EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSBTAG00000014874 (Gene tree)
Gene ID: 407149
Gene Symbol: FYTTD1
Alias: -
Full Name: Bos taurus forty-two-three domain containing 1 (FYTTD1)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Bos_taurus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30408 bases
Position: chr1:70342777-70373184
Accession: NM_001001137
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSBTAP00000043895	FYTT	PF07078.11	2.2e-171	1	1
ENSBTAP00000019804	FYTT	PF07078.11	5.1e-164	1	1
ENSBTAP00000068107	FYTT	PF07078.11	2.9e-139	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSBTAT00000046614	-	1687	-	ENSBTAP00000043895	318 (aa)	-	Q17QU6
ENSBTAT00000019804	-	1193	-	ENSBTAP00000019804	318 (aa)	-	E1BCV8
ENSBTAT00000086456	-	1558	-	ENSBTAP00000068107	275 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSBTAG00000014874's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSBTAG00000014874's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.476	ENSG00000122068	FYTTD1	100	93.625	Homo_sapiens
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	41.558	ENSAPOG00000015571	-	95	41.883	Acanthochromis_polyacanthus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	96.552	ENSAMEG00000004083	FYTTD1	100	96.552	Ailuropoda_melanoleuca
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	41.026	ENSACIG00000001559	-	94	41.026	Amphilophus_citrinellus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	94	42.633	ENSAOCG00000018069	-	97	42.633	Amphiprion_ocellaris
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	94	42.633	ENSAPEG00000003725	-	97	42.633	Amphiprion_percula
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	44.051	ENSATEG00000020932	-	95	44.051	Anabas_testudineus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	94	66.000	ENSAPLG00000015624	FYTTD1	93	66.330	Anas_platyrhynchos
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	94	65.000	ENSACAG00000002796	FYTTD1	95	65.101	Anolis_carolinensis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.790	ENSANAG00000024581	FYTTD1	100	92.476	Aotus_nancymaae
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	42.038	ENSACLG00000011379	-	95	42.765	Astatotilapia_calliptera
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	93	40.351	ENSAMXG00000043436	-	97	40.413	Astyanax_mexicanus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.476	ENSCJAG00000016488	FYTTD1	81	92.163	Callithrix_jacchus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	97.527	ENSCAFG00000029695	-	100	97.527	Canis_familiaris
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	96.855	ENSCAFG00000016270	FYTTD1	100	96.855	Canis_familiaris
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	96.855	ENSCAFG00020003266	FYTTD1	100	96.855	Canis_lupus_dingo
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	99.057	ENSCHIG00000021253	-	100	99.057	Capra_hircus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	95.597	ENSCHIG00000015524	-	100	95.597	Capra_hircus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	93.082	ENSTSYG00000013767	FYTTD1	100	92.767	Carlito_syrichta
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	85	86.087	ENSCPOG00000011463	FYTTD1	100	85.652	Cavia_porcellus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.790	ENSCCAG00000029719	FYTTD1	100	92.476	Cebus_capucinus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.790	ENSCATG00000037016	FYTTD1	100	93.625	Cercocebus_atys
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	91.250	ENSCLAG00000012210	-	100	90.938	Chinchilla_lanigera
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	98	74.038	ENSCLAG00000001980	-	95	74.161	Chinchilla_lanigera
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.163	ENSCSAG00000008466	FYTTD1	100	91.850	Chlorocebus_sabaeus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	75.472	ENSCHOG00000002881	FYTTD1	100	75.157	Choloepus_hoffmanni
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	71.331	ENSCPBG00000017348	FYTTD1	93	71.044	Chrysemys_picta_bellii
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	92.254	ENSCANG00000021075	-	99	92.254	Colobus_angolensis_palliatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	86.834	ENSCANG00000034075	-	100	90.164	Colobus_angolensis_palliatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	94.340	ENSCGRG00001023957	-	100	94.340	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	93.471	ENSCGRG00000014096	-	94	95.053	Cricetulus_griseus_crigri
