EuRBPDB

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Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSBTAG00000003268 (Gene tree)
Gene ID: 528728
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: Bos taurus pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor (PELO)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Bos_taurus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1957 bases
Position: chr20:26268089-26270045
Accession: NM_001034566
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSBTAP00000004233	eRF1_2	PF03464.15	4.4e-37	1	1
ENSBTAP00000004233	eRF1_3	PF03465.15	3.7e-27	1	1
ENSBTAP00000004233	eRF1_1	PF03463.15	2.2e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSBTAT00000004233	-	1658	-	ENSBTAP00000004233	386 (aa)	-	A0A140T849

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
bta03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.442	ENSG00000152684	PELO	100	98.442	Homo_sapiens
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.481	ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.481	Acanthochromis_polyacanthus
ENSBTAG00000003268	PELO	64	80.162	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSBTAG00000003268	PELO	64	80.162	ENSAPOG00000023700	-	90	80.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.922	ENSAMEG00000007734	PELO	100	97.922	Ailuropoda_melanoleuca
ENSBTAG00000003268	PELO	97	76.944	ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	Amphilophus_citrinellus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	ENSAOCG00000023717	pelo	100	79.740	Amphiprion_ocellaris
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	ENSAPEG00000011235	pelo	100	79.740	Amphiprion_percula
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.558	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	Anabas_testudineus
ENSBTAG00000003268	PELO	77	84.228	ENSAPLG00000013265	PELO	100	84.228	Anas_platyrhynchos
ENSBTAG00000003268	PELO	97	90.160	ENSACAG00000004352	PELO	100	89.870	Anolis_carolinensis
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSANAG00000014096	PELO	100	98.701	Aotus_nancymaae
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	ENSACLG00000010305	pelo	100	79.740	Astatotilapia_calliptera
ENSBTAG00000003268	PELO	97	80.965	ENSAMXG00000020299	pelo	100	79.793	Astyanax_mexicanus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	58.268	WBGene00011280	pelo-1	100	58.268	Caenorhabditis_elegans
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.961	Callithrix_jacchus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.182	ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.182	Canis_lupus_dingo
ENSBTAG00000003268	PELO	100	99.741	ENSCHIG00000016410	PELO	100	99.741	Capra_hircus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.961	Carlito_syrichta
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	Cavia_porcellus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	ENSCCAG00000035600	PELO	100	98.961	Cebus_capucinus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSCATG00000011829	PELO	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.442	ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	Chinchilla_lanigera
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	Chlorocebus_sabaeus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.182	ENSCHOG00000000523	PELO	100	98.182	Choloepus_hoffmanni
ENSBTAG00000003268	PELO	97	93.617	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	Chrysemys_picta_bellii
ENSBTAG00000003268	PELO	97	68.365	ENSCING00000001979	-	100	68.831	Ciona_intestinalis
ENSBTAG00000003268	PELO	99	70.390	ENSCSAVG00000006158	-	100	70.390	Ciona_savignyi
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSCANG00000023382	PELO	100	98.701	Colobus_angolensis_palliatus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	95.584	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSBTAG00000003268	PELO	99	96.883	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.883	Cricetulus_griseus_crigri
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	ENSCSEG00000008807	pelo	100	79.740	Cynoglossus_semilaevis
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.299	Cyprinodon_variegatus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	ENSDARG00000055477	pelo	100	81.299	Danio_rerio
ENSBTAG00000003268	PELO	99	95.337	ENSDNOG00000036721	PELO	100	95.337	Dasypus_novemcinctus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.662	ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	Dipodomys_ordii
ENSBTAG00000003268	PELO	96	67.655	FBgn0011207	pelo	96	67.282	Drosophila_melanogaster
ENSBTAG00000003268	PELO	71	81.287	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	Eptatretus_burgeri
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.442	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.442	Equus_asinus_asinus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	80.000	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.000	Esox_lucius
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.182	ENSFCAG00000032341	PELO	100	98.182	Felis_catus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	94.286	ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	Ficedula_albicollis
ENSBTAG00000003268	PELO	74	98.592	ENSFDAG00000002076	PELO	88	98.592	Fukomys_damarensis
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.481	ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.481	Fundulus_heteroclitus
ENSBTAG00000003268	PELO	98	80.106	ENSGMOG00000005849	pelo	100	79.740	Gadus_morhua
ENSBTAG00000003268	PELO	99	80.519	ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	Gambusia_affinis
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	ENSGACG00000007245	pelo	100	79.740	Gasterosteus_aculeatus
ENSBTAG00000003268	PELO	97	93.883	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	Gopherus_agassizii
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSGGOG00000012635	PELO	100	98.701	Gorilla_gorilla
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	ENSHBUG00000005866	pelo	100	79.740	Haplochromis_burtoni
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.442	ENSHGLG00000005932	PELO	100	98.442	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000003268	PELO	99	96.104	ENSHGLG00100017627	PELO	100	96.104	Heterocephalus_glaber_male
ENSBTAG00000003268	PELO	99	77.403	ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	Hippocampus_comes
