EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCAFG00000024306 (Gene tree)
Gene ID: 482480
Gene Symbol: AGO4
Alias: -
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_familiaris
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 32011 bases
Position: chr15:6324709-6356719
Accession: 37709
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00000005237	PAZ	PF02170.22	5.6e-28	1	1
ENSCAFP00000005237	Piwi	PF02171.17	2.4e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00000005657	-	7550	XM_005628961	ENSCAFP00000005237	794 (aa)	XP_005629018	F1PGN2

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	81.694	ENSCAFG00000024682	AGO3	92	81.694
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	84.131	ENSCAFG00000003443	AGO1	91	84.131
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	80.101	ENSCAFG00000001196	AGO2	96	80.101

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSG00000134698	AGO4	92	100.000	Homo_sapiens
ENSCAFG00000024306	AGO4	95	96.359	ENSAPOG00000023867	ago4	92	96.359	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSAMEG00000000573	AGO4	92	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	97.733	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.733	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	93.073	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.073	Amphiprion_percula
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.398	Anabas_testudineus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.496	ENSAPLG00000010882	AGO4	94	99.496	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.489	ENSACAG00000017275	AGO4	92	98.489	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.874	ENSANAG00000031428	AGO4	92	99.874	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSACLG00000005181	ago4	100	94.710	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.646	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.474	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.866	ENSBTAG00000015220	AGO4	92	98.866	Bos_taurus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSCJAG00000001610	AGO4	92	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.874	ENSCHIG00000026564	AGO4	92	99.874	Capra_hircus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSTSYG00000014007	AGO4	93	100.000	Carlito_syrichta
ENSCAFG00000024306	AGO4	93	99.469	ENSCAPG00000009369	AGO4	92	99.469	Cavia_aperea
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	97.985	ENSCPOG00000011557	AGO4	92	97.985	Cavia_porcellus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSCCAG00000001397	AGO4	92	100.000	Cebus_capucinus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSCATG00000043421	AGO4	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.874	ENSCLAG00000012097	AGO4	93	99.874	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSCSAG00000001090	AGO4	92	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00000024306	AGO4	79	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	74	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.496	ENSCPBG00000018602	AGO4	91	99.496	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSCANG00000016914	AGO4	93	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.496	ENSCGRG00001002701	Ago4	92	99.496	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.496	ENSCGRG00000013335	Ago4	93	99.496	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	91.709	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.709	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	97.859	ENSDARG00000100854	ago4	92	97.859	Danio_rerio
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSDNOG00000015674	AGO4	92	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSDORG00000008933	Ago4	92	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00000024306	AGO4	65	100.000	ENSETEG00000018390	AGO4	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSEASG00005012079	AGO4	92	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSECAG00000024686	AGO4	92	100.000	Equus_caballus
ENSCAFG00000024306	AGO4	78	96.759	ENSEEUG00000000745	AGO4	72	96.759	Erinaceus_europaeus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.273	ENSELUG00000023873	ago4	92	96.273	Esox_lucius
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSFCAG00000006218	AGO4	92	100.000	Felis_catus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSFDAG00000021483	AGO4	93	100.000	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	88.413	ENSFHEG00000019658	ago4	95	88.413	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	97.733	ENSGMOG00000009544	ago4	92	97.733	Gadus_morhua
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.496	ENSGALG00000039713	AGO4	100	99.496	Gallus_gallus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSGAFG00000017239	ago4	92	96.398	Gambusia_affinis
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	97.859	ENSGACG00000002683	ago4	92	97.859	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.496	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	Gopherus_agassizii
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.352	ENSGGOG00000036532	AGO4	93	96.352	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSHBUG00000001525	ago4	92	96.398	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSHGLG00000010241	AGO4	92	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSHGLG00100005233	AGO4	93	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.273	ENSHCOG00000003725	ago4	92	96.273	Hippocampus_comes
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.522	ENSIPUG00000015600	ago4	92	96.522	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSSTOG00000004725	AGO4	92	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.522	ENSKMAG00000018602	ago4	92	96.522	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	95.684	ENSLBEG00000010670	ago4	92	95.684	Labrus_bergylta
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.615	ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.615	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.522	ENSLOCG00000000584	ago4	92	96.522	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.245	ENSLAFG00000010394	AGO4	99	99.245	Loxodonta_africana
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSMFAG00000035543	AGO4	92	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.874	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSMLEG00000039490	AGO4	93	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.273	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.221	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSMZEG00005026346	ago4	92	96.398	Maylandia_zebra
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.118	ENSMGAG00000003851	AGO4	93	99.118	Meleagris_gallopavo
ENSCAFG00000024306	AGO4	81	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	87	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.748	ENSMICG00000033507	AGO4	93	99.748	Microcebus_murinus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.496	ENSMOCG00000005772	Ago4	92	99.496	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.725	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.725	Mola_mola
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.622	ENSMODG00000017888	AGO4	92	99.622	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	95.718	ENSMALG00000011797	ago4	92	95.718	Monopterus_albus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.992	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	98.992	Mus_caroli
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.741	ENSMUSG00000042500	Ago4	92	98.741	Mus_musculus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.363	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	98.363	Mus_pahari
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.489	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	92	98.489	Mus_spretus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.615	ENSMLUG00000017102	AGO4	91	98.615	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSNGAG00000020544	Ago4	93	100.000	Nannospalax_galili
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSNBRG00000013492	ago4	92	96.398	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSNLEG00000011125	AGO4	93	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSCAFG00000024306	AGO4	90	98.113	ENSMEUG00000001023	AGO4	83	98.113	Notamacropus_eugenii
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	91.940	ENSOPRG00000012309	AGO4	93	91.940	Ochotona_princeps
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.874	ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.874	Octodon_degus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	97.229	ENSONIG00000013603	ago4	92	96.398	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.622	ENSOANG00000002082	AGO4	100	99.622	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.874	ENSOCUG00000004076	AGO4	92	99.874	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSORLG00000009865	ago4	85	96.398	Oryzias_latipes
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSORLG00020016978	ago4	85	96.398	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSORLG00015008800	ago4	85	96.398	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSOMEG00000006399	ago4	92	96.398	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.489	ENSOGAG00000004233	-	99	98.489	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	92.317	ENSOGAG00000027107	-	92	92.317	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.370	ENSOARG00000019568	AGO4	91	99.370	Ovis_aries
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSPPAG00000031752	AGO4	93	100.000	Pan_paniscus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSPPRG00000006520	AGO4	92	100.000	Panthera_pardus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSPTIG00000020262	AGO4	93	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSPTRG00000000527	AGO4	92	100.000	Pan_troglodytes
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSPANG00000007232	AGO4	100	100.000	Papio_anubis
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSPKIG00000022598	ago4	92	96.398	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.496	ENSPSIG00000013832	AGO4	92	99.496	Pelodiscus_sinensis
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	97.607	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	88.442	ENSPEMG00000022651	-	88	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.622	ENSPCIG00000000092	AGO4	92	99.622	Phascolarctos_cinereus
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ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.522	ENSPREG00000010315	ago4	92	96.522	Poecilia_reticulata
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	ENSPPYG00000001552	AGO4	93	100.000	Pongo_abelii
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.748	ENSPCOG00000015935	AGO4	93	99.748	Propithecus_coquereli
ENSCAFG00000024306	AGO4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	81	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	ENSPNYG00000002089	ago4	92	96.398	Pundamilia_nyererei
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