EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000014391 (Gene tree)
Gene ID: 110957923
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase-like
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 78092 bases
Position: chrMVNR01000570.1:129637-207728
Accession: 110957923
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000011702	Wyosine_form	PF08608.12	2.1e-27	1	1
ENSAPOP00000011716	Wyosine_form	PF08608.12	2.5e-27	1	1
ENSAPOP00000011728	Wyosine_form	PF08608.12	2.5e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000019380	-	3066	XM_022204164	ENSAPOP00000011716	750 (aa)	XP_022059856	UPI000B8F4B31
ENSAPOT00000019384	-	3872	-	ENSAPOP00000011728	750 (aa)	-	UPI000B8F4B31
ENSAPOT00000019350	-	2004	-	ENSAPOP00000011702	667 (aa)	-	-

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Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.619	ENSG00000198874	TYW1	99	66.803	Homo_sapiens
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	59.389	ENSG00000277149	TYW1B	99	58.197	Homo_sapiens
ENSAPOG00000014391	tyw1	99	79.716	ENSACIG00000007325	tyw1	100	82.158	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	96.937	ENSAOCG00000016792	tyw1	100	96.937	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	97.337	ENSAPEG00000015939	tyw1	100	97.337	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000014391	tyw1	91	85.191	ENSATEG00000006856	tyw1	94	85.191	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	66.485	ENSANAG00000037051	-	99	65.259	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	84.687	ENSACLG00000018688	tyw1	100	84.421	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000014391	tyw1	96	76.210	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	77.040	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.804	ENSBTAG00000008446	TYW1	99	67.531	Bos_taurus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	66.076	ENSCJAG00000004295	-	99	65.123	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.847	ENSCAFG00000010867	-	99	66.485	Canis_familiaris
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	59.647	ENSCAFG00020005367	-	96	63.744	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	68.169	ENSCHIG00000019510	-	99	67.940	Capra_hircus
ENSAPOG00000014391	tyw1	88	67.365	ENSTSYG00000008236	-	99	66.117	Carlito_syrichta
ENSAPOG00000014391	tyw1	91	63.533	ENSCAPG00000013569	-	100	64.275	Cavia_aperea
ENSAPOG00000014391	tyw1	95	65.342	ENSCPOG00000011182	-	98	64.120	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	66.349	ENSCCAG00000026643	-	99	65.668	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.483	ENSCATG00000043677	-	99	66.667	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000014391	tyw1	96	65.710	ENSCLAG00000006321	-	98	65.937	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	65.600	ENSCSAG00000018274	-	99	64.640	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000014391	tyw1	54	81.197	ENSCHOG00000003801	-	56	81.197	Choloepus_hoffmanni
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	66.798	ENSCPBG00000014896	-	100	66.273	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000014391	tyw1	84	59.331	ENSCING00000004125	-	97	60.177	Ciona_intestinalis
ENSAPOG00000014391	tyw1	92	54.911	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.732	Ciona_savignyi
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.347	ENSCANG00000033209	-	99	66.531	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000014391	tyw1	69	76.037	ENSCGRG00001003679	Tyw1	86	76.869	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000014391	tyw1	99	80.481	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	79.893	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000014391	tyw1	91	81.765	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	82.085	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000014391	tyw1	99	74.468	ENSDARG00000062987	tyw1	99	74.468	Danio_rerio
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	68.213	ENSDNOG00000024165	-	99	67.623	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	57.416	ENSDORG00000014772	Tyw1	91	63.520	Dipodomys_ordii
ENSAPOG00000014391	tyw1	63	74.074	ENSEBUG00000004494	tyw1	92	74.074	Eptatretus_burgeri
ENSAPOG00000014391	tyw1	96	68.646	ENSEASG00005008818	-	98	67.265	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	62.910	ENSECAG00000023164	-	98	81.034	Equus_caballus
ENSAPOG00000014391	tyw1	60	80.412	ENSEEUG00000005950	-	55	79.592	Erinaceus_europaeus
ENSAPOG00000014391	tyw1	99	75.100	ENSELUG00000008449	tyw1	83	88.919	Esox_lucius
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.619	ENSFCAG00000014262	-	99	66.259	Felis_catus
ENSAPOG00000014391	tyw1	96	65.978	ENSFALG00000013810	-	99	64.690	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	64.626	ENSFDAG00000013270	-	99	64.626	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000014391	tyw1	81	83.306	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	83.306	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000014391	tyw1	96	66.988	ENSGALG00000001110	-	98	66.575	Gallus_gallus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	80.790	ENSGACG00000012692	tyw1	99	80.654	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.659	ENSGAGG00000022393	-	99	67.388	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000014391	tyw1	87	59.668	ENSGGOG00000001473	TYW1	99	58.912	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	84.421	ENSHBUG00000002640	tyw1	100	84.154	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000014391	tyw1	91	67.267	ENSHGLG00000012093	-	100	66.721	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	65.259	ENSHGLG00100011743	TYW1	99	64.315	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	70.815	ENSHCOG00000019949	tyw1	96	70.667	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	71.220	ENSIPUG00000016330	tyw1	96	73.997	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	65.082	ENSSTOG00000004067	-	91	65.353	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000014391	tyw1	99	61.648	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	64.543	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	83.222	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	83.222	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000014391	tyw1	99	63.565	ENSLACG00000018917	tyw1	99	63.696	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000014391	tyw1	96	73.895	ENSLOCG00000004035	tyw1	95	72.022	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.619	ENSMFAG00000035457	-	99	66.803	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.619	ENSMMUG00000030374	-	99	66.803	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.619	ENSMNEG00000041992	-	99	70.438	Macaca_nemestrina
