EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000016290 (Gene tree)
Gene ID: 110956124
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21121 bases
Position: chrMVNR01000448.1:180893-202013
Accession: 110956124
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000029999	PseudoU_synth_1	PF01416.20	7.1e-32	1	2
ENSAPOP00000029999	PseudoU_synth_1	PF01416.20	7.1e-32	2	2
ENSAPOP00000013462	PseudoU_synth_1	PF01416.20	3.3e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000021623	-	906	-	ENSAPOP00000013462	301 (aa)	-	-
ENSAPOT00000021644	-	5757	XM_022201430	ENSAPOP00000029999	298 (aa)	XP_022057122	UPI000B8F51D2

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.725	ENSG00000169972	PUSL1	97	49.593	Homo_sapiens
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	48.551	ENSAMEG00000013752	PUSL1	90	48.551	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	75.824	ENSACIG00000015240	pusl1	99	75.824	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	95.122	ENSAOCG00000019419	pusl1	97	88.294	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000016290	pusl1	100	94.966	ENSAPEG00000005452	pusl1	99	94.966	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	77.739	ENSATEG00000024154	pusl1	95	77.739	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	51.812	ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	51.812	Anas_platyrhynchos
ENSAPOG00000016290	pusl1	86	53.876	ENSACAG00000014111	PUSL1	97	53.876	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000016290	pusl1	93	51.071	ENSANAG00000037456	PUSL1	91	51.071	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	78.322	ENSACLG00000008675	pusl1	95	78.322	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000016290	pusl1	98	58.419	ENSAMXG00000044007	pusl1	99	57.778	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.725	ENSBTAG00000007619	PUSL1	94	50.725	Bos_taurus
ENSAPOG00000016290	pusl1	93	50.357	ENSCJAG00000010972	PUSL1	91	50.357	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	46.667	ENSCAFG00000019291	PUSL1	93	46.667	Canis_familiaris
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	47.719	ENSCAFG00020011568	PUSL1	92	47.719	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.362	ENSCHIG00000012615	PUSL1	95	50.362	Capra_hircus
ENSAPOG00000016290	pusl1	97	48.110	ENSCPOG00000005149	PUSL1	93	48.110	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000016290	pusl1	93	50.357	ENSCCAG00000027475	PUSL1	91	50.357	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	51.087	ENSCATG00000018260	PUSL1	90	51.087	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000016290	pusl1	97	47.423	ENSCLAG00000005232	PUSL1	94	47.423	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.725	ENSCSAG00000000680	PUSL1	90	50.725	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	55.594	ENSCPBG00000022621	PUSL1	97	55.594	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.725	ENSCANG00000034373	PUSL1	90	50.725	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	47.368	ENSCGRG00001012429	Pusl1	96	47.368	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	47.368	ENSCGRG00000006466	Pusl1	96	47.368	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPOG00000016290	pusl1	98	70.134	ENSCSEG00000005159	pusl1	100	70.134	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000016290	pusl1	80	60.338	ENSCVAG00000012923	pusl1	92	60.669	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	62.456	ENSDARG00000074565	pusl1	98	62.724	Danio_rerio
ENSAPOG00000016290	pusl1	94	32.899	FBgn0083976	CG34140	100	32.899	Drosophila_melanogaster
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	49.818	ENSECAG00000006248	PUSL1	89	49.818	Equus_caballus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	47.122	ENSEEUG00000000837	PUSL1	93	47.122	Erinaceus_europaeus
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	62.718	ENSELUG00000015945	pusl1	98	62.718	Esox_lucius
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.000	ENSFCAG00000007617	PUSL1	91	50.000	Felis_catus
ENSAPOG00000016290	pusl1	98	74.744	ENSFHEG00000006370	pusl1	98	74.744	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000016290	pusl1	94	73.310	ENSGMOG00000019388	pusl1	99	73.310	Gadus_morhua
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	53.004	ENSGALG00000001714	PUSL1	97	53.004	Gallus_gallus
