EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000007745 (Gene tree)
Gene ID: 113158006
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5589 bases
Position: chrOOHO01000014.1:35605318-35610906
Accession: 113158006
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000011094	SYF2	PF08231.12	4e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000011278	-	1354	-	ENSATEP00000011094	238 (aa)	XP_026209437	UPI000E463FE8

Gene Model

Click here to download ENSATEG00000007745's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSATEG00000007745's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	ENSG00000117614	SYF2	89	83.410	Homo_sapiens
ENSATEG00000007745	syf2	100	94.118	ENSAPOG00000001174	syf2	100	94.118	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000007745	syf2	82	83.077	ENSAMEG00000010134	-	100	83.077	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000007745	syf2	95	79.825	ENSAMEG00000010115	-	89	82.028	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000007745	syf2	99	92.340	ENSACIG00000023688	syf2	87	95.392	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000007745	syf2	100	93.697	ENSAOCG00000022046	syf2	92	94.470	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000007745	syf2	93	93.213	ENSAOCG00000010912	syf2	69	93.213	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000007745	syf2	100	93.697	ENSAPEG00000018858	syf2	92	93.697	Amphiprion_percula
ENSATEG00000007745	syf2	84	84.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.500	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000007745	syf2	70	70.060	ENSACAG00000026777	-	100	70.060	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000007745	syf2	86	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	ENSANAG00000032473	SYF2	89	83.410	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000007745	syf2	100	93.277	ENSACLG00000019916	syf2	100	93.277	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000007745	syf2	100	84.034	ENSAMXG00000004051	syf2	91	87.558	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000007745	syf2	97	79.828	ENSBTAG00000001651	SYF2	92	83.410	Bos_taurus
ENSATEG00000007745	syf2	87	51.659	WBGene00019402	syf-2	90	50.943	Caenorhabditis_elegans
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	ENSCJAG00000046570	SYF2	89	83.410	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000007745	syf2	91	82.407	ENSCAFG00000012895	-	88	82.028	Canis_familiaris
ENSATEG00000007745	syf2	93	74.775	ENSCAFG00000030331	-	92	77.315	Canis_familiaris
ENSATEG00000007745	syf2	76	74.176	ENSCAFG00020021094	-	95	74.176	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000007745	syf2	91	82.407	ENSCAFG00020021091	-	88	82.028	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000007745	syf2	99	77.917	ENSCHIG00000020874	SYF2	90	82.949	Capra_hircus
ENSATEG00000007745	syf2	99	77.917	ENSTSYG00000005114	SYF2	89	82.407	Carlito_syrichta
ENSATEG00000007745	syf2	83	83.333	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	Cavia_aperea
ENSATEG00000007745	syf2	100	78.571	ENSCPOG00000005326	SYF2	89	83.410	Cavia_porcellus
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	ENSCCAG00000022459	SYF2	89	83.410	Cebus_capucinus
ENSATEG00000007745	syf2	99	78.814	ENSCATG00000026917	SYF2	89	82.488	Cercocebus_atys
ENSATEG00000007745	syf2	98	81.116	ENSCLAG00000008474	SYF2	89	83.871	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000007745	syf2	99	78.814	ENSCSAG00000000948	SYF2	89	82.488	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000007745	syf2	72	64.368	ENSCHOG00000005273	-	88	65.432	Choloepus_hoffmanni
ENSATEG00000007745	syf2	94	83.556	ENSCPBG00000025073	SYF2	88	84.793	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000007745	syf2	89	55.869	ENSCING00000003017	-	89	56.338	Ciona_intestinalis
ENSATEG00000007745	syf2	89	52.113	ENSCSAVG00000006627	-	97	52.113	Ciona_savignyi
