EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000003196 (Gene tree)
Gene ID: 110970182
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14574 bases
Position: chrMVNR01002631.1:54199-68772
Accession: 110970182
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000001782	ResIII	PF04851.15	1.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000014567	-	3498	XM_022220410	ENSAPOP00000001782	1165 (aa)	XP_022076102	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPOG00000003196	sbno1	80	64.762	ENSAPOG00000003185	si:ch73-63e15.2	74	61.647

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.169	ENSG00000139697	SBNO1	82	81.083	Homo_sapiens
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.789	ENSAMEG00000015151	SBNO1	82	80.532	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.102	ENSACIG00000008088	sbno1	85	94.536	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	98.605	ENSAOCG00000014859	sbno1	81	98.605	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	98.518	ENSAPEG00000006069	sbno1	81	98.518	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	95.478	ENSATEG00000006667	sbno1	85	95.052	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000003196	sbno1	96	81.498	ENSAPLG00000015674	SBNO1	82	81.472	Anas_platyrhynchos
ENSAPOG00000003196	sbno1	96	82.076	ENSACAG00000015441	SBNO1	74	81.282	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.169	ENSANAG00000029958	-	83	83.333	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.783	ENSACLG00000024913	sbno1	86	93.520	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.234	ENSAMXG00000019473	sbno1	83	86.667	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.357	ENSBTAG00000020505	SBNO1	85	81.271	Bos_taurus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.255	ENSCJAG00000016599	SBNO1	82	81.083	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.858	ENSCAFG00000007503	SBNO1	96	85.317	Canis_familiaris
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.172	ENSCAFG00020015363	SBNO1	83	81.250	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.357	ENSCHIG00000008382	SBNO1	84	83.244	Capra_hircus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.169	ENSTSYG00000012749	SBNO1	85	81.590	Carlito_syrichta
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.911	ENSCAPG00000000384	SBNO1	86	83.393	Cavia_aperea
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.911	ENSCPOG00000008109	SBNO1	84	83.393	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	75.838	ENSCCAG00000035316	SBNO1	83	80.451	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.520	ENSCATG00000008239	SBNO1	85	83.393	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.834	ENSCLAG00000008995	SBNO1	84	83.393	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.255	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	81.169	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000003196	sbno1	93	82.244	ENSCHOG00000008814	SBNO1	78	82.121	Choloepus_hoffmanni
ENSAPOG00000003196	sbno1	96	81.322	ENSCPBG00000025968	SBNO1	84	81.039	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	77.042	ENSCANG00000042688	-	82	76.956	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.584	ENSCGRG00001017470	Sbno1	84	81.996	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.584	ENSCGRG00000004756	Sbno1	84	81.996	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.043	ENSCSEG00000011919	sbno1	86	93.200	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.565	ENSCVAG00000007038	sbno1	82	93.739	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.036	ENSDARG00000099080	sbno1	83	86.470	Danio_rerio
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	78.701	ENSDNOG00000017147	SBNO1	78	81.576	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000003196	sbno1	95	80.731	ENSDORG00000015261	Sbno1	83	80.553	Dipodomys_ordii
ENSAPOG00000003196	sbno1	90	74.629	ENSETEG00000005620	SBNO1	76	73.628	Echinops_telfairi
ENSAPOG00000003196	sbno1	68	71.726	ENSEBUG00000013823	sbno1	75	70.991	Eptatretus_burgeri
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.341	ENSECAG00000006127	SBNO1	85	81.255	Equus_caballus
ENSAPOG00000003196	sbno1	82	82.420	ENSEEUG00000003793	SBNO1	68	82.038	Erinaceus_europaeus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	87.608	ENSELUG00000002886	sbno1	82	87.348	Esox_lucius
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.083	ENSFCAG00000015331	SBNO1	82	80.825	Felis_catus
ENSAPOG00000003196	sbno1	96	81.498	ENSFALG00000009273	SBNO1	82	81.385	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	79.897	ENSFDAG00000014232	SBNO1	82	79.553	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.652	ENSFHEG00000007360	sbno1	82	93.913	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	88.317	ENSGMOG00000018229	sbno1	88	88.056	Gadus_morhua
ENSAPOG00000003196	sbno1	85	81.718	ENSGALG00000003392	SBNO1	80	82.294	Gallus_gallus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.913	ENSGAFG00000003960	sbno1	84	93.984	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	92.428	ENSGACG00000015633	sbno1	87	92.254	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000003196	sbno1	96	80.708	ENSGAGG00000001065	SBNO1	83	83.871	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.169	ENSGGOG00000015000	SBNO1	84	83.214	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	85.852	ENSHBUG00000011910	sbno1	85	84.917	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.911	ENSHGLG00000014165	-	82	80.997	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000003196	sbno1	88	93.491	ENSHCOG00000003246	sbno1	80	93.491	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.320	ENSIPUG00000015830	Sbno1	81	87.013	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.341	ENSSTOG00000023221	SBNO1	84	83.393	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.825	ENSJJAG00000001741	Sbno1	83	80.113	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	95.043	ENSKMAG00000009696	