EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSBTAG00000015220 (Gene tree)
Gene ID: 528046
Gene Symbol: AGO4
Alias: -
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Bos_taurus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30378 bases
Position: chr3:109947115-109977492
Accession: 25733
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSBTAP00000020250	PAZ	PF02170.22	2.6e-28	1	1
ENSBTAP00000020250	Piwi	PF02171.17	4.2e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSBTAT00000020250	-	2580	-	ENSBTAP00000020250	859 (aa)	-	F1MXK6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	82.904	ENSBTAG00000012253	AGO1	98	82.904
ENSBTAG00000015220	AGO4	100	80.046	ENSBTAG00000018324	AGO3	100	80.046
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	78.210	ENSBTAG00000001579	AGO2	100	76.905

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.834	ENSG00000134698	AGO4	99	98.834	Homo_sapiens
ENSBTAG00000015220	AGO4	96	95.569	ENSAPOG00000023867	ago4	99	95.569	Acanthochromis_polyacanthus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.718	ENSAMEG00000000573	AGO4	99	98.718	Ailuropoda_melanoleuca
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	97.103	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.103	Amphilophus_citrinellus
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	92.569	ENSAPEG00000022426	ago4	100	92.569	Amphiprion_percula
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.637	ENSATEG00000006717	ago4	100	95.776	Anabas_testudineus
ENSBTAG00000015220	AGO4	98	98.465	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	98.465	Anas_platyrhynchos
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.427	ENSACAG00000017275	AGO4	99	97.427	Anolis_carolinensis
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.830	ENSANAG00000031428	AGO4	99	98.830	Aotus_nancymaae
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.622	ENSACLG00000005181	ago4	99	95.522	Astatotilapia_calliptera
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.522	ENSAMXG00000010318	ago4	100	95.592	Astyanax_mexicanus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.947	ENSCJAG00000001610	AGO4	99	98.947	Callithrix_jacchus
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	98.866	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.866	Canis_familiaris
ENSBTAG00000015220	AGO4	100	98.605	ENSCHIG00000026564	AGO4	99	98.951	Capra_hircus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.830	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	98.830	Carlito_syrichta
ENSBTAG00000015220	AGO4	94	94.183	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	94.183	Cavia_aperea
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	96.956	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	96.956	Cavia_porcellus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.947	ENSCCAG00000001397	AGO4	99	98.947	Cebus_capucinus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.947	ENSCATG00000043421	AGO4	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.595	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	98.595	Chinchilla_lanigera
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.834	ENSCSAG00000001090	AGO4	99	98.834	Chlorocebus_sabaeus
ENSBTAG00000015220	AGO4	80	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.364	ENSCPBG00000018602	AGO4	99	98.364	Chrysemys_picta_bellii
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.947	ENSCANG00000016914	AGO4	100	98.947	Colobus_angolensis_palliatus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.252	ENSCGRG00001002701	Ago4	99	98.252	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.361	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	98.361	Cricetulus_griseus_crigri
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	91.080	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.080	Cynoglossus_semilaevis
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	96.744	ENSDARG00000100854	ago4	99	96.744	Danio_rerio
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.601	ENSDNOG00000015674	AGO4	99	98.601	Dasypus_novemcinctus
ENSBTAG00000015220	AGO4	100	98.258	ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.258	Dipodomys_ordii
ENSBTAG00000015220	AGO4	60	100.000	ENSETEG00000018390	AGO4	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.834	ENSEASG00005012079	AGO4	99	98.834	Equus_asinus_asinus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.834	ENSECAG00000024686	AGO4	99	98.834	Equus_caballus
ENSBTAG00000015220	AGO4	79	95.000	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	95.000	Erinaceus_europaeus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.392	ENSELUG00000023873	ago4	99	95.392	Esox_lucius
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.718	ENSFCAG00000006218	AGO4	99	98.718	Felis_catus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.829	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	98.829	Fukomys_damarensis
ENSBTAG00000015220	AGO4	97	88.383	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.383	Fundulus_heteroclitus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	96.387	ENSGMOG00000009544	ago4	99	96.387	Gadus_morhua
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.368	ENSGALG00000039713	AGO4	100	98.363	Gallus_gallus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.293	ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.293	Gambusia_affinis
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	96.860	ENSGACG00000002683	ago4	99	96.860	Gasterosteus_aculeatus
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	98.363	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.363	Gopherus_agassizii
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.535	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	95.535	Gorilla_gorilla
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.522	ENSHBUG00000001525	ago4	99	95.522	Haplochromis_burtoni
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.718	ENSHGLG00000010241	AGO4	99	98.718	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.941	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.941	Heterocephalus_glaber_male
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.408	ENSHCOG00000003725	ago4	99	95.408	Hippocampus_comes
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.408	ENSIPUG00000015600	ago4	99	95.408	Ictalurus_punctatus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.718	ENSSTOG00000004725	AGO4	99	98.718	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.408	ENSKMAG00000018602	ago4	99	95.408	Kryptolebias_marmoratus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	94.983	ENSLBEG00000010670	ago4	99	94.983	Labrus_bergylta
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.552	ENSLACG00000016888	AGO4	99	97.552	Latimeria_chalumnae
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.402	ENSLOCG00000000584	ago4	99	95.402	Lepisosteus_oculatus
ENSBTAG00000015220	AGO4	93	98.377	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	98.377	Loxodonta_africana
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.947	ENSMFAG00000035543	AGO4	99	98.947	Macaca_fascicularis
