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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000003453 (Gene tree)
Gene ID: 110949477
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26298 bases
Position: chrMVNR01000110.1:58612-84909
Accession: 110949477
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000002047	IBN_N	PF03810.19	1.7e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000014121	-	5864	XM_022191577	ENSAPOP00000002047	890 (aa)	XP_022047269	UPI000B8F8ED4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	87.162	ENSAPOG00000009339	TNPO2	99	87.162
ENSAPOG00000003453	tnpo1	81	84.669	ENSAPOG00000013185	-	96	84.669

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSG00000083312	TNPO1	100	94.819	Homo_sapiens
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	92.873	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.984	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000003453	tnpo1	87	98.450	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.450	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	99.888	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	99.888	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	99.888	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	99.888	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	99.101	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	99.101	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	89.741	ENSAPLG00000009619	-	97	90.711	Anas_platyrhynchos
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.045	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.045	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	83.708	ENSANAG00000025351	-	99	83.708	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.371	ENSANAG00000022453	-	99	93.371	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	58.869	ENSANAG00000027118	-	99	61.086	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	96.854	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.854	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	95.179	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.731	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.933	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.933	Bos_taurus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.483	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.483	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	93.816	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.816	Canis_familiaris
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	91.461	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.461	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.820	Capra_hircus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	90.282	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.632	Carlito_syrichta
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.371	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.371	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.820	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.371	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.371	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.820	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	94	82.122	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.122	Choloepus_hoffmanni
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.270	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.270	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	76.655	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.094	Ciona_savignyi
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.820	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.708	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	93.918	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.918	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	96.854	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.854	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.865	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.865	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	95.174	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.725	Danio_rerio
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	88.130	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	88.130	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	93	94.096	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.089	Dipodomys_ordii
ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	58.737	FBgn0035693	CG8219	99	58.174	Drosophila_melanogaster
ENSAPOG00000003453	tnpo1	86	95.506	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	Echinops_telfairi
ENSAPOG00000003453	tnpo1	94	85.357	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.357	Eptatretus_burgeri
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.820	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.820	Equus_caballus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	89.216	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.829	Esox_lucius
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.820	Felis_catus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.157	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.157	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.483	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.483	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.980	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.980	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.281	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.281	Gadus_morhua
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.371	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.371	Gallus_gallus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.758	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.758	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.079	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	97.079	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.157	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.157	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	78.587	ENSGGOG00000022535	-	98	78.587	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.820	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	98.652	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.652	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.371	ENSHGLG00000000970	-	99	93.371	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000003453	tnpo1	97	73.256	ENSHGLG00100000963	-	99	72.558	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	93.458	ENSHGLG00100017090	-	99	93.458	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.933	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.933	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.865	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.865	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	91	94.821	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.821	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	87.326	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.326	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	95.393	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.393	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	97	93.187	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	93.187	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.820	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.792	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.820	Macaca_nemestrina
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.820	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	99.101	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	99.101	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	98.202	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.202	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	90.112	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.112	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.708	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000003453	tnpo1	87	97.680	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.680	Mola_mola
ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	94.468	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	Monodelphis_domestica
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	98.090	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	98.090	Monopterus_albus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.928	Mus_caroli
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.928	Mus_musculus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	94.052	Mus_pahari
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.483	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.820	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	93.481	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.481	Myotis_lucifugus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.820	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000003453	tnpo1	87	98.450	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.450	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.820	Nomascus_leucogenys
ENSAPOG00000003453	tnpo1	90	88.548	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.525	Ochotona_princeps
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.146	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	93.146	Octodon_degus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.879	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.879	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	92	94.512	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	87.734	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.734	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	87	97.536	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.536	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	97.745	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.745	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	98.083	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	98.083	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	97.632	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.632	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.820	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.933	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.933	Ovis_aries
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.820	Pan_paniscus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.820	Panthera_pardus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.820	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.820	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000003453	tnpo1	94	82.459	ENSPTRG00000047731	-	100	82.459	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.820	Papio_anubis
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	91.685	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.685	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.382	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.382	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.613	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.388	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	93.918	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.918	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.831	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.831	Phascolarctos_cinereus
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.760	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	97.760	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.760	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	97.760	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	98.202	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.202	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.982	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.982	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.708	Pongo_abelii
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.820	Propithecus_coquereli
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.708	Pteropus_vampyrus
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ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	92.360	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.360	Xenopus_tropicalis
ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.980	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	97.980	Xiphophorus_maculatus