EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000002273 (Gene tree)
Gene ID: 113155872
Gene Symbol: xpo6
Alias: Ranbp20|fi24f12|wu:fi24f12
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12871 bases
Position: chrOOHO01000019.1:16559039-16571909
Accession: 113155872
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000003333	Xpo1	PF08389.12	1e-22	1	1
ENSATEP00000003353	Xpo1	PF08389.12	2.5e-22	1	1
ENSATEP00000003353	IBN_N	PF03810.19	2.3e-07	1	1
ENSATEP00000003333	IBN_N	PF03810.19	2.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000003363	-	5326	-	ENSATEP00000003333	1152 (aa)	XP_026206381	UPI000E45CFE6
ENSATET00000003383	-	3387	-	ENSATEP00000003353	1128 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSG00000169180	XPO6	100	94.118	Homo_sapiens
ENSATEG00000002273	xpo6	100	95.833	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	95.833	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.325	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	77.374	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000002273	xpo6	99	94.149	ENSACIG00000008055	xpo6	99	94.149	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	95.920	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	95.920	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000002273	xpo6	100	95.833	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	95.833	Amphiprion_percula
ENSATEG00000002273	xpo6	99	78.654	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	78.793	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000002273	xpo6	100	69.427	ENSACAG00000016883	XPO6	100	69.427	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.257	ENSANAG00000031761	XPO6	100	77.039	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000002273	xpo6	100	93.663	ENSACLG00000007048	xpo6	100	93.663	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.615	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	77.615	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.080	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	77.128	Bos_taurus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.522	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	77.305	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.699	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	77.640	Canis_familiaris
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.719	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	77.660	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.168	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	77.216	Capra_hircus
ENSATEG00000002273	xpo6	99	74.245	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	74.288	Carlito_syrichta
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.434	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	77.482	Cavia_porcellus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.257	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	77.039	Cebus_capucinus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSCATG00000034030	XPO6	100	77.394	Cercocebus_atys
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.148	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	77.196	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000002273	xpo6	91	77.153	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	76.978	Choloepus_hoffmanni
ENSATEG00000002273	xpo6	89	76.371	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	79.412	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000002273	xpo6	100	45.684	ENSCING00000006884	-	100	45.423	Ciona_intestinalis
ENSATEG00000002273	xpo6	99	44.176	ENSCSAVG00000000850	-	99	44.176	Ciona_savignyi
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.434	ENSCANG00000041578	XPO6	100	77.216	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.257	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	77.305	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000002273	xpo6	100	92.361	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	92.361	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000002273	xpo6	100	92.274	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	92.370	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000002273	xpo6	97	77.019	ENSDARG00000041217	xpo6	99	77.019	Danio_rerio
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.522	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	77.571	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	76.991	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	77.039	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000002273	xpo6	81	31.771	FBgn0266572	ebo	87	31.771	Drosophila_melanogaster
ENSATEG00000002273	xpo6	83	77.606	ENSETEG00000018768	XPO6	85	77.606	Echinops_telfairi
ENSATEG00000002273	xpo6	100	59.753	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	59.806	Eptatretus_burgeri
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.699	ENSEASG00005017296	XPO6	100	77.748	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.788	ENSECAG00000008601	XPO6	100	77.837	Equus_caballus
ENSATEG00000002273	xpo6	97	71.442	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	71.481	Erinaceus_europaeus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	86.123	ENSELUG00000009159	xpo6	100	85.776	Esox_lucius
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.807	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	77.748	Felis_catus
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.748	ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.023	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.502	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	77.551	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000002273	xpo6	100	91.927	ENSFHEG00000021190	xpo6	100	91.840	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	78.603	ENSGALG00000035360	XPO6	100	78.546	Gallus_gallus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	91.493	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.406	Gambusia_affinis
ENSATEG00000002273	xpo6	95	77.965	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	78.110	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.522	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	77.305	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000002273	xpo6	100	93.837	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	93.837	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000002273	xpo6	94	59.126	ENSHGLG00000003865	-	99	59.126	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.699	ENSHGLG00000009679	-	100	77.748	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSHGLG00100003673	-	99	77.660	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000002273	xpo6	94	63.836	ENSHGLG00100001081	-	99	63.836	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000002273	xpo6	100	92.101	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	92.101	Hippocampus_comes
