EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000020398 (Gene tree)
Gene ID: 113163099
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: GTPase IMAP family member 7-like
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1892 bases
Position: chrOOHO01000004.1:17283261-17285152
Accession: 113163099
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000029548	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000029995	-	1440	XM_026361433	ENSATEP00000029548	349 (aa)	XP_026217218	UPI000E4659D9

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSATEG00000020398	-	60	35.912	ENSATEG00000011635	-	52	35.519
ENSATEG00000020398	-	51	37.430	ENSATEG00000011979	-	84	37.430
ENSATEG00000020398	-	52	32.778	ENSATEG00000017209	-	67	32.778
ENSATEG00000020398	-	52	31.492	ENSATEG00000014085	-	61	32.044
ENSATEG00000020398	-	52	35.519	ENSATEG00000011953	-	51	35.519
ENSATEG00000020398	-	53	36.364	ENSATEG00000020391	-	76	36.364
ENSATEG00000020398	-	51	38.764	ENSATEG00000009383	-	59	38.764
ENSATEG00000020398	-	53	35.326	ENSATEG00000020431	zgc:113625	72	35.326
ENSATEG00000020398	-	52	33.880	ENSATEG00000011789	-	56	33.880
ENSATEG00000020398	-	51	33.149	ENSATEG00000014028	-	70	35.484
ENSATEG00000020398	-	52	33.880	ENSATEG00000019003	-	69	33.880
ENSATEG00000020398	-	52	35.135	ENSATEG00000017198	-	62	35.135
ENSATEG00000020398	-	51	35.359	ENSATEG00000017193	-	52	34.973
ENSATEG00000020398	-	52	33.702	ENSATEG00000013008	-	62	33.702
ENSATEG00000020398	-	53	31.217	ENSATEG00000005844	-	54	30.645
ENSATEG00000020398	-	53	34.409	ENSATEG00000011820	-	66	34.409
ENSATEG00000020398	-	54	36.702	ENSATEG00000011594	-	74	37.017
ENSATEG00000020398	-	59	32.381	ENSATEG00000017202	-	53	31.963
ENSATEG00000020398	-	53	34.043	ENSATEG00000011814	-	54	35.503
ENSATEG00000020398	-	52	34.946	ENSATEG00000011720	-	68	34.946
ENSATEG00000020398	-	52	34.239	ENSATEG00000011918	-	61	34.239
ENSATEG00000020398	-	51	37.430	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	68	35.912
ENSATEG00000020398	-	61	35.789	ENSATEG00000011931	-	58	35.789

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000020398	-	55	35.593	ENSAPOG00000022321	-	56	35.593	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	55	34.021	ENSAPOG00000009059	-	51	35.359	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	51	32.778	ENSAPOG00000020108	-	52	32.778	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	53	37.433	ENSAPOG00000018915	-	80	37.433	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	52	36.612	ENSAPOG00000010738	-	59	36.612	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	52	35.676	ENSAPOG00000001075	-	85	35.676	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	52	36.702	ENSAPOG00000000066	-	51	37.097	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	51	35.079	ENSAPOG00000009288	-	70	35.079	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	54	35.450	ENSAPOG00000007123	-	70	35.450	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	51	36.111	ENSAPOG00000021365	-	58	36.111	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	52	35.165	ENSAPOG00000002337	-	57	35.165	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020398	-	58	56.931	ENSACIG00000019509	-	88	56.931	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	60	34.434	ENSACIG00000005780	-	63	34.434	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	58	33.173	ENSACIG00000007178	-	72	33.173	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	52	35.326	ENSACIG00000016313	-	57	35.326	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	52	38.251	ENSACIG00000022355	-	63	38.251	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	52	34.239	ENSACIG00000005223	-	70	34.239	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	52	37.705	ENSACIG00000006478	-	68	37.705	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	52	33.880	ENSACIG00000006484	-	56	33.880	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	50	37.222	ENSACIG00000022374	-	92	37.222	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	51	38.587	ENSACIG00000012714	-	60	38.587	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	53	32.432	ENSACIG00000015088	-	73	32.432	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	52	36.364	ENSACIG00000007158	-	53	36.364	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	56	37.755	ENSACIG00000016635	-	71	37.755	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	52	37.500	ENSACIG00000022222	-	58	37.500	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	60	44.393	ENSACIG00000014670	-	80	43.925	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	51	34.637	ENSACIG00000003050	-	79	34.637	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	52	45.641	ENSACIG00000014737	-	90	43.590	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	52	34.783	ENSACIG00000012707	-	69	34.783	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	53	33.495	ENSACIG00000009149	-	69	33.171	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020398	-	52	31.492	ENSAOCG00000013326	-	57	32.515	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000020398	-	51	35.556	ENSAOCG00000015984	-	58	35.556	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000020398	-	55	31.606	ENSAPEG00000019003	-	73	31.606	Amphiprion_percula
ENSATEG00000020398	-	55	33.505	ENSAPEG00000003513	-	76	38.182	Amphiprion_percula
ENSATEG00000020398	-	51	33.702	ENSAPEG00000013532	-	91	32.222	Amphiprion_percula
ENSATEG00000020398	-	51	32.275	ENSAPEG00000002163	-	65	32.275	Amphiprion_percula
ENSATEG00000020398	-	51	33.702	ENSAPEG00000013508	-	75	32.222	Amphiprion_percula
ENSATEG00000020398	-	52	35.135	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	94	38.686	Amphiprion_percula
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ENSATEG00000020398	-	52	34.973	ENSACLG00000005232	-	80	34.177	Astatotilapia_calliptera
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ENSATEG00000020398	-	51	33.862	ENSACLG00000003763	-	55	33.862	Astatotilapia_calliptera
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ENSATEG00000020398	-	51	34.737	ENSAMXG00000040863	-	86	34.737	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020398	-	58	32.057	ENSAMXG00000032951	-	71	32.843	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020398	-	52	33.333	ENSAMXG00000035161	-	58	33.333	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020398	-	51	34.574	ENSAMXG00000025201	si:dkey-125e8.4	53	34.574	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020398	-	50	35.632	ENSAMXG00000041745	-	79	35.632	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020398	-	54	37.037	ENSAMXG00000031962	-	62	34.555	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020398	-	52	36.413	ENSAMXG00000015575	-	59	36.413	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020398	-	51	35.912	ENSAMXG00000032381	-	51	35.912	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020398	-	55	34.715	ENSAMXG00000035925	-	86	34.715	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020398	-	52	35.135	ENSAMXG00000041969	si:ch1073-185p12.2	56	35.135	Astyanax_mexicanus
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