EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000020930 (Gene tree)
Gene ID: 113174456
Gene Symbol: urb2
Alias: fc13e02|si:dkey-162b3.2|wu:fc13e02
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13927 bases
Position: chrOOHO01000010.1:4397971-4411897
Accession: 113174456
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000030312	Urb2	PF10441.9	3e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000030769	-	5433	XM_026378492	ENSATEP00000030312	1682 (aa)	XP_026234277	UPI000E45D468

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.444	ENSG00000135763	URB2	99	63.095	Homo_sapiens
ENSATEG00000020930	urb2	91	70.524	ENSAPOG00000000608	urb2	100	70.396	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.481	ENSAMEG00000009206	URB2	100	34.636	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000020930	urb2	100	72.531	ENSAOCG00000019961	urb2	100	72.472	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000020930	urb2	100	72.589	ENSAPEG00000005263	urb2	100	72.531	Amphiprion_percula
ENSATEG00000020930	urb2	98	35.957	ENSAPLG00000002998	URB2	99	36.196	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000020930	urb2	99	36.824	ENSACAG00000001285	URB2	99	36.824	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000020930	urb2	99	35.017	ENSANAG00000033963	URB2	99	34.959	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000020930	urb2	91	68.560	ENSACLG00000009254	urb2	100	68.496	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000020930	urb2	99	41.335	ENSAMXG00000003474	urb2	99	41.208	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.561	ENSBTAG00000010180	URB2	100	34.503	Bos_taurus
ENSATEG00000020930	urb2	95	62.411	ENSCJAG00000010968	URB2	99	62.411	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.327	ENSCAFG00000012118	URB2	99	34.366	Canis_familiaris
ENSATEG00000020930	urb2	94	32.837	ENSCAFG00020027217	URB2	99	32.878	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.054	ENSCHIG00000014513	URB2	100	33.995	Capra_hircus
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.513	ENSTSYG00000006924	URB2	100	34.841	Carlito_syrichta
ENSATEG00000020930	urb2	61	39.733	ENSCPOG00000020777	-	99	39.733	Cavia_porcellus
ENSATEG00000020930	urb2	99	35.026	ENSCCAG00000023932	URB2	99	34.968	Cebus_capucinus
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.991	ENSCATG00000043366	URB2	99	35.146	Cercocebus_atys
ENSATEG00000020930	urb2	99	35.359	ENSCLAG00000006268	URB2	99	35.631	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.640	ENSCSAG00000010599	URB2	99	34.795	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000020930	urb2	70	44.444	ENSCHOG00000010163	URB2	70	44.444	Choloepus_hoffmanni
ENSATEG00000020930	urb2	99	38.310	ENSCPBG00000006191	URB2	99	38.137	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.523	ENSCANG00000023711	URB2	99	34.912	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.912	ENSCGRG00001009591	Urb2	99	34.795	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.912	ENSCGRG00000011259	Urb2	99	34.795	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000020930	urb2	100	57.017	ENSCSEG00000000299	urb2	100	56.958	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000020930	urb2	100	60.695	ENSCVAG00000011011	urb2	100	61.088	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000020930	urb2	100	42.916	ENSDARG00000003217	urb2	100	70.192	Danio_rerio
ENSATEG00000020930	urb2	90	41.837	ENSDNOG00000043064	URB2	99	31.911	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000020930	urb2	99	33.804	ENSDORG00000014975	Urb2	99	33.999	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000020930	urb2	96	40.141	ENSETEG00000002869	URB2	95	40.141	Echinops_telfairi
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.957	ENSEASG00005012060	URB2	100	35.032	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000020930	urb2	94	62.937	ENSECAG00000012338	URB2	100	62.937	Equus_caballus
ENSATEG00000020930	urb2	93	56.738	ENSEEUG00000002669	URB2	92	56.738	Erinaceus_europaeus
ENSATEG00000020930	urb2	100	48.894	ENSELUG00000014647	urb2	100	48.894	Esox_lucius
ENSATEG00000020930	urb2	99	33.974	ENSFCAG00000007662	URB2	99	34.282	Felis_catus
