EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00000008081 (Gene tree)
Gene ID: 478093
Gene Symbol: TNPO1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_familiaris
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 51305 bases
Position: chr2:55799909-55851213
Accession: 47694
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00000011990	IBN_N	PF03810.19	7.2e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00000012955	-	2574	XM_535270	ENSCAFP00000011990	857 (aa)	XP_535270	F1PZL7

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	85.764	ENSCAFG00000017226	TNPO2	81	85.764

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.816	ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	93.816	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.305	ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	99.305	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00000008081	TNPO1	86	92.848	ENSACIG00000003711	tnpo1	95	92.848	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.932	ENSAOCG00000008154	tnpo1	96	93.932	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.932	ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	93.932	Amphiprion_percula
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.582	ENSATEG00000010408	tnpo1	96	93.582	Anabas_testudineus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	94.322	ENSAPLG00000009619	-	96	94.322	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	96.616	ENSACAG00000009599	TNPO1	96	96.616	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	90.665	ENSANAG00000025351	-	95	90.665	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.300	ENSANAG00000022453	-	95	99.300	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	64.740	ENSANAG00000027118	-	97	64.509	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	91.482	ENSACLG00000027223	tnpo1	96	91.482	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.782	ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	92.433	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.533	ENSBTAG00000007979	TNPO1	95	99.533	Bos_taurus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	99.417	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	96.499	ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	96.499	Canis_lupus_dingo
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	99.417	Capra_hircus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	98.016	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.016	Carlito_syrichta
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.300	ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	99.300	Cebus_capucinus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSCATG00000043792	TNPO1	96	99.767	Cercocebus_atys
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.300	ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	99.300	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.650	ENSCSAG00000015616	TNPO1	95	99.650	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	94	86.228	ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	86.228	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	97.666	ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	97.666	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	75.174	ENSCSAVG00000010981	-	96	75.174	Ciona_savignyi
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSCANG00000004353	TNPO1	95	99.767	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	99.417	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.417	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.415	ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	92.415	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.232	ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	93.232	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.657	ENSDARG00000035390	tnpo1	96	92.308	Danio_rerio
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.357	ENSDNOG00000006647	TNPO1	96	93.357	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	97	99.519	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.519	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00000008081	TNPO1	97	59.401	FBgn0035693	CG8219	96	58.922	Drosophila_melanogaster
ENSCAFG00000008081	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	85	99.625	Echinops_telfairi
ENSCAFG00000008081	TNPO1	98	84.917	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.036	Eptatretus_burgeri
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSEASG00005018055	TNPO1	96	99.767	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.650	ENSECAG00000024424	TNPO1	95	99.650	Equus_caballus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	86.441	ENSELUG00000002821	tnpo1	96	85.989	Esox_lucius
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSFCAG00000013181	TNPO1	96	99.767	Felis_catus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	97.316	ENSFALG00000010292	TNPO1	96	97.316	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	99.417	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.590	ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	93.590	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	90.000	ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	90.000	Gadus_morhua
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	96.616	ENSGALG00000015014	TNPO1	96	96.616	Gallus_gallus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.317	ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	92.317	Gambusia_affinis
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.116	ENSGACG00000015841	tnpo1	96	93.116	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	97.433	ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	97.433	Gopherus_agassizii
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSGGOG00000026800	TNPO1	96	99.767	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	82.887	ENSGGOG00000022535	-	95	82.887	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.116	ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	93.116	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.067	ENSHGLG00000000970	-	95	99.067	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.067	ENSHGLG00100017090	-	99	99.067	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00000008081	TNPO1	99	77.687	ENSHGLG00100000963	-	98	77.103	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.533	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	99.533	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.466	ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	93.466	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	90	89.974	ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	89.460	Labrus_bergylta
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	89.082	ENSLACG00000012199	TNPO1	99	89.082	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	95.216	ENSLOCG00000011092	tnpo1	93	95.216	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.533	ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	99.533	Loxodonta_africana
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSMFAG00000003636	TNPO1	95	99.767	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.650	ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	99.650	Macaca_mulatta
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSMNEG00000044581	TNPO1	95	99.767	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSMLEG00000030740	TNPO1	95	99.767	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.582	ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	93.582	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.882	ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	92.882	Maylandia_zebra
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	99.417	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	95.449	ENSMICG00000008468	TNPO1	95	95.449	Microcebus_murinus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	99.417	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00000008081	TNPO1	86	91.925	ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	92.194	Mola_mola
ENSCAFG00000008081	TNPO1	99	97.458	ENSMODG00000001721	TNPO1	77	97.458	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.415	ENSMALG00000009782	tnpo1	96	92.415	Monopterus_albus
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ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.300	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	99.225	Mus_pahari
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.183	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	96	99.096	Mus_spretus
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ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.071	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.071	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.533	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	99.533	Nannospalax_galili
ENSCAFG00000008081	TNPO1	86	92.713	ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	92.713	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSNLEG00000004572	TNPO1	96	99.767	Nomascus_leucogenys
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ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.067	ENSODEG00000001771	TNPO1	95	99.067	Octodon_degus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.352	ENSONIG00000011151	tnpo1	95	92.352	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	96	97.689	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.689	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.007	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.007	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	86	92.578	ENSORLG00000003182	tnpo1	95	92.578	Oryzias_latipes
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.882	ENSORLG00020011559	tnpo1	96	92.882	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.999	ENSORLG00015019113	tnpo1	96	92.999	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.882	ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	92.882	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.650	ENSOGAG00000000808	TNPO1	95	99.650	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.533	ENSOARG00000005038	TNPO1	80	99.533	Ovis_aries
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSPPAG00000042518	TNPO1	95	99.767	Pan_paniscus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSPPRG00000022336	TNPO1	96	99.767	Panthera_pardus
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSPTIG00000018839	TNPO1	96	99.767	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSPTRG00000016972	TNPO1	95	99.767	Pan_troglodytes
ENSCAFG00000008081	TNPO1	94	86.705	ENSPTRG00000047731	-	96	86.705	Pan_troglodytes
ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	ENSPANG00000006074	TNPO1	95	99.767	Papio_anubis
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ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.140	ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	93.140	Poecilia_latipinna
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