EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00000002975 (Gene tree)
Gene ID: 481382
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_familiaris
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 32037 bases
Position: chr10:60879126-60911162
Accession: 54531
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00000004417	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.4e-28	1	2
ENSCAFP00000004417	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.4e-28	2	2
ENSCAFP00000036305	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.4e-28	1	2
ENSCAFP00000036305	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.4e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00000044895	-	6383	XM_005626122	ENSCAFP00000036305	813 (aa)	XP_022280478	J9NS30
ENSCAFT00000004771	-	1155	-	ENSCAFP00000004417	384 (aa)	-	F1PYB9

Gene Model

Click here to download ENSCAFG00000002975's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cfa03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCAFG00000002975's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	89	59.813	ENSCAFG00000017783	PAPOLA	98	59.947

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	91.473	ENSG00000115421	PAPOLG	100	99.573	Homo_sapiens
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	72.037	ENSAPOG00000004798	papolg	99	69.959	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	92.383	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	97.962	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	69.303	ENSACIG00000010546	papolg	99	69.189	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	71.846	ENSAOCG00000010254	papolg	89	71.713	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	71.979	ENSAPEG00000006944	papolg	89	71.904	Amphiprion_percula
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	72.667	ENSATEG00000009007	papolg	96	72.533	Anabas_testudineus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	90	73.210	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.113	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	59.036	ENSACAG00000015048	-	100	63.399	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	92.248	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	95.007	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	68.952	ENSACLG00000015592	papolg	89	69.390	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	72.691	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.691	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	90.465	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	96.896	Bos_taurus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.531	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.142	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	96.373	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	99.059	Canis_lupus_dingo
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	89.731	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.356	Capra_hircus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	88.509	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	95.951	Carlito_syrichta
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.042	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.007	Cavia_porcellus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	92.506	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.142	Cebus_capucinus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.775	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.268	Cercocebus_atys
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	88.509	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.682	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.042	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	94.872	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	85.539	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.617	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	62	64.554	ENSCING00000024664	-	90	65.638	Ciona_intestinalis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	60	65.155	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.155	Ciona_savignyi
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	92.248	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	95.007	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	84.108	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	92.769	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	84.108	ENSCGRG00000005552	-	100	92.769	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	69.681	ENSCSEG00000000771	papolg	100	69.652	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	88	76.233	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.200	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	73.342	ENSDARG00000012141	papolg	100	72.679	Danio_rerio
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	93.387	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	93.252	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	53	99.301	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	71.776	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.919	Echinops_telfairi
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	56	70.833	ENSEBUG00000004020	papolg	94	70.390	Eptatretus_burgeri
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	59	56.485	ENSEBUG00000005042	-	79	57.511	Eptatretus_burgeri
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	89.731	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	96.761	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	99	95.577	ENSECAG00000009859	PAPOLG	100	95.577	Equus_caballus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	78.431	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.076	Erinaceus_europaeus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	65.396	ENSELUG00000014497	papolg	100	64.269	Esox_lucius
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	90.220	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	97.166	Felis_catus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	65.339	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.339	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.286	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	95.007	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	56.000	ENSFHEG00000019080	papolg	90	61.914	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	75	82.671	ENSGMOG00000018772	papolg	92	82.671	Gadus_morhua
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.267	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.267	Gallus_gallus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	68.455	ENSGAFG00000003263	papolg	96	69.393	Gambusia_affinis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	71.144	ENSGACG00000002718	papolg	100	71.883	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	91.990	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	94.737	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	68.952	ENSHBUG00000004882	papolg	89	69.520	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	88.206	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	95.115	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	88.206	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	100	95.412	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.706	ENSHCOG00000006782	papolg	89	70.573	Hippocampus_comes
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	71.932	ENSIPUG00000021642	papolg	100	73.289	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	88.020	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.277	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	53	99.068	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	99.068	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	94	67.360	ENSKMAG00000016439	papolg	98	69.987	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	68.798	ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.286	Labrus_bergylta
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	97	66.502	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	70.375	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	72.526	ENSLOCG00000016130	papolg	100	72.266	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	86.553	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	Loxodonta_africana
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.775	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	95.412	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	92.765	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	95.412	Macaca_mulatta
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	79.707	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	86.461	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	92.506	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	95.007	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	71.713	ENSMAMG00000010667	papolg	100	69.251	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	60.104	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.014	Maylandia_zebra
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.549	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.549	Meleagris_gallopavo