ENSATEG00000020930	urb2	99	37.841	ENSFALG00000003385	URB2	99	37.725	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000020930	urb2	99	35.067	ENSFDAG00000021079	URB2	99	35.026	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000020930	urb2	100	62.315	ENSFHEG00000010357	urb2	100	62.374	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000020930	urb2	99	53.787	ENSGMOG00000012459	urb2	100	53.728	Gadus_morhua
ENSATEG00000020930	urb2	99	38.172	ENSGALG00000011101	URB2	99	38.172	Gallus_gallus
ENSATEG00000020930	urb2	100	65.487	ENSGACG00000016179	urb2	100	66.352	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000020930	urb2	99	38.783	ENSGAGG00000021879	URB2	99	38.448	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000020930	urb2	99	33.996	ENSGGOG00000025643	URB2	99	34.211	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000020930	urb2	100	69.104	ENSHBUG00000018469	urb2	100	69.045	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000020930	urb2	98	34.048	ENSHGLG00000016561	URB2	99	34.146	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000020930	urb2	96	52.288	ENSHGLG00100001838	URB2	99	52.288	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000020930	urb2	100	41.325	ENSIPUG00000020315	urb2	100	40.827	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.284	ENSSTOG00000025323	URB2	99	34.282	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000020930	urb2	99	33.353	ENSJJAG00000011998	Urb2	99	33.372	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000020930	urb2	100	65.918	ENSKMAG00000020129	urb2	100	66.037	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000020930	urb2	99	38.479	ENSLACG00000002038	URB2	99	38.537	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000020930	urb2	99	42.757	ENSLOCG00000015462	urb2	99	42.815	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.889	ENSLAFG00000012484	URB2	100	34.831	Loxodonta_africana
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.699	ENSMFAG00000039905	URB2	99	34.854	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.757	ENSMMUG00000009509	URB2	99	34.912	Macaca_mulatta
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ENSATEG00000020930	urb2	99	34.933	ENSMLEG00000043252	URB2	99	35.088	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000020930	urb2	100	71.597	ENSMAMG00000020365	urb2	100	71.479	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000020930	urb2	100	69.163	ENSMZEG00005011027	urb2	100	69.104	Maylandia_zebra
ENSATEG00000020930	urb2	95	35.543	ENSMGAG00000012073	URB2	99	35.543	Meleagris_gallopavo
ENSATEG00000020930	urb2	95	60.284	ENSMAUG00000017980	Urb2	99	60.284	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.442	ENSMICG00000033302	URB2	100	34.638	Microcebus_murinus
ENSATEG00000020930	urb2	99	35.003	ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.869	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000020930	urb2	100	76.773	ENSMALG00000006529	urb2	100	76.596	Monopterus_albus
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.463	ENSMUSG00000031976	Urb2	99	34.618	Mus_musculus
ENSATEG00000020930	urb2	99	35.134	ENSMPUG00000012438	URB2	99	35.075	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.071	ENSNGAG00000016524	Urb2	99	34.692	Nannospalax_galili
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.582	ENSNLEG00000014450	URB2	99	34.737	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000020930	urb2	87	46.847	ENSMEUG00000016434	URB2	92	46.847	Notamacropus_eugenii
ENSATEG00000020930	urb2	89	80.952	ENSOPRG00000009906	URB2	87	80.952	Ochotona_princeps
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.977	ENSODEG00000005593	URB2	99	35.463	Octodon_degus
ENSATEG00000020930	urb2	100	64.973	ENSONIG00000017078	urb2	100	65.269	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000020930	urb2	95	50.311	ENSOANG00000013732	URB2	99	32.527	Ornithorhynchus_anatinus
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.306	ENSOCUG00000010700	URB2	100	34.636	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000020930	urb2	100	61.288	ENSORLG00000010915	urb2	100	61.252	Oryzias_latipes
