EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00000017515 (Gene tree)
Gene ID: 490830
Gene Symbol: NRDE2
Alias: -
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_familiaris
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 45427 bases
Position: chr8:61287117-61332543
Accession: 43965
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00000025791	NRDE-2	PF08424.10	1.6e-92	1	1
ENSCAFP00000036189	NRDE-2	PF08424.10	1.4e-91	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00000027739	-	3652	XM_547952	ENSCAFP00000025791	1179 (aa)	-	F1PQ39
ENSCAFT00000043149	-	3655	-	ENSCAFP00000036189	1154 (aa)	-	J9NRR4

Gene Model

Click here to download ENSCAFG00000017515's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCAFG00000017515's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.223	ENSG00000119720	NRDE2	99	80.273	Homo_sapiens
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	46.048	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	44.055	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	82.298	ENSAMEG00000001807	NRDE2	99	83.191	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00000017515	NRDE2	92	45.295	ENSACIG00000014783	nrde2	97	45.575	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.704	ENSAOCG00000015576	nrde2	99	43.780	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.709	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	43.948	Amphiprion_percula
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.887	ENSATEG00000010247	nrde2	99	43.079	Anabas_testudineus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	58.212	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	58.196	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	56.621	ENSACAG00000014571	NRDE2	99	56.537	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	78.921	ENSANAG00000025313	NRDE2	99	78.385	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.265	ENSACLG00000025154	nrde2	99	42.953	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00000017515	NRDE2	83	58.140	ENSAMXG00000034642	nrde2	91	40.483	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	75.192	ENSBTAG00000005427	NRDE2	99	79.096	Bos_taurus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	79.608	ENSCJAG00000017711	NRDE2	99	79.149	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	96.268	ENSCAFG00020016346	NRDE2	100	96.268	Canis_lupus_dingo
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	74.166	ENSCHIG00000005876	NRDE2	99	74.573	Capra_hircus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	74.893	ENSTSYG00000000161	NRDE2	99	75.021	Carlito_syrichta
ENSCAFG00000017515	NRDE2	97	78.087	ENSCAPG00000012039	NRDE2	99	77.797	Cavia_aperea
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	78.168	ENSCPOG00000002428	NRDE2	99	77.882	Cavia_porcellus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	79.437	ENSCCAG00000024917	NRDE2	99	78.979	Cebus_capucinus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	78.253	ENSCLAG00000015185	NRDE2	99	78.224	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.394	ENSCSAG00000011451	NRDE2	99	80.444	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	75	72.384	ENSCHOG00000006165	NRDE2	75	72.674	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	63.359	ENSCPBG00000008537	NRDE2	97	63.444	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.394	ENSCANG00000029067	NRDE2	99	80.444	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	74.830	ENSCGRG00001015658	Nrde2	99	74.385	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	74.829	ENSCGRG00000005062	Nrde2	99	74.468	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00000017515	NRDE2	90	44.695	ENSCSEG00000000089	nrde2	99	43.739	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.617	ENSCVAG00000023105	nrde2	99	43.364	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	46.199	ENSDARG00000074726	nrde2	99	46.212	Danio_rerio
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	78.907	ENSDNOG00000024057	NRDE2	99	79.419	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	80	76.857	ENSDORG00000003197	Nrde2	99	77.180	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00000017515	NRDE2	74	65.160	ENSETEG00000000198	NRDE2	75	65.747	Echinops_telfairi
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	39.786	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	39.229	Eptatretus_burgeri
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.137	ENSEASG00005020675	NRDE2	99	80.188	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.188	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	79.839	Equus_caballus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	67	86.466	ENSEEUG00000004026	-	68	86.290	Erinaceus_europaeus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	46.683	ENSELUG00000005973	nrde2	99	46.449	Esox_lucius