ENSATEG00000007745	syf2	99	69.492	ENSCANG00000037322	SYF2	88	72.350	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000007745	syf2	99	79.079	ENSCGRG00001020733	Syf2	90	83.410	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000007745	syf2	82	84.184	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.920	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000007745	syf2	92	89.498	ENSCSEG00000000117	syf2	91	89.401	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000007745	syf2	100	90.377	ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.121	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000007745	syf2	100	87.395	ENSDARG00000004706	syf2	100	87.395	Danio_rerio
ENSATEG00000007745	syf2	99	78.099	ENSDNOG00000047605	SYF2	89	82.949	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000007745	syf2	100	78.689	ENSDORG00000001274	Syf2	89	83.410	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000007745	syf2	94	54.825	FBgn0033556	CG12343	94	56.019	Drosophila_melanogaster
ENSATEG00000007745	syf2	87	68.599	ENSETEG00000015729	SYF2	88	68.966	Echinops_telfairi
ENSATEG00000007745	syf2	83	57.360	ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	Eptatretus_burgeri
ENSATEG00000007745	syf2	99	69.583	ENSEASG00005004232	-	90	73.733	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000007745	syf2	100	77.143	ENSEASG00005004224	-	89	83.410	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000007745	syf2	97	79.828	ENSECAG00000010440	-	91	83.410	Equus_caballus
ENSATEG00000007745	syf2	96	80.952	ENSECAG00000012023	-	89	83.410	Equus_caballus
ENSATEG00000007745	syf2	71	70.175	ENSEEUG00000015084	SYF2	85	72.436	Erinaceus_europaeus
ENSATEG00000007745	syf2	100	86.134	ENSELUG00000003465	syf2	91	90.783	Esox_lucius
ENSATEG00000007745	syf2	99	78.838	ENSFCAG00000010324	-	75	83.410	Felis_catus
ENSATEG00000007745	syf2	95	80.702	ENSFCAG00000043095	-	88	82.949	Felis_catus
ENSATEG00000007745	syf2	86	80.882	ENSFALG00000000460	SYF2	88	80.556	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000007745	syf2	92	83.028	ENSFDAG00000008310	SYF2	89	82.949	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000007745	syf2	95	77.434	ENSFHEG00000007238	syf2	96	77.523	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000007745	syf2	90	89.767	ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.767	Gadus_morhua
ENSATEG00000007745	syf2	93	82.883	ENSGALG00000013639	SYF2	86	83.871	Gallus_gallus
ENSATEG00000007745	syf2	100	89.496	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.496	Gambusia_affinis
ENSATEG00000007745	syf2	93	91.892	ENSGACG00000007305	syf2	91	93.088	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000007745	syf2	94	84.000	ENSGAGG00000010670	SYF2	88	85.253	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	ENSGGOG00000012796	SYF2	89	83.410	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000007745	syf2	100	92.857	ENSHBUG00000020477	syf2	100	92.857	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000007745	syf2	93	72.523	ENSHGLG00000004304	-	90	74.074	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000007745	syf2	93	82.432	ENSHGLG00000014393	SYF2	89	83.410	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000007745	syf2	93	82.432	ENSHGLG00100014722	SYF2	89	83.410	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000007745	syf2	100	90.336	ENSHCOG00000012904	syf2	78	90.336	Hippocampus_comes
ENSATEG00000007745	syf2	100	85.774	ENSIPUG00000019859	syf2	91	88.940	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000007745	syf2	61	78.082	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000007745	syf2	84	83.920	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000007745	syf2	100	92.857	ENSKMAG00000013856	syf2	100	90.756	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000007745	syf2	100	94.538	ENSLBEG00000014425	syf2	100	94.538	Labrus_bergylta
ENSATEG00000007745	syf2	97	77.922	ENSLACG00000012064	SYF2	91	82.407	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000007745	syf2	100	85.294	ENSLOCG00000002728	syf2	95	85.294	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000007745	syf2	100	77.959	ENSLAFG00000023150	-	89	83.410	Loxodonta_africana
