EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000020556 (Gene tree)
Gene ID: 113147874
Gene Symbol: snrpd3l
Alias: wu:fa18f04|zgc:56125
Full Name: small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide%2C like
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1457 bases
Position: chrOOHO01000007.1:12937155-12938611
Accession: ZDB-GENE-030131-5219
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000029779	LSM	PF01423.22	1.8e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000030230	-	712	-	ENSATEP00000029779	140 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSATEG00000020556	snrpd3l	59	31.325	ENSATEG00000014399	snrpd1	91	31.132

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSG00000100028	SNRPD3	100	99.213	Homo_sapiens
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSAPOG00000007512	snrpd3l	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSAMEG00000013935	SNRPD3	100	99.213	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSACIG00000008871	snrpd3l	100	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	76	100.000	ENSAOCG00000016759	-	98	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSAOCG00000022442	-	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSAOCG00000016743	snrpd3l	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSAOCG00000008497	SNRPD3	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000020556	snrpd3l	76	100.000	ENSAPEG00000006260	-	98	100.000	Amphiprion_percula
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSAPEG00000006273	snrpd3l	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSAPLG00000008670	SNRPD3	100	99.213	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSANAG00000026106	SNRPD3	100	99.213	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSACLG00000021295	snrpd3l	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	96.875	ENSAMXG00000038984	snrpd3l	100	96.875	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSBTAG00000021262	SNRPD3	100	99.213	Bos_taurus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	85	61.600	WBGene00004914	snr-1	81	62.727	Caenorhabditis_elegans
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCJAG00000009630	SNRPD3	100	99.213	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	98.425	ENSCAFG00000017258	-	100	98.425	Canis_familiaris
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCAFG00000013864	-	100	99.213	Canis_familiaris
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCAFG00020007165	-	100	99.213	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCHIG00000000057	SNRPD3	100	99.213	Capra_hircus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSTSYG00000007649	SNRPD3	100	99.213	Carlito_syrichta
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCAPG00000016432	-	100	99.213	Cavia_aperea
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCPOG00000033102	-	100	99.213	Cavia_porcellus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCCAG00000035006	SNRPD3	100	99.213	Cebus_capucinus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCATG00000038878	SNRPD3	100	99.213	Cercocebus_atys
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCLAG00000011403	SNRPD3	100	99.213	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCSAG00000010694	SNRPD3	100	99.213	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCPBG00000002065	SNRPD3	100	99.213	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000020556	snrpd3l	76	79.439	ENSCSAVG00000004708	-	80	79.439	Ciona_savignyi
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCANG00000032106	SNRPD3	100	99.213	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCGRG00001021990	Snrpd3	100	99.213	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSCGRG00000004280	Snrpd3	100	99.213	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	98.425	ENSCVAG00000001276	snrpd3l	100	98.425	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	95.276	ENSDARG00000013800	snrpd3	100	95.276	Danio_rerio
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	96.875	ENSDARG00000076283	snrpd3l	100	96.875	Danio_rerio
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSDNOG00000047424	-	100	99.213	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	87	77.869	ENSDNOG00000042638	-	99	75.410	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	89.231	ENSDNOG00000018004	-	100	86.923	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	70.866	ENSDORG00000027169	-	100	70.079	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000020556	snrpd3l	79	88.288	ENSDORG00000002800	-	100	87.387	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	84.252	ENSDORG00000027706	-	100	81.890	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000020556	snrpd3l	76	83.962	FBgn0023167	SmD3	71	83.178	Drosophila_melanogaster
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSEASG00005000273	SNRPD3	100	99.213	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSECAG00000023316	SNRPD3	100	99.213	Equus_caballus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	97.638	ENSEEUG00000015518	SNRPD3	100	97.638	Erinaceus_europaeus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	97.638	ENSELUG00000001854	snrpd3	100	97.638	Esox_lucius
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSELUG00000010092	snrpd3l	100	99.213	Esox_lucius
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSFCAG00000001512	SNRPD3	100	99.213	Felis_catus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSFALG00000007303	SNRPD3	100	99.213	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSFDAG00000010772	SNRPD3	100	99.213	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSFHEG00000010754	snrpd3l	100	99.213	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.219	ENSGMOG00000008469	snrpd3l	100	99.219	Gadus_morhua