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	83.863	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	92.297	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	92.506	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	95.277	Microcebus_murinus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	84.352	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.117	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	71.126	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.258	Mola_mola
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	79.137	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.399	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	71.448	ENSMALG00000007012	papolg	97	71.049	Monopterus_albus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	85.575	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.533	Mus_caroli
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	85.819	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	Mus_musculus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	85.330	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.657	Mus_pahari
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	85.086	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	Mus_spretus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	97.317	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	100	97.317	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.531	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	93.631	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	86.553	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	94.872	Nannospalax_galili
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	90	62.929	ENSNBRG00000011943	papolg	99	62.963	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	53	98.834	ENSNLEG00000009507	-	100	98.834	Nomascus_leucogenys
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	72	97.368	ENSMEUG00000013605	-	87	78.082	Notamacropus_eugenii
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.286	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	94.197	Ochotona_princeps
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	52	94.366	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.366	Octodon_degus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	65.020	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.060	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	90	86.059	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	86.059	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	88.753	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	95.277	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.120	ENSORLG00000001577	papolg	96	69.657	Oryzias_latipes
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.424	ENSORLG00020002482	papolg	96	69.974	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.120	ENSORLG00015008836	papolg	96	69.657	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	69.789	ENSOMEG00000001406	papolg	99	69.393	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	93.023	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	88.605	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	94.866	ENSOARG00000001563	PAPOLG	100	94.866	Ovis_aries
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	91.473	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	94.467	Pan_paniscus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	90.220	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	97.166	Panthera_pardus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	90.220	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	97.031	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	91.473	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	94.467	Pan_troglodytes
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.775	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	90.983	Papio_anubis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	86	70.183	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	69.620	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	64.194	ENSPKIG00000003313	papolg	100	71.812	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	69.065	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.976	Pelodiscus_sinensis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	83.130	ENSPEMG00000008960	-	100	92.360	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	60	63.395	ENSPMAG00000004864	-	96	63.395	Petromyzon_marinus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	48.792	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.510	Petromyzon_marinus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	78.897	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.717	Phascolarctos_cinereus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	68.979	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.129	Poecilia_formosa
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	68.848	ENSPLAG00000018445	papolg	96	68.799	Poecilia_latipinna
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	69.020	ENSPMEG00000003961	papolg	96	69.645	Poecilia_mexicana
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	68.709	ENSPREG00000010358	papolg	96	68.579	Poecilia_reticulata
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.042	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.602	Pongo_abelii
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	90	81.633	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	Procavia_capensis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	77.461	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	85.000	Propithecus_coquereli
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	81	94.504	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.504	Pteropus_vampyrus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.350	ENSPNYG00000006729	papolg	100	69.946	Pundamilia_nyererei
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	73.369	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.369	Pygocentrus_nattereri
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	85.086	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	93.522	Rattus_norvegicus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	83.863	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	88.934	Rhinopithecus_bieti
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	91.990	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	94.872	Rhinopithecus_roxellana
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	92.506	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.142	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	78.417	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.819	Sarcophilus_harrisii
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	69.201	ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.545	Scleropages_formosus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	62.753	ENSSFOG00015011874	papolg	100	62.348	Scleropages_formosus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	62.785	ENSSDUG00000000912	papolg	99	71.391	Seriola_dumerili
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	72.074	ENSSLDG00000001217	papolg	97	71.809	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	71.106	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	77.733	Sphenodon_punctatus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.040	ENSSPAG00000009004	papolg	99	69.636	Stegastes_partitus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	91.282	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.031	Sus_scrofa
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	67	76.568	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	100	76.568	Taeniopygia_guttata
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	70.738	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.738	Takifugu_rubripes
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	58.057	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.535	Tetraodon_nigroviridis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	90	87.619	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	87.619	Tupaia_belangeri
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	92.038	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	92.038	Tursiops_truncatus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	97.403	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	98.222	Ursus_americanus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	99	97.270	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	99	97.270	Ursus_maritimus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	88.753	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.653	Vicugna_pacos
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	99	99.503	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	99.593	Vulpes_vulpes
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	74.668	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.668	Xenopus_tropicalis
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	61	84.970	ENSXCOG00000006611	papolg	73	84.970	Xiphophorus_couchianus
ENSCAFG00000002975	PAPOLG	66	82.400	ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.400	Xiphophorus_maculatus