EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSBTAG00000002707 (Gene tree)
Gene ID: 510372
Gene Symbol: IPO4
Alias: -
Full Name: Bos taurus importin 4 (IPO4)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Bos_taurus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10081 bases
Position: chr10:20966510-20976590
Accession: NM_001083661
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSBTAP00000036318	IBN_N	PF03810.19	4.3e-11	1	1
ENSBTAP00000063951	IBN_N	PF03810.19	4.7e-11	1	1
ENSBTAP00000070816	IBN_N	PF03810.19	1.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSBTAT00000080214	-	4322	-	ENSBTAP00000063951	1109 (aa)	-	-
ENSBTAT00000078135	-	3108	-	ENSBTAP00000070816	1035 (aa)	-	-
ENSBTAT00000036460	-	3505	-	ENSBTAP00000036318	1081 (aa)	-	A4IFB8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.472	ENSG00000196497	IPO4	100	90.472	Homo_sapiens
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.537	ENSAPOG00000019018	ipo4	99	44.815	Acanthochromis_polyacanthus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	85.305	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	84.196	Ailuropoda_melanoleuca
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.363	ENSACIG00000004246	ipo4	99	44.353	Amphilophus_citrinellus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.475	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	44.659	Amphiprion_ocellaris
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.383	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	44.567	Amphiprion_percula
ENSBTAG00000002707	IPO4	90	45.685	ENSATEG00000017082	ipo4	97	45.888	Anabas_testudineus
ENSBTAG00000002707	IPO4	86	54.088	ENSACAG00000003973	-	99	54.641	Anolis_carolinensis
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	88.899	ENSANAG00000037973	IPO4	100	88.807	Aotus_nancymaae
ENSBTAG00000002707	IPO4	98	44.247	ENSACLG00000019742	ipo4	95	45.526	Astatotilapia_calliptera
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.773	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.496	Astyanax_mexicanus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	88.899	ENSCJAG00000006937	IPO4	100	88.807	Callithrix_jacchus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	91.859	ENSCAFG00000012049	IPO4	100	91.582	Canis_familiaris
ENSBTAG00000002707	IPO4	98	91.003	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	89.691	Canis_lupus_dingo
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	97.685	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	97.685	Capra_hircus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	89.917	ENSTSYG00000002643	IPO4	100	89.917	Carlito_syrichta
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	87.419	ENSCPOG00000014783	IPO4	100	87.234	Cavia_porcellus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	89.639	ENSCCAG00000037929	IPO4	100	89.547	Cebus_capucinus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.472	ENSCATG00000040395	IPO4	100	90.472	Cercocebus_atys
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	88.437	ENSCLAG00000012817	IPO4	100	88.344	Chinchilla_lanigera
ENSBTAG00000002707	IPO4	90	56.389	ENSCPBG00000025757	IPO4	94	56.288	Chrysemys_picta_bellii
ENSBTAG00000002707	IPO4	92	36.552	ENSCING00000008639	-	99	35.799	Ciona_intestinalis
ENSBTAG00000002707	IPO4	94	35.221	ENSCSAVG00000011482	-	100	34.712	Ciona_savignyi
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.287	ENSCANG00000029513	IPO4	100	90.287	Colobus_angolensis_palliatus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	82.054	ENSCGRG00001001217	Ipo4	100	82.054	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	82.146	ENSCGRG00000014404	Ipo4	100	82.146	Cricetulus_griseus_crigri
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.318	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	43.041	Cynoglossus_semilaevis
ENSBTAG00000002707	IPO4	98	43.599	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.658	Cyprinodon_variegatus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	46.617	ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.617	Danio_rerio
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	89.177	ENSDNOG00000000366	IPO4	100	89.084	Dasypus_novemcinctus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	88.899	ENSDORG00000009274	Ipo4	100	88.807	Dipodomys_ordii
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	85.596	ENSETEG00000018381	IPO4	100	85.596	Echinops_telfairi
ENSBTAG00000002707	IPO4	91	91.641	ENSEASG00005011954	IPO4	97	91.212	Equus_asinus_asinus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	91.674	ENSECAG00000009909	IPO4	100	91.397	Equus_caballus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	46.599	ENSELUG00000020628	ipo4	99	46.734	Esox_lucius
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	92.322	ENSFCAG00000005587	IPO4	100	92.044	Felis_catus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	81.273	ENSFDAG00000000725	IPO4	100	80.598	Fukomys_damarensis
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	38.863	ENSFHEG00000009351	ipo4	95	46.332	Fundulus_heteroclitus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	45.530	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.530	Gadus_morhua
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.026	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.026	Gambusia_affinis
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	45.438	ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.161	Gasterosteus_aculeatus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.657	ENSGGOG00000016062	IPO4	100	90.657	Gorilla_gorilla
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.383	ENSHBUG00000023269	ipo4	99	44.270	Haplochromis_burtoni
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	87.974	ENSHGLG00000002923	IPO4	100	87.882	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	87.604	ENSHGLG00100003725	IPO4	100	87.512	Heterocephalus_glaber_male
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.207	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	43.285	Hippocampus_comes
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	46.809	ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.059	Ictalurus_punctatus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.009	ENSSTOG00000002288	IPO4	100	89.917	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	86.322	ENSJJAG00000019002	Ipo4	100	86.229	Jaculus_jaculus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.974	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	43.923	Kryptolebias_marmoratus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.370	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.819	Labrus_bergylta
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	50.046	ENSLACG00000001428	IPO4	99	50.046	Latimeria_chalumnae
ENSBTAG00000002707	IPO4	76	47.680	ENSLOCG00000001149	ipo4	82	47.680	Lepisosteus_oculatus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	86.494	ENSLAFG00000015852	IPO4	100	85.939	Loxodonta_africana
