EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000006667 (Gene tree)
Gene ID: 113158749
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14774 bases
Position: chrOOHO01000014.1:24345265-24360038
Accession: 113158749
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000009529	ResIII	PF04851.15	1e-06	1	1
ENSATEP00000009474	ResIII	PF04851.15	1.2e-06	1	1
ENSATEP00000009488	ResIII	PF04851.15	1.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000009649	-	7352	XM_026354908	ENSATEP00000009488	1405 (aa)	XP_026210693	UPI000E4591F7
ENSATET00000009634	-	7221	XM_026354907	ENSATEP00000009474	1405 (aa)	XP_026210692	UPI000E4591F7
ENSATET00000009699	-	4080	-	ENSATEP00000009529	1359 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSATEG00000006667's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSATEG00000006667's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSATEG00000006667	sbno1	71	63.719	ENSATEG00000023838	si:ch73-63e15.2	80	63.719

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.980	ENSG00000139697	SBNO1	99	75.840	Homo_sapiens
ENSATEG00000006667	sbno1	85	95.052	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	95.478	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.031	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.751	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000006667	sbno1	100	88.277	ENSACIG00000008088	sbno1	99	88.489	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	93.096	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	93.523	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000006667	sbno1	100	93.025	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	93.452	Amphiprion_percula
ENSATEG00000006667	sbno1	98	76.550	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.885	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000006667	sbno1	98	75.107	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.947	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.420	ENSANAG00000029958	-	99	83.871	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000006667	sbno1	100	87.835	ENSACLG00000024913	sbno1	100	87.907	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000006667	sbno1	100	82.365	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	82.861	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	76.277	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	76.137	Bos_taurus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.840	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.770	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.154	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	85.913	Canis_familiaris
ENSATEG00000006667	sbno1	95	82.852	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	82.852	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.838	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	84.838	Capra_hircus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.980	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	78.261	Carlito_syrichta
ENSATEG00000006667	sbno1	90	84.991	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	84.991	Cavia_aperea
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.991	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	84.991	Cavia_porcellus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	71.779	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	73.418	Cebus_capucinus
ENSATEG00000006667	sbno1	91	84.381	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	84.381	Cercocebus_atys
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.991	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	84.991	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000006667	sbno1	85	81.826	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	81.741	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000006667	sbno1	96	73.477	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	73.290	Choloepus_hoffmanni
ENSATEG00000006667	sbno1	98	76.323	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	76.217	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000006667	sbno1	99	72.479	ENSCANG00000042688	-	99	72.339	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000006667	sbno1	95	83.604	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	83.604	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000006667	sbno1	95	83.604	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	83.604	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000006667	sbno1	100	91.032	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	91.032	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000006667	sbno1	100	90.974	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	91.187	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	81.863	ENSDARG00000099080	sbno1	99	82.575	Danio_rerio
ENSATEG00000006667	sbno1	99	78.828	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	81.746	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	72.911	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	80.553	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000006667	sbno1	93	73.585	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	73.585	Echinops_telfairi
ENSATEG00000006667	sbno1	75	61.795	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	60.886	Eptatretus_burgeri
ENSATEG00000006667	sbno1	51	72.966	ENSEASG00005012595	-	92	73.379	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.261	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	76.590	Equus_caballus
ENSATEG00000006667	sbno1	83	79.781	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	79.781	Erinaceus_europaeus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	84.158	ENSELUG00000002886	sbno1	99	84.158	Esox_lucius
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.261	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.980	Felis_catus
ENSATEG00000006667	sbno1	98	76.479	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	76.885	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000006667	sbno1	95	81.917	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	81.769	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000006667	sbno1	100	91.187	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	91.400	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000006667	sbno1	94	86.241	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	86.090	Gadus_morhua
ENSATEG00000006667	sbno1	88	76.145	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.990	Gallus_gallus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	91.898	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	91.827	Gambusia_affinis
ENSATEG00000006667	sbno1	94	90.240	ENSGACG00000015633	sbno1	99	90.240	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000006667	sbno1	95	86.338	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	85.172	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.810	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	84.810	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000006667	sbno1	100	81.286	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	80.880	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.964	ENSHGLG00000014165	-	99	84.991	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000006667	sbno1	91	94.246	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	94.246	Hippocampus_comes
ENSATEG00000006667	sbno1	100	82.649	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	83.569	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000006667	sbno1	95	85.018	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	85.018	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000006667	sbno1	95	81.227	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	81.227	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	92.587	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	92.587	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	91.477	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	91.548	Labrus_bergylta
ENSATEG00000006667	sbno1	100	71.710	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.099	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000006667	sbno1	100	82.336	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.055	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.630	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.560	Loxodonta_africana
ENSATEG00000006667	sbno1	95	81.429	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	81.429	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000006667	sbno1	95	81.429	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	81.429	Macaca_mulatta