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	73.498	ENSGAFG00000007546	pusl1	96	73.498	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000016290	pusl1	98	70.627	ENSGACG00000007848	pusl1	100	70.627	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	55.556	ENSGAGG00000004730	PUSL1	98	55.556	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000016290	pusl1	81	50.612	ENSGGOG00000005364	PUSL1	94	50.612	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	78.671	ENSHBUG00000001264	pusl1	95	78.671	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000016290	pusl1	93	48.387	ENSHGLG00000017570	PUSL1	90	48.387	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000016290	pusl1	83	48.996	ENSHGLG00100007641	PUSL1	82	48.996	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	74.182	ENSHCOG00000010077	pusl1	99	74.182	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	61.538	ENSIPUG00000023921	pusl1	98	61.538	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.000	ENSSTOG00000001783	PUSL1	85	50.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000016290	pusl1	97	48.630	ENSJJAG00000020471	Pusl1	98	48.630	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	66.547	ENSKMAG00000005154	pusl1	95	66.547	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000016290	pusl1	98	73.630	ENSLBEG00000013469	pusl1	100	73.630	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000016290	pusl1	64	59.585	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	59.585	Latimeria_chalumnae
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	55.282	ENSLOCG00000002210	pusl1	95	55.674	Lepisosteus_oculatus
ENSAPOG00000016290	pusl1	83	51.613	ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	51.613	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.725	ENSMFAG00000046288	PUSL1	90	50.725	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	44.203	ENSMMUG00000016279	PUSL1	89	44.203	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.725	ENSMNEG00000037989	PUSL1	90	50.725	Macaca_nemestrina
ENSAPOG00000016290	pusl1	97	72.667	ENSMAMG00000016538	pusl1	99	72.667	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	78.322	ENSMZEG00005026990	pusl1	95	78.322	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000016290	pusl1	93	52.330	ENSMGAG00000003037	PUSL1	95	52.330	Meleagris_gallopavo
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	47.368	ENSMAUG00000019924	Pusl1	96	47.368	Mesocricetus_auratus
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	50.000	ENSMICG00000014171	PUSL1	96	50.000	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	48.421	ENSMOCG00000005602	Pusl1	96	48.421	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000016290	pusl1	93	73.835	ENSMMOG00000003269	pusl1	99	73.835	Mola_mola
ENSAPOG00000016290	pusl1	97	72.667	ENSMALG00000021686	pusl1	99	72.667	Monopterus_albus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	47.826	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	94	47.826	Mus_caroli
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	47.826	ENSMUSG00000051557	Pusl1	94	47.826	Mus_musculus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	48.188	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	94	48.188	Mus_pahari
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	48.551	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	94	48.551	Mus_spretus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	49.819	ENSMPUG00000014313	PUSL1	90	49.819	Mustela_putorius_furo
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	48.252	ENSNGAG00000004647	Pusl1	85	48.252	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000016290	pusl1	94	67.138	ENSNBRG00000014762	pusl1	88	75.309	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000016290	pusl1	84	52.400	ENSNLEG00000000051	PUSL1	90	52.400	Nomascus_leucogenys
ENSAPOG00000016290	pusl1	91	42.857	ENSMEUG00000005176	-	98	42.857	Notamacropus_eugenii
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	51.264	ENSMEUG00000011649	-	96	51.264	Notamacropus_eugenii
ENSAPOG00000016290	pusl1	97	47.766	ENSODEG00000008247	PUSL1	93	47.766	Octodon_degus
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	78.322	ENSONIG00000019361	pusl1	95	78.322	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	72.438	ENSORLG00000016228	pusl1	96	72.438	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000016290	pusl1	98	70.890	ENSORLG00020013710	pusl1	99	70.890	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000016290	pusl1	94	72.143	ENSORLG00015008715	pusl1	99	72.143	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	73.498	ENSOMEG00000018897	pusl1	98	73.498	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.000	ENSOGAG00000031692	PUSL1	95	50.000	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000016290	pusl1	86	50.973	ENSOARG00000004905	PUSL1	95	50.973	Ovis_aries
