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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSAPOG00000023072 (Gene tree)
Gene ID: 110955414
Gene Symbol: pelo (1 of many)
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Acanthochromis_polyacanthus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8901 bases
Position: chrMVNR01000403.1:7221-16121
Accession: 110955414
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPOP00000019569	eRF1_2	PF03464.15	3e-33	1	1
ENSAPOP00000034076	eRF1_2	PF03464.15	3.2e-33	1	1
ENSAPOP00000034076	eRF1_3	PF03465.15	8.9e-26	1	1
ENSAPOP00000034076	eRF1_1	PF03463.15	1.5e-51	1	1
ENSAPOP00000019569	eRF1_1	PF03463.15	1.6e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPOT00000034899	-	1122	-	ENSAPOP00000019569	373 (aa)	-	-
ENSAPOT00000029516	-	2051	XM_022200403	ENSAPOP00000034076	385 (aa)	XP_022056095	UPI000B9062C7

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPOG00000023072	pelo	66	100.000	ENSAPOG00000000616	pelo	90	100.000
ENSAPOG00000023072	pelo	66	100.000	ENSAPOG00000023700	-	90	100.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSG00000152684	PELO	100	80.260	Homo_sapiens
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSAMEG00000007734	PELO	100	80.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPOG00000023072	pelo	97	88.740	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	Amphilophus_citrinellus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	99.740	ENSAOCG00000023717	pelo	100	99.740	Amphiprion_ocellaris
ENSAPOG00000023072	pelo	100	99.740	ENSAPEG00000011235	pelo	100	99.740	Amphiprion_percula
ENSAPOG00000023072	pelo	100	95.584	ENSATEG00000019550	pelo	100	95.584	Anabas_testudineus
ENSAPOG00000023072	pelo	77	71.141	ENSAPLG00000013265	PELO	100	71.141	Anas_platyrhynchos
ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.267	ENSACAG00000004352	PELO	100	79.740	Anolis_carolinensis
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.740	ENSANAG00000014096	PELO	100	79.740	Aotus_nancymaae
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	ENSACLG00000010305	pelo	100	91.948	Astatotilapia_calliptera
ENSAPOG00000023072	pelo	97	93.298	ENSAMXG00000020299	pelo	99	92.208	Astyanax_mexicanus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.481	ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.481	Bos_taurus
ENSAPOG00000023072	pelo	99	59.843	WBGene00011280	pelo-1	100	59.843	Caenorhabditis_elegans
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.000	Callithrix_jacchus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.260	Canis_lupus_dingo
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.221	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.221	Capra_hircus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.260	Carlito_syrichta
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.000	Cavia_porcellus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSCCAG00000035600	PELO	100	80.000	Cebus_capucinus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSCATG00000011829	PELO	100	80.260	Cercocebus_atys
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.481	ENSCLAG00000005043	PELO	100	79.481	Chinchilla_lanigera
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSCHOG00000000523	PELO	100	80.000	Choloepus_hoffmanni
ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.000	ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.481	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPOG00000023072	pelo	97	64.611	ENSCING00000001979	-	100	64.323	Ciona_intestinalis
ENSAPOG00000023072	pelo	99	65.365	ENSCSAVG00000006158	-	100	65.365	Ciona_savignyi
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSCANG00000023382	PELO	100	80.260	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.161	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	79.740	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.965	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.519	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.948	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.468	ENSCVAG00000016082	pelo	100	92.468	Cyprinodon_variegatus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	89.351	ENSDARG00000055477	pelo	100	89.351	Danio_rerio
ENSAPOG00000023072	pelo	100	77.202	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.202	Dasypus_novemcinctus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.519	ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.519	Dipodomys_ordii
ENSAPOG00000023072	pelo	96	67.027	FBgn0011207	pelo	97	65.535	Drosophila_melanogaster
ENSAPOG00000023072	pelo	71	79.532	ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	Eptatretus_burgeri
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.481	ENSEASG00005013348	PELO	100	79.481	Equus_asinus_asinus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.429	ENSELUG00000023229	pelo	100	91.429	Esox_lucius
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.740	ENSFCAG00000032341	PELO	100	79.740	Felis_catus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.260	Ficedula_albicollis
ENSAPOG00000023072	pelo	76	82.042	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.042	Fukomys_damarensis
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.169	ENSFHEG00000009769	pelo	100	91.281	Fundulus_heteroclitus
ENSAPOG00000023072	pelo	98	90.186	ENSGMOG00000005849	pelo	100	90.130	Gadus_morhua
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.169	ENSGAFG00000019350	pelo	100	91.169	Gambusia_affinis
ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.987	ENSGACG00000007245	pelo	100	92.987	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.000	ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	Gopherus_agassizii
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSGGOG00000012635	PELO	100	80.260	Gorilla_gorilla
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.948	Haplochromis_burtoni
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSHGLG00000005932	PELO	100	80.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPOG00000023072	pelo	100	77.922	ENSHGLG00100017627	PELO	100	77.922	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.429	ENSHCOG00000016782	pelo	100	91.429	Hippocampus_comes
