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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000010408 (Gene tree)
Gene ID: 113158683
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 20100 bases
Position: chrOOHO01000014.1:25928200-25948299
Accession: 113158683
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000015065	IBN_N	PF03810.19	4.1e-15	1	1
ENSATEP00000015042	IBN_N	PF03810.19	4.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000015278	-	6339	XM_026354766	ENSATEP00000015042	890 (aa)	XP_026210551	UPI000E4555D6
ENSATET00000015301	-	2655	-	ENSATEP00000015065	884 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSATEG00000010408	tnpo1	99	85.698	ENSATEG00000024761	TNPO2	99	85.698
ENSATEG00000010408	tnpo1	99	86.712	ENSATEG00000019171	-	99	86.712

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	99.101	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	99.101	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	92.539	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.650	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000010408	tnpo1	87	97.804	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.804	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	98.989	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	98.989	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	98.989	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.989	Amphiprion_percula
ENSATEG00000010408	tnpo1	99	89.515	ENSAPLG00000009619	-	97	90.482	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.933	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.933	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	83.483	ENSANAG00000025351	-	99	83.483	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.034	ENSANAG00000022453	-	99	93.034	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	58.315	ENSANAG00000027118	-	99	60.754	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	96.404	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.404	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.731	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.507	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.596	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.596	Bos_taurus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.146	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.146	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000010408	tnpo1	96	93.582	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.582	Canis_familiaris
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	91.124	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.124	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.483	Capra_hircus
ENSATEG00000010408	tnpo1	99	90.056	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.398	Carlito_syrichta
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.034	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.034	Cebus_capucinus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.483	Cercocebus_atys
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.034	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.034	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.483	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000010408	tnpo1	94	81.883	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.883	Choloepus_hoffmanni
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.157	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.157	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000010408	tnpo1	99	76.431	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.094	Ciona_savignyi
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.483	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.371	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000010408	tnpo1	96	93.684	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.684	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	96.629	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.629	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.528	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.528	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.949	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.276	Danio_rerio
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	87.794	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.794	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000010408	tnpo1	93	93.855	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.848	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000010408	tnpo1	99	58.512	FBgn0035693	CG8219	99	58.174	Drosophila_melanogaster
ENSATEG00000010408	tnpo1	86	95.131	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.131	Echinops_telfairi
ENSATEG00000010408	tnpo1	94	85.238	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.483	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.483	Equus_caballus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	88.889	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.453	Esox_lucius
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.483	Felis_catus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.045	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.045	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.146	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.146	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.643	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.643	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	92.833	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.833	Gadus_morhua
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.146	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.146	Gallus_gallus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.197	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.197	Gambusia_affinis
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	96.742	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.742	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.045	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.045	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	78.363	ENSGGOG00000022535	-	98	78.363	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.483	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	98.202	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.202	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.034	ENSHGLG00000000970	-	99	93.034	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000010408	tnpo1	96	93.224	ENSHGLG00100017090	-	99	93.224	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000010408	tnpo1	97	73.023	ENSHGLG00100000963	-	99	72.326	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.596	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.596	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.865	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.865	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000010408	tnpo1	91	94.451	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.451	Labrus_bergylta
ENSATEG00000010408	tnpo1	96	87.093	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.093	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.831	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.831	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000010408	tnpo1	97	92.956	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.956	Loxodonta_africana
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.483	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.567	Macaca_mulatta
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.483	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.483	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	99.101	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	99.101	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.753	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	97.753	Maylandia_zebra
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.697	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	89.775	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.775	Microcebus_murinus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.371	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000010408	tnpo1	87	97.294	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.294	Mola_mola
ENSATEG00000010408	tnpo1	99	94.255	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.255	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.865	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.865	Monopterus_albus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.680	Mus_caroli
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.680	Mus_musculus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.804	Mus_pahari
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.146	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.432	Mus_spretus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.483	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000010408	tnpo1	96	93.248	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.248	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.483	Nannospalax_galili
ENSATEG00000010408	tnpo1	87	97.545	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.545	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.483	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000010408	tnpo1	90	88.344	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.320	Ochotona_princeps
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	92.809	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.809	Octodon_degus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.433	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.433	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000010408	tnpo1	92	94.634	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	Ornithorhynchus_anatinus
ENSATEG00000010408	tnpo1	96	87.617	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.617	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000010408	tnpo1	87	96.887	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.887	Oryzias_latipes
ENSATEG00000010408	tnpo1	99	97.069	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.069	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000010408	tnpo1	99	97.407	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.407	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000010408	tnpo1	99	97.182	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.182	Oryzias_melastigma
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.483	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.596	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.596	Ovis_aries
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.483	Pan_paniscus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.483	Panthera_pardus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.483	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000010408	tnpo1	94	82.320	ENSPTRG00000047731	-	100	82.320	Pan_troglodytes
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.483	Pan_troglodytes
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.483	Papio_anubis
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	91.348	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.348	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.933	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.933	Pelodiscus_sinensis
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.501	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.276	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSATEG00000010408	tnpo1	96	93.684	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.684	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.494	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.494	Phascolarctos_cinereus
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.648	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	97.648	Poecilia_formosa
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.648	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	97.648	Poecilia_latipinna
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	98.090	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.090	Poecilia_mexicana
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.646	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.646	Poecilia_reticulata
ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.371	Pongo_abelii
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