EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSBTAG00000012253 (Gene tree)
Gene ID: 522972
Gene Symbol: AGO1
Alias: -
Full Name: Bos taurus argonaute 1%2C RISC catalytic component (AGO1)%2C transcript variant 1%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Bos_taurus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36397 bases
Position: chr3:109877713-109914109
Accession: NM_001317187
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSBTAP00000067266	PAZ	PF02170.22	9.6e-29	1	1
ENSBTAP00000016254	PAZ	PF02170.22	2.9e-24	1	1
ENSBTAP00000067266	Piwi	PF02171.17	1.6e-110	1	1
ENSBTAP00000016254	Piwi	PF02171.17	1.7e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSBTAT00000067110	-	8622	-	ENSBTAP00000067266	857 (aa)	-	UPI0000F33657
ENSBTAT00000016254	-	2610	-	ENSBTAP00000016254	869 (aa)	-	F1MXX2

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	83.815	ENSBTAG00000018324	AGO3	99	84.806
ENSBTAG00000012253	AGO1	98	83.771	ENSBTAG00000001579	AGO2	98	83.432
ENSBTAG00000012253	AGO1	98	82.904	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	82.904

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSG00000092847	AGO1	100	99.883	Homo_sapiens
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSAPOG00000024299	ago1	98	96.686	Acanthochromis_polyacanthus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	99.883	Ailuropoda_melanoleuca
ENSBTAG00000012253	AGO1	82	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSAOCG00000017727	ago1	98	96.686	Amphiprion_ocellaris
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.576	Amphiprion_percula
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSATEG00000008523	ago1	98	96.686	Anabas_testudineus
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	93.677	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.677	Anas_platyrhynchos
ENSBTAG00000012253	AGO1	91	99.744	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.744	Anolis_carolinensis
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSANAG00000037711	AGO1	100	99.883	Aotus_nancymaae
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	95.921	ENSACLG00000000890	ago1	98	96.450	Astatotilapia_calliptera
ENSBTAG00000012253	AGO1	80	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	99.883	Callithrix_jacchus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	99.883	Canis_familiaris
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	98.016	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.188	ENSCHIG00000011848	-	100	99.188	Capra_hircus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	Carlito_syrichta
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	78.646	ENSTSYG00000032426	-	99	79.380	Carlito_syrichta
ENSBTAG00000012253	AGO1	89	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	Cavia_porcellus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	99.883	Cebus_capucinus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.184	ENSCATG00000031521	AGO1	100	99.872	Cercocebus_atys
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	Chinchilla_lanigera
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	99.883	Chlorocebus_sabaeus
ENSBTAG00000012253	AGO1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.650	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.650	Chrysemys_picta_bellii
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSCANG00000039798	AGO1	100	99.883	Colobus_angolensis_palliatus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	99.883	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	99.882	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	99.882	Cricetulus_griseus_crigri
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	94.780	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.780	Cynoglossus_semilaevis
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	95.921	ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	Cyprinodon_variegatus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.503	ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	Danio_rerio
ENSBTAG00000012253	AGO1	91	99.872	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	99.872	Dasypus_novemcinctus
ENSBTAG00000012253	AGO1	93	98.673	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSBTAG00000012253	AGO1	84	93.065	ENSETEG00000007626	AGO1	100	93.065	Echinops_telfairi
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSEASG00005012086	AGO1	100	99.883	Equus_asinus_asinus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSECAG00000024353	AGO1	100	99.883	Equus_caballus
ENSBTAG00000012253	AGO1	92	91.487	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.487	Erinaceus_europaeus
ENSBTAG00000012253	AGO1	91	97.059	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	99.883	Felis_catus
ENSBTAG00000012253	AGO1	91	92.092	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.092	Ficedula_albicollis
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.767	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	Fukomys_damarensis
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	92.680	ENSFHEG00000017927	ago1	99	93.001	Fundulus_heteroclitus
ENSBTAG00000012253	AGO1	87	84.646	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.646	Gadus_morhua
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.767	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.767	Gallus_gallus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.270	ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.686	Gambusia_affinis
ENSBTAG00000012253	AGO1	87	97.204	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSBTAG00000012253	AGO1	91	99.744	ENSGAGG00000012893	-	100	99.744	Gopherus_agassizii
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	99.883	Gorilla_gorilla
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	95.921	ENSHBUG00000010459	ago1	98	96.450	Haplochromis_burtoni
