EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000006856 (Gene tree)
Gene ID: 113169040
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 40858 bases
Position: chrOOHO01000021.1:3508540-3549397
Accession: ZDB-GENE-060929-688
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000009761	Wyosine_form	PF08608.12	4.7e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000009904	-	3133	-	ENSATEP00000009728	693 (aa)	-	-
ENSATET00000009937	-	4577	-	ENSATEP00000009761	720 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.921	ENSG00000198874	TYW1	89	66.819	Homo_sapiens
ENSATEG00000006856	tyw1	90	58.193	ENSG00000277149	TYW1B	88	58.410	Homo_sapiens
ENSATEG00000006856	tyw1	94	85.191	ENSAPOG00000014391	tyw1	91	85.191	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000006856	tyw1	91	81.011	ENSACIG00000007325	tyw1	90	81.040	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000006856	tyw1	94	85.191	ENSAOCG00000016792	tyw1	91	85.191	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000006856	tyw1	94	85.337	ENSAPEG00000015939	tyw1	91	85.337	Amphiprion_percula
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.061	ENSANAG00000037051	-	89	66.364	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000006856	tyw1	94	83.994	ENSACLG00000018688	tyw1	90	83.994	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000006856	tyw1	91	73.242	ENSAMXG00000004157	tyw1	89	75.688	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.818	ENSBTAG00000008446	TYW1	89	66.818	Bos_taurus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.819	ENSCJAG00000004295	-	89	66.869	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.818	ENSCAFG00000010867	-	89	67.121	Canis_familiaris
ENSATEG00000006856	tyw1	86	62.219	ENSCAFG00020005367	-	88	62.540	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000006856	tyw1	90	65.913	ENSCHIG00000019510	-	89	65.913	Capra_hircus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.819	ENSTSYG00000008236	-	99	66.819	Carlito_syrichta
ENSATEG00000006856	tyw1	79	62.522	ENSCAPG00000013569	-	88	62.762	Cavia_aperea
ENSATEG00000006856	tyw1	89	64.134	ENSCPOG00000011182	-	90	63.690	Cavia_porcellus
ENSATEG00000006856	tyw1	92	66.119	ENSCCAG00000026643	-	95	66.170	Cebus_capucinus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.971	ENSCATG00000043677	-	89	66.869	Cercocebus_atys
ENSATEG00000006856	tyw1	90	65.152	ENSCLAG00000006321	-	89	65.356	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000006856	tyw1	81	71.069	ENSCSAG00000018274	-	88	70.921	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000006856	tyw1	51	79.915	ENSCHOG00000003801	-	56	79.915	Choloepus_hoffmanni
ENSATEG00000006856	tyw1	90	67.988	ENSCPBG00000014896	-	90	68.341	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000006856	tyw1	74	55.514	ENSCING00000004125	-	87	58.022	Ciona_intestinalis
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.819	ENSCANG00000033209	-	89	66.717	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000006856	tyw1	62	75.956	ENSCGRG00001003679	Tyw1	77	75.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000006856	tyw1	93	80.148	ENSCSEG00000005810	tyw1	88	81.278	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000006856	tyw1	94	79.265	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	79.559	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000006856	tyw1	91	73.556	ENSDARG00000062987	tyw1	86	74.886	Danio_rerio
ENSATEG00000006856	tyw1	93	66.470	ENSDNOG00000024165	-	89	67.481	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000006856	tyw1	77	63.538	ENSDORG00000014772	Tyw1	80	63.604	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000006856	tyw1	50	75.862	ENSEBUG00000004494	tyw1	77	75.862	Eptatretus_burgeri
ENSATEG00000006856	tyw1	91	66.917	ENSEASG00005008818	-	90	66.917	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000006856	tyw1	91	59.517	ENSECAG00000023164	-	89	60.150	Equus_caballus
ENSATEG00000006856	tyw1	61	78.947	ENSEEUG00000005950	-	60	78.947	Erinaceus_europaeus
ENSATEG00000006856	tyw1	94	72.581	ENSELUG00000008449	tyw1	88	73.792	Esox_lucius