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.619	ENSMLEG00000039741	-	99	66.803	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPOG00000014391	tyw1	98	87.092	ENSMAMG00000016089	tyw1	99	86.170	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000014391	tyw1	92	86.483	ENSMZEG00005024386	tyw1	100	85.901	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000014391	tyw1	96	66.392	ENSMGAG00000002176	-	98	65.659	Meleagris_gallopavo
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	66.392	ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	66.071	Mesocricetus_auratus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.667	ENSMICG00000014374	-	99	66.849	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	66.758	ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	66.347	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	85.037	ENSMMOG00000005064	tyw1	97	85.037	Mola_mola
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	66.441	ENSMODG00000025697	-	99	66.892	Monodelphis_domestica
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	84.820	ENSMALG00000010238	tyw1	100	84.820	Monopterus_albus
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	63.099	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	98	66.667	Mus_caroli
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	63.380	ENSMUSG00000056310	Tyw1	98	66.898	Mus_musculus
ENSAPOG00000014391	tyw1	96	67.270	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	98	67.270	Mus_pahari
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	62.958	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	98	66.481	Mus_spretus
ENSAPOG00000014391	tyw1	93	67.453	ENSMPUG00000016191	-	95	70.000	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	61.272	ENSMLUG00000013582	-	98	64.529	Myotis_lucifugus
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	64.799	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	65.934	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000014391	tyw1	92	82.849	ENSNBRG00000016996	tyw1	98	82.729	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.030	ENSNLEG00000013210	-	98	65.986	Nomascus_leucogenys
ENSAPOG00000014391	tyw1	90	53.097	ENSOPRG00000008734	-	74	67.213	Ochotona_princeps
ENSAPOG00000014391	tyw1	99	60.206	ENSODEG00000014729	-	95	63.636	Octodon_degus
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	83.089	ENSONIG00000005872	tyw1	100	82.823	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000014391	tyw1	95	67.867	ENSOCUG00000003173	-	98	67.586	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	79.627	ENSORLG00000001393	tyw1	99	80.027	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	79.494	ENSORLG00020019361	tyw1	100	79.893	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	79.283	ENSORLG00015008095	tyw1	99	79.814	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000014391	tyw1	93	67.638	ENSOGAG00000016555	-	98	67.127	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.751	ENSOARG00000010673	-	99	67.480	Ovis_aries
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	68.082	ENSPPRG00000004945	-	99	67.808	Panthera_pardus
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	64.773	ENSPTIG00000019545	-	99	67.170	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	62.432	ENSPTRG00000023076	TYW1B	98	61.570	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.211	ENSPANG00000019053	-	99	66.395	Papio_anubis
ENSAPOG00000014391	tyw1	99	69.108	ENSPKIG00000006545	tyw1	96	71.349	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000014391	tyw1	94	79.462	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	78.298	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.627	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.215	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	81.806	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	83.973	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	81.325	ENSPLAG00000000838	tyw1	92	92.593	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	81.673	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	82.072	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000014391	tyw1	98	78.854	ENSPREG00000018773	tyw1	99	79.400	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.483	ENSPPYG00000017514	TYW1	99	66.757	Pongo_abelii
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	53.930	ENSPCOG00000015294	-	99	52.989	Propithecus_coquereli
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	84.554	ENSPNYG00000022381	tyw1	100	84.288	Pundamilia_nyererei
ENSAPOG00000014391	tyw1	96	77.393	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	77.393	Pygocentrus_nattereri
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	66.621	ENSRNOG00000024352	Tyw1	99	66.621	Rattus_norvegicus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.347	ENSRBIG00000039619	-	99	66.531	Rhinopithecus_bieti
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.347	ENSRROG00000039780	-	99	66.531	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	65.940	ENSSBOG00000025873	-	99	64.986	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	63.955	ENSSHAG00000010346	-	99	67.313	Sarcophilus_harrisii
ENSAPOG00000014391	tyw1	96	72.954	ENSSFOG00015001054	tyw1	99	71.701	Scleropages_formosus
ENSAPOG00000014391	tyw1	98	85.598	ENSSMAG00000020514	tyw1	100	82.933	Scophthalmus_maximus
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	88.344	ENSSDUG00000001552	tyw1	100	88.344	Seriola_dumerili
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ENSAPOG00000014391	tyw1	100	65.149	ENSSPUG00000002715	-	98	65.289	Sphenodon_punctatus
ENSAPOG00000014391	tyw1	98	66.576	ENSSSCG00000007733	-	99	66.849	Sus_scrofa
ENSAPOG00000014391	tyw1	88	67.814	ENSTGUG00000003428	-	99	67.368	Taeniopygia_guttata
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	83.600	ENSTRUG00000016107	tyw1	98	83.600	Takifugu_rubripes
ENSAPOG00000014391	tyw1	88	86.507	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	85.307	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	68.256	ENSUMAG00000015343	-	99	67.711	Ursus_maritimus
ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.531	ENSVVUG00000016457	-	99	66.166	Vulpes_vulpes
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	65.786	ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.923	Xenopus_tropicalis
ENSAPOG00000014391	tyw1	100	80.267	ENSXMAG00000013125	tyw1	100	82.133	Xiphophorus_maculatus