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	99.883	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	99.883	Heterocephalus_glaber_male
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	96.576	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.576	Hippocampus_comes
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	Ictalurus_punctatus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	99.883	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.767	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.767	Jaculus_jaculus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSKMAG00000019464	ago1	98	96.686	Kryptolebias_marmoratus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.270	ENSLBEG00000007694	ago1	98	96.686	Labrus_bergylta
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	93.404	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.506	Latimeria_chalumnae
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	94.056	ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	Lepisosteus_oculatus
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	99.882	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	Loxodonta_africana
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	99.883	Macaca_fascicularis
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	94.854	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.136	Macaca_mulatta
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	95.916	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	99.872	Macaca_nemestrina
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	99.883	Mandrillus_leucophaeus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSMAMG00000008381	ago1	98	96.686	Mastacembelus_armatus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	95.921	ENSMZEG00005007996	ago1	98	96.450	Maylandia_zebra
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	94.179	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.366	Meleagris_gallopavo
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	99.883	Mesocricetus_auratus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSMICG00000016147	AGO1	100	99.883	Microcebus_murinus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.767	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.767	Microtus_ochrogaster
ENSBTAG00000012253	AGO1	78	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.533	ENSMODG00000023335	AGO1	100	99.533	Monodelphis_domestica
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	96.458	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.797	Monopterus_albus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	Mus_caroli
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.883	Mus_musculus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.883	Mus_pahari
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.883	Mus_spretus
ENSBTAG00000012253	AGO1	84	99.861	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	99.861	Mustela_putorius_furo
ENSBTAG00000012253	AGO1	61	99.425	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.425	Myotis_lucifugus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.650	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.650	Nannospalax_galili
ENSBTAG00000012253	AGO1	91	97.059	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.767	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	Nomascus_leucogenys
ENSBTAG00000012253	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSBTAG00000012253	AGO1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSODEG00000005321	AGO1	100	99.883	Octodon_degus
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	96.340	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	Oreochromis_niloticus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	91.860	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.860	Ornithorhynchus_anatinus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.767	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.767	Oryctolagus_cuniculus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSORLG00000014965	ago1	98	96.686	Oryzias_latipes
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSORLG00020018253	ago1	98	96.686	Oryzias_latipes_hni
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSORLG00015003287	ago1	98	96.686	Oryzias_latipes_hsok
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	ENSOMEG00000020528	ago1	98	96.686	Oryzias_melastigma
ENSBTAG00000012253	AGO1	99	99.882	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	99.882	Otolemur_garnettii
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	100.000	ENSOARG00000019591	AGO1	100	100.000	Ovis_aries
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	99.883	Pan_paniscus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	99.883	Panthera_pardus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.650	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.650	Panthera_tigris_altaica
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	99.883	Pan_troglodytes
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSPANG00000009060	AGO1	100	99.883	Papio_anubis
ENSBTAG00000012253	AGO1	98	98.931	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.931	Pelodiscus_sinensis
ENSBTAG00000012253	AGO1	80	97.384	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.533	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.533	Phascolarctos_cinereus
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.270	ENSPFOG00000005867	ago1	98	96.686	Poecilia_formosa
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.270	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.119	Poecilia_latipinna
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.270	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	Poecilia_mexicana
ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.270	ENSPREG00000006534	ago1	98	96.686	Poecilia_reticulata
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