EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000017956 (Gene tree)
Gene ID: 113155471
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3703 bases
Position: chrOOHO01000017.1:35895949-35899651
Accession: 113155471
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000025891	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	2.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000026310	-	2656	-	ENSATEP00000025891	374 (aa)	XP_026206019	UPI000E456446

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000017956	twistnb	88	45.562	ENSG00000105849	TWISTNB	89	46.037	Homo_sapiens
ENSATEG00000017956	twistnb	99	74.737	ENSAPOG00000011796	twistnb	95	74.792	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000017956	twistnb	98	69.947	ENSACIG00000020400	twistnb	95	69.252	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000017956	twistnb	99	74.474	ENSAOCG00000024200	twistnb	95	74.238	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000017956	twistnb	99	74.474	ENSAPEG00000016750	twistnb	95	74.238	Amphiprion_percula
ENSATEG00000017956	twistnb	83	47.619	ENSANAG00000026418	TWISTNB	90	44.545	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000017956	twistnb	95	68.056	ENSACLG00000022280	twistnb	89	67.598	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000017956	twistnb	52	63.265	ENSAMXG00000035868	twistnb	69	57.018	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000017956	twistnb	88	45.152	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	91	46.835	Bos_taurus
ENSATEG00000017956	twistnb	87	46.707	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	84	45.714	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000017956	twistnb	79	46.497	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	60	54.106	Capra_hircus
ENSATEG00000017956	twistnb	88	44.970	ENSCATG00000035621	TWISTNB	89	45.427	Cercocebus_atys
ENSATEG00000017956	twistnb	88	46.386	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	54	59.341	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000017956	twistnb	88	44.970	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	89	45.427	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000017956	twistnb	50	57.754	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	58	58.065	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000017956	twistnb	94	59.151	ENSCVAG00000014324	twistnb	97	63.926	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000017956	twistnb	83	49.153	ENSDARG00000024416	twistnb	65	55.556	Danio_rerio
ENSATEG00000017956	twistnb	51	58.333	ENSDNOG00000006438	-	57	58.333	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000017956	twistnb	79	45.724	ENSDORG00000007795	Twistnb	57	58.470	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000017956	twistnb	98	57.453	ENSELUG00000000098	TWISTNB	95	57.465	Esox_lucius
ENSATEG00000017956	twistnb	81	40.938	ENSFALG00000009761	TWISTNB	51	54.487	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000017956	twistnb	99	64.151	ENSFHEG00000013318	twistnb	96	64.689	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000017956	twistnb	63	77.350	ENSGAFG00000018309	twistnb	96	64.266	Gambusia_affinis
ENSATEG00000017956	twistnb	67	69.048	ENSGACG00000006425	twistnb	93	68.651	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000017956	twistnb	88	45.266	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	89	46.984	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000017956	twistnb	95	68.056	ENSHBUG00000020155	twistnb	89	67.598	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000017956	twistnb	90	46.532	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	54	59.341	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000017956	twistnb	96	56.824	ENSHCOG00000010590	twistnb	95	56.391	Hippocampus_comes
ENSATEG00000017956	twistnb	91	49.718	ENSIPUG00000004117	twistnb	95	49.722	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000017956	twistnb	81	48.185	ENSJJAG00000015887	Twistnb	57	59.043	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000017956	twistnb	99	63.467	ENSKMAG00000001591	twistnb	94	67.606	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000017956	twistnb	99	69.393	ENSLBEG00000024225	twistnb	94	69.167	Labrus_bergylta
ENSATEG00000017956	twistnb	87	48.624	ENSLACG00000010508	TWISTNB	96	43.175	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000017956	twistnb	88	44.970	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	89	45.015	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000017956	twistnb	90	44.638	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	88	45.015	Macaca_mulatta
ENSATEG00000017956	twistnb	87	44.510	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	89	44.545	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000017956	twistnb	88	44.970	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	89	45.427	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000017956	twistnb	95	68.056	ENSMZEG00005007561	twistnb	89	67.598	Maylandia_zebra
ENSATEG00000017956	twistnb	83	46.006	ENSMOCG00000003458	Twistnb	59	59.896	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000017956	twistnb	99	63.212	ENSMMOG00000020085	twistnb	95	62.670	Mola_mola
ENSATEG00000017956	twistnb	84	43.533	ENSMODG00000001402	-	67	42.679	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000017956	twistnb	99	69.430	ENSMALG00000016407	twistnb	94	69.210	Monopterus_albus
ENSATEG00000017956	twistnb	88	47.289	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	51	59.341	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000017956	twistnb	95	67.318	ENSNBRG00000008652	twistnb	94	69.167	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000017956	twistnb	87	44.910	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	88	46.474	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000017956	twistnb	91	44.633	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	93	45.238	Ochotona_princeps
ENSATEG00000017956	twistnb	96	67.027	ENSORLG00000004005	twistnb	85	68.508	Oryzias_latipes
ENSATEG00000017956	twistnb	99	65.617	ENSORLG00020002579	twistnb	99	67.192	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000017956	twistnb	99	67.454	ENSORLG00015013403	twistnb	88	67.454	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000017956	twistnb	79	45.687	ENSOARG00000009803	TWISTNB	59	54.106	Ovis_aries
ENSATEG00000017956	twistnb	88	45.401	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	89	45.872	Pan_paniscus
ENSATEG00000017956	twistnb	88	43.917	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	90	44.548	Panthera_pardus
ENSATEG00000017956	twistnb	84	45.483	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	54	59.375	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000017956	twistnb	88	45.266	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	89	45.732	Pan_troglodytes
ENSATEG00000017956	twistnb	88	45.373	ENSPANG00000015736	TWISTNB	89	45.427	Papio_anubis
ENSATEG00000017956	twistnb	61	60.435	ENSPKIG00000025635	twistnb	62	60.435	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000017956	twistnb	97	63.757	ENSPMGG00000019023	twistnb	94	63.760	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSATEG00000017956	twistnb	82	42.122	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	55	53.226	Phascolarctos_cinereus
ENSATEG00000017956	twistnb	88	46.176	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	89	44.343	Pongo_abelii
ENSATEG00000017956	twistnb	52	56.410	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	57	56.410	Pteropus_vampyrus
ENSATEG00000017956	twistnb	95	68.056	ENSPNYG00000002674	twistnb	94	67.318	Pundamilia_nyererei
ENSATEG00000017956	twistnb	92	47.009	ENSPNAG00000011956	twistnb	94	48.580	Pygocentrus_nattereri
ENSATEG00000017956	twistnb	84	47.289	ENSSFOG00015012788	twistnb	52	66.258	Scleropages_formosus
ENSATEG00000017956	twistnb	99	72.895	ENSSMAG00000012792	twistnb	94	72.576	Scophthalmus_maximus
ENSATEG00000017956	twistnb	99	77.632	ENSSDUG00000007038	twistnb	94	77.285	Seriola_dumerili
ENSATEG00000017956	twistnb	79	38.188	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	55	53.571	Sphenodon_punctatus
ENSATEG00000017956	twistnb	94	75.071	ENSSPAG00000005871	twistnb	94	75.071	Stegastes_partitus
ENSATEG00000017956	twistnb	51	56.545	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	61	54.412	Sus_scrofa
ENSATEG00000017956	twistnb	88	60.472	ENSTNIG00000017778	twistnb	93	61.755	Tetraodon_nigroviridis
ENSATEG00000017956	twistnb	87	45.994	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	89	45.511	Tupaia_belangeri
ENSATEG00000017956	twistnb	94	64.306	ENSXCOG00000020199	twistnb	68	76.210	Xiphophorus_couchianus