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	84.478	ENSFCAG00000011312	NRDE2	99	84.701	Felis_catus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	58.778	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	58.291	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	77.930	ENSFDAG00000021350	NRDE2	99	77.730	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.173	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	43.328	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	64	48.963	ENSGMOG00000015815	nrde2	90	48.967	Gadus_morhua
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	58.615	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	57.988	Gallus_gallus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	45.750	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	46.246	Gambusia_affinis
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	45.289	ENSGACG00000012619	nrde2	99	44.722	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	62.511	ENSGAGG00000003252	NRDE2	99	62.341	Gopherus_agassizii
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.137	ENSGGOG00000008835	NRDE2	99	80.188	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	42.671	ENSHBUG00000016736	nrde2	99	42.762	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	78.529	ENSHGLG00000006731	NRDE2	99	78.328	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00000017515	NRDE2	97	78.746	ENSHGLG00100017736	NRDE2	98	78.540	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00000017515	NRDE2	91	43.836	ENSHCOG00000009559	nrde2	97	43.226	Hippocampus_comes
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	42.075	ENSIPUG00000016129	nrde2	99	41.773	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	77.055	ENSSTOG00000001678	NRDE2	99	77.199	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	75.277	ENSJJAG00000000907	Nrde2	99	75.043	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.775	ENSKMAG00000008647	nrde2	99	43.586	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	47.108	ENSLBEG00000021428	nrde2	99	42.120	Labrus_bergylta
ENSCAFG00000017515	NRDE2	72	58.313	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	57.978	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	50.631	ENSLOCG00000009037	nrde2	99	50.127	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	98	75.501	ENSLAFG00000004966	NRDE2	99	76.083	Loxodonta_africana
ENSCAFG00000017515	NRDE2	80	81.857	ENSMMUG00000010442	NRDE2	99	82.024	Macaca_mulatta
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.087	ENSMAMG00000013452	nrde2	99	43.252	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.113	ENSMZEG00005008319	nrde2	99	42.929	Maylandia_zebra
ENSCAFG00000017515	NRDE2	85	61.492	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	61.280	Meleagris_gallopavo
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	74.510	ENSMAUG00000018578	Nrde2	99	74.298	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.394	ENSMICG00000016741	NRDE2	99	80.102	Microcebus_murinus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	72.184	ENSMOCG00000014472	Nrde2	99	71.915	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00000017515	NRDE2	74	45.600	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	45.371	Mola_mola
ENSCAFG00000017515	NRDE2	94	66.549	ENSMODG00000002711	NRDE2	100	66.814	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	44.981	ENSMALG00000021869	nrde2	94	44.197	Monopterus_albus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	74.659	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	74.128	Mus_caroli
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	74.488	ENSMUSG00000021179	Nrde2	99	74.043	Mus_musculus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	73.891	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	74.638	Mus_pahari
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	74.743	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	98	80.423	Mus_spretus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.496	ENSMPUG00000008135	NRDE2	99	80.631	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.394	ENSMLUG00000007484	NRDE2	99	80.786	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	74.829	ENSNGAG00000002993	Nrde2	99	74.681	Nannospalax_galili
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	46.503	ENSNBRG00000010184	nrde2	98	46.065	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	78.220	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	80.158	Nomascus_leucogenys
ENSCAFG00000017515	NRDE2	73	72.581	ENSMEUG00000011097	NRDE2	73	72.581	Notamacropus_eugenii
ENSCAFG00000017515	NRDE2	61	81.818	ENSOPRG00000001375	-	60	81.373	Ochotona_princeps
ENSCAFG00000017515	NRDE2	97	76.199	ENSODEG00000012422	NRDE2	99	75.913	Octodon_degus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.683	ENSONIG00000019512	nrde2	99	43.882	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	76.325	ENSOCUG00000010083	NRDE2	99	76.215	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	90	45.249	ENSORLG00000017730	nrde2	97	43.966	Oryzias_latipes
