 110955488
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: RNA-binding protein Musashi homolog 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21608 bases
Position: chrMVNR01000017.1:733362-754969
Accession: 110955488
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000022149	RRM_1	PF00076.22	2.2e-33	1	2
ENSAPOP00000022149	RRM_1	PF00076.22	2.2e-33	2	2
ENSAPOP00000001815	RRM_1	PF00076.22	2.3e-29	1	2
ENSAPOP00000001815	RRM_1	PF00076.22	2.3e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000014493	MSI1-201	1202	XM_022200506	ENSAPOP00000022149	349 (aa)	XP_022056198	UPI000B8FB310
ENSAPOT00000014507	MSI1-202	1023	-	ENSAPOP00000001815	340 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPOG00000003191	MSI1	52	34.637	ENSAPOG00000003364	HNRNPA0	73	38.222
ENSAPOG00000003191	MSI1	55	38.660	ENSAPOG00000003688	hnrnpa3	65	34.146
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	67.353	ENSAPOG00000001658	msi2a	100	67.353
ENSAPOG00000003191	MSI1	55	38.660	ENSAPOG00000014678	-	54	39.785
ENSAPOG00000003191	MSI1	52	33.146	ENSAPOG00000003387	HNRNPA0	65	37.634
ENSAPOG00000003191	MSI1	80	31.188	ENSAPOG00000003301	rbm38	72	31.188
ENSAPOG00000003191	MSI1	54	43.915	ENSAPOG00000016726	-	87	37.324
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.308	ENSAPOG00000023458	-	100	92.308
ENSAPOG00000003191	MSI1	55	38.660	ENSAPOG00000003641	hnrnpa3	74	39.785
ENSAPOG00000003191	MSI1	57	44.000	ENSAPOG00000006184	hnrnpd	77	40.079
ENSAPOG00000003191	MSI1	54	40.212	ENSAPOG00000019369	-	55	41.436
ENSAPOG00000003191	MSI1	54	45.503	ENSAPOG00000009207	hnrnpaba	83	37.809

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSG00000135097	MSI1	99	87.069	Homo_sapiens
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	64.042	ENSAMEG00000013302	MSI1	83	92.308	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000003191	MSI1	50	65.000	ENSACIG00000018210	zgc:110796	98	82.609	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000003191	MSI1	87	94.059	ENSACIG00000017754	-	78	91.640	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	100.000	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	83.792	ENSAOCG00000009031	-	95	85.246	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.308	ENSAPEG00000006857	-	84	92.308	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	100.000	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	91.501	ENSATEG00000023779	-	100	91.501	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	87.955	ENSATEG00000017059	MSI1	100	87.955	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.425	ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000003191	MSI1	82	82.986	ENSANAG00000027901	-	88	82.986	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSANAG00000027151	MSI1	100	83.791	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.571	ENSACLG00000000117	-	100	93.578	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.006	ENSACLG00000011230	MSI1	100	98.006	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	89.655	ENSAMXG00000038960	msi1	76	89.655	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	86.392	Bos_taurus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	83.791	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.516	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	83.516	Canis_familiaris
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.852	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	85.852	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	82.114	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	82.114	Capra_hircus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.321	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.321	Carlito_syrichta
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	86.081	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	86.081	Cavia_aperea
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.965	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	85.965	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	83.791	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.791	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.965	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	85.965	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000003191	MSI1	78	82.437	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	82.437	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	86.686	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	86.686	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.366	ENSCANG00000040651	MSI1	100	85.366	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.791	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.410	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	91.143	ENSCSEG00000008352	-	100	91.143	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.286	ENSCSEG00000005834	-	100	98.286	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	84.049	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	87.129	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000003191	MSI1	51	73.134	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	73.134	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	76	81.019	ENSCVAG00000017463	-	89	81.019	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.857	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	92.857	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	50	72.000	ENSDARG00000041299	zgc:110796	98	91.304	Danio_rerio
ENSAPOG00000003191	MSI1	79	91.628	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	98	91.628	Danio_rerio
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.079	ENSDARG00000010710	msi1	100	92.991	Danio_rerio
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	82.278	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	82.278	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	84.731	ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.731	Dipodomys_ordii
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	82.622	ENSETEG00000004756	MSI1	100	82.622	Echinops_telfairi
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSEASG00005004736	MSI1	100	83.791	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSECAG00000017526	MSI1	100	83.791	Equus_caballus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	87.423	ENSELUG00000023280	-	100	87.423	Esox_lucius
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.960	ENSELUG00000023219	MSI1	92	85.960	Esox_lucius
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.791	Felis_catus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	89.000	ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.061	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.286	ENSFHEG00000003560	-	100	98.286	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.593	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	92.593	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	91.404	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	91.117	Gadus_morhua
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	87.006	ENSGMOG00000017838	-	100	87.006	Gadus_morhua
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	89.695	ENSGALG00000007227	MSI1	98	75.318	Gallus_gallus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	98.165	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	98.165	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	73.684	ENSGAFG00000005860	-	100	73.684	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	88.154	ENSGACG00000008674	-	100	88.154	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	90.598	ENSGACG00000012679	MSI1	100	90.598	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	86.402	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	86.402	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.669	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	85.669	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.571	ENSHBUG00000011841	-	100	92.571	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.006	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	98.006	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.516	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	83.516	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.061	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000003191	MSI1	90	97.125	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	95.050	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	87.571	ENSHCOG00000012067	-	100	87.571	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	88.319	ENSIPUG00000001976	msi1	100	88.319	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.852	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.852	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	83.791	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	71.547	ENSJJAG00000010643	-	100	71.111	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.837	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	92.837	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	92.638	ENSKMAG00000019877	-	100	96.370	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.857	ENSLBEG00000001375	-	100	98.857	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.593	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	92.593	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	83.430	ENSLACG00000018287	MSI1	100	83.430	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000003191	MSI1	52	76.786	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	76.786	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	90	76.435	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	78.033	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.965	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	85.965	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.965	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	85.057	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	83.791	Macaca_nemestrina