ENSATEG00000007745	syf2	77	55.435	ENSLAFG00000030814	-	100	55.435	Loxodonta_africana
ENSATEG00000007745	syf2	99	78.814	ENSMFAG00000041831	SYF2	89	82.488	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000007745	syf2	91	82.870	ENSMMUG00000002968	SYF2	89	82.488	Macaca_mulatta
ENSATEG00000007745	syf2	99	78.814	ENSMNEG00000030180	SYF2	89	82.488	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000007745	syf2	99	78.814	ENSMLEG00000030248	SYF2	89	82.488	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000007745	syf2	100	93.277	ENSMAMG00000010403	syf2	98	93.277	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000007745	syf2	100	92.857	ENSMZEG00005006429	syf2	100	92.857	Maylandia_zebra
ENSATEG00000007745	syf2	84	84.422	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.422	Meleagris_gallopavo
ENSATEG00000007745	syf2	100	79.339	ENSMAUG00000018974	Syf2	90	84.793	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000007745	syf2	84	83.920	ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	Microcebus_murinus
ENSATEG00000007745	syf2	100	78.926	ENSMOCG00000022938	Syf2	90	84.332	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000007745	syf2	95	90.308	ENSMMOG00000002396	syf2	91	91.705	Mola_mola
ENSATEG00000007745	syf2	93	78.571	ENSMODG00000013951	-	96	79.452	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000007745	syf2	100	90.871	ENSMALG00000010706	syf2	90	93.119	Monopterus_albus
ENSATEG00000007745	syf2	100	79.339	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	90	84.793	Mus_caroli
ENSATEG00000007745	syf2	100	79.339	ENSMUSG00000028821	Syf2	90	84.793	Mus_musculus
ENSATEG00000007745	syf2	100	79.339	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	90	84.793	Mus_pahari
ENSATEG00000007745	syf2	100	79.339	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	90	84.793	Mus_spretus
ENSATEG00000007745	syf2	92	82.569	ENSMPUG00000015801	-	88	82.488	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000007745	syf2	91	82.407	ENSMPUG00000015802	-	88	82.028	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000007745	syf2	97	78.205	ENSMLUG00000001885	SYF2	89	82.488	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000007745	syf2	100	76.423	ENSNGAG00000007912	Syf2	88	82.949	Nannospalax_galili
ENSATEG00000007745	syf2	100	82.231	ENSNBRG00000010720	syf2	99	82.231	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	ENSNLEG00000035185	SYF2	89	83.410	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000007745	syf2	100	76.955	ENSOPRG00000012870	SYF2	89	82.028	Ochotona_princeps
ENSATEG00000007745	syf2	97	79.221	ENSODEG00000017664	-	91	82.028	Octodon_degus
ENSATEG00000007745	syf2	99	69.787	ENSODEG00000014338	-	90	72.811	Octodon_degus
ENSATEG00000007745	syf2	100	93.277	ENSONIG00000008213	syf2	100	93.277	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000007745	syf2	85	83.663	ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	Ornithorhynchus_anatinus
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	ENSOCUG00000013050	SYF2	89	83.410	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000007745	syf2	98	88.412	ENSORLG00000028820	syf2	93	92.627	Oryzias_latipes
ENSATEG00000007745	syf2	100	87.395	ENSORLG00020018333	syf2	92	92.627	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000007745	syf2	100	87.815	ENSORLG00015014665	syf2	91	92.627	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000007745	syf2	100	89.076	ENSOMEG00000013911	syf2	100	89.076	Oryzias_melastigma
ENSATEG00000007745	syf2	99	80.000	ENSOGAG00000009962	SYF2	89	83.871	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000007745	syf2	82	56.923	ENSOARG00000006269	-	100	56.923	Ovis_aries
ENSATEG00000007745	syf2	96	79.399	ENSOARG00000006348	-	89	82.192	Ovis_aries
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	ENSPPAG00000036579	SYF2	89	83.410	Pan_paniscus
ENSATEG00000007745	syf2	95	80.702	ENSPPRG00000001651	-	88	82.949	Panthera_pardus
ENSATEG00000007745	syf2	99	79.079	ENSPPRG00000001638	-	88	83.410	Panthera_pardus
