EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00000024373 (Gene tree)
Gene ID: 100683678
Gene Symbol: RPP38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_familiaris
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 846 bases
Position: chr2:21612200-21613045
Accession: 45724
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00000033188	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1.5e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00000037644	-	846	XM_003433729	ENSCAFP00000033188	281 (aa)	XP_003433777	E2RA36

Gene Model

Click here to download ENSCAFG00000024373's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cfa03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
cfa03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCAFG00000024373's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	75.265	ENSG00000152464	RPP38	100	77.381	Homo_sapiens
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	44.000	ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	89.324	ENSAMEG00000018832	RPP38	100	89.324	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00000024373	RPP38	93	42.910	ENSACIG00000011592	rpp38	97	43.116	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	41.812	ENSAOCG00000017293	rpp38	97	42.268	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	43.750	ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.203	Amphiprion_percula
ENSCAFG00000024373	RPP38	96	44.964	ENSATEG00000000731	rpp38	98	44.964	Anabas_testudineus
ENSCAFG00000024373	RPP38	91	50.763	ENSAPLG00000002054	RPP38	96	51.460	Anas_platyrhynchos
ENSCAFG00000024373	RPP38	74	48.815	ENSACLG00000016958	rpp38	97	43.636	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00000024373	RPP38	74	48.815	ENSACLG00000016962	rpp38	97	43.636	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00000024373	RPP38	89	44.223	ENSAMXG00000025023	rpp38	96	44.649	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	74.468	ENSBTAG00000007702	RPP38	100	75.532	Bos_taurus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	100.000	ENSCAFG00020008008	RPP38	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	74.468	ENSCHIG00000012484	RPP38	100	75.532	Capra_hircus
ENSCAFG00000024373	RPP38	99	72.857	ENSCPOG00000003981	RPP38	99	72.857	Cavia_porcellus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	74.296	ENSCLAG00000010194	RPP38	100	73.944	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	76.226	ENSCSAG00000019055	RPP38	100	76.325	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	79.577	ENSCHOG00000004335	RPP38	100	78.873	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	70.423	ENSCGRG00001001395	Rpp38	100	70.423	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	70.423	ENSCGRG00000017441	Rpp38	100	70.423	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	42.199	ENSCSEG00000001721	rpp38	99	41.404	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00000024373	RPP38	95	40.000	ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.414	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00000024373	RPP38	90	45.490	ENSDARG00000040350	rpp38	95	44.776	Danio_rerio
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	77.032	ENSDNOG00000040314	RPP38	100	76.325	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	69.258	ENSDORG00000009783	Rpp38	100	69.258	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	71.479	ENSETEG00000002839	RPP38	100	71.479	Echinops_telfairi
ENSCAFG00000024373	RPP38	99	79.496	ENSEASG00005019783	RPP38	98	79.496	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00000024373	RPP38	99	73.022	ENSEEUG00000014677	RPP38	99	74.101	Erinaceus_europaeus
ENSCAFG00000024373	RPP38	88	43.066	ENSELUG00000010160	rpp38	94	43.310	Esox_lucius
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	80.071	ENSFCAG00000022449	RPP38	100	80.071	Felis_catus
ENSCAFG00000024373	RPP38	91	51.145	ENSFALG00000014804	RPP38	94	51.825	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00000024373	RPP38	99	76.071	ENSFDAG00000018669	RPP38	99	75.714	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00000024373	RPP38	95	40.780	ENSFHEG00000013741	rpp38	100	44.257	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00000024373	RPP38	92	50.758	ENSGALG00000008794	RPP38	92	51.460	Gallus_gallus
ENSCAFG00000024373	RPP38	58	50.595	ENSGACG00000009258	rpp38	98	49.390	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00000024373	RPP38	74	48.815	ENSHBUG00000010937	rpp38	97	44.000	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00000024373	RPP38	99	75.000	ENSHGLG00000012144	RPP38	99	74.643	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00000024373	RPP38	88	42.339	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	43.820	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	75.972	ENSSTOG00000025699	RPP38	98	75.972	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	76.056	ENSJJAG00000007523	Rpp38	100	76.056	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00000024373	RPP38	88	41.065	ENSKMAG00000003986	rpp38	95	42.143	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00000024373	RPP38	92	45.489	ENSLBEG00000006853	rpp38	94	45.556	Labrus_bergylta
ENSCAFG00000024373	RPP38	95	51.761	ENSLACG00000006502	RPP38	100	51.505	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	50.558	ENSLOCG00000018347	rpp38	94	50.186	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	78.445	ENSLAFG00000000509	RPP38	100	78.445	Loxodonta_africana
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	75.094	ENSMMUG00000007679	RPP38	100	75.265	Macaca_mulatta
ENSCAFG00000024373	RPP38	96	45.455	ENSMAMG00000012774	rpp38	96	45.455	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00000024373	RPP38	74	49.289	ENSMZEG00005003189	rpp38	97	44.364	Maylandia_zebra
ENSCAFG00000024373	RPP38	74	48.815	ENSMZEG00005003200	rpp38	97	43.636	Maylandia_zebra
ENSCAFG00000024373	RPP38	92	49.430	ENSMGAG00000008217	RPP38	92	50.183	Meleagris_gallopavo
