EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSATEG00000024154 (Gene tree)
Gene ID: 113154461
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anabas_testudineus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12175 bases
Position: chrOOHO01000017.1:5942660-5954834
Accession: 113154461
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSATEP00000035151	PseudoU_synth_1	PF01416.20	5.3e-32	1	2
ENSATEP00000035151	PseudoU_synth_1	PF01416.20	5.3e-32	2	2
ENSATEP00000035148	PseudoU_synth_1	PF01416.20	2.1e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSATET00000035656	-	4165	-	ENSATEP00000035148	300 (aa)	-	-
ENSATET00000035659	-	4089	-	ENSATEP00000035151	299 (aa)	XP_026204475	UPI000E4565BB

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSATEG00000024154	pusl1	92	51.087	ENSG00000169972	PUSL1	97	47.967	Homo_sapiens
ENSATEG00000024154	pusl1	95	77.739	ENSAPOG00000016290	pusl1	95	77.739	Acanthochromis_polyacanthus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.362	ENSAMEG00000013752	PUSL1	90	50.362	Ailuropoda_melanoleuca
ENSATEG00000024154	pusl1	92	76.642	ENSACIG00000015240	pusl1	100	76.642	Amphilophus_citrinellus
ENSATEG00000024154	pusl1	99	74.747	ENSAOCG00000019419	pusl1	89	74.747	Amphiprion_ocellaris
ENSATEG00000024154	pusl1	95	77.385	ENSAPEG00000005452	pusl1	95	77.385	Amphiprion_percula
ENSATEG00000024154	pusl1	92	52.899	ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	52.899	Anas_platyrhynchos
ENSATEG00000024154	pusl1	85	57.031	ENSACAG00000014111	PUSL1	97	57.031	Anolis_carolinensis
ENSATEG00000024154	pusl1	93	51.071	ENSANAG00000037456	PUSL1	91	51.071	Aotus_nancymaae
ENSATEG00000024154	pusl1	99	77.441	ENSACLG00000008675	pusl1	99	77.441	Astatotilapia_calliptera
ENSATEG00000024154	pusl1	94	62.633	ENSAMXG00000044007	pusl1	95	62.633	Astyanax_mexicanus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	51.087	ENSBTAG00000007619	PUSL1	94	51.087	Bos_taurus
ENSATEG00000024154	pusl1	93	50.714	ENSCJAG00000010972	PUSL1	91	50.714	Callithrix_jacchus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	48.551	ENSCAFG00000019291	PUSL1	90	48.551	Canis_familiaris
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.638	ENSCAFG00020011568	PUSL1	89	49.638	Canis_lupus_dingo
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.725	ENSCHIG00000012615	PUSL1	95	50.725	Capra_hircus
ENSATEG00000024154	pusl1	91	48.000	ENSCPOG00000005149	PUSL1	89	48.000	Cavia_porcellus
ENSATEG00000024154	pusl1	93	50.714	ENSCCAG00000027475	PUSL1	91	50.714	Cebus_capucinus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	51.079	ENSCATG00000018260	PUSL1	90	51.079	Cercocebus_atys
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.275	ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	49.275	Chinchilla_lanigera
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.719	ENSCSAG00000000680	PUSL1	90	50.719	Chlorocebus_sabaeus
ENSATEG00000024154	pusl1	93	56.989	ENSCPBG00000022621	PUSL1	95	56.989	Chrysemys_picta_bellii
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.719	ENSCANG00000034373	PUSL1	90	50.719	Colobus_angolensis_palliatus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.097	ENSCGRG00001012429	Pusl1	94	49.097	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.097	ENSCGRG00000006466	Pusl1	94	49.097	Cricetulus_griseus_crigri