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	42.432	ENSORLG00020015965	nrde2	99	43.105	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	42.466	ENSORLG00015012437	nrde2	99	43.022	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	45.430	ENSOMEG00000010890	nrde2	99	43.894	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	79.060	ENSOGAG00000006624	NRDE2	99	79.625	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00000017515	NRDE2	97	73.141	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	73.601	Ovis_aries
ENSCAFG00000017515	NRDE2	97	79.843	ENSPPAG00000034133	NRDE2	99	81.701	Pan_paniscus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	84.224	ENSPPRG00000006422	NRDE2	99	84.444	Panthera_pardus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	84.224	ENSPTIG00000009989	NRDE2	99	84.444	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.394	ENSPTRG00000023399	NRDE2	99	80.444	Pan_troglodytes
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	45.008	ENSPKIG00000009331	nrde2	99	45.180	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	61.205	ENSPSIG00000005588	NRDE2	99	61.630	Pelodiscus_sinensis
ENSCAFG00000017515	NRDE2	92	43.882	ENSPMGG00000024089	nrde2	91	44.316	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	75.939	ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	75.574	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAFG00000017515	NRDE2	55	39.704	ENSPMAG00000003270	-	99	39.497	Petromyzon_marinus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	67.262	ENSPCIG00000018567	NRDE2	98	70.098	Phascolarctos_cinereus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	44.101	ENSPFOG00000013217	nrde2	99	41.995	Poecilia_formosa
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	44.455	ENSPLAG00000022350	nrde2	99	42.336	Poecilia_latipinna
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	44.537	ENSPMEG00000000778	nrde2	99	42.407	Poecilia_mexicana
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	42.704	ENSPREG00000009066	nrde2	99	42.071	Poecilia_reticulata
ENSCAFG00000017515	NRDE2	84	80.021	ENSPPYG00000006245	NRDE2	99	80.185	Pongo_abelii
ENSCAFG00000017515	NRDE2	82	84.615	ENSPCAG00000016399	NRDE2	81	83.929	Procavia_capensis
ENSCAFG00000017515	NRDE2	94	79.462	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	79.372	Propithecus_coquereli
ENSCAFG00000017515	NRDE2	97	77.895	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	77.982	Pteropus_vampyrus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	43.434	ENSPNYG00000022833	nrde2	97	45.772	Pundamilia_nyererei
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	47.308	ENSPNAG00000015807	nrde2	92	47.485	Pygocentrus_nattereri
ENSCAFG00000017515	NRDE2	91	73.714	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	73.714	Rattus_norvegicus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.394	ENSSBOG00000024346	NRDE2	99	79.932	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	67.745	ENSSHAG00000016736	NRDE2	97	67.830	Sarcophilus_harrisii
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	46.611	ENSSFOG00015011794	nrde2	99	46.380	Scleropages_formosus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	42.963	ENSSMAG00000011671	nrde2	98	42.799	Scophthalmus_maximus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.604	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	43.555	Seriola_dumerili
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	46.553	ENSSLDG00000023798	nrde2	98	47.536	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCAFG00000017515	NRDE2	88	63.194	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	63.477	Sphenodon_punctatus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	45.798	ENSSPAG00000000539	nrde2	98	45.643	Stegastes_partitus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	81.764	ENSSSCG00000002434	NRDE2	99	82.067	Sus_scrofa
ENSCAFG00000017515	NRDE2	98	59.466	ENSTGUG00000012462	-	99	59.532	Taeniopygia_guttata
ENSCAFG00000017515	NRDE2	78	46.950	ENSTRUG00000002798	nrde2	96	46.550	Takifugu_rubripes
ENSCAFG00000017515	NRDE2	94	74.770	ENSTBEG00000011834	NRDE2	94	74.725	Tupaia_belangeri
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	80.513	ENSTTRG00000013583	NRDE2	99	80.818	Tursiops_truncatus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	96	80.936	ENSUAMG00000004159	NRDE2	99	80.936	Ursus_americanus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	96	81.730	ENSUMAG00000006393	NRDE2	97	84.089	Ursus_maritimus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	94.073	ENSVVUG00000018202	NRDE2	99	94.496	Vulpes_vulpes
ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	52.207	ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.845	Xenopus_tropicalis
ENSCAFG00000017515	NRDE2	91	44.167	ENSXCOG00000013298	nrde2	94	44.798	Xiphophorus_couchianus
ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	42.973	ENSXMAG00000009320	nrde2	99	42.927	Xiphophorus_maculatus