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	70.775	ENSMAUG00000003644	Rpp38	100	70.775	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	72.887	ENSMOCG00000007020	Rpp38	100	72.887	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00000024373	RPP38	93	41.971	ENSMMOG00000003446	rpp38	94	41.392	Mola_mola
ENSCAFG00000024373	RPP38	95	67.037	ENSMODG00000024091	RPP38	100	66.901	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00000024373	RPP38	91	41.481	ENSMALG00000002356	rpp38	93	41.481	Monopterus_albus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	72.632	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	72.183	Mus_caroli
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	71.579	ENSMUSG00000049950	Rpp38	100	71.127	Mus_musculus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	73.333	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	72.887	Mus_pahari
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	71.228	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	70.775	Mus_spretus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	88.968	ENSMPUG00000018523	RPP38	100	88.968	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	80.228	ENSMLUG00000002153	RPP38	100	80.427	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	72.281	ENSNGAG00000011066	Rpp38	100	71.930	Nannospalax_galili
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	42.963	ENSNBRG00000006994	rpp38	98	44.364	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	44.000	ENSONIG00000020467	rpp38	96	45.091	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	70.189	ENSOCUG00000022768	-	100	70.671	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	69.811	ENSOCUG00000024367	-	100	70.318	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00000024373	RPP38	90	45.247	ENSORLG00000009219	rpp38	96	44.981	Oryzias_latipes
ENSCAFG00000024373	RPP38	89	45.174	ENSORLG00020011503	rpp38	90	44.649	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00000024373	RPP38	89	45.000	ENSORLG00015017702	rpp38	90	45.185	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00000024373	RPP38	89	45.594	ENSOMEG00000005414	rpp38	99	45.296	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	76.950	ENSOGAG00000008059	RPP38	100	76.950	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	74.823	ENSOARG00000004534	RPP38	100	75.887	Ovis_aries
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	75.265	ENSPPAG00000041577	RPP38	91	75.265	Pan_paniscus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	80.427	ENSPPRG00000015329	RPP38	100	80.427	Panthera_pardus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	80.783	ENSPTIG00000007188	RPP38	100	80.783	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	75.265	ENSPTRG00000002318	RPP38	91	75.265	Pan_troglodytes
ENSCAFG00000024373	RPP38	93	47.170	ENSPKIG00000025652	rpp38	93	47.015	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00000024373	RPP38	97	55.755	ENSPSIG00000001527	RPP38	98	55.755	Pelodiscus_sinensis
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	74.296	ENSPEMG00000008375	Rpp38	100	74.296	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	68.662	ENSPCIG00000009096	RPP38	94	68.662	Phascolarctos_cinereus
ENSCAFG00000024373	RPP38	65	45.455	ENSPFOG00000016823	rpp38	88	45.455	Poecilia_formosa
ENSCAFG00000024373	RPP38	89	40.613	ENSPLAG00000007626	rpp38	91	42.586	Poecilia_latipinna
ENSCAFG00000024373	RPP38	88	36.576	ENSPMEG00000020392	rpp38	93	38.662	Poecilia_mexicana
ENSCAFG00000024373	RPP38	96	40.283	ENSPREG00000017744	rpp38	97	42.049	Poecilia_reticulata
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	76.325	ENSPPYG00000002113	RPP38	100	76.325	Pongo_abelii
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	82.576	ENSPVAG00000007155	RPP38	100	82.270	Pteropus_vampyrus
ENSCAFG00000024373	RPP38	74	49.289	ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.364	Pundamilia_nyererei
ENSCAFG00000024373	RPP38	88	44.000	ENSPNAG00000010633	rpp38	99	43.321	Pygocentrus_nattereri
ENSCAFG00000024373	RPP38	99	69.751	ENSRNOG00000038025	Rpp38	99	69.395	Rattus_norvegicus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	68.310	ENSSHAG00000015529	RPP38	100	68.310	Sarcophilus_harrisii
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	44.074	ENSSMAG00000018276	rpp38	95	44.074	Scophthalmus_maximus
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	44.238	ENSSDUG00000001651	rpp38	98	45.714	Seriola_dumerili
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	45.055	ENSSLDG00000014355	rpp38	98	45.520	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	56.228	ENSSARG00000012099	RPP38	100	55.872	Sorex_araneus
ENSCAFG00000024373	RPP38	99	56.491	ENSSPUG00000018363	-	99	56.491	Sphenodon_punctatus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	57.491	ENSSPUG00000005237	-	100	57.491	Sphenodon_punctatus
ENSCAFG00000024373	RPP38	96	53.818	ENSSPUG00000008560	-	97	53.818	Sphenodon_punctatus
ENSCAFG00000024373	RPP38	94	42.379	ENSSPAG00000020387	rpp38	96	42.857	Stegastes_partitus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	73.333	ENSSSCG00000027110	RPP38	100	73.333	Sus_scrofa
ENSCAFG00000024373	RPP38	91	51.527	ENSTGUG00000001366	RPP38	97	52.190	Taeniopygia_guttata
ENSCAFG00000024373	RPP38	95	44.043	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	44.043	Tetraodon_nigroviridis
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	74.823	ENSTTRG00000004420	RPP38	100	74.823	Tursiops_truncatus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	89.324	ENSUAMG00000002618	RPP38	100	89.324	Ursus_americanus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	87.633	ENSUMAG00000012382	RPP38	100	88.693	Ursus_maritimus
ENSCAFG00000024373	RPP38	100	98.221	ENSVVUG00000005272	RPP38	100	98.221	Vulpes_vulpes
ENSCAFG00000024373	RPP38	92	50.752	ENSXETG00000003419	rpp38	97	50.182	Xenopus_tropicalis