EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000012873 (Gene tree)
Gene ID: 110960304
Gene Symbol: xpo6
Alias: Ranbp20|fi24f12|wu:fi24f12
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20442 bases
Position: chrMVNR01000781.1:333919-354360
Accession: 110960304
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000027916	Xpo1	PF08389.12	9.4e-23	1	1
ENSAPOP00000010325	Xpo1	PF08389.12	1.5e-22	1	1
ENSAPOP00000010325	IBN_N	PF03810.19	1.9e-07	1	1
ENSAPOP00000027916	IBN_N	PF03810.19	2.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000000004	-	5660	XM_022207498	ENSAPOP00000027916	1152 (aa)	XP_022063190	UPI000B8FBE20
ENSAPOT00000000043	-	3381	-	ENSAPOP00000010325	1126 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSAPOG00000012873's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPOG00000012873's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.476	ENSG00000169180	XPO6	100	94.118	Homo_sapiens
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.455	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	76.083	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	94.164	ENSACIG00000008055	xpo6	99	93.728	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	99.045	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	99.045	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	98.958	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	98.958	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	95.833	ENSATEG00000002273	xpo6	100	95.833	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	77.585	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	77.498	Anas_platyrhynchos
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	68.626	ENSACAG00000016883	XPO6	100	68.539	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.215	ENSANAG00000031761	XPO6	100	76.215	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	95.312	ENSACLG00000007048	xpo6	100	95.312	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	77.960	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	77.960	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.302	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	75.931	Bos_taurus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	76.389	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.803	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	76.430	Canis_familiaris
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.823	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	76.450	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	76.017	Capra_hircus
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	73.693	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	73.328	Carlito_syrichta
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.476	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	76.104	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.128	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	76.128	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSCATG00000034030	XPO6	100	76.389	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.368	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	75.997	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000012873	xpo6	91	75.874	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	75.377	Choloepus_hoffmanni
ENSAPOG00000012873	xpo6	82	82.353	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	82.353	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	44.917	ENSCING00000006884	-	100	44.596	Ciona_intestinalis
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	43.990	ENSCSAVG00000000850	-	99	43.990	Ciona_savignyi
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.215	ENSCANG00000041578	XPO6	100	76.215	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	76.017	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	93.142	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	93.142	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	93.056	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	92.969	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000012873	xpo6	97	77.333	ENSDARG00000041217	xpo6	99	77.333	Danio_rerio
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.649	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	76.277	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.215	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	75.844	Dipodomys_ordii
ENSAPOG00000012873	xpo6	83	76.834	ENSETEG00000018768	XPO6	85	76.834	Echinops_telfairi
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	59.205	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	59.610	Eptatretus_burgeri
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.736	ENSEASG00005017296	XPO6	100	76.364	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.910	ENSECAG00000008601	XPO6	100	76.537	Equus_caballus
ENSAPOG00000012873	xpo6	97	70.572	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	70.205	Erinaceus_europaeus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	86.644	ENSELUG00000009159	xpo6	100	86.383	Esox_lucius
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.910	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	76.537	Felis_catus
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	77.411	ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.411	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.890	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	76.516	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	92.969	ENSFHEG00000021190	xpo6	100	92.882	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	77.517	ENSGALG00000035360	XPO6	100	77.431	Gallus_gallus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	92.795	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	92.708	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000012873	xpo6	95	76.761	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	76.670	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	76.389	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	95.486	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	95.486	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000012873	xpo6	94	59.126	ENSHGLG00000003865	-	99	59.126	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.736	ENSHGLG00000009679	-	100	76.364	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.649	ENSHGLG00100003673	-	99	76.277	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000012873	xpo6	94	63.836	ENSHGLG00100001081	-	99	63.836	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	93.316	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	93.316	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.537	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	77.229	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.302	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	75.931	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	75.434	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	75.347	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	94.097	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	93.924	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	96.267	ENSLBEG00000023039	xpo6	100	96.267	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	75.868	ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.868	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000012873	xpo6	94	82.581	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.581	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.195	ENSLAFG00000011960	XPO6	98	78.729	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	76.389	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	76.389	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	76.389	Macaca_nemestrina