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.718	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.834	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.946	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	98.946	Mandrillus_leucophaeus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.522	ENSMAMG00000003874	ago4	100	95.547	Mastacembelus_armatus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.622	ENSMZEG00005026346	ago4	99	95.522	Maylandia_zebra
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.014	ENSMGAG00000003851	AGO4	100	98.014	Meleagris_gallopavo
ENSBTAG00000015220	AGO4	82	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	97.080	Mesocricetus_auratus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.713	ENSMICG00000033507	AGO4	100	98.713	Microcebus_murinus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.368	ENSMOCG00000005772	Ago4	99	98.368	Microtus_ochrogaster
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	96.096	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.096	Mola_mola
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.485	ENSMODG00000017888	AGO4	99	98.485	Monodelphis_domestica
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	94.988	ENSMALG00000011797	ago4	100	94.988	Monopterus_albus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.902	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	97.902	Mus_caroli
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.669	ENSMUSG00000042500	Ago4	99	97.669	Mus_musculus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.552	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	97.552	Mus_pahari
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.436	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	99	97.436	Mus_spretus
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	98.866	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	98.866	Mustela_putorius_furo
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.544	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	97.544	Myotis_lucifugus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.829	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	98.829	Nannospalax_galili
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.522	ENSNBRG00000013492	ago4	99	95.522	Neolamprologus_brichardi
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.946	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	98.946	Nomascus_leucogenys
ENSBTAG00000015220	AGO4	90	96.615	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	96.615	Notamacropus_eugenii
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	91.335	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	91.335	Ochotona_princeps
ENSBTAG00000015220	AGO4	93	98.747	ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.747	Octodon_degus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	96.042	ENSONIG00000013603	ago4	99	96.042	Oreochromis_niloticus
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	98.489	ENSOANG00000002082	AGO4	100	98.489	Ornithorhynchus_anatinus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.601	ENSOCUG00000004076	AGO4	99	98.601	Oryctolagus_cuniculus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.637	ENSORLG00000009865	ago4	92	95.637	Oryzias_latipes
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.637	ENSORLG00020016978	ago4	92	95.637	Oryzias_latipes_hni
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.637	ENSORLG00015008800	ago4	92	95.637	Oryzias_latipes_hsok
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.833	ENSOMEG00000006399	ago4	99	95.833	Oryzias_melastigma
ENSBTAG00000015220	AGO4	93	97.372	ENSOGAG00000004233	-	100	97.372	Otolemur_garnettii
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	90.599	ENSOGAG00000027107	-	99	90.599	Otolemur_garnettii
ENSBTAG00000015220	AGO4	100	98.023	ENSOARG00000019568	AGO4	98	98.023	Ovis_aries
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.946	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	98.946	Pan_paniscus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.718	ENSPPRG00000006520	AGO4	99	98.718	Panthera_pardus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.829	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	98.829	Panthera_tigris_altaica
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.834	ENSPTRG00000000527	AGO4	99	98.834	Pan_troglodytes
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	98.866	ENSPANG00000007232	AGO4	100	98.866	Papio_anubis
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.293	ENSPKIG00000022598	ago4	99	95.293	Paramormyrops_kingsleyae
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.364	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	98.364	Pelodiscus_sinensis
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	96.977	ENSPMGG00000023325	ago4	100	96.977	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSBTAG00000015220	AGO4	88	100.000	ENSPEMG00000022651	-	96	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.485	ENSPCIG00000000092	AGO4	99	98.485	Phascolarctos_cinereus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.408	ENSPFOG00000001935	ago4	99	95.408	Poecilia_formosa
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	96.628	ENSPLAG00000011534	ago4	99	96.628	Poecilia_latipinna
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.408	ENSPMEG00000005049	ago4	99	95.408	Poecilia_mexicana
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.602	ENSPREG00000010315	ago4	99	95.408	Poecilia_reticulata
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.946	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	98.946	Pongo_abelii
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.596	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	98.596	Propithecus_coquereli
ENSBTAG00000015220	AGO4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.522	ENSPNYG00000002089	ago4	99	95.522	Pundamilia_nyererei
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	96.163	ENSPNAG00000005191	ago4	99	96.163	Pygocentrus_nattereri
ENSBTAG00000015220	AGO4	69	98.157	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	98.157	Rattus_norvegicus
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.471	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSBTAG00000015220	AGO4	92	98.866	ENSRROG00000035783	AGO4	100	98.866	Rhinopithecus_roxellana
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	94.994	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	98.679	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.250	ENSSHAG00000017320	AGO4	99	98.250	Sarcophilus_harrisii
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ENSBTAG00000015220	AGO4	79	99.501	ENSSARG00000011504	AGO4	79	99.501	Sorex_araneus
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ENSBTAG00000015220	AGO4	92	98.866	ENSVVUG00000000465	-	100	98.866	Vulpes_vulpes
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	85.012	ENSXETG00000009664	ago4	99	85.012	Xenopus_tropicalis
ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.408	ENSXMAG00000016657	ago4	99	95.408	Xiphophorus_maculatus