EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000010003 (Gene tree)
Gene ID: 113151391
Gene Symbol: ptrh1
Alias: zgc:112961
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6437 bases
Position: chrOOHO01000012.1:23509150-23515586
Accession: 113151391
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000014324	Pept_tRNA_hydro	PF01195.19	1.8e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000014553	-	4429	XM_026344365	ENSATEP00000014324	279 (aa)	XP_026200150	UPI000E461FF9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.704	ENSG00000187024	PTRH1	97	47.826	Homo_sapiens
ENSATEG00000010003	ptrh1	98	79.927	ENSAPOG00000003014	-	95	79.927	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000010003	ptrh1	98	79.927	ENSAPOG00000010719	ptrh1	95	79.927	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000010003	ptrh1	98	79.927	ENSAPOG00000000947	PTRH1	95	79.927	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	53.005	ENSAMEG00000016791	PTRH1	87	53.005	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000010003	ptrh1	77	83.256	ENSACIG00000006734	ptrh1	91	83.256	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000010003	ptrh1	93	80.769	ENSAOCG00000009725	ptrh1	95	78.832	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000010003	ptrh1	93	80.769	ENSAPEG00000020993	ptrh1	95	78.832	Amphiprion_percula
ENSATEG00000010003	ptrh1	73	53.659	ENSANAG00000025547	PTRH1	90	53.659	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000010003	ptrh1	99	78.986	ENSACLG00000025462	ptrh1	99	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000010003	ptrh1	91	62.016	ENSAMXG00000034117	ptrh1	94	62.016	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000010003	ptrh1	56	52.903	ENSBTAG00000012736	PTRH1	51	52.903	Bos_taurus
ENSATEG00000010003	ptrh1	73	53.202	ENSCJAG00000019841	PTRH1	73	52.083	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	54.348	ENSCAFG00000020123	PTRH1	86	54.348	Canis_familiaris
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	54.645	ENSCAFG00020015776	PTRH1	82	54.645	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	56.831	ENSCHIG00000008188	PTRH1	86	56.831	Capra_hircus
ENSATEG00000010003	ptrh1	65	57.065	ENSCPOG00000023968	PTRH1	86	57.065	Cavia_porcellus
ENSATEG00000010003	ptrh1	73	52.683	ENSCCAG00000023134	PTRH1	90	52.683	Cebus_capucinus
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.704	ENSCATG00000042852	PTRH1	94	50.704	Cercocebus_atys
ENSATEG00000010003	ptrh1	74	53.810	ENSCLAG00000011155	PTRH1	93	53.810	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.704	ENSCSAG00000013748	PTRH1	88	50.704	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000010003	ptrh1	62	53.179	ENSCPBG00000025207	PTRH1	98	53.179	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.704	ENSCANG00000039856	PTRH1	94	50.704	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000010003	ptrh1	67	55.851	ENSCGRG00001013108	Ptrh1	92	55.851	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000010003	ptrh1	63	57.062	ENSCGRG00000016553	Ptrh1	97	57.062	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000010003	ptrh1	90	71.146	ENSCSEG00000010332	ptrh1	91	71.146	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000010003	ptrh1	97	72.426	ENSCVAG00000010701	ptrh1	98	75.368	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000010003	ptrh1	94	59.091	ENSDARG00000098206	ptrh1	92	67.123	Danio_rerio
ENSATEG00000010003	ptrh1	63	59.091	ENSDNOG00000024194	PTRH1	82	59.091	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000010003	ptrh1	73	53.431	ENSDORG00000013321	Ptrh1	89	53.431	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	56.284	ENSEASG00005020466	PTRH1	86	56.284	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	55.738	ENSECAG00000007615	PTRH1	67	55.738	Equus_caballus
ENSATEG00000010003	ptrh1	98	66.667	ENSELUG00000015467	ptrh1	99	66.667	Esox_lucius
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	54.891	ENSFCAG00000001483	PTRH1	86	55.191	Felis_catus