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.161	ENSFCAG00000014262	-	89	66.161	Felis_catus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	64.580	ENSFALG00000013810	-	89	65.244	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000006856	tyw1	90	64.795	ENSFDAG00000013270	-	89	65.046	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000006856	tyw1	84	73.977	ENSFHEG00000020824	tyw1	79	73.977	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	65.809	ENSGALG00000001110	-	89	66.616	Gallus_gallus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	79.421	ENSGACG00000012692	tyw1	89	79.421	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000006856	tyw1	91	67.117	ENSGAGG00000022393	-	90	67.616	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000006856	tyw1	90	59.542	ENSGGOG00000001473	TYW1	98	59.604	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000006856	tyw1	94	83.847	ENSHBUG00000002640	tyw1	90	83.847	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000006856	tyw1	80	65.969	ENSHGLG00000012093	-	88	65.969	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000006856	tyw1	90	65.396	ENSHGLG00100011743	TYW1	89	65.601	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000006856	tyw1	90	67.275	ENSHCOG00000019949	tyw1	86	67.275	Hippocampus_comes
ENSATEG00000006856	tyw1	94	70.700	ENSIPUG00000016330	tyw1	91	72.012	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	64.482	ENSSTOG00000004067	-	81	64.286	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000006856	tyw1	89	64.341	ENSJJAG00000022959	Tyw1	89	64.472	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000006856	tyw1	92	82.432	ENSKMAG00000018599	tyw1	89	82.432	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000006856	tyw1	93	62.518	ENSLACG00000018917	tyw1	90	64.338	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000006856	tyw1	90	72.256	ENSLOCG00000004035	tyw1	86	72.256	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.971	ENSMFAG00000035457	-	89	66.869	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.971	ENSMMUG00000030374	-	89	66.869	Macaca_mulatta
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.971	ENSMNEG00000041992	-	88	71.130	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000006856	tyw1	90	67.123	ENSMLEG00000039741	-	89	67.021	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000006856	tyw1	92	85.865	ENSMAMG00000016089	tyw1	89	85.316	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000006856	tyw1	93	84.375	ENSMZEG00005024386	tyw1	95	84.375	Maylandia_zebra
ENSATEG00000006856	tyw1	90	65.957	ENSMGAG00000002176	-	88	66.616	Meleagris_gallopavo
ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.906	ENSMAUG00000002959	Tyw1	90	66.058	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	67.173	ENSMICG00000014374	-	90	67.173	Microcebus_murinus
ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.297	ENSMOCG00000017720	Tyw1	90	65.297	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000006856	tyw1	91	75.000	ENSMMOG00000005064	tyw1	88	76.687	Mola_mola
ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.961	ENSMODG00000025697	-	89	67.368	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000006856	tyw1	94	84.875	ENSMALG00000010238	tyw1	91	85.169	Monopterus_albus
ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.549	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	90	65.549	Mus_caroli
ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.046	ENSMUSG00000056310	Tyw1	90	65.303	Mus_musculus
ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.549	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	90	65.549	Mus_pahari
ENSATEG00000006856	tyw1	91	64.742	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	90	65.000	Mus_spretus
ENSATEG00000006856	tyw1	83	69.076	ENSMPUG00000016191	-	85	69.076	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000006856	tyw1	91	63.378	ENSMLUG00000013582	-	90	63.378	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.104	ENSNGAG00000002742	Tyw1	89	66.411	Nannospalax_galili
ENSATEG00000006856	tyw1	88	80.190	ENSNBRG00000016996	tyw1	89	80.190	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.362	ENSNLEG00000013210	-	88	66.261	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000006856	tyw1	82	51.939	ENSOPRG00000008734	-	77	51.783	Ochotona_princeps