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	44.340	ENSCSEG00000011478	-	95	44.340	Cynoglossus_semilaevis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	39.286	ENSCVAG00000008388	-	92	40.514	Cyprinodon_variegatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	93.082	ENSDNOG00000040247	FYTTD1	100	92.767	Dasypus_novemcinctus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	88.050	ENSDORG00000011686	Fyttd1	100	87.736	Dipodomys_ordii
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	91.509	ENSETEG00000000700	FYTTD1	100	91.509	Echinops_telfairi
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	95.597	ENSEASG00005006793	FYTTD1	100	94.969	Equus_asinus_asinus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	95.912	ENSECAG00000019051	FYTTD1	100	95.283	Equus_caballus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	87	91.632	ENSEEUG00000001433	-	100	91.632	Erinaceus_europaeus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	87	89.958	ENSEEUG00000002650	-	100	89.958	Erinaceus_europaeus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	93	39.941	ENSELUG00000024402	-	97	40.828	Esox_lucius
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	95.912	ENSFCAG00000009992	FYTTD1	100	95.912	Felis_catus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	71.020	ENSFALG00000007503	FYTTD1	90	68.641	Ficedula_albicollis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	84.591	ENSFDAG00000005650	-	97	84.277	Fukomys_damarensis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	94.681	ENSFDAG00000010594	-	100	94.681	Fukomys_damarensis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	42.722	ENSFHEG00000016387	-	95	43.366	Fundulus_heteroclitus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	40.256	ENSGMOG00000002130	-	95	40.256	Gadus_morhua
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	30.671	ENSGALG00000030064	-	88	30.333	Gallus_gallus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	98	64.423	ENSGALG00000007581	FYTTD1	93	66.554	Gallus_gallus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	99	38.793	ENSGAFG00000008375	-	95	40.248	Gambusia_affinis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	42.258	ENSGACG00000016088	-	92	42.258	Gasterosteus_aculeatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	95	68.977	ENSGAGG00000011127	FYTTD1	85	70.034	Gopherus_agassizii
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	31.046	ENSGAGG00000022107	-	94	31.046	Gopherus_agassizii
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	91.850	ENSGGOG00000011665	FYTTD1	100	91.536	Gorilla_gorilla
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	42.038	ENSHBUG00000017614	-	95	42.765	Haplochromis_burtoni
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	93	86.149	ENSHGLG00000017583	-	100	86.149	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	71.384	ENSHGLG00000015565	-	100	69.811	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	93.711	ENSHGLG00000019355	-	100	93.396	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	88	77.500	ENSHGLG00000006924	-	94	77.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	94.326	ENSHGLG00100017162	-	100	94.326	Heterocephalus_glaber_male
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	71.698	ENSHGLG00100004761	-	100	70.126	Heterocephalus_glaber_male
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	79.245	ENSHGLG00100014883	-	100	78.931	Heterocephalus_glaber_male
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	88	67.500	ENSHGLG00100004604	-	94	67.500	Heterocephalus_glaber_male
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	41.137	ENSHCOG00000021011	-	96	41.333	Hippocampus_comes
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	41.066	ENSIPUG00000012096	-	96	40.979	Ictalurus_punctatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	94.969	ENSSTOG00000028291	FYTTD1	100	94.654	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	90.712	ENSJJAG00000016455	Fyttd1	94	95.868	Jaculus_jaculus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	41.358	ENSKMAG00000004518	-	95	42.284	Kryptolebias_marmoratus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	43.175	ENSLBEG00000009232	-	95	43.175	Labrus_bergylta
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	34.098	ENSLACG00000005906	-	94	34.098	Latimeria_chalumnae
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	97	54.848	ENSLACG00000006864	FYTTD1	93	56.051	Latimeria_chalumnae
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	95	45.161	ENSLOCG00000008490	FYTTD1	96	45.808	Lepisosteus_oculatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	93.396	ENSLAFG00000017209	FYTTD1	100	93.082	Loxodonta_africana
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.476	ENSMFAG00000033352	FYTTD1	98	91.156	Macaca_fascicularis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	91.156	ENSMMUG00000048439	FYTTD1	97	93.310	Macaca_mulatta
