EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000010378 (Gene tree)
Gene ID: 110953932
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC110953932
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12406 bases
Position: chrMVNR01000015.1:450650-463055
Accession: 110953932
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000026491	MMR_HSR1	PF01926.23	8.7e-07	1	1
ENSAPOP00000026506	MMR_HSR1	PF01926.23	9.2e-07	1	1
ENSAPOP00000008275	MMR_HSR1	PF01926.23	9.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000003545	-	1486	-	ENSAPOP00000026506	451 (aa)	-	-
ENSAPOT00000003582	-	1296	-	ENSAPOP00000026491	431 (aa)	-	-
ENSAPOT00000003531	-	1483	XM_022198163	ENSAPOP00000008275	448 (aa)	XP_022053855	UPI000B8FCF90

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.778

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	93.973	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	93.973	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	58.537	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.537	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	98.438	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	98.438	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	98.438	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	98.438	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	99	58.482	ENSACAG00000028632	-	99	58.705	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	81.960	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.960	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	60.352	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.352	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	81	61.364	ENSCING00000020807	-	93	61.364	Ciona_intestinalis
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	98	55.682	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.136	Ciona_savignyi
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	87.264	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.490	Danio_rerio
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	98	83.864	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	Danio_rerio
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	85	55.764	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	99	55.764	Eptatretus_burgeri
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	99	81.166	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.166	Esox_lucius
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	59.424	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	93	55.112	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.112	Gadus_morhua
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	90.848	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	60	95.349	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	95.349	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	83	67.222	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.443	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	92.857	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	92.857	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	99	88.940	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	88.940	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	85	59.178	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	81	59.178	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	96	60.138	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.138	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	78.396	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.396	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	62.361	ENSLACG00000004899	-	99	62.361	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	99	62.022	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.472	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	99	69.820	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.820	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	99	74.944	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.944	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	96	60.599	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.599	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	57.650	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.650	Mola_mola
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	98	90.433	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	90.433	Monopterus_albus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Monopterus_albus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	96	60.138	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	99	60.138	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	93.750	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	93.750	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	87.277	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.277	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	77.060	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.060	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	58.862	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.307	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	58.129	ENSPKIG00000023918	-	98	58.129	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	86.384	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	86.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.022	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	90.022	Poecilia_formosa
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ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Scophthalmus_maximus
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