EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000017696 (Gene tree)
Gene ID: 113171704
Gene Symbol: rab11bb
Alias: zgc:92772
Full Name: ras-related protein Rab-11B
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5493 bases
Position: chrOOHO01000003.1:17173450-17178942
Accession: 113171704
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000025490	MMR_HSR1	PF01926.23	3.4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000025908	-	1641	XM_026374291	ENSATEP00000025490	218 (aa)	XP_026230076	UPI0000364045

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSATEG00000017696	rab11bb	77	52.695	ENSATEG00000018600	rab14	78	52.695
ENSATEG00000017696	rab11bb	74	45.679	ENSATEG00000021911	rab18a	79	45.679
ENSATEG00000017696	rab11bb	74	40.120	ENSATEG00000018261	RAB9A	77	40.120
ENSATEG00000017696	rab11bb	77	36.310	ENSATEG00000001111	rabl2	73	36.310
ENSATEG00000017696	rab11bb	75	47.853	ENSATEG00000001937	rab5c	90	42.718
ENSATEG00000017696	rab11bb	75	45.732	ENSATEG00000002952	rab18b	80	45.732
ENSATEG00000017696	rab11bb	96	44.019	ENSATEG00000013281	rab35b	99	44.019
ENSATEG00000017696	rab11bb	78	40.462	ENSATEG00000007761	zgc:101559	74	40.462
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	95.413	ENSATEG00000023730	rab11ba	100	95.413
ENSATEG00000017696	rab11bb	78	47.093	ENSATEG00000012781	-	77	47.093
ENSATEG00000017696	rab11bb	74	33.533	ENSATEG00000004893	si:cabz01085950.1	82	33.533
ENSATEG00000017696	rab11bb	96	46.411	ENSATEG00000015844	-	99	46.411
ENSATEG00000017696	rab11bb	93	32.407	ENSATEG00000003390	rab36	79	32.407
ENSATEG00000017696	rab11bb	72	40.491	ENSATEG00000017237	RAB7A	78	40.491
ENSATEG00000017696	rab11bb	90	50.000	ENSATEG00000002553	rab2a	97	50.000
ENSATEG00000017696	rab11bb	96	40.476	ENSATEG00000010475	rab30	97	40.476
ENSATEG00000017696	rab11bb	77	36.257	ENSATEG00000010784	si:dkey-34d22.5	66	36.257
ENSATEG00000017696	rab11bb	94	41.546	ENSATEG00000009865	RAB39B	96	41.546
ENSATEG00000017696	rab11bb	74	32.948	ENSATEG00000014272	rasl11a	67	32.948
ENSATEG00000017696	rab11bb	71	34.810	ENSATEG00000014958	si:dkey-13a21.4	77	34.810
ENSATEG00000017696	rab11bb	70	36.538	ENSATEG00000023047	rab34a	60	36.538
ENSATEG00000017696	rab11bb	99	63.470	ENSATEG00000014851	rab25a	99	63.470
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	63.761	ENSATEG00000006124	rab25b	100	63.761
ENSATEG00000017696	rab11bb	75	42.424	ENSATEG00000019683	rab12	68	42.424
ENSATEG00000017696	rab11bb	72	37.580	ENSATEG00000015992	rab41	74	37.580
ENSATEG00000017696	rab11bb	96	45.933	ENSATEG00000002479	rab1ba	99	45.933
ENSATEG00000017696	rab11bb	74	34.756	ENSATEG00000012108	si:ch73-116o1.2	82	36.364
ENSATEG00000017696	rab11bb	77	52.096	ENSATEG00000012604	-	78	52.096
ENSATEG00000017696	rab11bb	70	34.839	ENSATEG00000021300	kras	87	35.928
ENSATEG00000017696	rab11bb	91	39.000	ENSATEG00000009052	rab42a	92	39.000
ENSATEG00000017696	rab11bb	84	36.757	ENSATEG00000016312	rab33ba	81	35.859
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	98.165	ENSATEG00000023725	-	100	98.165
ENSATEG00000017696	rab11bb	73	33.125	ENSATEG00000020171	rheb	86	33.125
ENSATEG00000017696	rab11bb	66	42.000	ENSATEG00000022993	-	63	42.000
ENSATEG00000017696	rab11bb	53	30.252	ENSATEG00000019469	arl4cb	60	30.252
ENSATEG00000017696	rab11bb	96	40.670	ENSATEG00000019238	si:dkey-16l2.16	98	40.670
ENSATEG00000017696	rab11bb	79	33.140	ENSATEG00000020913	rab23	80	32.984
ENSATEG00000017696	rab11bb	77	33.929	ENSATEG00000020001	hrasb	92	35.000
ENSATEG00000017696	rab11bb	75	41.667	ENSATEG00000004488	rab9b	79	41.667
ENSATEG00000017696	rab11bb	94	41.748	ENSATEG00000014748	rab5aa	90	41.748
ENSATEG00000017696	rab11bb	72	40.491	ENSATEG00000002860	RAB7A	78	40.491
ENSATEG00000017696	rab11bb	88	32.124	ENSATEG00000008400	rras	94	33.171
ENSATEG00000017696	rab11bb	96	45.755	ENSATEG00000008052	rab1ab	99	45.755
ENSATEG00000017696	rab11bb	82	37.500	ENSATEG00000017702	rab33a	82	37.500
ENSATEG00000017696	rab11bb	58	38.281	ENSATEG00000006851	rab34b	52	38.281
ENSATEG00000017696	rab11bb	72	40.373	ENSATEG00000013396	rab9a	79	40.373
ENSATEG00000017696	rab11bb	72	35.669	ENSATEG00000011879	rab6bb	74	35.669
ENSATEG00000017696	rab11bb	73	49.686	ENSATEG00000023662	-	80	49.686
ENSATEG00000017696	rab11bb	72	37.580	ENSATEG00000012459	-	75	37.580
ENSATEG00000017696	rab11bb	77	51.190	ENSATEG00000003430	zgc:171927	79	51.190
ENSATEG00000017696	rab11bb	79	45.977	ENSATEG00000013086	-	82	45.977
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	87.156	ENSATEG00000022531	rab11a	100	87.156
ENSATEG00000017696	rab11bb	74	42.857	ENSATEG00000025079	rab22a	83	42.857
ENSATEG00000017696	rab11bb	76	43.373	ENSATEG00000019023	rab15	78	43.373
ENSATEG00000017696	rab11bb	99	82.870	ENSATEG00000006156	rab11al	99	82.870
ENSATEG00000017696	rab11bb	75	31.098	ENSATEG00000017315	-	89	31.098