ENSAPOG00000023072	pelo	100	89.870	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.870	Ictalurus_punctatus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	78.182	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	78.182	Jaculus_jaculus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.727	ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPOG00000023072	pelo	99	92.708	ENSLBEG00000022399	pelo	100	92.708	Labrus_bergylta
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.740	ENSLAFG00000020551	PELO	100	79.740	Loxodonta_africana
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSMFAG00000000651	PELO	100	80.260	Macaca_fascicularis
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSMMUG00000039101	PELO	100	80.260	Macaca_mulatta
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSMNEG00000035538	PELO	100	80.260	Macaca_nemestrina
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSMLEG00000039113	PELO	100	80.260	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPOG00000023072	pelo	97	96.247	ENSMAMG00000013260	pelo	100	95.325	Mastacembelus_armatus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	ENSMZEG00005014258	pelo	100	91.948	Maylandia_zebra
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.000	Mesocricetus_auratus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSMICG00000044040	PELO	100	80.000	Microcebus_murinus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	80.260	Microtus_ochrogaster
ENSAPOG00000023072	pelo	100	94.805	ENSMMOG00000001324	pelo	100	94.805	Mola_mola
ENSAPOG00000023072	pelo	100	94.286	ENSMALG00000008194	pelo	100	94.286	Monopterus_albus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.740	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	79.740	Mus_caroli
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.740	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	79.740	Mus_musculus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.000	Mus_pahari
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.740	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	79.740	Mus_spretus
ENSAPOG00000023072	pelo	99	79.427	ENSMLUG00000024132	PELO	100	79.427	Myotis_lucifugus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.519	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	80.519	Nannospalax_galili
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.948	Neolamprologus_brichardi
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSNLEG00000035970	PELO	100	80.260	Nomascus_leucogenys
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.481	ENSMEUG00000005468	PELO	100	79.481	Notamacropus_eugenii
ENSAPOG00000023072	pelo	98	79.420	ENSOPRG00000018793	PELO	100	79.420	Ochotona_princeps
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSODEG00000017579	PELO	100	80.260	Octodon_degus
ENSAPOG00000023072	pelo	96	92.992	ENSONIG00000011511	pelo	100	92.468	Oreochromis_niloticus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.260	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.688	ENSORLG00000005827	pelo	100	91.688	Oryzias_latipes
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	ENSORLG00020016456	pelo	100	91.948	Oryzias_latipes_hni
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	ENSORLG00015014447	pelo	100	91.948	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPOG00000023072	pelo	100	93.247	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.247	Oryzias_melastigma
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.779	ENSOGAG00000027940	PELO	100	80.779	Otolemur_garnettii
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.481	ENSOARG00000008324	PELO	99	79.481	Ovis_aries
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSPPAG00000038951	PELO	100	80.260	Pan_paniscus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.740	ENSPPRG00000018800	PELO	100	79.740	Panthera_pardus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.740	ENSPTIG00000019988	PELO	100	79.740	Panthera_tigris_altaica
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	Pan_troglodytes
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSPANG00000010902	PELO	100	80.260	Papio_anubis
ENSAPOG00000023072	pelo	100	89.091	ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.091	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.267	ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.740	Pelodiscus_sinensis
ENSAPOG00000023072	pelo	68	94.488	ENSPMGG00000014561	pelo	94	94.488	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	80.260	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSPCIG00000004880	PELO	100	80.260	Phascolarctos_cinereus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.208	ENSPFOG00000007277	pelo	100	92.208	Poecilia_formosa
ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.468	ENSPLAG00000020787	pelo	100	92.468	Poecilia_latipinna
ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.208	ENSPMEG00000016964	pelo	100	92.208	Poecilia_mexicana
ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.468	ENSPREG00000023071	pelo	100	92.468	Poecilia_reticulata
ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.965	ENSPPYG00000015451	PELO	96	80.260	Pongo_abelii
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	ENSPCOG00000021178	PELO	100	80.000	Propithecus_coquereli
ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	ENSPNYG00000017325	pelo	100	91.948	Pundamilia_nyererei
ENSAPOG00000023072	pelo	97	92.225	ENSPNAG00000012458	pelo	99	91.688	Pygocentrus_nattereri
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	80.260	Rattus_norvegicus
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSRBIG00000007299	PELO	100	80.260	Rhinopithecus_bieti
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSRROG00000035507	PELO	100	80.260	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPOG00000023072	pelo	98	32.905	YNL001W	-	99	32.905	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	ENSSBOG00000036140	PELO	100	80.260	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPOG00000023072	pelo	63	77.869	ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.869	Sarcophilus_harrisii
ENSAPOG00000023072	pelo	98	90.451	ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.390	Scleropages_formosus
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ENSAPOG00000023072	pelo	81	78.387	ENSXETG00000018368	pelo	100	76.994	Xenopus_tropicalis
ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.987	ENSXMAG00000018474	pelo	100	92.987	Xiphophorus_maculatus