ENSATEG00000020930	urb2	100	60.757	ENSORLG00020003361	urb2	100	61.193	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000020930	urb2	100	61.052	ENSORLG00015001534	urb2	100	60.957	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000020930	urb2	100	61.029	ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.029	Oryzias_melastigma
ENSATEG00000020930	urb2	100	33.934	ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.088	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000020930	urb2	100	33.801	ENSOARG00000003102	URB2	100	34.014	Ovis_aries
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.055	ENSPPAG00000040629	URB2	99	34.503	Pan_paniscus
ENSATEG00000020930	urb2	99	33.974	ENSPPRG00000012767	URB2	99	34.282	Panthera_pardus
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.246	ENSPTIG00000012577	URB2	99	34.553	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.231	ENSPTRG00000002092	URB2	99	34.444	Pan_troglodytes
ENSATEG00000020930	urb2	96	38.841	ENSPANG00000002245	URB2	99	38.841	Papio_anubis
ENSATEG00000020930	urb2	99	43.016	ENSPKIG00000005787	urb2	99	42.674	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000020930	urb2	99	37.753	ENSPSIG00000002690	URB2	99	37.753	Pelodiscus_sinensis
ENSATEG00000020930	urb2	96	33.232	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.273	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSATEG00000020930	urb2	99	35.476	ENSPCIG00000030071	URB2	99	35.476	Phascolarctos_cinereus
ENSATEG00000020930	urb2	100	61.789	ENSPFOG00000014330	urb2	100	62.026	Poecilia_formosa
ENSATEG00000020930	urb2	100	61.197	ENSPLAG00000014654	urb2	100	61.434	Poecilia_latipinna
ENSATEG00000020930	urb2	100	62.500	ENSPMEG00000012356	urb2	100	62.500	Poecilia_mexicana
ENSATEG00000020930	urb2	100	61.848	ENSPREG00000010268	urb2	100	61.916	Poecilia_reticulata
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.503	ENSPPYG00000000123	URB2	100	34.600	Pongo_abelii
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.463	ENSPCOG00000023537	URB2	100	34.851	Propithecus_coquereli
ENSATEG00000020930	urb2	99	31.813	ENSPVAG00000002108	URB2	99	31.579	Pteropus_vampyrus
ENSATEG00000020930	urb2	91	68.367	ENSPNYG00000016840	urb2	100	68.496	Pundamilia_nyererei
ENSATEG00000020930	urb2	99	41.844	ENSPNAG00000013684	urb2	99	41.373	Pygocentrus_nattereri
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.264	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	34.651	Rattus_norvegicus
ENSATEG00000020930	urb2	99	35.105	ENSRBIG00000037937	URB2	99	35.201	Rhinopithecus_bieti
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.980	ENSRROG00000039854	URB2	99	35.075	Rhinopithecus_roxellana
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.366	ENSSBOG00000023055	URB2	99	34.307	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSATEG00000020930	urb2	99	35.363	ENSSHAG00000014735	URB2	99	35.497	Sarcophilus_harrisii
ENSATEG00000020930	urb2	98	42.617	ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.737	Scleropages_formosus
ENSATEG00000020930	urb2	91	72.926	ENSSMAG00000004984	urb2	100	72.669	Scophthalmus_maximus
ENSATEG00000020930	urb2	100	77.686	ENSSDUG00000000902	urb2	100	77.686	Seriola_dumerili
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ENSATEG00000020930	urb2	100	71.637	ENSSPAG00000013632	urb2	100	71.520	Stegastes_partitus
ENSATEG00000020930	urb2	100	35.056	ENSSSCG00000010186	URB2	100	35.115	Sus_scrofa
ENSATEG00000020930	urb2	99	37.048	ENSTGUG00000009990	URB2	99	36.860	Taeniopygia_guttata
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ENSATEG00000020930	urb2	95	58.562	ENSTNIG00000017689	urb2	99	58.105	Tetraodon_nigroviridis
ENSATEG00000020930	urb2	96	80.952	ENSTTRG00000014864	URB2	91	80.952	Tursiops_truncatus
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.247	ENSUAMG00000015022	URB2	100	34.344	Ursus_americanus
ENSATEG00000020930	urb2	100	34.422	ENSUMAG00000004728	URB2	100	34.577	Ursus_maritimus
ENSATEG00000020930	urb2	54	62.676	ENSVPAG00000001750	-	51	62.676	Vicugna_pacos
ENSATEG00000020930	urb2	99	34.269	ENSVVUG00000006747	URB2	99	34.366	Vulpes_vulpes
ENSATEG00000020930	urb2	99	33.508	ENSXETG00000023331	urb2	99	33.449	Xenopus_tropicalis
ENSATEG00000020930	urb2	100	61.352	ENSXMAG00000015059	urb2	100	61.589	Xiphophorus_maculatus