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.476	ENSMNEG00000038497	FYTTD1	100	92.163	Macaca_nemestrina
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	93.310	ENSMLEG00000033370	FYTTD1	99	93.310	Mandrillus_leucophaeus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	42.949	ENSMAMG00000002358	-	95	42.395	Mastacembelus_armatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	42.038	ENSMZEG00005007182	-	96	41.776	Maylandia_zebra
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	87	70.000	ENSMGAG00000007933	FYTTD1	100	67.719	Meleagris_gallopavo
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	83.019	ENSMAUG00000010679	Fyttd1	100	83.019	Mesocricetus_auratus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	94.969	ENSMICG00000049152	FYTTD1	100	94.654	Microcebus_murinus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	93.711	ENSMOCG00000015509	Fyttd1	100	93.396	Microtus_ochrogaster
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	39.571	ENSMMOG00000018430	-	95	40.184	Mola_mola
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	72.477	ENSMODG00000018393	FYTTD1	79	74.267	Monodelphis_domestica
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	93	41.104	ENSMALG00000005624	-	97	41.104	Monopterus_albus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.453	MGP_CAROLIEiJ_G0020682	Fyttd1	100	92.453	Mus_caroli
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	93.396	ENSMUSG00000022800	Fyttd1	100	93.467	Mus_musculus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.767	MGP_PahariEiJ_G0016385	Fyttd1	100	92.767	Mus_pahari
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.767	MGP_SPRETEiJ_G0021578	Fyttd1	100	92.767	Mus_spretus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	95.597	ENSMPUG00000004085	FYTTD1	100	95.597	Mustela_putorius_furo
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	94.654	ENSMLUG00000005630	FYTTD1	100	94.654	Myotis_lucifugus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	93.082	ENSNGAG00000020280	Fyttd1	100	93.082	Nannospalax_galili
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	42.222	ENSNBRG00000005032	-	95	42.949	Neolamprologus_brichardi
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	93.993	ENSNLEG00000015547	FYTTD1	100	93.993	Nomascus_leucogenys
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	50.157	ENSMEUG00000001523	-	94	50.502	Notamacropus_eugenii
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	92.199	ENSOPRG00000008211	FYTTD1	100	92.199	Ochotona_princeps
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	85	81.545	ENSODEG00000013104	-	92	83.594	Octodon_degus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	91.509	ENSODEG00000012844	-	100	91.195	Octodon_degus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	44.262	ENSONIG00000010717	-	100	44.118	Oreochromis_niloticus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	66.901	ENSOANG00000014284	FYTTD1	100	66.901	Ornithorhynchus_anatinus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	93.082	ENSOCUG00000012770	FYTTD1	100	92.767	Oryctolagus_cuniculus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	42.675	ENSORLG00000009073	-	95	43.450	Oryzias_latipes
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	43.770	ENSORLG00020012343	-	91	43.770	Oryzias_latipes_hni
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	44.089	ENSORLG00015008022	-	91	44.089	Oryzias_latipes_hsok
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	40.683	ENSOMEG00000006553	-	95	44.062	Oryzias_melastigma
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	83.333	ENSOGAG00000011888	FYTTD1	100	83.025	Otolemur_garnettii
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	71	83.111	ENSOARG00000002583	-	97	83.111	Ovis_aries
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	96	98.366	ENSOARG00000020275	-	95	98.366	Ovis_aries
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.476	ENSPPAG00000027558	FYTTD1	100	92.163	Pan_paniscus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	90	96.853	ENSPPRG00000009562	FYTTD1	100	96.853	Panthera_pardus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	95.912	ENSPTIG00000006326	FYTTD1	100	95.912	Panthera_tigris_altaica
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.476	ENSPTRG00000015796	FYTTD1	100	92.163	Pan_troglodytes
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	90	92.334	ENSPANG00000030359	FYTTD1	100	91.986	Papio_anubis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	93	47.115	ENSPKIG00000022465	-	83	47.115	Paramormyrops_kingsleyae
