EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSBTAG00000001651 (Gene tree)
Gene ID: 522372
Gene Symbol: SYF2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Bos_taurus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5319 bases
Position: chr2:127725940-127731258
Accession: 35512
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSBTAP00000069820	SYF2	PF08231.12	5.5e-54	1	1
ENSBTAP00000002165	SYF2	PF08231.12	6.3e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSBTAT00000083714	-	1246	-	ENSBTAP00000069820	236 (aa)	-	UPI0000F33E8B
ENSBTAT00000002165	-	1027	-	ENSBTAP00000002165	245 (aa)	XP_024838322	F1N607

Gene Model

Click here to download ENSBTAG00000001651's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
bta03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSBTAG00000001651's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	91.837	ENSG00000117614	SYF2	100	92.245	Homo_sapiens
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	84.234	ENSAPOG00000001174	syf2	97	81.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSBTAG00000001651	SYF2	83	97.436	ENSAMEG00000010134	-	100	97.436	Ailuropoda_melanoleuca
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.937	ENSAMEG00000010115	-	98	94.937	Ailuropoda_melanoleuca
ENSBTAG00000001651	SYF2	97	79.399	ENSACIG00000023688	syf2	93	79.399	Amphilophus_citrinellus
ENSBTAG00000001651	SYF2	91	81.308	ENSAOCG00000010912	syf2	66	81.308	Amphiprion_ocellaris
ENSBTAG00000001651	SYF2	98	82.684	ENSAOCG00000022046	syf2	97	82.684	Amphiprion_ocellaris
ENSBTAG00000001651	SYF2	98	82.684	ENSAPEG00000018858	syf2	88	82.684	Amphiprion_percula
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	97	79.828	Anabas_testudineus
ENSBTAG00000001651	SYF2	84	88.945	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	Anas_platyrhynchos
ENSBTAG00000001651	SYF2	86	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSBTAG00000001651	SYF2	70	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSBTAG00000001651	SYF2	97	96.070	ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.653	Aotus_nancymaae
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	81.081	ENSACLG00000019916	syf2	97	78.112	Astatotilapia_calliptera
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	78.481	ENSAMXG00000004051	syf2	99	78.481	Astyanax_mexicanus
ENSBTAG00000001651	SYF2	88	50.952	WBGene00019402	syf-2	99	47.863	Caenorhabditis_elegans
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.492	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.653	Callithrix_jacchus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.937	ENSCAFG00000012895	-	100	94.309	Canis_familiaris
ENSBTAG00000001651	SYF2	96	88.106	ENSCAFG00000030331	-	97	88.106	Canis_familiaris
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.937	ENSCAFG00020021091	-	100	94.309	Canis_lupus_dingo
ENSBTAG00000001651	SYF2	77	89.011	ENSCAFG00020021094	-	83	97.436	Canis_lupus_dingo
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	99.153	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	97.959	Capra_hircus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.068	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.061	Carlito_syrichta
ENSBTAG00000001651	SYF2	84	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	95.299	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.469	Cavia_porcellus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.915	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	93.061	Cebus_capucinus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	ENSCATG00000026917	SYF2	100	91.837	Cercocebus_atys
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.915	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.469	Chinchilla_lanigera
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.429	Chlorocebus_sabaeus
ENSBTAG00000001651	SYF2	77	77.901	ENSCHOG00000005273	-	100	77.901	Choloepus_hoffmanni
ENSBTAG00000001651	SYF2	95	88.444	ENSCPBG00000025073	SYF2	97	84.647	Chrysemys_picta_bellii
ENSBTAG00000001651	SYF2	89	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSBTAG00000001651	SYF2	89	51.643	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.643	Ciona_savignyi
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	80.085	ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.776	Colobus_angolensis_palliatus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.837	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSBTAG00000001651	SYF2	84	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.477	Cynoglossus_semilaevis
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	81.900	ENSCVAG00000019543	syf2	100	77.406	Cyprinodon_variegatus
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	78.151	ENSDARG00000004706	syf2	100	78.151	Danio_rerio
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.492	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.878	Dasypus_novemcinctus
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	93.162	ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.837	Dipodomys_ordii
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	56.364	FBgn0033556	CG12343	97	56.364	Drosophila_melanogaster
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	77.477	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.623	Echinops_telfairi
ENSBTAG00000001651	SYF2	83	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	95.745	ENSEASG00005004224	-	100	94.286	Equus_asinus_asinus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	82.449	ENSEASG00005004232	-	100	82.449	Equus_asinus_asinus
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	97.447	ENSECAG00000012023	-	100	95.918	Equus_caballus
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	95.745	ENSECAG00000010440	-	98	95.745	Equus_caballus
ENSBTAG00000001651	SYF2	74	82.857	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.522	Erinaceus_europaeus