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSGALG00000006596	SNRPD3	100	99.213	Gallus_gallus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	76	100.000	ENSGAFG00000006661	snrpd3l	82	100.000	Gambusia_affinis
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.219	ENSGACG00000017533	snrpd3l	100	99.219	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSGAGG00000023325	SNRPD3	100	99.213	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSGGOG00000015640	SNRPD3	100	99.213	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSHBUG00000001332	snrpd3l	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000020556	snrpd3l	90	96.032	ENSHGLG00000009844	-	99	96.032	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSHGLG00000016496	SNRPD3	100	99.213	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000020556	snrpd3l	90	96.032	ENSHGLG00100011326	-	99	96.032	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSHGLG00100019304	SNRPD3	100	99.213	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSHCOG00000014396	snrpd3l	100	99.213	Hippocampus_comes
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	96.875	ENSIPUG00000003083	snrpd3	100	96.875	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSSTOG00000025674	SNRPD3	100	99.213	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSJJAG00000013303	Snrpd3	100	99.213	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSKMAG00000012493	snrpd3l	100	99.213	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSLBEG00000003202	snrpd3l	100	100.000	Labrus_bergylta
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	98.425	ENSLACG00000015192	SNRPD3	100	98.425	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSLOCG00000006978	snrpd3	100	100.000	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSLAFG00000028180	SNRPD3	100	99.213	Loxodonta_africana
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMFAG00000033628	SNRPD3	100	99.213	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMMUG00000000264	SNRPD3	100	99.213	Macaca_mulatta
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMNEG00000020857	SNRPD3	100	99.213	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMLEG00000037548	SNRPD3	100	99.213	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSMZEG00005017664	snrpd3l	100	100.000	Maylandia_zebra
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMAUG00000021393	Snrpd3	100	99.213	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMICG00000034782	SNRPD3	100	99.213	Microcebus_murinus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMOCG00000009361	Snrpd3	100	99.213	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000020556	snrpd3l	76	100.000	ENSMMOG00000020985	snrpd3l	67	100.000	Mola_mola
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMODG00000004024	SNRPD3	100	99.213	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSMALG00000013334	snrpd3l	100	100.000	Monopterus_albus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	MGP_CAROLIEiJ_G0015441	Snrpd3	100	99.213	Mus_caroli
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMUSG00000020180	Snrpd3	100	99.213	Mus_musculus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	MGP_PahariEiJ_G0030857	Snrpd3	100	99.213	Mus_pahari
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	MGP_SPRETEiJ_G0016254	Snrpd3	100	99.213	Mus_spretus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMPUG00000002889	SNRPD3	100	99.213	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMLUG00000009838	SNRPD3	100	99.213	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSNGAG00000010328	Snrpd3	100	99.213	Nannospalax_galili
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSNBRG00000020307	snrpd3l	100	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSNLEG00000035757	SNRPD3	100	99.213	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSMEUG00000003772	SNRPD3	100	99.213	Notamacropus_eugenii
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSOPRG00000005763	SNRPD3	100	99.213	Ochotona_princeps
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	96.063	ENSODEG00000020162	-	100	96.063	Octodon_degus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	98.425	ENSODEG00000019354	-	100	98.425	Octodon_degus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSODEG00000008064	-	100	99.213	Octodon_degus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSONIG00000003828	snrpd3l	100	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSOANG00000002463	SNRPD3	100	99.213	Ornithorhynchus_anatinus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSOCUG00000004845	SNRPD3	100	99.213	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSORLG00000010586	snrpd3l	100	100.000	Oryzias_latipes
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSORLG00020011769	snrpd3l	100	100.000	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	100.000	ENSORLG00015022940	snrpd3l	100	100.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSOMEG00000022734	snrpd3l	100	99.213	Oryzias_melastigma
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSOGAG00000012708	SNRPD3	100	99.213	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSOARG00000013984	SNRPD3	100	99.213	Ovis_aries
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSPPAG00000039191	SNRPD3	100	99.213	Pan_paniscus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSPPRG00000001470	SNRPD3	100	99.213	Panthera_pardus
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSPTIG00000016610	SNRPD3	100	99.213	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000020556	snrpd3l	91	99.213	ENSPTRG00000014176	SNRPD3	100	99.213	Pan_troglodytes
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