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.481	ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	Ictalurus_punctatus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.961	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	94.286	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	94.286	Jaculus_jaculus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	Kryptolebias_marmoratus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	80.779	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.779	Labrus_bergylta
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.701	Loxodonta_africana
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSMFAG00000000651	PELO	100	98.701	Macaca_fascicularis
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSMMUG00000039101	PELO	100	98.701	Macaca_mulatta
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSMNEG00000035538	PELO	100	98.701	Macaca_nemestrina
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSMLEG00000039113	PELO	100	98.701	Mandrillus_leucophaeus
ENSBTAG00000003268	PELO	97	82.842	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	Mastacembelus_armatus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	ENSMZEG00005014258	pelo	100	79.740	Maylandia_zebra
ENSBTAG00000003268	PELO	99	96.883	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	96.883	Mesocricetus_auratus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.961	Microcebus_murinus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.403	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.403	Microtus_ochrogaster
ENSBTAG00000003268	PELO	99	78.701	ENSMMOG00000001324	pelo	100	78.701	Mola_mola
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.558	ENSMALG00000008194	pelo	100	81.558	Monopterus_albus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.662	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.662	Mus_caroli
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.662	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	97.662	Mus_musculus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.922	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	97.922	Mus_pahari
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.662	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.662	Mus_spretus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	95.844	ENSMLUG00000024132	PELO	100	95.844	Myotis_lucifugus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.922	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	97.922	Nannospalax_galili
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	ENSNBRG00000011799	pelo	100	79.740	Neolamprologus_brichardi
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSNLEG00000035970	PELO	100	98.701	Nomascus_leucogenys
ENSBTAG00000003268	PELO	99	94.805	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.805	Notamacropus_eugenii
ENSBTAG00000003268	PELO	98	97.361	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.361	Ochotona_princeps
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.662	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	Octodon_degus
ENSBTAG00000003268	PELO	96	80.270	ENSONIG00000011511	pelo	100	79.740	Oreochromis_niloticus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.442	ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	Oryctolagus_cuniculus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	80.779	ENSORLG00000005827	pelo	100	80.779	Oryzias_latipes
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.039	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	Oryzias_latipes_hni
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes_hsok
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.558	ENSOMEG00000021567	pelo	100	81.558	Oryzias_melastigma
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.662	ENSOGAG00000027940	PELO	100	97.662	Otolemur_garnettii
ENSBTAG00000003268	PELO	100	100.000	ENSOARG00000008324	PELO	100	100.000	Ovis_aries
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSPPAG00000038951	PELO	100	98.701	Pan_paniscus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.182	ENSPPRG00000018800	PELO	100	98.182	Panthera_pardus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.182	ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	Panthera_tigris_altaica
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.961	Pan_troglodytes
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSPANG00000010902	PELO	100	98.701	Papio_anubis
ENSBTAG00000003268	PELO	99	82.338	ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	Paramormyrops_kingsleyae
ENSBTAG00000003268	PELO	97	93.351	ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	Pelodiscus_sinensis
ENSBTAG00000003268	PELO	67	78.295	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.295	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.403	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.403	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.143	ENSPCIG00000004880	PELO	100	97.143	Phascolarctos_cinereus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.299	Poecilia_formosa
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.558	ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.558	Poecilia_latipinna
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.299	Poecilia_mexicana
ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.558	ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	Poecilia_reticulata
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.442	ENSPPYG00000015451	PELO	96	98.442	Pongo_abelii
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	ENSPCOG00000021178	PELO	100	98.961	Propithecus_coquereli
ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	ENSPNYG00000017325	pelo	100	79.740	Pundamilia_nyererei
ENSBTAG00000003268	PELO	97	81.501	ENSPNAG00000012458	pelo	100	80.311	Pygocentrus_nattereri
ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.403	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.403	Rattus_norvegicus
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSRBIG00000007299	PELO	100	98.701	Rhinopithecus_bieti
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSRROG00000035507	PELO	100	98.701	Rhinopithecus_roxellana
ENSBTAG00000003268	PELO	97	34.115	YNL001W	-	98	34.115	Saccharomyces_cerevisiae
ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	ENSSBOG00000036140	PELO	100	98.701	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSBTAG00000003268	PELO	63	95.902	ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.902	Sarcophilus_harrisii
ENSBTAG00000003268	PELO	98	83.554	ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	Scleropages_formosus
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