EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000023043 (Gene tree)
Gene ID: 113167450
Gene Symbol: APOBEC2
Alias: apo2b
Full Name: probable C->U-editing enzyme APOBEC-2
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3048 bases
Position: chrOOHO01000023.1:13820331-13823378
Accession: 113167450
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000033434	APOBEC_N	PF08210.11	4.5e-45	1	1
ENSATEP00000033434	APOBEC_C	PF05240.14	8.1e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000033920	APOBEC2-201	1138	-	ENSATEP00000033434	269 (aa)	XP_026223862	UPI000E45493D

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSATEG00000023043	APOBEC2	89	52.191	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	59.429
ENSATEG00000023043	APOBEC2	62	33.721	ENSATEG00000022035	aicda	85	33.721

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	ENSG00000124701	APOBEC2	85	59.686	Homo_sapiens
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	84.758	ENSAPOG00000019390	apobec2b	100	84.758	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	64	56.111	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	89	48.214	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000023043	APOBEC2	71	55.208	ENSACIG00000016370	apobec2a	83	51.643	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	82.528	ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	75.465	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	49.817	ENSAOCG00000003291	apobec2a	88	56.944	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	85.130	ENSAOCG00000023355	apobec2b	100	85.130	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000023043	APOBEC2	99	50.368	ENSAPEG00000003630	apobec2a	87	56.744	Amphiprion_percula
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	84.758	ENSAPEG00000004591	apobec2b	100	84.758	Amphiprion_percula
ENSATEG00000023043	APOBEC2	81	49.778	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	99	50.000	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000023043	APOBEC2	70	51.031	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	53.933	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	ENSANAG00000026993	APOBEC2	85	59.686	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	81.784	ENSACLG00000007634	APOBEC2	100	81.784	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000023043	APOBEC2	64	59.302	ENSACLG00000026736	-	97	59.302	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000023043	APOBEC2	82	59.471	ENSAMXG00000015966	apobec2b	100	56.537	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	99	48.905	ENSAMXG00000042992	apobec2a	83	58.216	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	70	55.000	Bos_taurus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	54.545	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.162	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	85	59.162	Canis_familiaris
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.162	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	85	59.162	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.115	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	98	53.182	Capra_hircus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	99	52.889	Carlito_syrichta
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.639	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	84	58.639	Cavia_aperea
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.639	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	84	58.639	Cavia_porcellus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	85	59.686	Cebus_capucinus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	60.209	ENSCATG00000010691	APOBEC2	85	60.209	Cercocebus_atys
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.162	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	84	59.162	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	60.209	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	98	54.545	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	64	57.222	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	57.222	Choloepus_hoffmanni
ENSATEG00000023043	APOBEC2	67	56.216	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	96	51.121	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	60.209	ENSCANG00000035072	APOBEC2	98	54.545	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.115	ENSCGRG00001014983	Apobec2	85	58.115	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.115	ENSCGRG00000007835	Apobec2	85	58.115	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000023043	APOBEC2	70	75.532	ENSCSEG00000000690	-	100	61.993	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000023043	APOBEC2	91	51.383	ENSCSEG00000020201	apobec2a	87	55.963	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	76.208	ENSCVAG00000012342	apobec2b	100	74.349	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	53.237	ENSDARG00000018881	apobec2a	94	53.237	Danio_rerio
ENSATEG00000023043	APOBEC2	84	62.069	ENSDARG00000113992	apobec2b	100	57.500	Danio_rerio
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	41.538	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	99	38.938	Dasypus_novemcinctus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	57.592	ENSDORG00000006447	Apobec2	83	57.592	Dipodomys_ordii
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.639	ENSETEG00000000624	APOBEC2	83	58.639	Echinops_telfairi
ENSATEG00000023043	APOBEC2	58	58.491	ENSEASG00005002937	APOBEC2	83	58.491	Equus_asinus_asinus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.639	ENSECAG00000006576	APOBEC2	85	58.639	Equus_caballus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.162	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	85	59.686	Erinaceus_europaeus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	70	62.963	ENSELUG00000003736	apobec2a	74	59.809	Esox_lucius
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.639	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	85	58.639	Felis_catus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	48.404	ENSFALG00000003910	APOBEC2	96	46.262	Ficedula_albicollis
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.639	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	85	58.639	Fukomys_damarensis
ENSATEG00000023043	APOBEC2	79	82.075	ENSFHEG00000005492	apobec2b	100	70.632	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	77	72.727	ENSGMOG00000006819	apobec2b	100	59.712	Gadus_morhua
ENSATEG00000023043	APOBEC2	64	60.227	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	60.227	Gadus_morhua