ENSATEG00000024154	pusl1	97	72.449	ENSCSEG00000005159	pusl1	99	72.449	Cynoglossus_semilaevis
ENSATEG00000024154	pusl1	79	62.025	ENSCVAG00000012923	pusl1	91	62.025	Cyprinodon_variegatus
ENSATEG00000024154	pusl1	97	65.398	ENSDARG00000074565	pusl1	100	63.889	Danio_rerio
ENSATEG00000024154	pusl1	93	33.443	FBgn0083976	CG34140	99	33.443	Drosophila_melanogaster
ENSATEG00000024154	pusl1	91	49.819	ENSECAG00000006248	PUSL1	89	49.819	Equus_caballus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	47.482	ENSEEUG00000000837	PUSL1	93	47.482	Erinaceus_europaeus
ENSATEG00000024154	pusl1	96	65.854	ENSELUG00000015945	pusl1	97	65.854	Esox_lucius
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.000	ENSFCAG00000007617	PUSL1	91	50.000	Felis_catus
ENSATEG00000024154	pusl1	96	76.042	ENSFHEG00000006370	pusl1	96	76.042	Fundulus_heteroclitus
ENSATEG00000024154	pusl1	94	72.954	ENSGMOG00000019388	pusl1	99	72.954	Gadus_morhua
ENSATEG00000024154	pusl1	93	52.500	ENSGALG00000001714	PUSL1	96	52.500	Gallus_gallus
ENSATEG00000024154	pusl1	96	74.216	ENSGAFG00000007546	pusl1	98	74.216	Gambusia_affinis
ENSATEG00000024154	pusl1	99	71.906	ENSGACG00000007848	pusl1	99	71.906	Gasterosteus_aculeatus
ENSATEG00000024154	pusl1	96	54.704	ENSGAGG00000004730	PUSL1	98	54.704	Gopherus_agassizii
ENSATEG00000024154	pusl1	80	51.452	ENSGGOG00000005364	PUSL1	93	51.452	Gorilla_gorilla
ENSATEG00000024154	pusl1	99	77.778	ENSHBUG00000001264	pusl1	99	77.778	Haplochromis_burtoni
ENSATEG00000024154	pusl1	97	45.734	ENSHGLG00000017570	PUSL1	94	45.734	Heterocephalus_glaber_female
ENSATEG00000024154	pusl1	82	48.193	ENSHGLG00100007641	PUSL1	82	48.193	Heterocephalus_glaber_male
ENSATEG00000024154	pusl1	94	71.530	ENSHCOG00000010077	pusl1	100	72.464	Hippocampus_comes
ENSATEG00000024154	pusl1	93	66.308	ENSIPUG00000023921	pusl1	96	66.308	Ictalurus_punctatus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.362	ENSSTOG00000001783	PUSL1	85	50.362	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSATEG00000024154	pusl1	93	50.000	ENSJJAG00000020471	Pusl1	94	50.000	Jaculus_jaculus
ENSATEG00000024154	pusl1	88	71.591	ENSKMAG00000005154	pusl1	90	71.591	Kryptolebias_marmoratus
ENSATEG00000024154	pusl1	98	75.685	ENSLBEG00000013469	pusl1	100	75.685	Labrus_bergylta
ENSATEG00000024154	pusl1	64	54.404	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	54.404	Latimeria_chalumnae
ENSATEG00000024154	pusl1	99	54.362	ENSLOCG00000002210	pusl1	98	54.362	Lepisosteus_oculatus
ENSATEG00000024154	pusl1	82	51.613	ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	51.613	Loxodonta_africana
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.719	ENSMFAG00000046288	PUSL1	90	50.719	Macaca_fascicularis
ENSATEG00000024154	pusl1	92	43.525	ENSMMUG00000016279	PUSL1	89	43.525	Macaca_mulatta
ENSATEG00000024154	pusl1	92	51.812	ENSMNEG00000037989	PUSL1	90	51.812	Macaca_nemestrina
ENSATEG00000024154	pusl1	99	79.054	ENSMAMG00000016538	pusl1	98	79.054	Mastacembelus_armatus
ENSATEG00000024154	pusl1	99	77.441	ENSMZEG00005026990	pusl1	99	77.441	Maylandia_zebra
ENSATEG00000024154	pusl1	93	51.071	ENSMGAG00000003037	PUSL1	95	51.071	Meleagris_gallopavo