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	76.389	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	96.007	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	96.007	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	95.399	ENSMZEG00005010620	xpo6	100	95.399	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000012873	xpo6	97	76.512	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	76.423	Meleagris_gallopavo
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	69.060	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	69.060	Mesocricetus_auratus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.736	ENSMICG00000001923	XPO6	100	76.364	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	76.017	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	92.535	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	92.535	Mola_mola
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	77.083	ENSMODG00000015516	XPO6	100	76.970	Monodelphis_domestica
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	84.696	ENSMALG00000020612	xpo6	99	84.435	Monopterus_albus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.302	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	78.729	Mus_caroli
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	76.017	Mus_musculus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	76.017	Mus_pahari
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.042	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	75.671	Mus_spretus
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.281	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	75.910	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	75.934	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	75.563	Myotis_lucifugus
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.368	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	75.997	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	95.660	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	95.660	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.476	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	76.476	Nomascus_leucogenys
ENSAPOG00000012873	xpo6	86	79.328	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	79.328	Ochotona_princeps
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.649	ENSODEG00000012917	XPO6	100	76.277	Octodon_degus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	95.660	ENSONIG00000019366	xpo6	100	95.660	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.629	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	76.256	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	91.761	ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.587	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	92.281	ENSORLG00020000386	xpo6	100	92.108	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	92.021	ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.847	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	92.628	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	92.454	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.803	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	76.430	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.281	ENSOARG00000000960	XPO6	100	75.910	Ovis_aries
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	76.389	Pan_paniscus
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.362	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	75.986	Panthera_pardus
ENSAPOG00000012873	xpo6	97	75.741	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	75.358	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	76.389	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSPANG00000017103	XPO6	100	76.389	Papio_anubis
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	81.889	ENSPKIG00000022550	xpo6	100	81.427	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	75.944	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	75.856	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	91.125	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	91.125	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.302	ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.931	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	68.430	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	68.430	Petromyzon_marinus
ENSAPOG00000012873	xpo6	97	76.586	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	75.982	Phascolarctos_cinereus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	93.322	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	93.235	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	93.316	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	93.229	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	93.490	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	93.403	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000012873	xpo6	97	93.666	ENSPREG00000016421	xpo6	96	93.577	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSPPYG00000007218	XPO6	100	76.389	Pongo_abelii
ENSAPOG00000012873	xpo6	90	77.907	ENSPCAG00000008918	XPO6	90	77.907	Procavia_capensis
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.823	ENSPCOG00000017886	XPO6	100	76.450	Propithecus_coquereli
ENSAPOG00000012873	xpo6	80	91.304	ENSPVAG00000012234	XPO6	80	91.304	Pteropus_vampyrus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	95.399	ENSPNYG00000008375	xpo6	100	95.399	Pundamilia_nyererei
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	77.701	ENSPNAG00000008284	xpo6	100	77.547	Pygocentrus_nattereri
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.042	ENSRNOG00000016722	Xpo6	100	75.671	Rattus_norvegicus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	ENSRBIG00000031469	XPO6	100	76.389	Rhinopithecus_bieti
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.302	ENSRROG00000044864	XPO6	100	76.302	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.128	ENSSBOG00000027650	XPO6	100	76.128	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.910	ENSSHAG00000013864	XPO6	100	76.797	Sarcophilus_harrisii
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	78.559	ENSSFOG00015009347	xpo6	100	78.472	Scleropages_formosus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	95.312	ENSSMAG00000010566	xpo6	100	95.312	Scophthalmus_maximus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	97.396	ENSSDUG00000017294	xpo6	100	97.396	Seriola_dumerili
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	97.309	ENSSLDG00000006580	xpo6	100	97.309	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPOG00000012873	xpo6	93	77.473	ENSSARG00000013120	XPO6	93	77.473	Sorex_araneus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.997	ENSSPUG00000009217	XPO6	100	76.997	Sphenodon_punctatus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	98.524	ENSSPAG00000009469	xpo6	100	98.524	Stegastes_partitus
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.823	ENSSSCG00000007812	XPO6	100	76.450	Sus_scrofa
ENSAPOG00000012873	xpo6	87	77.007	ENSTGUG00000003781	XPO6	100	76.809	Taeniopygia_guttata
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	93.142	ENSTRUG00000004696	xpo6	100	92.882	Takifugu_rubripes
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	93.223	ENSTNIG00000018949	xpo6	99	93.223	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPOG00000012873	xpo6	93	90.370	ENSTBEG00000009945	XPO6	93	90.370	Tupaia_belangeri
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.455	ENSTTRG00000009558	XPO6	100	76.083	Tursiops_truncatus
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	74.891	ENSUMAG00000007086	XPO6	99	74.520	Ursus_maritimus
ENSAPOG00000012873	xpo6	91	91.176	ENSVPAG00000008493	XPO6	94	91.176	Vicugna_pacos
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.823	ENSVVUG00000024150	XPO6	100	76.450	Vulpes_vulpes
ENSAPOG00000012873	xpo6	99	72.333	ENSXETG00000010326	xpo6	99	72.333	Xenopus_tropicalis
ENSAPOG00000012873	xpo6	100	93.576	ENSXMAG00000011630	xpo6	100	93.490	Xiphophorus_maculatus