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	85.520	ENSELUG00000003465	syf2	93	85.520	Esox_lucius
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.515	ENSFCAG00000043095	-	100	93.902	Felis_catus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.937	ENSFCAG00000010324	-	85	92.683	Felis_catus
ENSBTAG00000001651	SYF2	86	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	98	78.838	Ficedula_albicollis
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.068	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.061	Fukomys_damarensis
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	67.265	ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.265	Fundulus_heteroclitus
ENSBTAG00000001651	SYF2	91	84.186	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	Gadus_morhua
ENSBTAG00000001651	SYF2	95	87.556	ENSGALG00000013639	SYF2	92	85.776	Gallus_gallus
ENSBTAG00000001651	SYF2	98	77.155	ENSGAFG00000019435	syf2	96	77.155	Gambusia_affinis
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	82.569	ENSGACG00000007305	syf2	99	77.273	Gasterosteus_aculeatus
ENSBTAG00000001651	SYF2	95	88.889	ENSGAGG00000010670	SYF2	97	85.062	Gopherus_agassizii
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	92.245	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	92.653	Gorilla_gorilla
ENSBTAG00000001651	SYF2	97	79.399	ENSHBUG00000020477	syf2	100	79.399	Haplochromis_burtoni
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.653	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	84.685	ENSHGLG00000004304	-	96	80.435	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.653	Heterocephalus_glaber_male
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	78.243	ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.366	Hippocampus_comes
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	80.342	ENSIPUG00000019859	syf2	99	79.339	Ictalurus_punctatus
ENSBTAG00000001651	SYF2	62	97.260	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSBTAG00000001651	SYF2	84	97.990	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	Jaculus_jaculus
ENSBTAG00000001651	SYF2	97	79.310	ENSKMAG00000013856	syf2	98	79.310	Kryptolebias_marmoratus
ENSBTAG00000001651	SYF2	93	83.562	ENSLBEG00000014425	syf2	93	82.883	Labrus_bergylta
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	85.780	ENSLACG00000012064	SYF2	92	85.780	Latimeria_chalumnae
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	83.408	ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.408	Lepisosteus_oculatus
ENSBTAG00000001651	SYF2	78	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.068	ENSLAFG00000023150	-	100	93.061	Loxodonta_africana
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	91.837	Macaca_fascicularis
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	91.429	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.837	Macaca_mulatta
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	91.837	Macaca_nemestrina
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.837	Mandrillus_leucophaeus
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	82.028	ENSMAMG00000010403	syf2	97	76.446	Mastacembelus_armatus
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	81.081	ENSMZEG00005006429	syf2	95	79.476	Maylandia_zebra
ENSBTAG00000001651	SYF2	84	88.945	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	Meleagris_gallopavo
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	92.797	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.020	Mesocricetus_auratus
ENSBTAG00000001651	SYF2	84	97.487	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.245	Microtus_ochrogaster
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	79.730	ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.730	Mola_mola
ENSBTAG00000001651	SYF2	96	86.900	ENSMODG00000013951	-	100	86.900	Monodelphis_domestica
ENSBTAG00000001651	SYF2	98	79.741	ENSMALG00000010706	syf2	99	77.366	Monopterus_albus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.429	Mus_caroli
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.429	Mus_musculus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.429	Mus_pahari
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.429	Mus_spretus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.937	ENSMPUG00000015801	-	100	92.683	Mustela_putorius_furo
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	95.359	ENSMPUG00000015802	-	100	94.715	Mustela_putorius_furo
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	ENSMLUG00000001885	SYF2	97	93.220	Myotis_lucifugus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.277	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.308	Nannospalax_galili
ENSBTAG00000001651	SYF2	97	73.362	ENSNBRG00000010720	syf2	99	70.954	Neolamprologus_brichardi
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	92.245	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.653	Nomascus_leucogenys
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	92.797	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.429	Ochotona_princeps
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	83.051	ENSODEG00000014338	-	99	83.051	Octodon_degus
ENSBTAG00000001651	SYF2	97	94.760	ENSODEG00000017664	-	96	94.760	Octodon_degus
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	81.081	ENSONIG00000008213	syf2	97	78.112	Oreochromis_niloticus
ENSBTAG00000001651	SYF2	86	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.915	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.878	Oryctolagus_cuniculus
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	79.060	ENSORLG00000028820	syf2	99	79.060	Oryzias_latipes
ENSBTAG00000001651	SYF2	97	80.172	ENSORLG00020018333	syf2	98	80.172	Oryzias_latipes_hni
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	83.028	ENSORLG00015014665	syf2	92	83.028	Oryzias_latipes_hsok