ENSATEG00000002273	xpo6	100	76.311	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	76.950	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.080	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	77.128	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	76.596	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	76.596	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	93.229	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	93.056	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	95.052	ENSLBEG00000023039	xpo6	100	95.052	Labrus_bergylta
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.168	ENSLACG00000017930	XPO6	100	77.128	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000002273	xpo6	94	83.396	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.945	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000002273	xpo6	99	76.971	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	77.019	Loxodonta_africana
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	77.394	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	77.394	Macaca_mulatta
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	77.394	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	77.394	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	95.052	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	95.052	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	93.750	ENSMZEG00005010620	xpo6	100	93.750	Maylandia_zebra
ENSATEG00000002273	xpo6	97	77.607	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	77.545	Meleagris_gallopavo
ENSATEG00000002273	xpo6	99	68.589	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	68.356	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.522	ENSMICG00000001923	XPO6	100	77.571	Microcebus_murinus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.168	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	77.216	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000002273	xpo6	100	93.440	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	93.440	Mola_mola
ENSATEG00000002273	xpo6	100	78.280	ENSMODG00000015516	XPO6	100	78.280	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000002273	xpo6	99	85.828	ENSMALG00000020612	xpo6	99	85.828	Monopterus_albus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.257	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	78.747	Mus_caroli
ENSATEG00000002273	xpo6	100	76.991	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	77.039	Mus_musculus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.168	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	77.216	Mus_pahari
ENSATEG00000002273	xpo6	100	76.814	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	76.862	Mus_spretus
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.168	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	77.107	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000002273	xpo6	99	76.814	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	76.752	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.148	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	77.196	Nannospalax_galili
ENSATEG00000002273	xpo6	100	93.837	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	93.837	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	77.394	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000002273	xpo6	87	79.540	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	79.692	Ochotona_princeps
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSODEG00000012917	XPO6	100	77.394	Octodon_degus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	94.184	ENSONIG00000019366	xpo6	100	94.184	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.414	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	77.462	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	90.546	ENSORLG00000011231	xpo6	100	90.373	Oryzias_latipes
ENSATEG00000002273	xpo6	100	90.893	ENSORLG00020000386	xpo6	100	90.720	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000002273	xpo6	100	90.633	ENSORLG00015003636	xpo6	100	90.460	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000002273	xpo6	100	91.240	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	91.067	Oryzias_melastigma
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.591	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	77.640	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.059	ENSOARG00000000960	XPO6	100	77.107	Ovis_aries
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	77.394	Pan_paniscus
ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.350	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	77.289	Panthera_pardus
ENSATEG00000002273	xpo6	97	76.740	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	76.676	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	77.394	Pan_troglodytes
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.611	ENSPANG00000017103	XPO6	100	77.394	Papio_anubis
ENSATEG00000002273	xpo6	100	82.535	ENSPKIG00000022550	xpo6	100	82.261	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000002273	xpo6	99	76.771	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	76.771	Pelodiscus_sinensis
ENSATEG00000002273	xpo6	99	91.921	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	91.831	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.080	ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	77.128	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSATEG00000002273	xpo6	99	68.657	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	68.657	Petromyzon_marinus
ENSATEG00000002273	xpo6	97	77.900	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	77.341	Phascolarctos_cinereus
ENSATEG00000002273	xpo6	100	92.021	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	91.934	Poecilia_formosa
ENSATEG00000002273	xpo6	100	92.014	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	91.927	Poecilia_latipinna
ENSATEG00000002273	xpo6	100	92.101	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	92.014	Poecilia_mexicana
ENSATEG00000002273	xpo6	97	92.239	ENSPREG00000016421	xpo6	96	92.150	Poecilia_reticulata
ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.522	ENSPPYG00000007218	XPO6	100	77.305	Pongo_abelii
ENSATEG00000002273	xpo6	90	78.198	ENSPCAG00000008918	XPO6	90	78.198	Procavia_capensis
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ENSATEG00000002273	xpo6	80	91.304	ENSPVAG00000012234	XPO6	80	91.304	Pteropus_vampyrus
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