ENSATEG00000024154	pusl1	92	48.736	ENSMAUG00000019924	Pusl1	94	48.736	Mesocricetus_auratus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.725	ENSMICG00000014171	PUSL1	93	50.725	Microcebus_murinus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.181	ENSMOCG00000005602	Pusl1	94	50.181	Microtus_ochrogaster
ENSATEG00000024154	pusl1	93	74.286	ENSMMOG00000003269	pusl1	100	74.286	Mola_mola
ENSATEG00000024154	pusl1	99	78.930	ENSMALG00000021686	pusl1	99	78.930	Monopterus_albus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	48.921	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	94	48.921	Mus_caroli
ENSATEG00000024154	pusl1	92	48.561	ENSMUSG00000051557	Pusl1	94	48.561	Mus_musculus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.281	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	94	49.281	Mus_pahari
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.281	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	94	49.281	Mus_spretus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.181	ENSMPUG00000014313	PUSL1	90	50.181	Mustela_putorius_furo
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.281	ENSNGAG00000004647	Pusl1	82	49.281	Nannospalax_galili
ENSATEG00000024154	pusl1	82	74.390	ENSNBRG00000014762	pusl1	89	74.390	Neolamprologus_brichardi
ENSATEG00000024154	pusl1	83	52.610	ENSNLEG00000000051	PUSL1	90	52.610	Nomascus_leucogenys
ENSATEG00000024154	pusl1	91	42.857	ENSMEUG00000005176	-	98	42.857	Notamacropus_eugenii
ENSATEG00000024154	pusl1	92	53.791	ENSMEUG00000011649	-	96	53.791	Notamacropus_eugenii
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.638	ENSODEG00000008247	PUSL1	88	49.638	Octodon_degus
ENSATEG00000024154	pusl1	99	77.104	ENSONIG00000019361	pusl1	98	77.104	Oreochromis_niloticus
ENSATEG00000024154	pusl1	98	70.748	ENSORLG00000016228	pusl1	99	70.748	Oryzias_latipes
ENSATEG00000024154	pusl1	95	72.632	ENSORLG00020013710	pusl1	96	72.632	Oryzias_latipes_hni
ENSATEG00000024154	pusl1	94	72.598	ENSORLG00015008715	pusl1	99	72.598	Oryzias_latipes_hsok
ENSATEG00000024154	pusl1	95	72.632	ENSOMEG00000018897	pusl1	98	72.632	Oryzias_melastigma
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.275	ENSOGAG00000031692	PUSL1	95	49.275	Otolemur_garnettii
ENSATEG00000024154	pusl1	82	51.210	ENSOARG00000004905	PUSL1	92	51.210	Ovis_aries
ENSATEG00000024154	pusl1	92	51.449	ENSPPAG00000029283	PUSL1	90	51.449	Pan_paniscus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.000	ENSPPRG00000023329	PUSL1	91	50.000	Panthera_pardus
ENSATEG00000024154	pusl1	82	51.210	ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	51.210	Panthera_tigris_altaica
ENSATEG00000024154	pusl1	92	51.087	ENSPTRG00000000021	PUSL1	90	51.087	Pan_troglodytes
ENSATEG00000024154	pusl1	95	49.658	ENSPANG00000000591	PUSL1	95	49.658	Papio_anubis
ENSATEG00000024154	pusl1	94	63.958	ENSPKIG00000002447	pusl1	97	63.958	Paramormyrops_kingsleyae
ENSATEG00000024154	pusl1	84	59.684	ENSPSIG00000002781	PUSL1	94	59.684	Pelodiscus_sinensis
ENSATEG00000024154	pusl1	92	69.203	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	69.203	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.903	ENSPEMG00000013541	Pusl1	94	50.903	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSATEG00000024154	pusl1	93	51.418	ENSPCIG00000007816	-	64	51.418	Phascolarctos_cinereus
