EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000017059 (Gene tree)
Gene ID: 113150152
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15165 bases
Position: chrOOHO01000012.1:5723192-5738356
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000024890	RRM_1	PF00076.22	5.1e-29	1	2
ENSATEP00000024890	RRM_1	PF00076.22	5.1e-29	2	2
ENSATEP00000024886	RRM_1	PF00076.22	6e-29	1	2
ENSATEP00000024886	RRM_1	PF00076.22	6e-29	2	2
ENSATEP00000024915	RRM_1	PF00076.22	3.3e-28	1	2
ENSATEP00000024915	RRM_1	PF00076.22	3.3e-28	2	2
ENSATEP00000024926	RRM_1	PF00076.22	4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000025285	MSI1-201	1068	-	ENSATEP00000024886	355 (aa)	-	-
ENSATET00000025318	MSI1-203	1005	-	ENSATEP00000024915	334 (aa)	-	-
ENSATET00000025329	MSI1-204	726	-	ENSATEP00000024926	241 (aa)	-	-
ENSATET00000025291	MSI1-202	1011	-	ENSATEP00000024890	336 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSATEG00000017059	MSI1	95	72.333	ENSATEG00000003301	-	100	76.868
ENSATEG00000017059	MSI1	100	70.326	ENSATEG00000010498	msi2a	100	70.326
ENSATEG00000017059	MSI1	53	46.753	ENSATEG00000006705	hnrnpaba	74	44.000
ENSATEG00000017059	MSI1	70	30.000	ENSATEG00000016366	rbm38	76	30.769
ENSATEG00000017059	MSI1	56	37.234	ENSATEG00000022918	hnrnpa1a	86	38.037
ENSATEG00000017059	MSI1	100	82.222	ENSATEG00000023779	-	100	82.222
ENSATEG00000017059	MSI1	50	39.645	ENSATEG00000015304	hnrnpa3	94	33.684
ENSATEG00000017059	MSI1	50	33.735	ENSATEG00000024840	tardbp	55	34.416

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSG00000135097	MSI1	99	87.500	Homo_sapiens
ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.930	ENSAPOG00000023458	-	100	94.930	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	87.955	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	87.955	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	67.454	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	70.994	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000017059	MSI1	93	88.341	ENSACIG00000017754	-	78	90.203	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	87.955	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	87.955	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000017059	MSI1	95	88.644	ENSAOCG00000009031	-	95	92.977	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000017059	MSI1	100	87.955	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	87.955	Amphiprion_percula
ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.930	ENSAPEG00000006857	-	84	94.930	Amphiprion_percula
ENSATEG00000017059	MSI1	95	86.280	ENSACAG00000002762	MSI1	99	86.280	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000017059	MSI1	76	85.827	ENSANAG00000027901	-	88	85.827	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSANAG00000027151	MSI1	100	80.435	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000017059	MSI1	100	88.515	ENSACLG00000011230	MSI1	100	88.515	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.930	ENSACLG00000000117	-	100	99.684	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000017059	MSI1	95	94.304	ENSAMXG00000038960	msi1	76	94.322	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	86.452	Bos_taurus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	80.435	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.163	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	80.163	Canis_familiaris
ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.852	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	85.852	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000017059	MSI1	100	78.284	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	82.388	Capra_hircus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.015	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.015	Carlito_syrichta
ENSATEG00000017059	MSI1	90	82.969	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	84.982	Cavia_aperea
ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.848	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	85.106	Cavia_porcellus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	80.435	Cebus_capucinus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSCATG00000030019	MSI1	100	80.435	Cercocebus_atys
ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.848	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	85.106	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000017059	MSI1	74	83.200	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	79.152	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	83.754	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	83.754	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.061	ENSCANG00000040651	MSI1	100	85.061	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	80.435	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.106	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.106	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000017059	MSI1	95	88.644	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	94.613	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000017059	MSI1	100	93.239	ENSCSEG00000008352	-	100	93.239	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000017059	MSI1	100	87.115	ENSCSEG00000005834	-	100	87.115	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.085	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	94.085	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000017059	MSI1	54	56.429	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	56.429	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000017059	MSI1	89	74.884	ENSCVAG00000017463	-	89	74.312	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000017059	MSI1	93	91.518	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	97	91.416	Danio_rerio
ENSATEG00000017059	MSI1	95	89.524	ENSDARG00000010710	msi1	100	95.327	Danio_rerio
ENSATEG00000017059	MSI1	95	82.595	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	82.595	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.106	ENSDORG00000005610	Msi1	93	85.106	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000017059	MSI1	95	81.707	ENSETEG00000004756	MSI1	100	81.707	Echinops_telfairi
ENSATEG00000017059	MSI1	100	81.375	ENSEASG00005004736	MSI1	100	81.375	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSECAG00000017526	MSI1	100	80.435	Equus_caballus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	86.435	ENSELUG00000023280	-	100	86.774	Esox_lucius
ENSATEG00000017059	MSI1	95	90.208	ENSELUG00000023219	MSI1	92	90.476	Esox_lucius
