EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000005042 (Gene tree)
Gene ID: 110959335
Gene Symbol: cnot1
Alias: cdc39-like|im:7141761|kiaa1007l|wu:fc58h04|zgc:152902
Full Name: CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24178 bases
Position: chrMVNR01000683.1:288084-312261
Accession: 110959335
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000003438	Not1	PF04054.15	3.8e-153	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000011747	-	6930	XM_022206157	ENSAPOP00000003438	2309 (aa)	XP_022061849	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSG00000125107	CNOT1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSAMEG00000017298	CNOT1	97	96.914	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000005042	cnot1	90	98.036	ENSACIG00000016003	cnot1	97	98.036	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	94.650	ENSAPEG00000022342	cnot1	100	94.650	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	98.400	ENSATEG00000012892	cnot1	100	98.400	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	95.938	ENSAPLG00000007162	CNOT1	97	96.919	Anas_platyrhynchos
ENSAPOG00000005042	cnot1	90	95.528	ENSACAG00000001602	CNOT1	95	95.528	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	88.965	ENSANAG00000038198	CNOT1	97	89.257	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.762	ENSACLG00000014234	cnot1	100	96.762	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	91.961	ENSAMXG00000013170	cnot1	100	92.214	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSBTAG00000020782	CNOT1	97	96.914	Bos_taurus
ENSAPOG00000005042	cnot1	76	44.202	WBGene00002845	let-711	92	54.008	Caenorhabditis_elegans
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSCJAG00000011318	CNOT1	97	96.914	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	95.961	ENSCAFG00000008426	CNOT1	97	95.961	Canis_familiaris
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	94.685	ENSCAFG00020010156	CNOT1	97	94.685	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSCHIG00000010452	CNOT1	97	96.914	Capra_hircus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSTSYG00000006888	CNOT1	97	96.914	Carlito_syrichta
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	97.055	ENSCPOG00000013026	CNOT1	97	97.055	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSCCAG00000026333	CNOT1	97	96.914	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSCATG00000032625	CNOT1	97	96.914	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	97.055	ENSCLAG00000006289	CNOT1	97	97.055	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSCSAG00000004731	CNOT1	97	96.914	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000005042	cnot1	80	97.727	ENSCHOG00000009712	CNOT1	80	97.527	Choloepus_hoffmanni
ENSAPOG00000005042	cnot1	98	96.774	ENSCPBG00000026222	CNOT1	96	96.774	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	57.036	ENSCING00000009149	-	100	56.576	Ciona_intestinalis
ENSAPOG00000005042	cnot1	89	77.019	ENSCSAVG00000002414	-	97	77.019	Ciona_savignyi
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	95.972	ENSCANG00000040534	CNOT1	97	95.972	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.774	ENSCGRG00001016365	Cnot1	97	96.774	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.774	ENSCGRG00000001714	Cnot1	97	96.774	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	95.082	ENSCVAG00000018930	cnot1	100	94.607	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	91.020	ENSDARG00000004174	cnot1	100	90.898	Danio_rerio
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	94.118	ENSDNOG00000013250	CNOT1	97	94.118	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000005042	cnot1	99	45.561	FBgn0085436	Not1	99	47.412	Drosophila_melanogaster
ENSAPOG00000005042	cnot1	86	94.729	ENSETEG00000012806	CNOT1	84	94.729	Echinops_telfairi
ENSAPOG00000005042	cnot1	83	75.893	ENSEBUG00000011534	cnot1	95	75.893	Eptatretus_burgeri
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSEASG00005005819	CNOT1	97	96.914	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSECAG00000009889	CNOT1	97	96.914	Equus_caballus
ENSAPOG00000005042	cnot1	87	98.667	ENSEEUG00000006015	CNOT1	85	98.667	Erinaceus_europaeus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.730	ENSELUG00000014085	cnot1	97	96.730	Esox_lucius
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	95.972	ENSFCAG00000025155	CNOT1	97	96.914	Felis_catus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSFALG00000007285	CNOT1	97	96.914	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	97.055	ENSFDAG00000013399	CNOT1	97	97.055	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	92.944	ENSFHEG00000020574	cnot1	100	92.860	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000005042	cnot1	90	99.180	ENSGMOG00000012864	cnot1	99	99.180	Gadus_morhua