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.366	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	85.366	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	99.140	ENSMAMG00000018426	-	100	99.140	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.264	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	92.264	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.006	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	98.006	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.571	ENSMZEG00005000340	-	100	92.571	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000003191	MSI1	63	92.899	ENSMGAG00000016518	-	100	92.899	Meleagris_gallopavo
ENSAPOG00000003191	MSI1	70	88.477	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.477	Mesocricetus_auratus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSMICG00000033181	MSI1	100	83.791	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.516	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.516	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	89.412	ENSMMOG00000012265	-	100	89.412	Mola_mola
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	81.957	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	81.957	Mola_mola
ENSAPOG00000003191	MSI1	90	59.036	ENSMODG00000003189	-	100	58.434	Monodelphis_domestica
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	98.773	ENSMALG00000001426	-	100	98.773	Monopterus_albus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.571	ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.571	Monopterus_albus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.242	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	89.354	Mus_caroli
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.242	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	89.354	Mus_musculus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	86.080	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	89.695	Mus_pahari
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.242	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	89.354	Mus_spretus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.852	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	85.852	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	76.488	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	76.488	Myotis_lucifugus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.410	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	Nannospalax_galili
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ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.571	ENSNBRG00000000841	-	100	92.571	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000003191	MSI1	88	88.525	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	88.525	Neolamprologus_brichardi
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ENSAPOG00000003191	MSI1	94	86.174	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	86.174	Oryctolagus_cuniculus
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ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.281	ENSORLG00015003916	MSI1	100	98.281	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.308	ENSOMEG00000017536	MSI1	100	92.308	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.567	ENSOMEG00000002272	-	100	98.567	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000003191	MSI1	99	82.143	ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	83.030	ENSOARG00000012097	MSI1	100	83.030	Ovis_aries
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.366	ENSPPAG00000043073	MSI1	100	85.366	Pan_paniscus
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ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSPTRG00000005531	MSI1	100	83.791	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.516	ENSPANG00000006335	MSI1	100	83.516	Papio_anubis
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	91.143	ENSPKIG00000023575	-	100	91.143	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	94.286	ENSPKIG00000016497	MSI1	100	94.286	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000003191	MSI1	79	82.018	ENSPSIG00000009621	-	100	82.456	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	86.544	ENSPSIG00000011608	-	93	86.544	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	77.204	ENSPMGG00000007743	-	98	71.758	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.286	ENSPLAG00000012431	-	97	98.286	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.308	ENSPLAG00000014025	-	100	92.308	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.281	ENSPMEG00000007025	-	86	98.281	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.308	ENSPMEG00000012796	MSI1	100	92.308	Poecilia_mexicana
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ENSAPOG00000003191	MSI1	87	97.651	ENSPREG00000021416	-	98	90.663	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000003191	MSI1	50	68.142	ENSPREG00000020265	zgc:110796	91	68.224	Poecilia_reticulata
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ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.791	Propithecus_coquereli
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ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.006	ENSPNYG00000004379	MSI1	100	98.006	Pundamilia_nyererei
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ENSAPOG00000003191	MSI1	100	88.889	ENSPNAG00000019337	msi1	100	88.889	Pygocentrus_nattereri
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.531	ENSRNOG00000001156	Msi1	100	85.531	Rattus_norvegicus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.852	ENSRBIG00000036889	MSI1	100	85.852	Rhinopithecus_bieti
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.152	ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.965	ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.965	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	74.837	ENSSHAG00000006834	MSI1	100	74.837	Sarcophilus_harrisii
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	93.051	ENSSFOG00015005350	MSI1	100	91.475	Scleropages_formosus
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ENSAPOG00000003191	MSI1	94	98.084	ENSSMAG00000009156	-	73	98.020	Scophthalmus_maximus
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ENSAPOG00000003191	MSI1	100	92.308	ENSSLDG00000016832	MSI1	100	92.308	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	87.252	ENSSLDG00000018706	-	100	87.252	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSAPOG00000003191	MSI1	59	82.099	ENSSPAG00000015573	zgc:110796	82	82.099	Stegastes_partitus
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.516	ENSSSCG00000029365	MSI1	100	85.531	Sus_scrofa
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ENSAPOG00000003191	MSI1	50	81.818	ENSTRUG00000021586	-	99	81.818	Takifugu_rubripes
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	87.784	ENSTNIG00000011469	MSI1	100	87.784	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPOG00000003191	MSI1	96	66.471	ENSTNIG00000019814	-	97	66.471	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	77.656	ENSTBEG00000007182	MSI1	100	77.289	Tupaia_belangeri
ENSAPOG00000003191	MSI1	76	87.970	ENSTTRG00000005663	MSI1	78	87.970	Tursiops_truncatus
ENSAPOG00000003191	MSI1	71	87.500	ENSUAMG00000015514	MSI1	94	87.500	Ursus_americanus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	82.410	ENSUMAG00000006176	MSI1	88	83.893	Ursus_maritimus
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.410	ENSVVUG00000020993	MSI1	100	84.685	Vulpes_vulpes
ENSAPOG00000003191	MSI1	100	84.241	ENSXETG00000012216	msi1	100	84.241	Xenopus_tropicalis
ENSAPOG00000003191	MSI1	94	80.734	ENSXCOG00000017605	MSI1	90	81.410	Xiphophorus_couchianus
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ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.567	ENSXMAG00000018237	-	100	98.567	Xiphophorus_maculatus