EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSBTAG00000016720 (Gene tree)
Gene ID: 539339
Gene Symbol: RAB1A
Alias: -
Full Name: Bos taurus RAB1A%2C member RAS oncogene family (RAB1A)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Bos_taurus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 28840 bases
Position: chr11:63471793-63500632
Accession: NM_001033628
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSBTAP00000060659	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-05	1	1
ENSBTAP00000022227	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-05	1	1
ENSBTAP00000062646	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSBTAT00000044735	-	1326	-	ENSBTAP00000042206	173 (aa)	-	Q3ZBD1
ENSBTAT00000067272	-	597	-	ENSBTAP00000060659	198 (aa)	-	-
ENSBTAT00000070415	-	666	-	ENSBTAP00000062646	221 (aa)	-	-
ENSBTAT00000022227	-	1415	-	ENSBTAP00000022227	205 (aa)	XP_005212926	A1L528

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Pathway ID	Pathway Name	Source
bta05134	Legionellosis	KEGG

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSBTAG00000016720	RAB1A	83	50.610	ENSBTAG00000002417	RAB30	82	50.602
ENSBTAG00000016720	RAB1A	89	32.292	ENSBTAG00000004876	RABL2B	66	35.948
ENSBTAG00000016720	RAB1A	86	44.767	ENSBTAG00000019779	RAB39B	84	43.820
ENSBTAG00000016720	RAB1A	85	33.728	ENSBTAG00000005362	RAB23	73	32.948
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	42.211	ENSBTAG00000048711	-	93	42.211
ENSBTAG00000016720	RAB1A	98	43.367	ENSBTAG00000046385	RAB5A	90	43.367
ENSBTAG00000016720	RAB1A	60	34.454	ENSBTAG00000006574	ARL8A	61	35.043
ENSBTAG00000016720	RAB1A	97	36.410	ENSBTAG00000000905	RAB6B	94	36.410
ENSBTAG00000016720	RAB1A	98	42.564	ENSBTAG00000006982	RAB5C	89	42.564
ENSBTAG00000016720	RAB1A	82	44.643	ENSBTAG00000003208	RAB33B	76	43.429
ENSBTAG00000016720	RAB1A	59	31.933	ENSBTAG00000002869	ARL4A	62	30.645
ENSBTAG00000016720	RAB1A	59	32.203	ENSBTAG00000012902	ARL8B	61	32.479
ENSBTAG00000016720	RAB1A	90	33.514	ENSBTAG00000002174	RERG	90	33.514
ENSBTAG00000016720	RAB1A	82	38.415	ENSBTAG00000046797	NRAS	86	38.415
ENSBTAG00000016720	RAB1A	96	54.737	ENSBTAG00000017604	RAB13	94	54.359
ENSBTAG00000016720	RAB1A	78	39.623	ENSBTAG00000010923	RAB9A	78	39.623
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	39.906	ENSBTAG00000021525	-	96	39.906
ENSBTAG00000016720	RAB1A	81	50.000	ENSBTAG00000009871	RAB18	85	44.554
ENSBTAG00000016720	RAB1A	85	37.640	ENSBTAG00000010193	RAB7A	79	39.264
ENSBTAG00000016720	RAB1A	98	37.629	ENSBTAG00000018053	RAB22A	97	37.824
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	33.486	ENSBTAG00000017277	RAB36	67	33.486
ENSBTAG00000016720	RAB1A	97	38.384	ENSBTAG00000000025	RAB6A	94	38.384
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	46.829	ENSBTAG00000018959	RAB11A	95	46.829
ENSBTAG00000016720	RAB1A	82	47.619	ENSBTAG00000034712	RAB33A	71	47.619
ENSBTAG00000016720	RAB1A	81	51.250	ENSBTAG00000003474	RAB15	78	50.909
ENSBTAG00000016720	RAB1A	59	30.081	ENSBTAG00000053459	-	68	30.081
ENSBTAG00000016720	RAB1A	81	41.317	ENSBTAG00000046129	RAB34	62	41.317
ENSBTAG00000016720	RAB1A	78	51.613	ENSBTAG00000000948	RAB2A	99	47.980
ENSBTAG00000016720	RAB1A	68	31.206	ENSBTAG00000016847	ARL4D	72	30.822
ENSBTAG00000016720	RAB1A	78	39.623	ENSBTAG00000019820	RAB9B	79	39.623
ENSBTAG00000016720	RAB1A	97	44.845	ENSBTAG00000050873	-	93	44.845
ENSBTAG00000016720	RAB1A	87	35.028	ENSBTAG00000046644	HRAS	93	35.028
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	44.554	ENSBTAG00000017803	RAB14	93	44.554
ENSBTAG00000016720	RAB1A	83	37.576	ENSBTAG00000009778	KRAS	95	36.111
ENSBTAG00000016720	RAB1A	81	31.056	ENSBTAG00000024233	-	73	31.056
ENSBTAG00000016720	RAB1A	85	50.296	ENSBTAG00000010356	RAB12	82	44.221
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	45.755	ENSBTAG00000044207	RAB2B	99	45.794
ENSBTAG00000016720	RAB1A	81	30.303	ENSBTAG00000018239	DNAJC27	60	30.303
ENSBTAG00000016720	RAB1A	98	38.660	ENSBTAG00000046533	RAB31	97	38.660
ENSBTAG00000016720	RAB1A	98	43.367	ENSBTAG00000014129	RAB5B	90	43.367
ENSBTAG00000016720	RAB1A	59	33.333	ENSBTAG00000017322	ARL14	62	32.540
ENSBTAG00000016720	RAB1A	98	93.299	ENSBTAG00000046485	RAB1B	67	91.919
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	42.079	ENSBTAG00000018914	RAB25	95	42.157
ENSBTAG00000016720	RAB1A	85	32.544	ENSBTAG00000031861	RHEB	95	32.000
ENSBTAG00000016720	RAB1A	83	35.329	ENSBTAG00000001497	MRAS	80	35.329
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	45.581	ENSBTAG00000002475	RAB11B	99	45.581
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	54.315	ENSBTAG00000022044	RAB35	100	53.960
ENSBTAG00000016720	RAB1A	59	33.058	ENSBTAG00000002238	ARL2	61	33.333
ENSBTAG00000016720	RAB1A	66	30.137	ENSBTAG00000004318	ARL3	68	30.137

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	96	100.000	Capra_hircus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	99.495	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	99.492	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	100.000	ENSHGLG00100007994	RAB1A	97	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	98.990	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSBTAG00000016720	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSBTAG00000016720	RAB1A	97	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	93.909	ENSONIG00000006819	-	100	93.627	Oreochromis_niloticus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	99.512	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	99.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
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ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	95.939	ENSPMGG00000021015	-	99	95.588	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSSSCG00000008359	RAB1A	100	100.000	Sus_scrofa
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ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	99.495	ENSVPAG00000005640	RAB1A	99	99.495	Vicugna_pacos
ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	ENSVVUG00000027588	RAB1A	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	94.554	ENSXMAG00000015776	-	100	94.554	Xiphophorus_maculatus