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	51.087	ENSPPAG00000029283	PUSL1	90	51.087	Pan_paniscus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	49.638	ENSPPRG00000023329	PUSL1	91	49.638	Panthera_pardus
ENSAPOG00000016290	pusl1	83	50.806	ENSPTIG00000018532	PUSL1	94	48.828	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	51.087	ENSPTRG00000000021	PUSL1	90	51.087	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.725	ENSPANG00000000591	PUSL1	90	50.725	Papio_anubis
ENSAPOG00000016290	pusl1	97	58.419	ENSPKIG00000002447	pusl1	99	58.419	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000016290	pusl1	84	60.317	ENSPSIG00000002781	PUSL1	93	60.317	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000016290	pusl1	93	67.148	ENSPMGG00000011051	pusl1	100	67.148	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	48.070	ENSPEMG00000013541	Pusl1	96	48.070	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	48.772	ENSPCIG00000007816	-	64	48.772	Phascolarctos_cinereus
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	74.205	ENSPFOG00000015448	pusl1	94	74.205	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	74.558	ENSPLAG00000004348	pusl1	95	74.558	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	74.558	ENSPMEG00000000931	pusl1	95	74.558	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	73.498	ENSPREG00000002324	pusl1	95	73.498	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000016290	pusl1	81	50.206	ENSPPYG00000002014	PUSL1	87	49.796	Pongo_abelii
ENSAPOG00000016290	pusl1	63	50.794	ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	50.794	Procavia_capensis
ENSAPOG00000016290	pusl1	72	50.617	ENSPVAG00000001016	PUSL1	69	50.617	Pteropus_vampyrus
ENSAPOG00000016290	pusl1	81	80.417	ENSPNYG00000006588	pusl1	100	80.417	Pundamilia_nyererei
ENSAPOG00000016290	pusl1	96	62.937	ENSPNAG00000024441	pusl1	99	62.937	Pygocentrus_nattereri
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	49.275	ENSRNOG00000022354	Pusl1	98	47.619	Rattus_norvegicus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.362	ENSRBIG00000036842	PUSL1	90	50.362	Rhinopithecus_bieti
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	50.362	ENSRROG00000030704	PUSL1	90	50.362	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPOG00000016290	pusl1	84	50.397	ENSSBOG00000032249	PUSL1	90	50.397	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPOG00000016290	pusl1	93	62.230	ENSSFOG00015008281	pusl1	91	62.230	Scleropages_formosus
ENSAPOG00000016290	pusl1	98	71.854	ENSSMAG00000007187	pusl1	100	71.854	Scophthalmus_maximus
ENSAPOG00000016290	pusl1	97	75.433	ENSSDUG00000000287	pusl1	92	74.400	Seriola_dumerili
ENSAPOG00000016290	pusl1	97	76.125	ENSSLDG00000009605	pusl1	92	76.125	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPOG00000016290	pusl1	57	50.296	ENSSARG00000005323	-	89	50.296	Sorex_araneus
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	76.923	ENSSPAG00000002528	pusl1	99	76.923	Stegastes_partitus
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	50.526	ENSSSCG00000003338	PUSL1	92	50.526	Sus_scrofa
ENSAPOG00000016290	pusl1	92	53.285	ENSTGUG00000003214	PUSL1	99	52.297	Taeniopygia_guttata
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	71.127	ENSTRUG00000010102	pusl1	96	71.127	Takifugu_rubripes
ENSAPOG00000016290	pusl1	61	66.298	ENSTNIG00000005789	pusl1	82	66.298	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPOG00000016290	pusl1	59	45.506	ENSTBEG00000005001	PUSL1	74	45.506	Tupaia_belangeri
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	43.706	ENSTTRG00000017030	PUSL1	93	43.706	Tursiops_truncatus
ENSAPOG00000016290	pusl1	84	47.410	ENSUAMG00000012801	PUSL1	82	47.410	Ursus_americanus
ENSAPOG00000016290	pusl1	84	47.809	ENSUMAG00000002084	PUSL1	82	47.809	Ursus_maritimus
ENSAPOG00000016290	pusl1	94	48.227	ENSVVUG00000004320	PUSL1	93	42.547	Vulpes_vulpes
ENSAPOG00000016290	pusl1	77	54.348	ENSXETG00000011145	pusl1	100	54.348	Xenopus_tropicalis
ENSAPOG00000016290	pusl1	94	70.463	ENSXCOG00000017748	pusl1	99	70.463	Xiphophorus_couchianus
ENSAPOG00000016290	pusl1	95	75.618	ENSXMAG00000018846	pusl1	95	75.618	Xiphophorus_maculatus