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	80.435	Felis_catus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	89.667	ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.667	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.756	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.756	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.648	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	94.648	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	87.955	ENSFHEG00000003560	-	100	87.955	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	79.224	ENSGMOG00000017838	-	100	79.224	Gadus_morhua
ENSATEG00000017059	MSI1	100	91.268	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.986	Gadus_morhua
ENSATEG00000017059	MSI1	95	89.313	ENSGALG00000007227	MSI1	98	73.280	Gallus_gallus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	91.483	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	91.772	Gambusia_affinis
ENSATEG00000017059	MSI1	100	78.338	ENSGAFG00000005860	-	100	78.338	Gambusia_affinis
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.381	ENSGACG00000008674	-	100	80.381	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	93.803	ENSGACG00000012679	MSI1	100	93.803	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	84.911	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	84.911	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.669	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	85.669	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.930	ENSHBUG00000011841	-	100	94.930	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000017059	MSI1	100	88.515	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	88.515	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.163	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	80.163	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.756	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.756	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000017059	MSI1	91	90.132	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	90.572	Hippocampus_comes
ENSATEG00000017059	MSI1	100	92.676	ENSHCOG00000012067	-	100	92.676	Hippocampus_comes
ENSATEG00000017059	MSI1	95	94.006	ENSIPUG00000001976	msi1	99	93.939	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.852	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.852	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	80.435	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	70.774	ENSJJAG00000010643	-	100	70.774	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	86.120	ENSKMAG00000019877	-	100	91.919	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	93.803	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	93.803	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.930	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	94.930	Labrus_bergylta
ENSATEG00000017059	MSI1	100	87.955	ENSLBEG00000001375	-	100	87.955	Labrus_bergylta
ENSATEG00000017059	MSI1	95	83.939	ENSLACG00000018287	MSI1	100	84.195	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000017059	MSI1	56	66.379	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	66.379	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	75.831	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	76.721	Loxodonta_africana
ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.848	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	85.106	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.848	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	85.106	Macaca_mulatta
ENSATEG00000017059	MSI1	100	81.375	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	81.375	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.061	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	85.061	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.085	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	94.085	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	87.395	ENSMAMG00000018426	-	100	87.395	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	88.515	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	88.515	Maylandia_zebra
ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.930	ENSMZEG00005000340	-	100	94.930	Maylandia_zebra
ENSATEG00000017059	MSI1	62	94.083	ENSMGAG00000016518	-	100	94.083	Meleagris_gallopavo
ENSATEG00000017059	MSI1	69	88.312	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.696	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSMICG00000033181	MSI1	100	80.435	Microcebus_murinus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.163	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	80.163	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.489	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	91.246	Mola_mola
ENSATEG00000017059	MSI1	100	85.928	ENSMMOG00000012265	-	100	85.928	Mola_mola
ENSATEG00000017059	MSI1	95	58.133	ENSMODG00000003189	-	100	58.133	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000017059	MSI1	100	95.211	ENSMALG00000017889	MSI1	100	95.211	Monopterus_albus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	91.798	ENSMALG00000001426	-	100	92.089	Monopterus_albus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	79.891	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	88.973	Mus_caroli
ENSATEG00000017059	MSI1	95	87.147	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	88.973	Mus_musculus
ENSATEG00000017059	MSI1	100	82.073	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	88.593	Mus_pahari
ENSATEG00000017059	MSI1	100	79.891	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	88.973	Mus_spretus
ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.852	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	85.852	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000017059	MSI1	95	76.488	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	76.488	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000017059	MSI1	99	82.969	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.106	Nannospalax_galili
ENSATEG00000017059	MSI1	95	89.700	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	85.246	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000017059	MSI1	100	94.930	ENSNBRG00000000841	-	100	94.930	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000017059	MSI1	94	75.610	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	Nomascus_leucogenys
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ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	ENSPPYG00000005027	MSI1	100	80.435	Pongo_abelii
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ENSATEG00000017059	MSI1	100	89.014	ENSPNAG00000019337	msi1	100	89.014	Pygocentrus_nattereri
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ENSATEG00000017059	MSI1	91	82.488	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	78.788	Xiphophorus_couchianus
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