EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000022222 (Gene tree)
Gene ID: 113166732
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: ADP ribosylation factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4632 bases
Position: chrOOHO01000023.1:13056946-13061577
Accession: 113166732
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000032271	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000032743	-	2976	XM_026366859	ENSATEP00000032271	181 (aa)	XP_026203698	UPI00000012C8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSATEG00000022222	-	92	43.678	ENSATEG00000010065	-	86	43.678
ENSATEG00000022222	-	90	66.258	ENSATEG00000000391	-	98	66.258
ENSATEG00000022222	-	98	48.588	ENSATEG00000000181	arl5c	98	48.588
ENSATEG00000022222	-	99	43.333	ENSATEG00000018332	-	96	43.333
ENSATEG00000022222	-	96	47.486	ENSATEG00000019469	arl4cb	91	47.486
ENSATEG00000022222	-	98	68.927	ENSATEG00000003847	-	98	68.927
ENSATEG00000022222	-	98	48.876	ENSATEG00000003498	arl5a	99	48.876
ENSATEG00000022222	-	99	90.503	ENSATEG00000005611	-	99	90.503
ENSATEG00000022222	-	78	32.168	ENSATEG00000003466	sar1ab	72	32.168
ENSATEG00000022222	-	96	32.759	ENSATEG00000024817	arl8ba	94	32.759
ENSATEG00000022222	-	98	56.180	ENSATEG00000005559	arl1	96	56.180
ENSATEG00000022222	-	100	92.818	ENSATEG00000003174	-	100	92.818
ENSATEG00000022222	-	92	46.988	ENSATEG00000003947	arl3	91	46.988
ENSATEG00000022222	-	92	44.767	ENSATEG00000003663	arl4aa	85	44.767
ENSATEG00000022222	-	96	33.155	ENSATEG00000002756	arfrp1	92	33.155
ENSATEG00000022222	-	72	30.534	ENSATEG00000012904	sar1b	66	30.534
ENSATEG00000022222	-	88	42.945	ENSATEG00000001425	-	87	42.945
ENSATEG00000022222	-	92	46.108	ENSATEG00000008185	arl3l2	89	46.108
ENSATEG00000022222	-	90	49.383	ENSATEG00000004632	arl8	97	49.383
ENSATEG00000022222	-	98	80.226	ENSATEG00000001302	-	98	80.226
ENSATEG00000022222	-	78	32.394	ENSATEG00000023368	-	72	32.394
ENSATEG00000022222	-	96	65.318	ENSATEG00000003808	-	98	65.318
ENSATEG00000022222	-	90	50.000	ENSATEG00000016272	arl2	89	50.000
ENSATEG00000022222	-	100	45.213	ENSATEG00000013007	-	95	45.213
ENSATEG00000022222	-	99	80.556	ENSATEG00000003053	ARF5	100	80.556
ENSATEG00000022222	-	100	93.370	ENSATEG00000009653	arf2b	100	93.370
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSATEG00000001951	arf3b	100	100.000
ENSATEG00000022222	-	96	32.184	ENSATEG00000009204	arl8bb	94	32.184

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSG00000134287	ARF3	100	100.000	Homo_sapiens
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSG00000143761	ARF1	100	96.133	Homo_sapiens
ENSATEG00000022222	-	97	100.000	ENSAPOG00000015419	arf3b	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000022222	-	99	88.333	ENSAPOG00000014968	-	100	88.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000022222	-	100	91.713	ENSAPOG00000023828	arf2a	100	91.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSAPOG00000014921	-	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000022222	-	100	93.370	ENSAPOG00000021053	-	100	93.370	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSAMEG00000016301	ARF1	100	96.133	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSAMEG00000007042	-	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000022222	-	100	93.923	ENSAMEG00000004184	-	100	93.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSACIG00000022896	arf3b	100	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSACIG00000016782	-	100	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000022222	-	99	88.889	ENSACIG00000019050	-	100	88.889	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000022222	-	100	93.370	ENSACIG00000012912	arf2b	82	93.370	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000022222	-	99	100.000	ENSAOCG00000007571	arf3b	97	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000022222	-	100	92.818	ENSAOCG00000001809	arf2b	100	92.818	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSAOCG00000013349	-	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSAPEG00000016302	arf3b	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSATEG00000022222	-	100	92.818	ENSAPEG00000003390	arf2b	100	92.818	Amphiprion_percula
