EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000019550 (Gene tree)
Gene ID: 113155851
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5562 bases
Position: chrOOHO01000022.1:8963198-8968759
Accession: 113155851
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000028302	eRF1_2	PF03464.15	3.3e-33	1	1
ENSATEP00000028302	eRF1_3	PF03465.15	1.6e-25	1	1
ENSATEP00000028302	eRF1_1	PF03463.15	1.2e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000028743	-	1684	XM_026350566	ENSATEP00000028302	385 (aa)	XP_026206351	UPI000E46574F

Gene Model

Click here to download ENSATEG00000019550's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSATEG00000019550's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSG00000152684	PELO	100	81.818	Homo_sapiens
ENSATEG00000019550	pelo	64	95.547	ENSAPOG00000000616	pelo	90	95.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000019550	pelo	64	95.547	ENSAPOG00000023700	-	90	95.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000019550	pelo	100	95.584	ENSAPOG00000023072	pelo	100	95.584	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.299	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000019550	pelo	97	89.544	ENSACIG00000014386	pelo	97	94.675	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000019550	pelo	100	95.844	ENSAOCG00000023717	pelo	100	95.844	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000019550	pelo	100	95.844	ENSAPEG00000011235	pelo	100	95.844	Amphiprion_percula
ENSATEG00000019550	pelo	77	71.477	ENSAPLG00000013265	PELO	100	71.477	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000019550	pelo	97	81.067	ENSACAG00000004352	PELO	100	80.779	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.039	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.039	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000019550	pelo	100	91.948	ENSACLG00000010305	pelo	100	91.948	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000019550	pelo	97	92.761	ENSAMXG00000020299	pelo	100	92.487	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.558	Bos_taurus
ENSATEG00000019550	pelo	99	58.793	WBGene00011280	pelo-1	100	58.701	Caenorhabditis_elegans
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.558	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.299	Capra_hircus
ENSATEG00000019550	pelo	100	82.078	ENSTSYG00000005203	PELO	100	82.078	Carlito_syrichta
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.818	Cavia_porcellus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.299	Cebus_capucinus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSCATG00000011829	PELO	100	81.558	Cercocebus_atys
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.299	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.558	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000019550	pelo	100	82.078	ENSCHOG00000000523	PELO	100	82.078	Choloepus_hoffmanni
ENSATEG00000019550	pelo	97	80.800	ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.519	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000019550	pelo	97	65.147	ENSCING00000001979	-	100	65.195	Ciona_intestinalis
ENSATEG00000019550	pelo	100	66.753	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.753	Ciona_savignyi
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSCANG00000023382	PELO	100	81.558	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000019550	pelo	97	82.038	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.818	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000019550	pelo	97	82.842	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.597	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000019550	pelo	100	93.247	ENSCSEG00000008807	pelo	100	93.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	ENSCVAG00000016082	pelo	100	94.026	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000019550	pelo	100	89.870	ENSDARG00000055477	pelo	100	89.870	Danio_rerio
ENSATEG00000019550	pelo	100	78.497	ENSDNOG00000036721	PELO	100	78.497	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000019550	pelo	100	82.597	ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.597	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000019550	pelo	96	67.568	FBgn0011207	pelo	97	66.057	Drosophila_melanogaster
ENSATEG00000019550	pelo	71	79.532	ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	Eptatretus_burgeri
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	ENSEASG00005013348	PELO	100	81.299	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000019550	pelo	100	91.948	ENSELUG00000023229	pelo	100	91.948	Esox_lucius
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSFCAG00000032341	PELO	100	81.558	Felis_catus
ENSATEG00000019550	pelo	100	80.779	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.779	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000019550	pelo	74	83.451	ENSFDAG00000002076	PELO	88	83.451	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000019550	pelo	100	92.468	ENSFHEG00000009769	pelo	100	92.468	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000019550	pelo	98	91.247	ENSGMOG00000005849	pelo	100	90.909	Gadus_morhua
ENSATEG00000019550	pelo	100	92.727	ENSGAFG00000019350	pelo	100	92.727	Gambusia_affinis
ENSATEG00000019550	pelo	100	93.766	ENSGACG00000007245	pelo	100	93.766	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000019550	pelo	97	80.800	ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.519	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSGGOG00000012635	PELO	100	81.558	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000019550	pelo	100	91.948	ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.948	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSHGLG00000005932	PELO	100	81.818	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000019550	pelo	100	79.740	ENSHGLG00100017627	PELO	100	79.740	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000019550	pelo	100	91.688	ENSHCOG00000016782	pelo	100	91.688	Hippocampus_comes
ENSATEG00000019550	pelo	100	89.870	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.870	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000019550	pelo	100	79.740	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	79.740	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000019550	pelo	100	92.727	ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000019550	pelo	100	94.805	ENSLBEG00000022399	pelo	100	94.805	Labrus_bergylta
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSLAFG00000020551	PELO	100	81.558	Loxodonta_africana
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSMFAG00000000651	PELO	100	81.558	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSMMUG00000039101	PELO	100	81.558	Macaca_mulatta