ENSATEG00000010003	ptrh1	67	51.872	ENSFALG00000001352	PTRH1	86	51.872	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000010003	ptrh1	70	56.186	ENSFDAG00000020077	PTRH1	93	56.186	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000010003	ptrh1	87	80.328	ENSFHEG00000010590	ptrh1	98	78.846	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000010003	ptrh1	51	66.197	ENSGMOG00000009801	PTRH1	100	66.197	Gadus_morhua
ENSATEG00000010003	ptrh1	90	80.159	ENSGAFG00000016215	ptrh1	94	80.159	Gambusia_affinis
ENSATEG00000010003	ptrh1	72	84.000	ENSGACG00000014682	ptrh1	97	82.258	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000010003	ptrh1	73	54.680	ENSGAGG00000022860	PTRH1	89	54.680	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.235	ENSGGOG00000011033	PTRH1	94	50.235	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000010003	ptrh1	99	78.261	ENSHBUG00000020824	ptrh1	99	78.261	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000010003	ptrh1	70	55.385	ENSHGLG00000019147	PTRH1	93	55.385	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000010003	ptrh1	70	51.795	ENSHGLG00100003681	PTRH1	96	51.795	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000010003	ptrh1	85	64.979	ENSHCOG00000014772	ptrh1	95	63.710	Hippocampus_comes
ENSATEG00000010003	ptrh1	92	62.308	ENSIPUG00000015364	ptrh1	93	65.289	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000010003	ptrh1	59	58.434	ENSSTOG00000008942	PTRH1	89	53.886	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000010003	ptrh1	65	57.459	ENSJJAG00000014338	Ptrh1	88	57.459	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000010003	ptrh1	98	76.727	ENSKMAG00000003253	ptrh1	98	76.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000010003	ptrh1	68	58.947	ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.947	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	52.717	ENSLAFG00000021934	PTRH1	90	52.717	Loxodonta_africana
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.704	ENSMFAG00000001700	PTRH1	94	50.704	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.704	ENSMMUG00000016424	PTRH1	94	50.704	Macaca_mulatta
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.704	ENSMNEG00000033061	PTRH1	88	50.704	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000010003	ptrh1	99	77.174	ENSMAMG00000017386	ptrh1	99	80.072	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000010003	ptrh1	90	79.200	ENSMZEG00005020001	ptrh1	99	79.200	Maylandia_zebra
ENSATEG00000010003	ptrh1	67	56.383	ENSMAUG00000006266	Ptrh1	92	56.383	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000010003	ptrh1	70	54.082	ENSMICG00000005611	PTRH1	90	54.082	Microcebus_murinus
ENSATEG00000010003	ptrh1	65	57.692	ENSMOCG00000013992	Ptrh1	89	57.692	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000010003	ptrh1	99	80.072	ENSMMOG00000014747	ptrh1	97	80.072	Mola_mola
ENSATEG00000010003	ptrh1	71	54.822	ENSMODG00000005503	PTRH1	90	54.822	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000010003	ptrh1	60	76.647	ENSMALG00000005392	ptrh1	96	76.647	Monopterus_albus
ENSATEG00000010003	ptrh1	65	57.692	MGP_CAROLIEiJ_G0023450	Ptrh1	89	57.692	Mus_caroli
ENSATEG00000010003	ptrh1	65	57.692	ENSMUSG00000053746	Ptrh1	89	57.692	Mus_musculus
ENSATEG00000010003	ptrh1	65	57.692	MGP_PahariEiJ_G0024907	Ptrh1	89	57.692	Mus_pahari
ENSATEG00000010003	ptrh1	65	57.143	MGP_SPRETEiJ_G0024367	Ptrh1	89	57.143	Mus_spretus
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	53.514	ENSMPUG00000013790	PTRH1	86	53.514	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000010003	ptrh1	69	50.000	ENSMLUG00000013454	PTRH1	92	50.000	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	57.377	ENSNGAG00000014008	Ptrh1	90	57.377	Nannospalax_galili
ENSATEG00000010003	ptrh1	99	78.623	ENSNBRG00000015590	ptrh1	99	78.623	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.235	ENSNLEG00000017468	PTRH1	94	50.235	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000010003	ptrh1	65	57.459	ENSODEG00000004012	PTRH1	86	57.459	Octodon_degus
