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Description

Ensembl ID: ENSATEG00000000956 (Gene tree)
Gene ID: 113151739
Gene Symbol: apobec2a
Alias: apo2a|zgc:110762
Full Name: C->U-editing enzyme APOBEC-2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10067 bases
Position: chrOOHO01000009.1:1002339-1012405
Accession: 113151739
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000001363	APOBEC_N	PF08210.11	6.1e-47	1	1
ENSATEP00000001362	APOBEC_N	PF08210.11	1.5e-46	1	1
ENSATEP00000001363	APOBEC_C	PF05240.14	2.7e-26	1	1
ENSATEP00000001362	APOBEC_C	PF05240.14	5.7e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000001384	-	759	-	ENSATEP00000001362	252 (aa)	XP_026200441	UPI000E465711
ENSATET00000001385	-	537	-	ENSATEP00000001363	178 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSATEG00000000956	apobec2a	94	34.682	ENSATEG00000022035	aicda	85	34.682
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	59.429	ENSATEG00000023043	APOBEC2	89	52.191

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSG00000124701	APOBEC2	98	55.000	Homo_sapiens
ENSATEG00000000956	apobec2a	56	85.000	ENSAPOG00000010919	-	85	85.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.714	ENSAPOG00000019390	apobec2b	91	51.181	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000000956	apobec2a	99	59.890	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	93	50.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000000956	apobec2a	99	84.181	ENSACIG00000016370	apobec2a	70	83.333	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000000956	apobec2a	97	58.382	ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	50.988	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.714	ENSAOCG00000023355	apobec2b	91	51.181	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	85.143	ENSAOCG00000003291	apobec2a	100	76.984	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.143	ENSAPEG00000004591	apobec2b	91	50.198	Amphiprion_percula
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	84.571	ENSAPEG00000003630	apobec2a	100	76.984	Amphiprion_percula
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	55.056	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	94	51.643	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000000956	apobec2a	99	56.111	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	56.425	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSANAG00000026993	APOBEC2	98	54.091	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000000956	apobec2a	97	57.803	ENSACLG00000007634	APOBEC2	100	48.519	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000000956	apobec2a	99	76.836	ENSACLG00000026736	-	99	76.836	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	66.292	ENSAMXG00000015966	apobec2b	89	57.540	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	63.128	ENSAMXG00000042992	apobec2a	100	56.031	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.011	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	70	55.455	Bos_taurus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	97	55.505	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	96	55.556	Canis_familiaris
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	59.116	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	96	56.019	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	98	55.455	Capra_hircus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	98	54.464	Carlito_syrichta
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.011	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	95	53.670	Cavia_aperea
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.011	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	95	53.670	Cavia_porcellus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	97	55.505	Cebus_capucinus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSCATG00000010691	APOBEC2	93	56.459	Cercocebus_atys
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.011	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	98	53.125	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	98	54.545	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.011	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	58.011	Choloepus_hoffmanni
ENSATEG00000000956	apobec2a	99	56.667	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	85	57.219	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSCANG00000035072	APOBEC2	98	54.545	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	60.221	ENSCGRG00001014983	Apobec2	96	56.481	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	60.221	ENSCGRG00000007835	Apobec2	96	56.481	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.143	ENSCSEG00000000690	-	100	50.929	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	84.000	ENSCSEG00000020201	apobec2a	100	73.810	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	59.429	ENSCVAG00000012342	apobec2b	91	53.200	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	66.292	ENSDARG00000113992	apobec2b	100	55.109	Danio_rerio
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	71.429	ENSDARG00000018881	apobec2a	94	58.175	Danio_rerio
ENSATEG00000000956	apobec2a	79	41.667	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	98	36.161	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSDORG00000006447	Apobec2	98	53.778	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.011	ENSETEG00000000624	APOBEC2	84	58.763	Echinops_telfairi
ENSATEG00000000956	apobec2a	82	59.060	ENSEASG00005002937	APOBEC2	95	55.435	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.459	ENSECAG00000006576	APOBEC2	96	53.704	Equus_caballus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	56.906	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	97	53.425	Erinaceus_europaeus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	74.713	ENSELUG00000003736	apobec2a	86	63.786	Esox_lucius
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	98	54.545	Felis_catus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	44.944	ENSFALG00000003910	APOBEC2	96	43.192	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	86	59.278	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.857	ENSFHEG00000005492	apobec2b	100	51.984	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	53.448	ENSGMOG00000006819	apobec2b	100	50.000	Gadus_morhua
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	77.143	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	77.143	Gadus_morhua
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	54.749	ENSGALG00000003226	APOBEC2	96	50.935	Gallus_gallus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.857	ENSGAFG00000007634	apobec2b	87	50.000	Gambusia_affinis
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.143	ENSHBUG00000005993	apobec2b	88	50.403	Haplochromis_burtoni
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	59.116	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	99	51.982	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	59.429	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	91	52.000	Hippocampus_comes
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	81.143	ENSHCOG00000020319	apobec2a	100	70.204	Hippocampus_comes
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	66.102	ENSIPUG00000013784	Apobec2	86	59.916	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	68.539	ENSIPUG00000017355	apobec2a	71	58.366	Ictalurus_punctatus
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.046	ENSKMAG00000020631	apobec2b	99	49.254	Kryptolebias_marmoratus
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.714	ENSLBEG00000009422	-	87	52.000	Labrus_bergylta
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	60.000	ENSLACG00000015985	APOBEC2	91	55.714	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	68.000	ENSLOCG00000012415	apobec2b	84	59.592	Lepisosteus_oculatus
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	98	54.545	Macaca_mulatta
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	98	54.545	Macaca_nemestrina
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	89.714	ENSMAMG00000023685	apobec2a	97	80.159	Mastacembelus_armatus
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ENSATEG00000000956	apobec2a	97	56.647	ENSMMOG00000008681	apobec2b	100	48.519	Mola_mola
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.143	ENSMALG00000013779	APOBEC2	100	49.807	Monopterus_albus
ENSATEG00000000956	apobec2a	94	60.920	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	96	55.556	Mus_caroli
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ENSATEG00000000956	apobec2a	94	60.920	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	96	55.556	Mus_pahari
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.459	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	93	54.884	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000000956	apobec2a	98	59.669	ENSNGAG00000013717	Apobec2	96	56.019	Nannospalax_galili
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	85.057	ENSNBRG00000021776	apobec2a	99	72.908	Neolamprologus_brichardi
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.714	ENSONIG00000012289	apobec2b	100	48.889	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000000956	apobec2a	94	57.059	ENSOANG00000000824	APOBEC2	98	55.000	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSATEG00000000956	apobec2a	98	57.714	ENSXCOG00000007398	apobec2b	100	51.562	Xiphophorus_couchianus
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