ENSATEG00000006856	tyw1	90	57.034	ENSODEG00000014729	-	88	57.230	Octodon_degus
ENSATEG00000006856	tyw1	94	81.965	ENSONIG00000005872	tyw1	90	82.258	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000006856	tyw1	89	65.850	ENSOCUG00000003173	-	90	65.367	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000006856	tyw1	94	77.566	ENSORLG00000001393	tyw1	90	77.566	Oryzias_latipes
ENSATEG00000006856	tyw1	94	77.566	ENSORLG00020019361	tyw1	90	77.566	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000006856	tyw1	94	77.372	ENSORLG00015008095	tyw1	97	77.551	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000006856	tyw1	83	70.549	ENSOGAG00000016555	-	89	66.063	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000006856	tyw1	90	65.719	ENSOARG00000010673	-	89	65.719	Ovis_aries
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.667	ENSPPRG00000004945	-	89	66.667	Panthera_pardus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.208	ENSPTIG00000019545	-	89	66.208	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000006856	tyw1	90	61.550	ENSPTRG00000023076	TYW1B	87	61.608	Pan_troglodytes
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.667	ENSPANG00000019053	-	89	66.565	Papio_anubis
ENSATEG00000006856	tyw1	90	70.750	ENSPKIG00000006545	tyw1	86	70.904	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000006856	tyw1	88	80.315	ENSPMGG00000004240	tyw1	90	80.346	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.606	ENSPEMG00000008274	Tyw1	90	65.606	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSATEG00000006856	tyw1	94	77.697	ENSPFOG00000015855	tyw1	90	79.027	Poecilia_formosa
ENSATEG00000006856	tyw1	94	77.114	ENSPLAG00000000838	tyw1	91	77.551	Poecilia_latipinna
ENSATEG00000006856	tyw1	94	77.551	ENSPMEG00000019437	tyw1	90	77.988	Poecilia_mexicana
ENSATEG00000006856	tyw1	92	74.813	ENSPREG00000018773	tyw1	89	75.412	Poecilia_reticulata
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.819	ENSPPYG00000017514	TYW1	89	66.717	Pongo_abelii
ENSATEG00000006856	tyw1	90	50.758	ENSPCOG00000015294	-	87	50.758	Propithecus_coquereli
ENSATEG00000006856	tyw1	94	83.994	ENSPNYG00000022381	tyw1	90	83.994	Pundamilia_nyererei
ENSATEG00000006856	tyw1	92	72.741	ENSPNAG00000009001	tyw1	90	74.849	Pygocentrus_nattereri
ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.906	ENSRNOG00000024352	Tyw1	90	66.058	Rattus_norvegicus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.971	ENSRBIG00000039619	-	89	66.869	Rhinopithecus_bieti
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.971	ENSRROG00000039780	-	89	66.869	Rhinopithecus_roxellana
ENSATEG00000006856	tyw1	82	39.607	YPL207W	-	65	39.607	Saccharomyces_cerevisiae
ENSATEG00000006856	tyw1	90	65.809	ENSSBOG00000025873	-	89	65.809	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSATEG00000006856	tyw1	92	63.988	ENSSHAG00000010346	-	90	66.869	Sarcophilus_harrisii
ENSATEG00000006856	tyw1	90	72.350	ENSSFOG00015001054	tyw1	86	72.987	Scleropages_formosus
ENSATEG00000006856	tyw1	92	85.307	ENSSMAG00000020514	tyw1	90	84.435	Scophthalmus_maximus
ENSATEG00000006856	tyw1	94	87.408	ENSSDUG00000001552	tyw1	91	87.408	Seriola_dumerili
ENSATEG00000006856	tyw1	94	87.555	ENSSLDG00000003554	tyw1	91	87.555	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSATEG00000006856	tyw1	90	64.329	ENSSPUG00000002715	-	88	65.091	Sphenodon_punctatus
ENSATEG00000006856	tyw1	91	67.873	ENSSSCG00000007733	-	97	67.922	Sus_scrofa
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.565	ENSTGUG00000003428	-	98	67.223	Taeniopygia_guttata
ENSATEG00000006856	tyw1	94	82.474	ENSTRUG00000016107	tyw1	88	82.474	Takifugu_rubripes
ENSATEG00000006856	tyw1	82	85.810	ENSTNIG00000018999	tyw1	89	85.810	Tetraodon_nigroviridis
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.970	ENSUMAG00000015343	-	89	66.970	Ursus_maritimus
ENSATEG00000006856	tyw1	90	66.768	ENSVVUG00000016457	-	89	66.920	Vulpes_vulpes
ENSATEG00000006856	tyw1	90	68.037	ENSXETG00000010094	tyw1	89	68.950	Xenopus_tropicalis
ENSATEG00000006856	tyw1	94	76.799	ENSXMAG00000013125	tyw1	90	77.827	Xiphophorus_maculatus