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	82.883	ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.883	Oryzias_melastigma
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.068	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.061	Otolemur_garnettii
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	98.739	ENSOARG00000006348	-	100	98.381	Ovis_aries
ENSBTAG00000001651	SYF2	83	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	67.179	Ovis_aries
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	92.245	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	92.653	Pan_paniscus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	95.359	ENSPPRG00000001638	-	100	92.276	Panthera_pardus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.515	ENSPPRG00000001651	-	100	93.902	Panthera_pardus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.515	ENSPTIG00000007036	-	100	93.902	Panthera_tigris_altaica
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	98.165	ENSPTIG00000005711	-	80	98.165	Panthera_tigris_altaica
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	92.245	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.653	Pan_troglodytes
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	ENSPANG00000008139	SYF2	100	91.837	Papio_anubis
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	77.959	ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.959	Paramormyrops_kingsleyae
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	83.682	ENSPSIG00000011816	SYF2	93	83.682	Pelodiscus_sinensis
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	82.353	ENSPMGG00000008755	syf2	86	82.353	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.245	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSBTAG00000001651	SYF2	95	92.857	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	91.739	Phascolarctos_cinereus
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	77.021	ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.286	Poecilia_formosa
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	77.021	ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.021	Poecilia_latipinna
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	74.468	ENSPMEG00000011684	syf2	98	75.000	Poecilia_mexicana
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	100	75.102	Poecilia_reticulata
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.492	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	92.653	Pongo_abelii
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	63.559	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.857	Propithecus_coquereli
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	83.051	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.857	Pteropus_vampyrus
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	81.081	ENSPNYG00000004979	syf2	97	78.112	Pundamilia_nyererei
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	81.013	ENSPNAG00000015570	syf2	99	81.013	Pygocentrus_nattereri
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.429	Rattus_norvegicus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	91.525	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.796	Rhinopithecus_bieti
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.837	Rhinopithecus_roxellana
ENSBTAG00000001651	SYF2	95	97.333	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.837	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSBTAG00000001651	SYF2	87	93.204	ENSSHAG00000007152	-	100	93.204	Sarcophilus_harrisii
ENSBTAG00000001651	SYF2	96	90.749	ENSSHAG00000015630	-	100	85.141	Sarcophilus_harrisii
ENSBTAG00000001651	SYF2	95	83.482	ENSSFOG00015023647	syf2	95	83.482	Scleropages_formosus
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	77.273	ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.273	Scophthalmus_maximus
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	83.486	ENSSDUG00000013072	syf2	92	83.486	Seriola_dumerili
ENSBTAG00000001651	SYF2	92	83.486	ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.486	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	75.424	ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.102	Sorex_araneus
ENSBTAG00000001651	SYF2	98	84.914	ENSSPUG00000005251	SYF2	92	84.914	Sphenodon_punctatus
ENSBTAG00000001651	SYF2	99	78.571	ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.571	Stegastes_partitus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	97.458	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	97.143	Sus_scrofa
ENSBTAG00000001651	SYF2	63	59.603	ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.857	Taeniopygia_guttata
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	80.631	ENSTRUG00000001499	syf2	89	80.631	Takifugu_rubripes
ENSBTAG00000001651	SYF2	94	79.372	ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	Tetraodon_nigroviridis
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	70.763	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.204	Tupaia_belangeri
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	97.458	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	96.327	Tursiops_truncatus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.937	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	94.309	Ursus_americanus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.515	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.902	Ursus_maritimus
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	95.763	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	94.694	Vicugna_pacos
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.937	ENSVVUG00000027175	-	100	94.309	Vulpes_vulpes
ENSBTAG00000001651	SYF2	100	90.726	ENSVVUG00000027181	-	100	90.726	Vulpes_vulpes
ENSBTAG00000001651	SYF2	97	84.211	ENSXETG00000022797	syf2	92	84.211	Xenopus_tropicalis
ENSBTAG00000001651	SYF2	91	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	96	76.724	Xiphophorus_maculatus