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	57.143	ENSGALG00000003226	APOBEC2	95	53.271	Gallus_gallus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	77.695	ENSGAFG00000007634	apobec2b	87	75.836	Gambusia_affinis
ENSATEG00000023043	APOBEC2	69	59.574	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	59.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	77.323	ENSGACG00000009663	apobec2b	99	85.135	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	67	56.216	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	98	50.885	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	98	53.540	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	80.669	ENSHBUG00000005993	apobec2b	100	80.669	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000023043	APOBEC2	79	57.658	ENSHBUG00000015890	apobec2a	90	57.658	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000023043	APOBEC2	74	55.502	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	92	55.502	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000023043	APOBEC2	74	55.502	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	92	55.502	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000023043	APOBEC2	91	49.194	ENSHCOG00000020319	apobec2a	78	60.000	Hippocampus_comes
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	76.384	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	100	74.170	Hippocampus_comes
ENSATEG00000023043	APOBEC2	77	56.604	ENSIPUG00000017355	apobec2a	64	54.464	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	56.475	ENSIPUG00000013784	Apobec2	100	56.989	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	75	56.667	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	99	54.299	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.115	ENSJJAG00000009733	Apobec2	98	53.182	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	99	77.239	ENSKMAG00000020631	apobec2b	99	73.881	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	72.500	ENSLBEG00000009422	-	100	75.089	Labrus_bergylta
ENSATEG00000023043	APOBEC2	87	52.500	ENSLBEG00000025214	apobec2a	90	55.760	Labrus_bergylta
ENSATEG00000023043	APOBEC2	84	56.332	ENSLACG00000015985	APOBEC2	96	56.696	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000023043	APOBEC2	73	62.687	ENSLOCG00000012415	apobec2b	99	53.791	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	85	59.686	Loxodonta_africana
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	60.209	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	98	54.545	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	60.209	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	98	54.545	Macaca_mulatta
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	60.209	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	98	54.545	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	60.209	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	98	54.545	Mandrillus_leucophaeus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	86	56.596	ENSMAMG00000023685	apobec2a	86	58.904	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	84.615	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	100	83.883	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	79	57.207	ENSMZEG00005005240	-	94	57.207	Maylandia_zebra
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	82.156	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	100	82.156	Maylandia_zebra
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	57.143	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	55.307	Meleagris_gallopavo
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.639	ENSMAUG00000011016	Apobec2	85	58.639	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	ENSMICG00000043339	APOBEC2	85	59.686	Microcebus_murinus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.162	ENSMOCG00000001904	Apobec2	85	59.162	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	79.182	ENSMMOG00000008681	apobec2b	100	76.952	Mola_mola
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	56.842	ENSMODG00000013090	APOBEC2	99	51.364	Monodelphis_domestica
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	78.148	ENSMALG00000013779	APOBEC2	100	77.491	Monopterus_albus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	86	51.464	ENSMALG00000020523	apobec2a	85	56.398	Monopterus_albus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	57.592	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	85	57.592	Mus_caroli
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	57.592	ENSMUSG00000040694	Apobec2	85	57.592	Mus_musculus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	57.592	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	57.592	Mus_pahari
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	60.209	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	97	54.222	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.115	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	99	51.754	Myotis_lucifugus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.115	ENSNGAG00000013717	Apobec2	85	58.115	Nannospalax_galili
ENSATEG00000023043	APOBEC2	86	55.794	ENSNBRG00000021776	apobec2a	88	57.991	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	81.784	ENSNBRG00000018806	apobec2b	89	81.784	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	59.686	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	57.368	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	99	51.818	Notamacropus_eugenii
ENSATEG00000023043	APOBEC2	77	55.300	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	93	55.300	Ochotona_princeps
ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.162	ENSODEG00000016183	APOBEC2	83	59.162	Octodon_degus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	80	60.092	ENSONIG00000004644	-	88	60.092	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	83.271	ENSONIG00000012289	apobec2b	100	83.271	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	61	54.762	ENSOANG00000000824	APOBEC2	99	53.039	Ornithorhynchus_anatinus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	76	55.399	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	93	55.300	Oryctolagus_cuniculus
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	82.156	ENSORLG00000022372	APOBEC2	100	79.182	Oryzias_latipes
ENSATEG00000023043	APOBEC2	83	56.140	ENSORLG00000010752	apobec2a	95	56.444	Oryzias_latipes
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	82.528	ENSORLG00020006164	APOBEC2	100	79.554	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000023043	APOBEC2	83	56.140	ENSORLG00020004153	apobec2a	95	56.444	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	82.156	ENSORLG00015022089	-	100	79.554	Oryzias_latipes_hsok
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