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.472	ENSMFAG00000000743	IPO4	100	90.472	Macaca_fascicularis
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.472	ENSMMUG00000012481	IPO4	100	90.472	Macaca_mulatta
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.379	ENSMNEG00000043531	IPO4	100	90.379	Macaca_nemestrina
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.472	ENSMLEG00000042067	IPO4	100	90.472	Mandrillus_leucophaeus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.547	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.824	Mastacembelus_armatus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.229	ENSMZEG00005017273	ipo4	99	44.455	Maylandia_zebra
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	81.423	ENSMAUG00000017565	Ipo4	100	81.793	Mesocricetus_auratus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	88.899	ENSMICG00000001719	IPO4	100	88.807	Microcebus_murinus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	80.407	ENSMOCG00000020462	Ipo4	100	80.776	Microtus_ochrogaster
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.985	ENSMMOG00000005264	ipo4	99	43.985	Mola_mola
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	72.938	ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.753	Monodelphis_domestica
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	42.870	ENSMALG00000001587	ipo4	99	42.765	Monopterus_albus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	80.222	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	80.684	Mus_caroli
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	79.963	ENSMUSG00000002319	Ipo4	100	80.517	Mus_musculus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	80.037	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	100	80.499	Mus_pahari
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	80.240	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	100	80.055	Mus_spretus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	91.489	ENSMPUG00000005916	IPO4	100	91.397	Mustela_putorius_furo
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	87.222	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	87.778	Myotis_lucifugus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	87.604	ENSNGAG00000019340	Ipo4	100	87.512	Nannospalax_galili
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.866	ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.278	Neolamprologus_brichardi
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	87.165	ENSOPRG00000016615	IPO4	100	86.981	Ochotona_princeps
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	87.604	ENSODEG00000002609	IPO4	100	87.419	Octodon_degus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.732	ENSONIG00000014574	ipo4	99	44.732	Oreochromis_niloticus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	87.165	ENSOCUG00000002881	IPO4	100	87.627	Oryctolagus_cuniculus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.871	ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.319	Oryzias_latipes
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.598	ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.321	Oryzias_latipes_hni
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.783	ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.506	Oryzias_latipes_hsok
ENSBTAG00000002707	IPO4	98	44.134	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	44.280	Oryzias_melastigma
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	88.693	ENSOGAG00000010642	IPO4	100	88.508	Otolemur_garnettii
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	95.749	ENSOARG00000019188	IPO4	100	95.749	Ovis_aries
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	89.177	ENSPPAG00000035476	IPO4	100	88.992	Pan_paniscus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	92.229	ENSPPRG00000023607	IPO4	100	91.952	Panthera_pardus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	92.322	ENSPTIG00000008720	IPO4	100	92.044	Panthera_tigris_altaica
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.379	ENSPTRG00000006200	IPO4	100	90.379	Pan_troglodytes
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.379	ENSPANG00000026278	IPO4	100	90.379	Papio_anubis
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	48.203	ENSPKIG00000007830	ipo4	99	48.387	Paramormyrops_kingsleyae
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	46.204	ENSPKIG00000007683	-	99	46.204	Paramormyrops_kingsleyae
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.566	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	43.422	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	81.608	ENSPEMG00000016160	Ipo4	100	81.701	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSBTAG00000002707	IPO4	94	75.442	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	75.344	Phascolarctos_cinereus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.383	ENSPFOG00000009255	ipo4	99	44.475	Poecilia_formosa
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.475	ENSPLAG00000020556	ipo4	99	44.567	Poecilia_latipinna
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.291	ENSPMEG00000013102	ipo4	99	44.383	Poecilia_mexicana
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.250	ENSPREG00000017605	ipo4	99	44.383	Poecilia_reticulata
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.009	ENSPPYG00000005688	IPO4	100	89.917	Pongo_abelii
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	87.535	ENSPCAG00000015669	IPO4	100	87.350	Procavia_capensis
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	89.084	ENSPCOG00000015319	IPO4	100	88.992	Propithecus_coquereli
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	91.027	ENSPVAG00000010755	IPO4	100	90.934	Pteropus_vampyrus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.860	ENSPNYG00000021414	ipo4	99	44.270	Pundamilia_nyererei
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	46.623	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	46.809	Pygocentrus_nattereri
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	82.255	ENSRNOG00000019553	Ipo4	100	82.255	Rattus_norvegicus
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.287	ENSRBIG00000027704	IPO4	100	90.287	Rhinopithecus_bieti
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	90.102	ENSRROG00000011492	IPO4	100	90.102	Rhinopithecus_roxellana
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	87.789	ENSSBOG00000020162	IPO4	100	87.697	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSBTAG00000002707	IPO4	100	73.339	ENSSHAG00000002619	IPO4	97	73.247	Sarcophilus_harrisii
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ENSBTAG00000002707	IPO4	99	48.897	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	48.346	Scleropages_formosus
ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.107	ENSSMAG00000019912	ipo4	99	44.291	Scophthalmus_maximus
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