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Description

Ensembl ID: ENSATEG00000006916 (Gene tree)
Gene ID: 113150160
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 46074 bases
Position: chrOOHO01000012.1:21544114-21590187
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000009807	ResIII	PF04851.15	7.4e-08	1	1
ENSATEP00000009807	BRK	PF07533.16	2.2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000009983	SMARCA2-201	8514	-	ENSATEP00000009807	1595 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	69.288	ENSATEG00000001094	-	97	73.148
ENSATEG00000006916	SMARCA2	93	73.453	ENSATEG00000011524	smarca4a	99	71.534

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	81.429	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	94.505	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	99	94.569	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	88	77.510	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	86.545	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	90.759	ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	90.823	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	94.121	ENSAOCG00000009647	-	99	94.121	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	94.121	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	99	94.185	Amphiprion_percula
ENSATEG00000006916	SMARCA2	86	78.985	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	78.512	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	80.862	ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	80.522	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.308	ENSANAG00000026498	SMARCA2	99	81.453	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	91.502	ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	91.885	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	86.203	ENSAMXG00000012404	smarca2	99	86.275	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	81.113	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	99	80.762	Bos_taurus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	81.282	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.761	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	81.060	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	99	80.943	Canis_familiaris
ENSATEG00000006916	SMARCA2	73	87.210	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	87.039	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	81.242	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	99	80.825	Capra_hircus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	78.520	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	81.226	Carlito_syrichta
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	78.063	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	78.776	Cavia_aperea
ENSATEG00000006916	SMARCA2	97	79.758	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	99	80.955	Cavia_porcellus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.545	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	99	81.644	Cebus_capucinus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.233	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	80.865	Cercocebus_atys
ENSATEG00000006916	SMARCA2	97	80.180	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	80.940	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000006916	SMARCA2	91	81.527	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.946	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	83	81.969	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	81.969	Choloepus_hoffmanni
ENSATEG00000006916	SMARCA2	92	85.572	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	98	84.281	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.604	ENSCANG00000039597	SMARCA2	99	81.708	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	86.943	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	99	86.943	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000006916	SMARCA2	84	88.370	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	88.519	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	85.260	ENSDARG00000008904	smarca2	99	85.079	Danio_rerio
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.695	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	99	81.512	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.857	ENSDORG00000014832	Smarca2	99	80.686	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000006916	SMARCA2	86	61.119	ENSEBUG00000002449	-	95	62.855	Eptatretus_burgeri
ENSATEG00000006916	SMARCA2	94	69.221	ENSEBUG00000011442	-	97	68.877	Eptatretus_burgeri
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.866	ENSEASG00005010312	SMARCA2	99	80.880	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	60	91.176	ENSEEUG00000015540	-	68	77.027	Erinaceus_europaeus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	94	84.110	ENSELUG00000010318	smarca2	99	82.432	Esox_lucius
ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	80.872	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	99	80.943	Felis_catus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	80.757	ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	82.647	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	79.845	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	79.987	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	92.332	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	92.586	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	83.407	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.027	Gadus_morhua
ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	81.018	ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	81.119	Gallus_gallus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	94	83.630	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	83.498	Gambusia_affinis
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	89.404	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	89.150	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	81.409	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	99	81.310	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	76.833	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	98	86.002	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	92.862	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	93.244	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.414	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	80.566	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.921	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	99	80.713	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000006916	SMARCA2	89	81.876	ENSHCOG00000015348	-	95	89.296	Hippocampus_comes
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	85.307	ENSIPUG00000011060	smarca2	99	84.828	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.986	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	99	81.182	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	79.898	ENSJJAG00000010867	Smarca2	99	80.774	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	92.844	ENSKMAG00000015844	-	99	92.975	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	83.974	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	83.750	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.475	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	80.682	Loxodonta_africana
ENSATEG00000006916	SMARCA2	78	86.714	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	99	80.497	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.488	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	99	81.644	Macaca_mulatta
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.597	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	81.095	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000006916	SMARCA2	89	87.089	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	78.324	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	95.466	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	99	95.466	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	93.231	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	99	93.614	Maylandia_zebra
ENSATEG00000006916	SMARCA2	73	69.221	ENSMGAG00000005160	-	100	68.692	Meleagris_gallopavo
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	81.181	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	81.708	Microcebus_murinus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	81.141	ENSMOCG00000001611	Smarca2	99	81.119	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	87.959	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	100	88.023	Mola_mola
ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	81.639	ENSMODG00000003578	SMARCA2	99	81.552	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	92.366	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	92.492	Monopterus_albus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	80.206	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	99	80.889	Mus_caroli
ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	81.030	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	80	86.516	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	99	80.838	Mus_pahari
ENSATEG00000006916	SMARCA2	83	84.369	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	87.029	Mus_spretus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	78	86.074	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	93	86.418	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	76.756	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	76.756	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	79.148	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	79.156	Nannospalax_galili
ENSATEG00000006916	SMARCA2	93	77.979	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	92	88.571	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000006916	SMARCA2	90	85.862	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	78.904	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000006916	SMARCA2	91	75.528	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	99	73.598	Notamacropus_eugenii
ENSATEG00000006916	SMARCA2	78	81.970	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	77.183	Ochotona_princeps
ENSATEG00000006916	SMARCA2	81	85.494	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	80.692	Octodon_degus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	92.812	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	93.062	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	78	87.310	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	99	80.443	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	92.061	ENSORLG00000020820	SMARCA2	99	92.263	Oryzias_latipes
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	92.061	ENSORLG00015006289	SMARCA2	99	92.327	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	90.781	ENSOMEG00000009736	-	99	91.165	Oryzias_melastigma
ENSATEG00000006916	SMARCA2	78	86.736	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	80.063	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000006916	SMARCA2	78	86.418	ENSOARG00000013265	SMARCA2	99	80.051	Ovis_aries
ENSATEG00000006916	SMARCA2	89	87.227	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	97	86.731	Pan_paniscus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	80.937	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	99	81.007	Panthera_pardus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	81.205	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	99	81.743	Pan_troglodytes
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	76.236	ENSPANG00000025121	SMARCA2	99	75.748	Papio_anubis
ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	85.352	ENSPKIG00000018469	-	99	84.920	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000006916	SMARCA2	94	80.817	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	99	80.711	Pelodiscus_sinensis
ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	82.956	ENSPMGG00000013696	-	99	83.333	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.129	ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	80.368	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSATEG00000006916	SMARCA2	94	70.450	ENSPMAG00000005337	-	97	70.191	Petromyzon_marinus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	81.477	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	99	81.552	Phascolarctos_cinereus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	91.985	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	92.176	Poecilia_formosa
ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	91.359	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	97	91.609	Poecilia_latipinna
ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	91.291	ENSPMEG00000001815	-	99	91.530	Poecilia_mexicana
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	91.093	ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	91.346	Poecilia_reticulata
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.039	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	99	81.134	Pongo_abelii
ENSATEG00000006916	SMARCA2	75	74.296	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	74.296	Procavia_capensis
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	78.764	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	99	79.414	Propithecus_coquereli
ENSATEG00000006916	SMARCA2	89	82.311	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	93	82.084	Pteropus_vampyrus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	89.457	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	99	89.618	Pundamilia_nyererei
ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	87.152	ENSPNAG00000014635	smarca2	98	87.152	Pygocentrus_nattereri
ENSATEG00000006916	SMARCA2	81	84.897	ENSRNOG00000011931	Smarca2	99	79.725	Rattus_norvegicus
ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	76.265	ENSRBIG00000038618	SMARCA2	93	87.231	Rhinopithecus_bieti
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