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	ENSPTIG00000005711	-	79	83.410	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000007745	syf2	95	80.702	ENSPTIG00000007036	-	88	82.949	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	ENSPTRG00000000352	SYF2	89	83.410	Pan_troglodytes
ENSATEG00000007745	syf2	99	78.814	ENSPANG00000008139	SYF2	89	82.488	Papio_anubis
ENSATEG00000007745	syf2	100	84.874	ENSPKIG00000008130	syf2	92	89.862	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000007745	syf2	97	80.000	ENSPSIG00000011816	SYF2	84	83.871	Pelodiscus_sinensis
ENSATEG00000007745	syf2	97	89.177	ENSPMGG00000008755	syf2	85	92.627	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSATEG00000007745	syf2	100	78.512	ENSPEMG00000008283	Syf2	90	83.871	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSATEG00000007745	syf2	93	82.883	ENSPCIG00000014235	SYF2	87	83.871	Phascolarctos_cinereus
ENSATEG00000007745	syf2	100	88.285	ENSPFOG00000004116	syf2	90	91.705	Poecilia_formosa
ENSATEG00000007745	syf2	98	89.700	ENSPLAG00000006691	syf2	93	91.244	Poecilia_latipinna
ENSATEG00000007745	syf2	100	87.395	ENSPMEG00000011684	syf2	100	87.395	Poecilia_mexicana
ENSATEG00000007745	syf2	100	89.496	ENSPREG00000003009	syf2	100	89.496	Poecilia_reticulata
ENSATEG00000007745	syf2	92	83.486	ENSPPYG00000001713	SYF2	89	83.410	Pongo_abelii
ENSATEG00000007745	syf2	100	53.909	ENSPCOG00000027011	SYF2	85	56.682	Propithecus_coquereli
ENSATEG00000007745	syf2	99	70.339	ENSPVAG00000005841	SYF2	89	73.733	Pteropus_vampyrus
ENSATEG00000007745	syf2	100	92.857	ENSPNYG00000004979	syf2	100	92.857	Pundamilia_nyererei
ENSATEG00000007745	syf2	100	85.714	ENSPNAG00000015570	syf2	91	89.401	Pygocentrus_nattereri
ENSATEG00000007745	syf2	100	79.339	ENSRNOG00000060597	Syf2	90	84.793	Rattus_norvegicus
ENSATEG00000007745	syf2	99	76.695	ENSRBIG00000042970	SYF2	89	80.184	Rhinopithecus_bieti
ENSATEG00000007745	syf2	99	78.814	ENSRROG00000001347	SYF2	89	82.488	Rhinopithecus_roxellana
ENSATEG00000007745	syf2	91	83.333	ENSSBOG00000020184	SYF2	89	82.949	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSATEG00000007745	syf2	86	83.495	ENSSHAG00000007152	-	100	83.495	Sarcophilus_harrisii
ENSATEG00000007745	syf2	93	81.982	ENSSHAG00000015630	-	87	82.949	Sarcophilus_harrisii
ENSATEG00000007745	syf2	93	89.593	ENSSFOG00015023647	syf2	92	89.401	Scleropages_formosus
ENSATEG00000007745	syf2	100	89.496	ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.496	Scophthalmus_maximus
ENSATEG00000007745	syf2	100	92.017	ENSSDUG00000013072	syf2	91	93.548	Seriola_dumerili
ENSATEG00000007745	syf2	100	92.017	ENSSLDG00000012677	syf2	91	93.548	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSATEG00000007745	syf2	99	60.581	ENSSARG00000012889	SYF2	89	63.594	Sorex_araneus
ENSATEG00000007745	syf2	99	79.752	ENSSPUG00000005251	SYF2	86	84.793	Sphenodon_punctatus
ENSATEG00000007745	syf2	100	92.017	ENSSPAG00000009626	syf2	100	92.017	Stegastes_partitus
ENSATEG00000007745	syf2	96	80.087	ENSSSCG00000037481	SYF2	89	82.949	Sus_scrofa
ENSATEG00000007745	syf2	63	52.318	ENSTGUG00000001126	SYF2	78	55.063	Taeniopygia_guttata
ENSATEG00000007745	syf2	100	85.833	ENSTRUG00000001499	syf2	87	89.401	Takifugu_rubripes
ENSATEG00000007745	syf2	93	89.189	ENSTNIG00000016912	syf2	97	89.401	Tetraodon_nigroviridis
ENSATEG00000007745	syf2	100	57.613	ENSTBEG00000017370	SYF2	87	60.829	Tupaia_belangeri
ENSATEG00000007745	syf2	91	82.870	ENSTTRG00000003550	SYF2	89	82.488	Tursiops_truncatus
ENSATEG00000007745	syf2	95	79.825	ENSUAMG00000002897	SYF2	88	82.028	Ursus_americanus
ENSATEG00000007745	syf2	91	81.944	ENSUMAG00000013108	SYF2	88	81.567	Ursus_maritimus
ENSATEG00000007745	syf2	98	79.060	ENSVPAG00000005705	SYF2	89	82.488	Vicugna_pacos
ENSATEG00000007745	syf2	86	81.951	ENSVVUG00000027181	-	88	81.567	Vulpes_vulpes
ENSATEG00000007745	syf2	91	82.407	ENSVVUG00000027175	-	88	82.028	Vulpes_vulpes
ENSATEG00000007745	syf2	99	76.371	ENSXETG00000022797	syf2	87	80.184	Xenopus_tropicalis
ENSATEG00000007745	syf2	100	89.076	ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.076	Xiphophorus_maculatus