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	65.870	ENSPSIG00000002293	FYTTD1	100	65.965	Pelodiscus_sinensis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	34.727	ENSPMGG00000009334	-	86	57.143	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	93.396	ENSPEMG00000011670	Fyttd1	100	93.396	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	75.636	ENSPCIG00000018720	FYTTD1	94	77.258	Phascolarctos_cinereus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	59	53.333	ENSPFOG00000022975	-	94	49.485	Poecilia_formosa
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	99	41.954	ENSPLAG00000009293	-	95	45.253	Poecilia_latipinna
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	99	43.695	ENSPMEG00000015488	-	95	45.570	Poecilia_mexicana
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	99	42.941	ENSPREG00000006038	-	95	44.762	Poecilia_reticulata
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.476	ENSPPYG00000014456	FYTTD1	100	92.163	Pongo_abelii
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	94.654	ENSPCAG00000003873	FYTTD1	100	94.340	Procavia_capensis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	94.969	ENSPCOG00000024162	FYTTD1	100	94.654	Propithecus_coquereli
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.453	ENSPVAG00000016445	FYTTD1	100	92.138	Pteropus_vampyrus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	42.038	ENSPNYG00000002296	-	95	42.765	Pundamilia_nyererei
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	40.663	ENSPNAG00000016146	-	96	41.265	Pygocentrus_nattereri
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	91.901	ENSRNOG00000034233	Fyttd1	100	91.901	Rattus_norvegicus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	89	93.662	ENSRBIG00000018859	-	100	93.662	Rhinopithecus_bieti
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	77	88.980	ENSRBIG00000038260	-	100	88.980	Rhinopithecus_bieti
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	92.790	ENSRROG00000014194	FYTTD1	100	92.476	Rhinopithecus_roxellana
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	90	91.958	ENSSBOG00000035412	FYTTD1	99	91.958	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	90	77.273	ENSSHAG00000005704	FYTTD1	100	77.273	Sarcophilus_harrisii
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	93	45.141	ENSSFOG00015014729	-	93	45.141	Scleropages_formosus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	90	46.097	ENSSMAG00000008798	-	96	46.014	Scophthalmus_maximus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	43.478	ENSSDUG00000009615	-	95	45.000	Seriola_dumerili
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	95	42.687	ENSSLDG00000021326	-	95	45.079	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	87	90.795	ENSSARG00000009996	FYTTD1	100	74.922	Sorex_araneus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	93	71.622	ENSSPUG00000012549	FYTTD1	95	71.622	Sphenodon_punctatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	90	41.584	ENSSPAG00000002856	-	90	41.584	Stegastes_partitus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	96.727	ENSSSCG00000027139	FYTTD1	100	96.727	Sus_scrofa
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	92	67.007	ENSTGUG00000009645	FYTTD1	100	67.007	Taeniopygia_guttata
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	94	43.210	ENSTRUG00000008895	-	82	43.210	Takifugu_rubripes
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	91	44.300	ENSTNIG00000007811	-	94	44.300	Tetraodon_nigroviridis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	78.302	ENSTBEG00000005595	FYTTD1	100	77.987	Tupaia_belangeri
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	94	97.667	ENSTTRG00000016288	FYTTD1	99	97.667	Tursiops_truncatus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	100	97.170	ENSUMAG00000003373	FYTTD1	100	97.170	Ursus_maritimus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	99	77.574	ENSVPAG00000003854	FYTTD1	100	77.574	Vicugna_pacos
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	93	93.243	ENSVVUG00000008003	FYTTD1	98	96.820	Vulpes_vulpes
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	95	51.325	ENSXETG00000024516	fyttd1	97	51.701	Xenopus_tropicalis
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	99	41.908	ENSXCOG00000007479	-	95	43.614	Xiphophorus_couchianus
ENSBTAG00000014874	FYTTD1	99	42.197	ENSXMAG00000004764	-	95	43.925	Xiphophorus_maculatus

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0003729	mRNA binding	-	ISS	Function
GO:0005654	nucleoplasm	-	ISS	Component
GO:0006406	mRNA export from nucleus	-	ISS	Process
GO:0016607	nuclear speck	-	ISS	Component