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSMNEG00000035538	PELO	100	81.558	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSMLEG00000039113	PELO	100	81.558	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000019550	pelo	100	97.143	ENSMAMG00000013260	pelo	100	97.143	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000019550	pelo	100	91.948	ENSMZEG00005014258	pelo	100	91.948	Maylandia_zebra
ENSATEG00000019550	pelo	100	82.078	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	82.078	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSMICG00000044040	PELO	100	81.818	Microcebus_murinus
ENSATEG00000019550	pelo	100	82.078	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	82.078	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000019550	pelo	100	94.545	ENSMMOG00000001324	pelo	100	94.545	Mola_mola
ENSATEG00000019550	pelo	100	94.805	ENSMALG00000008194	pelo	100	94.805	Monopterus_albus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	81.818	Mus_caroli
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	81.818	Mus_musculus
ENSATEG00000019550	pelo	100	82.078	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	82.078	Mus_pahari
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	81.818	Mus_spretus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSMLUG00000024132	PELO	100	81.818	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000019550	pelo	100	83.117	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	83.117	Nannospalax_galili
ENSATEG00000019550	pelo	100	91.948	ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.948	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSNLEG00000035970	PELO	100	81.558	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000019550	pelo	100	80.519	ENSMEUG00000005468	PELO	100	80.519	Notamacropus_eugenii
ENSATEG00000019550	pelo	98	81.003	ENSOPRG00000018793	PELO	100	81.003	Ochotona_princeps
ENSATEG00000019550	pelo	100	82.338	ENSODEG00000017579	PELO	100	82.338	Octodon_degus
ENSATEG00000019550	pelo	96	92.992	ENSONIG00000011511	pelo	100	92.727	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000019550	pelo	100	92.468	ENSORLG00000005827	pelo	100	92.468	Oryzias_latipes
ENSATEG00000019550	pelo	100	92.727	ENSORLG00020016456	pelo	100	92.727	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000019550	pelo	100	92.727	ENSORLG00015014447	pelo	100	92.727	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000019550	pelo	100	93.506	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.506	Oryzias_melastigma
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSOGAG00000027940	PELO	100	81.558	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSOARG00000008324	PELO	99	81.558	Ovis_aries
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSPPAG00000038951	PELO	100	81.558	Pan_paniscus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSPPRG00000018800	PELO	100	81.558	Panthera_pardus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.558	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.558	Pan_troglodytes
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSPANG00000010902	PELO	100	81.558	Papio_anubis
ENSATEG00000019550	pelo	100	89.870	ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.870	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000019550	pelo	97	81.067	ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	Pelodiscus_sinensis
ENSATEG00000019550	pelo	67	91.473	ENSPMGG00000014561	pelo	95	91.473	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSATEG00000019550	pelo	100	82.338	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	82.338	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSATEG00000019550	pelo	100	82.078	ENSPCIG00000004880	PELO	100	82.078	Phascolarctos_cinereus
ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	ENSPFOG00000007277	pelo	100	94.026	Poecilia_formosa
ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	ENSPLAG00000020787	pelo	100	94.026	Poecilia_latipinna
ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	ENSPMEG00000016964	pelo	100	94.026	Poecilia_mexicana
ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	ENSPREG00000023071	pelo	100	94.026	Poecilia_reticulata
ENSATEG00000019550	pelo	97	82.038	ENSPPYG00000015451	PELO	96	81.558	Pongo_abelii
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSPCOG00000021178	PELO	100	81.818	Propithecus_coquereli
ENSATEG00000019550	pelo	100	91.948	ENSPNYG00000017325	pelo	100	91.948	Pundamilia_nyererei
ENSATEG00000019550	pelo	97	92.493	ENSPNAG00000012458	pelo	99	91.688	Pygocentrus_nattereri
ENSATEG00000019550	pelo	100	82.338	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	82.338	Rattus_norvegicus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSRBIG00000007299	PELO	100	81.558	Rhinopithecus_bieti
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSRROG00000035507	PELO	100	81.558	Rhinopithecus_roxellana
ENSATEG00000019550	pelo	97	33.421	YNL001W	-	97	33.421	Saccharomyces_cerevisiae
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSSBOG00000036140	PELO	100	81.558	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSATEG00000019550	pelo	63	78.689	ENSSHAG00000010770	PELO	100	78.689	Sarcophilus_harrisii
ENSATEG00000019550	pelo	98	90.981	ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.649	Scleropages_formosus
ENSATEG00000019550	pelo	100	94.286	ENSSMAG00000017171	pelo	100	94.286	Scophthalmus_maximus
ENSATEG00000019550	pelo	100	95.065	ENSSDUG00000022938	pelo	100	95.065	Seriola_dumerili
ENSATEG00000019550	pelo	100	91.169	ENSSLDG00000017884	pelo	100	91.169	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSATEG00000019550	pelo	97	82.133	ENSSPUG00000005545	PELO	100	81.818	Sphenodon_punctatus
ENSATEG00000019550	pelo	98	95.491	ENSSPAG00000008501	pelo	100	95.065	Stegastes_partitus
ENSATEG00000019550	pelo	100	80.260	ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.260	Sus_scrofa
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.299	Taeniopygia_guttata
ENSATEG00000019550	pelo	100	93.247	ENSTRUG00000005809	pelo	100	93.247	Takifugu_rubripes
ENSATEG00000019550	pelo	100	93.247	ENSTNIG00000018937	pelo	100	93.247	Tetraodon_nigroviridis
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	ENSTTRG00000001857	PELO	100	81.299	Tursiops_truncatus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSUAMG00000002535	PELO	100	81.818	Ursus_americanus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	ENSUMAG00000005809	PELO	100	81.818	Ursus_maritimus
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSVPAG00000001113	PELO	100	81.558	Vicugna_pacos
ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	ENSVVUG00000025499	PELO	100	81.558	Vulpes_vulpes
ENSATEG00000019550	pelo	81	78.065	ENSXETG00000018368	pelo	100	76.380	Xenopus_tropicalis
ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	ENSXMAG00000018474	pelo	100	94.026	Xiphophorus_maculatus