sbno1	85	95.043	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.316	ENSLBEG00000007623	sbno1	83	93.142	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	76.577	ENSLACG00000017227	SBNO1	80	81.087	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.926	ENSLOCG00000005725	sbno1	81	86.926	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.482	ENSLAFG00000002135	SBNO1	83	80.842	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.255	ENSMFAG00000031429	SBNO1	85	79.641	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.255	ENSMMUG00000011496	SBNO1	85	79.641	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.255	ENSMLEG00000033260	SBNO1	84	83.214	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.783	ENSMAMG00000005473	sbno1	82	95.043	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000003196	sbno1	96	82.092	ENSMGAG00000003274	SBNO1	83	81.558	Meleagris_gallopavo
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	79.278	ENSMICG00000006573	-	83	80.645	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	78.430	ENSMOCG00000009390	Sbno1	84	82.709	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	89.764	ENSMMOG00000008691	sbno1	84	90.070	Mola_mola
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.620	ENSMODG00000012470	SBNO1	81	80.534	Monodelphis_domestica
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.261	ENSMALG00000001056	sbno1	85	94.071	Monopterus_albus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.245	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.789	Mus_caroli
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.809	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.789	Mus_musculus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.395	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.789	Mus_pahari
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.142	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.789	Mus_spretus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.083	ENSMPUG00000001658	SBNO1	82	80.825	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.997	ENSMLUG00000017159	SBNO1	82	80.911	Myotis_lucifugus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.255	ENSNGAG00000012620	Sbno1	81	84.466	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.257	ENSNBRG00000019189	sbno1	85	92.382	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	77.730	ENSNLEG00000001502	SBNO1	83	80.451	Nomascus_leucogenys
ENSAPOG00000003196	sbno1	53	76.989	ENSMEUG00000008768	-	67	76.989	Notamacropus_eugenii
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.640	ENSOPRG00000011054	SBNO1	82	80.846	Ochotona_princeps
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.513	ENSODEG00000009997	SBNO1	84	83.571	Octodon_degus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.323	ENSONIG00000015348	sbno1	81	94.061	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000003196	sbno1	97	80.560	ENSOCUG00000002441	SBNO1	78	80.210	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	92.708	ENSORLG00000001593	sbno1	82	92.708	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	92.789	ENSORLG00020015216	sbno1	82	92.876	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.050	ENSORLG00015002726	sbno1	82	93.136	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.374	ENSOMEG00000019313	sbno1	82	93.200	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.132	ENSOARG00000004404	SBNO1	83	81.046	Ovis_aries
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.083	ENSPPAG00000024635	SBNO1	83	83.214	Pan_paniscus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.083	ENSPPRG00000022092	SBNO1	82	80.825	Panthera_pardus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.083	ENSPTIG00000017803	SBNO1	83	80.825	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.083	ENSPTRG00000005597	SBNO1	83	83.214	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.606	ENSPANG00000011640	SBNO1	83	83.214	Papio_anubis
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.234	ENSPKIG00000001441	sbno1	83	86.320	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000003196	sbno1	96	81.410	ENSPSIG00000009572	-	85	81.039	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000003196	sbno1	89	78.335	ENSPSIG00000009256	-	81	78.701	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.241	ENSPEMG00000016087	Sbno1	84	82.531	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.620	ENSPCIG00000010985	SBNO1	84	80.637	Phascolarctos_cinereus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.435	ENSPFOG00000005069	sbno1	82	94.435	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.348	ENSPLAG00000015015	sbno1	82	94.348	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.522	ENSPMEG00000021212	sbno1	82	94.522	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.739	ENSPREG00000017746	sbno1	88	92.900	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.911	ENSPPYG00000005084	SBNO1	83	81.341	Pongo_abelii
ENSAPOG00000003196	sbno1	85	78.893	ENSPCAG00000008634	SBNO1	71	78.395	Procavia_capensis
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.637	ENSPCOG00000024277	SBNO1	83	83.094	Propithecus_coquereli
ENSAPOG00000003196	sbno1	83	83.897	ENSPVAG00000015304	SBNO1	69	83.897	Pteropus_vampyrus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.148	ENSPNYG00000004291	sbno1	84	93.805	Pundamilia_nyererei
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.320	ENSPNAG00000015622	sbno1	82	86.147	Pygocentrus_nattereri
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.498	ENSRNOG00000001064	Sbno1	84	82.857	Rattus_norvegicus
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.255	ENSRROG00000034230	SBNO1	83	83.214	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	78.590	ENSSBOG00000015422	SBNO1	86	78.418	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.234	ENSSFOG00015019025	sbno1	85	87.273	Scleropages_formosus
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