ENSATEG00000024154	pusl1	95	74.035	ENSPFOG00000015448	pusl1	94	74.035	Poecilia_formosa
ENSATEG00000024154	pusl1	95	74.912	ENSPLAG00000004348	pusl1	95	74.912	Poecilia_latipinna
ENSATEG00000024154	pusl1	95	74.912	ENSPMEG00000000931	pusl1	95	74.912	Poecilia_mexicana
ENSATEG00000024154	pusl1	95	74.205	ENSPREG00000002324	pusl1	95	74.205	Poecilia_reticulata
ENSATEG00000024154	pusl1	85	49.020	ENSPPYG00000002014	PUSL1	91	49.020	Pongo_abelii
ENSATEG00000024154	pusl1	63	49.735	ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	49.735	Procavia_capensis
ENSATEG00000024154	pusl1	67	55.556	ENSPVAG00000001016	PUSL1	66	55.556	Pteropus_vampyrus
ENSATEG00000024154	pusl1	80	79.583	ENSPNYG00000006588	pusl1	100	79.583	Pundamilia_nyererei
ENSATEG00000024154	pusl1	94	63.830	ENSPNAG00000024441	pusl1	97	63.830	Pygocentrus_nattereri
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.458	ENSRNOG00000022354	Pusl1	94	49.458	Rattus_norvegicus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.360	ENSRBIG00000036842	PUSL1	90	50.360	Rhinopithecus_bieti
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.360	ENSRROG00000030704	PUSL1	90	50.360	Rhinopithecus_roxellana
ENSATEG00000024154	pusl1	87	49.064	ENSSBOG00000032249	PUSL1	90	50.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSATEG00000024154	pusl1	51	52.941	ENSSHAG00000004840	-	84	49.390	Sarcophilus_harrisii
ENSATEG00000024154	pusl1	93	63.082	ENSSFOG00015008281	pusl1	92	63.082	Scleropages_formosus
ENSATEG00000024154	pusl1	99	77.181	ENSSMAG00000007187	pusl1	99	77.181	Scophthalmus_maximus
ENSATEG00000024154	pusl1	98	78.231	ENSSDUG00000000287	pusl1	91	78.231	Seriola_dumerili
ENSATEG00000024154	pusl1	99	77.181	ENSSLDG00000009605	pusl1	95	77.181	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSATEG00000024154	pusl1	56	51.497	ENSSARG00000005323	-	88	51.497	Sorex_araneus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	70.438	ENSSPAG00000002528	pusl1	100	70.438	Stegastes_partitus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	50.719	ENSSSCG00000003338	PUSL1	89	50.719	Sus_scrofa
ENSATEG00000024154	pusl1	91	53.285	ENSTGUG00000003214	PUSL1	96	53.455	Taeniopygia_guttata
ENSATEG00000024154	pusl1	96	74.653	ENSTRUG00000010102	pusl1	97	74.653	Takifugu_rubripes
ENSATEG00000024154	pusl1	61	70.718	ENSTNIG00000005789	pusl1	82	70.718	Tetraodon_nigroviridis
ENSATEG00000024154	pusl1	59	43.889	ENSTBEG00000005001	PUSL1	74	43.889	Tupaia_belangeri
ENSATEG00000024154	pusl1	92	44.803	ENSTTRG00000017030	PUSL1	90	44.803	Tursiops_truncatus
ENSATEG00000024154	pusl1	80	50.826	ENSUAMG00000012801	PUSL1	79	50.826	Ursus_americanus
ENSATEG00000024154	pusl1	80	51.240	ENSUMAG00000002084	PUSL1	79	51.240	Ursus_maritimus
ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.638	ENSVVUG00000004320	PUSL1	90	43.949	Vulpes_vulpes
ENSATEG00000024154	pusl1	75	54.667	ENSXETG00000011145	pusl1	98	54.667	Xenopus_tropicalis
ENSATEG00000024154	pusl1	94	71.174	ENSXCOG00000017748	pusl1	99	71.174	Xiphophorus_couchianus
ENSATEG00000024154	pusl1	95	75.618	ENSXMAG00000018846	pusl1	95	75.618	Xiphophorus_maculatus