ENSATEG00000010003	ptrh1	92	81.395	ENSONIG00000013912	ptrh1	99	81.395	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000010003	ptrh1	68	55.789	ENSOANG00000011891	PTRH1	84	55.789	Ornithorhynchus_anatinus
ENSATEG00000010003	ptrh1	77	50.233	ENSOCUG00000006894	PTRH1	88	50.233	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	56.284	ENSOGAG00000008094	PTRH1	88	56.284	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000010003	ptrh1	66	52.577	ENSOARG00000011808	PTRH1	87	52.577	Ovis_aries
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.704	ENSPPAG00000041782	PTRH1	94	50.704	Pan_paniscus
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ENSATEG00000010003	ptrh1	76	50.704	ENSPTRG00000021394	PTRH1	94	50.704	Pan_troglodytes
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	43.519	ENSPANG00000031755	PTRH1	94	43.519	Papio_anubis
ENSATEG00000010003	ptrh1	90	59.921	ENSPKIG00000005449	ptrh1	82	59.921	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000010003	ptrh1	79	48.696	ENSPSIG00000013828	PTRH1	82	48.696	Pelodiscus_sinensis
ENSATEG00000010003	ptrh1	81	63.158	ENSPMGG00000002148	ptrh1	96	55.755	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSATEG00000010003	ptrh1	60	60.119	ENSPEMG00000014360	Ptrh1	92	57.447	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSATEG00000010003	ptrh1	94	79.468	ENSPFOG00000003715	ptrh1	98	79.468	Poecilia_formosa
ENSATEG00000010003	ptrh1	94	74.809	ENSPLAG00000023354	ptrh1	98	74.809	Poecilia_latipinna
ENSATEG00000010003	ptrh1	94	79.468	ENSPMEG00000000447	ptrh1	98	79.468	Poecilia_mexicana
ENSATEG00000010003	ptrh1	94	77.567	ENSPREG00000012612	ptrh1	98	77.567	Poecilia_reticulata
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ENSATEG00000010003	ptrh1	67	55.319	ENSPCAG00000007016	PTRH1	87	55.319	Procavia_capensis
ENSATEG00000010003	ptrh1	70	54.082	ENSPCOG00000014541	PTRH1	90	54.082	Propithecus_coquereli
ENSATEG00000010003	ptrh1	73	54.146	ENSPVAG00000000954	PTRH1	90	54.146	Pteropus_vampyrus
ENSATEG00000010003	ptrh1	99	77.536	ENSPNYG00000007789	ptrh1	99	77.536	Pundamilia_nyererei
ENSATEG00000010003	ptrh1	92	63.424	ENSPNAG00000029930	ptrh1	93	63.424	Pygocentrus_nattereri
ENSATEG00000010003	ptrh1	65	58.791	ENSRNOG00000049034	Ptrh1	89	58.791	Rattus_norvegicus
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	51.174	ENSRBIG00000027290	PTRH1	94	51.174	Rhinopithecus_bieti
ENSATEG00000010003	ptrh1	76	51.415	ENSRROG00000028799	PTRH1	88	51.174	Rhinopithecus_roxellana
ENSATEG00000010003	ptrh1	64	33.333	YHR189W	PTH1	97	33.333	Saccharomyces_cerevisiae
ENSATEG00000010003	ptrh1	73	52.195	ENSSBOG00000026699	PTRH1	85	52.195	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSATEG00000010003	ptrh1	64	56.831	ENSSHAG00000018238	PTRH1	89	56.831	Sarcophilus_harrisii
ENSATEG00000010003	ptrh1	73	65.686	ENSSFOG00015007053	ptrh1	84	71.176	Scleropages_formosus
ENSATEG00000010003	ptrh1	72	81.773	ENSSMAG00000016747	ptrh1	86	81.773	Scophthalmus_maximus
ENSATEG00000010003	ptrh1	90	79.200	ENSSDUG00000013471	ptrh1	100	82.869	Seriola_dumerili
ENSATEG00000010003	ptrh1	77	77.209	ENSSLDG00000024662	ptrh1	93	81.481	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSATEG00000010003	ptrh1	69	54.404	ENSSPUG00000000040	PTRH1	85	54.404	Sphenodon_punctatus
ENSATEG00000010003	ptrh1	84	84.188	ENSSPAG00000003298	ptrh1	100	81.349	Stegastes_partitus
ENSATEG00000010003	ptrh1	77	52.315	ENSSSCG00000005615	PTRH1	93	52.315	Sus_scrofa
ENSATEG00000010003	ptrh1	94	76.336	ENSTRUG00000019801	PTRH1	99	76.190	Takifugu_rubripes
ENSATEG00000010003	ptrh1	80	79.018	ENSTNIG00000016735	ptrh1	99	79.018	Tetraodon_nigroviridis
ENSATEG00000010003	ptrh1	77	49.302	ENSTTRG00000016458	PTRH1	94	49.302	Tursiops_truncatus
ENSATEG00000010003	ptrh1	70	53.333	ENSUAMG00000023948	-	86	53.333	Ursus_americanus
ENSATEG00000010003	ptrh1	62	44.509	ENSVPAG00000001805	PTRH1	95	44.509	Vicugna_pacos
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