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSGALG00000002301	CNOT1	97	96.914	Gallus_gallus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	98.878	ENSGAFG00000015005	cnot1	97	98.878	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000005042	cnot1	90	93.788	ENSGACG00000002606	cnot1	99	93.788	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.774	ENSGAGG00000022646	CNOT1	97	96.774	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSGGOG00000009547	CNOT1	97	96.914	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	97.058	ENSHBUG00000001729	cnot1	100	97.058	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	97.055	ENSHGLG00000014322	CNOT1	97	97.055	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	93.085	ENSHCOG00000006501	cnot1	100	93.085	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	90.092	ENSIPUG00000011915	cnot1	100	90.092	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	97.055	ENSSTOG00000005490	CNOT1	97	97.055	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.353	ENSJJAG00000000633	Cnot1	97	96.353	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	93.997	ENSKMAG00000006149	cnot1	100	93.997	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000005042	cnot1	91	98.802	ENSLBEG00000004740	cnot1	94	98.802	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSLACG00000010869	CNOT1	99	96.914	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	99.299	ENSLOCG00000006324	cnot1	97	99.299	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.774	ENSLAFG00000000098	CNOT1	97	96.774	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSMFAG00000035888	CNOT1	97	96.914	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSMMUG00000014625	CNOT1	97	96.914	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	95.972	ENSMNEG00000031820	CNOT1	97	96.914	Macaca_nemestrina
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	92.361	ENSMLEG00000040933	CNOT1	97	92.361	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	91.997	ENSMAMG00000016524	cnot1	100	91.997	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	94.991	ENSMZEG00005016210	cnot1	100	94.991	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSMGAG00000001908	CNOT1	97	96.914	Meleagris_gallopavo
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSMICG00000007071	CNOT1	97	96.914	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.774	ENSMOCG00000017969	Cnot1	97	96.774	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	97.187	ENSMMOG00000019134	cnot1	100	97.187	Mola_mola
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	95.938	ENSMODG00000014199	CNOT1	97	96.919	Monodelphis_domestica
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	92.502	ENSMALG00000008645	cnot1	100	92.797	Monopterus_albus
ENSAPOG00000005042	cnot1	98	96.190	MGP_CAROLIEiJ_G0031430	Cnot1	92	96.190	Mus_caroli
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ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.774	MGP_PahariEiJ_G0023028	Cnot1	97	96.774	Mus_pahari
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.774	MGP_SPRETEiJ_G0032549	Cnot1	97	96.774	Mus_spretus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSMPUG00000004830	CNOT1	97	96.914	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.774	ENSMLUG00000003728	CNOT1	97	96.774	Myotis_lucifugus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSNGAG00000018628	Cnot1	97	96.914	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000005042	cnot1	97	95.958	ENSNBRG00000019358	cnot1	100	95.958	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSNLEG00000003566	CNOT1	97	96.914	Nomascus_leucogenys
ENSAPOG00000005042	cnot1	86	91.855	ENSMEUG00000006145	CNOT1	84	91.855	Notamacropus_eugenii
ENSAPOG00000005042	cnot1	85	97.778	ENSOPRG00000005604	CNOT1	83	97.778	Ochotona_princeps
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	97.055	ENSODEG00000016337	CNOT1	97	97.055	Octodon_degus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	93.621	ENSONIG00000007358	cnot1	100	93.370	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000005042	cnot1	90	95.902	ENSOANG00000012109	CNOT1	97	96.634	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSOCUG00000006911	CNOT1	97	96.914	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	93.235	ENSORLG00000013734	cnot1	100	93.235	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	91.498	ENSORLG00020017012	cnot1	100	91.498	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	91.372	ENSORLG00015007091	cnot1	100	91.372	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	91.509	ENSOMEG00000015124	cnot1	100	91.047	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSOGAG00000000543	CNOT1	97	96.914	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSOARG00000001567	CNOT1	97	96.914	Ovis_aries
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSPPAG00000022013	CNOT1	97	96.914	Pan_paniscus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSPPRG00000004867	CNOT1	97	96.914	Panthera_pardus
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSPTIG00000012589	CNOT1	97	96.914	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	95.972	ENSPTRG00000008183	CNOT1	97	95.972	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	86.505	ENSPANG00000020901	CNOT1	100	86.697	Papio_anubis
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	98.317	ENSPKIG00000023538	CNOT1	97	98.317	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000005042	cnot1	99	88.898	ENSPKIG00000002914	CNOT1	99	88.769	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	ENSPSIG00000005499	CNOT1	97	96.914	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	74.477	ENSPMAG00000009381	cnot1	100	74.215	Petromyzon_marinus
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ENSAPOG00000005042	cnot1	95	98.204	ENSPREG00000018793	cnot1	100	98.204	Poecilia_reticulata
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ENSAPOG00000005042	cnot1	88	92.958	ENSPCAG00000003241	CNOT1	86	92.958	Procavia_capensis
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	95.972	ENSPCOG00000027139	CNOT1	97	95.972	Propithecus_coquereli
ENSAPOG00000005042	cnot1	100	89.621	ENSPVAG00000004243	CNOT1	97	89.621	Pteropus_vampyrus
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