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	ENSAPOG00000023455	rab11bb	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	87.156	ENSACIG00000019631	rab11bb	100	87.156	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.706	ENSACIG00000024376	-	100	97.706	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	ENSAOCG00000018239	rab11bb	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.706	ENSAOCG00000018849	-	100	97.706	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	ENSAPEG00000016590	rab11bb	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSATEG00000017696	rab11bb	94	98.058	ENSAPLG00000011046	-	94	98.058	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	ENSACLG00000007076	rab11bb	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.706	ENSACLG00000005446	-	100	97.706	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	98.624	ENSAMXG00000042655	rab11bb	100	98.624	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	96.789	ENSAMXG00000037623	-	100	96.789	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	96.330	ENSBTAG00000002475	RAB11B	100	96.330	Bos_taurus
ENSATEG00000017696	rab11bb	96	94.737	ENSCHIG00000022426	-	93	94.737	Capra_hircus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	96.330	ENSCATG00000029188	-	100	96.330	Cercocebus_atys
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.248	ENSCPBG00000017056	-	100	97.248	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	ENSCSEG00000012149	rab11bb	100	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.248	ENSCSEG00000007239	-	100	97.248	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	96.789	ENSCVAG00000019718	-	100	96.789	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	ENSCVAG00000017021	-	100	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	94.495	ENSCVAG00000019751	-	100	94.495	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	98.165	ENSDARG00000090086	rab11bb	100	98.165	Danio_rerio
ENSATEG00000017696	rab11bb	99	94.931	ENSETEG00000000905	-	99	94.931	Echinops_telfairi
ENSATEG00000017696	rab11bb	99	94.884	ENSEASG00005003708	-	99	94.884	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000017696	rab11bb	99	94.884	ENSECAG00000000716	RAB11B	99	94.884	Equus_caballus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	98.165	ENSELUG00000021148	rab11bb	100	98.165	Esox_lucius
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	96.330	ENSELUG00000020948	-	98	100.000	Esox_lucius
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	95.413	ENSELUG00000000916	-	100	95.413	Esox_lucius
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.248	ENSFALG00000011828	-	100	97.248	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	ENSFHEG00000018353	rab11bb	100	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	98.165	ENSFHEG00000022676	-	100	98.165	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000017696	rab11bb	99	93.519	ENSGMOG00000009668	-	99	93.519	Gadus_morhua
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	99.541	ENSGMOG00000009211	rab11bb	100	99.541	Gadus_morhua
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.248	ENSGALG00000000613	RAB11B	100	97.248	Gallus_gallus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	ENSGAFG00000007102	rab11bb	100	100.000	Gambusia_affinis
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	99.541	ENSGACG00000015479	rab11bb	100	99.541	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	94.495	ENSGACG00000013297	-	99	94.495	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	96.330	ENSGGOG00000014516	RAB11B	100	96.330	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.706	ENSHBUG00000009947	-	100	97.706	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	ENSHBUG00000014777	rab11bb	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	99.541	ENSHCOG00000002423	rab11bb	100	99.541	Hippocampus_comes
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	93.578	ENSHCOG00000000985	-	100	93.578	Hippocampus_comes
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	95.413	ENSHCOG00000000954	-	100	95.413	Hippocampus_comes
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.248	ENSIPUG00000025100	rab11b	100	97.248	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	99.083	ENSIPUG00000019927	rab11bb	100	99.083	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.706	ENSKMAG00000006170	-	100	97.706	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	100.000	ENSKMAG00000009033	rab11bb	100	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	89.450	ENSLBEG00000005981	-	100	89.450	Labrus_bergylta
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	96.789	ENSLBEG00000004172	-	100	96.789	Labrus_bergylta
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	99.541	ENSLBEG00000015248	rab11bb	100	99.541	Labrus_bergylta
ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.248	ENSLACG00000016857	-	100	97.248	Latimeria_chalumnae
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ENSATEG00000017696	rab11bb	100	96.789	ENSMAMG00000018533	-	100	96.789	Mastacembelus_armatus
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ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.706	ENSMZEG00005010975	-	100	97.706	Maylandia_zebra
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