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.838	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	84.838	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.893	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	93.106	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000006667	sbno1	98	76.660	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	76.923	Meleagris_gallopavo
ENSATEG00000006667	sbno1	50	73.455	ENSMAUG00000004834	-	99	73.876	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000006667	sbno1	95	81.522	ENSMICG00000006573	-	99	81.004	Microcebus_murinus
ENSATEG00000006667	sbno1	95	83.935	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	83.935	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000006667	sbno1	100	85.480	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	85.989	Mola_mola
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.034	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	75.893	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.537	ENSMALG00000001056	sbno1	100	92.608	Monopterus_albus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.073	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	89.912	Mus_caroli
ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.806	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	89.912	Mus_musculus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.806	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	89.912	Mus_pahari
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.197	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	89.912	Mus_spretus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.331	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	76.050	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.630	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	75.560	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000006667	sbno1	92	85.855	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	86.051	Nannospalax_galili
ENSATEG00000006667	sbno1	100	88.043	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	87.687	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000006667	sbno1	99	73.039	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	76.715	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000006667	sbno1	62	71.069	ENSMEUG00000008768	-	93	73.750	Notamacropus_eugenii
ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.457	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.563	Ochotona_princeps
ENSATEG00000006667	sbno1	95	85.172	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	85.172	Octodon_degus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.335	ENSONIG00000015348	sbno1	100	92.335	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000006667	sbno1	98	75.231	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	75.465	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	89.858	ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.858	Oryzias_latipes
ENSATEG00000006667	sbno1	100	89.922	ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.922	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000006667	sbno1	100	90.064	ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.064	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000006667	sbno1	100	89.560	ENSOMEG00000019313	sbno1	100	89.631	Oryzias_melastigma
ENSATEG00000006667	sbno1	50	71.950	ENSOGAG00000010781	-	99	72.511	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000006667	sbno1	100	76.031	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.891	Ovis_aries
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.810	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	84.810	Pan_paniscus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.261	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.980	Panthera_pardus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.211	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.930	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.810	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	84.810	Pan_troglodytes
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.838	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	84.838	Papio_anubis
ENSATEG00000006667	sbno1	99	80.821	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.892	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000006667	sbno1	92	72.762	ENSPSIG00000009256	-	99	72.762	Pelodiscus_sinensis
ENSATEG00000006667	sbno1	98	75.783	ENSPSIG00000009572	-	99	75.385	Pelodiscus_sinensis
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.116	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	84.116	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.823	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	75.910	Phascolarctos_cinereus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.182	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	92.182	Poecilia_formosa
ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.253	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	92.253	Poecilia_latipinna
ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.116	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	92.116	Poecilia_mexicana
ENSATEG00000006667	sbno1	100	91.335	ENSPREG00000017746	sbno1	100	91.335	Poecilia_reticulata
ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.893	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	76.104	Pongo_abelii
ENSATEG00000006667	sbno1	88	69.721	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	69.507	Procavia_capensis
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.517	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	84.517	Propithecus_coquereli
ENSATEG00000006667	sbno1	87	85.288	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	85.288	Pteropus_vampyrus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.253	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	91.827	Pundamilia_nyererei
ENSATEG00000006667	sbno1	100	82.649	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	82.295	Pygocentrus_nattereri
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.296	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	84.448	Rattus_norvegicus
ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.838	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	84.838	Rhinopithecus_roxellana
ENSATEG00000006667	sbno1	97	74.407	ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	74.332	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSATEG00000006667	sbno1	99	82.107	ENSSFOG00015019025	sbno1	99	82.815	Scleropages_formosus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	93.310	ENSSMAG00000013640	sbno1	100	93.310	Scophthalmus_maximus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	95.160	ENSSDUG00000023480	sbno1	100	95.160	Seriola_dumerili
ENSATEG00000006667	sbno1	100	94.947	ENSSLDG00000007928	sbno1	100	94.947	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSATEG00000006667	sbno1	89	81.774	ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.935	Sorex_araneus
ENSATEG00000006667	sbno1	98	75.625	ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.865	Sphenodon_punctatus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	94.243	ENSSPAG00000016244	sbno1	100	94.243	Stegastes_partitus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.050	ENSSSCG00000009776	SBNO1	99	75.910	Sus_scrofa
ENSATEG00000006667	sbno1	98	76.408	ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	76.815	Taeniopygia_guttata
ENSATEG00000006667	sbno1	99	88.265	ENSTRUG00000018490	sbno1	99	88.407	Takifugu_rubripes
ENSATEG00000006667	sbno1	57	86.177	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	86.717	Tetraodon_nigroviridis
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.261	ENSUAMG00000019671	SBNO1	99	75.980	Ursus_americanus
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.261	ENSUMAG00000004002	SBNO1	99	75.980	Ursus_maritimus
ENSATEG00000006667	sbno1	95	73.333	ENSVPAG00000007024	SBNO1	90	78.654	Vicugna_pacos
ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.261	ENSVVUG00000027807	SBNO1	99	75.980	Vulpes_vulpes
ENSATEG00000006667	sbno1	99	73.752	ENSXETG00000031930	SBNO1	99	73.628	Xenopus_tropicalis
ENSATEG00000006667	sbno1	89	88.711	ENSXCOG00000011607	sbno1	99	87.309	Xiphophorus_couchianus
ENSATEG00000006667	sbno1	100	91.761	ENSXMAG00000002140	sbno1	100	91.832	Xiphophorus_maculatus