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSAPEG00000002821	-	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSACAG00000006923	ARF1	100	96.133	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSACAG00000008240	-	100	100.000	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSANAG00000036021	-	84	96.133	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000022222	-	95	83.721	ENSANAG00000023642	-	89	83.030	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000022222	-	94	82.456	ENSANAG00000021775	-	77	82.456	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSANAG00000025111	-	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSACLG00000006072	-	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSACLG00000024971	arf3b	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000022222	-	100	93.370	ENSACLG00000022124	arf2b	100	93.370	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000022222	-	99	91.061	ENSACLG00000017387	-	99	91.061	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSAMXG00000016434	arf3a	79	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000022222	-	100	95.028	ENSAMXG00000035742	arf2a	100	95.028	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000022222	-	100	95.028	ENSAMXG00000037485	arf2b	100	95.028	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSBTAG00000051755	ARF3	100	100.000	Bos_taurus
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSBTAG00000007725	ARF1	100	96.133	Bos_taurus
ENSATEG00000022222	-	100	94.475	ENSBTAG00000006785	ARF2	100	94.475	Bos_taurus
ENSATEG00000022222	-	100	92.265	WBGene00000182	arf-1.2	100	92.265	Caenorhabditis_elegans
ENSATEG00000022222	-	92	91.018	ENSCJAG00000041786	-	95	91.018	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCJAG00000020800	-	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000022222	-	100	93.923	ENSCAFG00000029422	-	100	93.923	Canis_familiaris
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCAFG00020013389	-	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000022222	-	100	93.923	ENSCAFG00020026857	-	100	93.923	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCAFG00020005724	ARF1	100	96.133	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCHIG00000010924	ARF1	100	96.133	Capra_hircus
ENSATEG00000022222	-	100	94.475	ENSCHIG00000027099	-	100	94.475	Capra_hircus
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCHIG00000019252	-	100	100.000	Capra_hircus
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSTSYG00000027538	ARF1	100	96.133	Carlito_syrichta
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSTSYG00000011564	-	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCAPG00000002502	ARF1	100	96.133	Cavia_aperea
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCPOG00000039117	ARF1	100	96.133	Cavia_porcellus
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCPOG00000040787	-	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCCAG00000023374	-	100	96.133	Cebus_capucinus
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCCAG00000025067	-	83	96.133	Cebus_capucinus
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCCAG00000037739	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCATG00000033929	-	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCATG00000034162	-	100	96.133	Cercocebus_atys
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCLAG00000003101	-	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000022222	-	100	91.713	ENSCLAG00000007475	-	100	91.713	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCLAG00000000520	ARF1	100	96.133	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCSAG00000016460	ARF1	100	96.133	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCSAG00000006224	-	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCPBG00000001732	ARF1	100	96.133	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCPBG00000019994	-	100	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000022222	-	100	93.370	ENSCPBG00000018544	-	100	93.370	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000022222	-	100	82.873	ENSCING00000021790	-	99	82.873	Ciona_intestinalis
ENSATEG00000022222	-	100	78.571	ENSCING00000020806	-	99	78.571	Ciona_intestinalis
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ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCANG00000031504	-	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCANG00000035715	-	100	96.133	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000022222	-	100	96.133	ENSCANG00000030439	-	100	96.133	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCGRG00001004437	Arf3	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
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ENSATEG00000022222	-	100	94.475	ENSCGRG00001001863	Arf2	100	94.475	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCGRG00000006593	Arf3	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000022222	-	98	88.764	ENSCSEG00000012285	-	99	88.764	Cynoglossus_semilaevis
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ENSATEG00000022222	-	100	100.000	ENSCSEG00000003101	arf3b	100	100.000	Cynoglossus_semilaevis
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