EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020002140 (Gene tree)
Gene ID: 112670539
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20117 bases
Position: chrQKWQ01001689.1:6192546-6212662
Accession: 18027
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020002525	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	1.9e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020002921	TWISTNB-201	1333	-	ENSCAFP00020002525	364 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.941	ENSG00000105849	TWISTNB	98	78.466	Homo_sapiens
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	90	45.029	ENSAPOG00000011796	twistnb	81	45.860	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	74.872	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	98	73.846	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	86	45.455	ENSAOCG00000024200	twistnb	80	46.230	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	86	45.455	ENSAPEG00000016750	twistnb	80	46.230	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	84	45.714	ENSATEG00000017956	twistnb	87	46.707	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	52	62.234	ENSACAG00000011817	TWISTNB	86	66.272	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	91	78.042	ENSANAG00000026418	TWISTNB	100	76.968	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	53	56.250	ENSAMXG00000035868	twistnb	55	58.333	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	79.646	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	100	77.876	Bos_taurus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	91	78.338	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	76.968	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	100	98.098	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	100	98.098	Canis_familiaris
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	79.646	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	100	78.761	Capra_hircus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	80.645	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	99	79.765	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	79.883	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	100	78.426	Cavia_porcellus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	75.660	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	99	77.419	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.056	ENSCATG00000035621	TWISTNB	98	77.876	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.765	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	78.299	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.351	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	98	78.171	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	73	88.636	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	77	88.636	Choloepus_hoffmanni
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	86	60.188	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	95	57.944	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.351	ENSCANG00000038759	TWISTNB	98	78.171	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	73.900	ENSCGRG00001000499	Twistnb	100	71.554	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	52	57.895	ENSCVAG00000014324	twistnb	50	57.895	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	79.300	ENSDNOG00000006438	-	100	78.717	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	85	78.095	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	75.873	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	82.799	ENSEASG00005021702	TWISTNB	96	81.341	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	83.090	ENSECAG00000014563	TWISTNB	96	81.633	Equus_caballus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	84	46.006	ENSELUG00000000098	TWISTNB	83	47.682	Esox_lucius
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	84.211	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	100	82.164	Felis_catus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	79	53.974	ENSFALG00000009761	TWISTNB	98	53.289	Ficedula_albicollis
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	91	78.338	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	100	76.676	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	99	51.934	ENSGALG00000010863	TWISTNB	82	53.043	Gallus_gallus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	52	56.842	ENSGAFG00000018309	twistnb	52	56.842	Gambusia_affinis
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	56	50.000	ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.646	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	98	78.171	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	78.299	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	76.385	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	91	78.338	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	76.385	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	88	39.286	ENSIPUG00000004117	twistnb	50	54.945	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.532	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	77.485	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	72.595	ENSJJAG00000015887	Twistnb	100	72.012	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	85	45.399	ENSLBEG00000024225	twistnb	82	45.687	Labrus_bergylta
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	86	50.949	ENSLACG00000010508	TWISTNB	57	66.834	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	51	63.243	ENSLOCG00000011399	twistnb	60	61.881	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	80.938	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	79.765	Loxodonta_africana
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.351	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	98	78.171	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.351	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	97	78.171	Macaca_mulatta
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	78.761	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	98	77.581	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.351	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	98	78.171	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	78.426	ENSMICG00000036489	TWISTNB	100	77.259	Microcebus_murinus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	88	75.000	ENSMOCG00000003458	Twistnb	98	73.006	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	78	59.028	ENSMODG00000001402	-	71	55.589	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	72.965	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	100	70.845	Mus_caroli
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	73.099	ENSMUSG00000020561	Twistnb	100	70.760	Mus_musculus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	89	73.939	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	71.515	Mus_pahari
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	73.099	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	100	70.760	Mus_spretus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	88.304	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	94	86.550	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	86	77.778	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	100	76.341	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	54	86.935	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	86.935	Nannospalax_galili
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	85	44.923	ENSNBRG00000008652	twistnb	53	55.556	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	88	80.625	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	93	79.062	Nomascus_leucogenys
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	73.684	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	99	72.515	Ochotona_princeps
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	79.009	ENSODEG00000007222	TWISTNB	100	78.426	Octodon_degus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	77.126	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	99	76.833	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	79.646	ENSOARG00000009803	TWISTNB	99	78.466	Ovis_aries
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.351	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	98	78.171	Pan_paniscus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	83.626	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	100	81.579	Panthera_pardus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	83	84.539	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	82.237	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.941	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	98	78.466	Pan_troglodytes
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.056	ENSPANG00000015736	TWISTNB	98	77.876	Papio_anubis
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	57	58.685	ENSPKIG00000025635	twistnb	59	58.685	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	86	45.897	ENSPMGG00000019023	twistnb	56	53.521	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	82	57.377	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	96	52.537	Phascolarctos_cinereus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	78.466	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	98	77.286	Pongo_abelii
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	75.588	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	77.353	Propithecus_coquereli
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	78.824	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	98	78.529	Pteropus_vampyrus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	85	44.343	ENSPNYG00000002674	twistnb	52	55.556	Pundamilia_nyererei
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	89	45.401	ENSPNAG00000011956	twistnb	56	55.172	Pygocentrus_nattereri
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	88	75.841	ENSRNOG00000010750	Twistnb	99	73.394	Rattus_norvegicus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.056	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	97	77.876	Rhinopithecus_bieti
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.056	ENSRROG00000040155	TWISTNB	98	77.876	Rhinopithecus_roxellana
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	91	77.745	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	100	77.259	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	41.311	ENSSMAG00000012792	twistnb	53	53.731	Scophthalmus_maximus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	87	44.880	ENSSDUG00000007038	twistnb	81	47.727	Seriola_dumerili
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	87	51.220	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	96	49.359	Sphenodon_punctatus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	81	45.183	ENSSPAG00000005871	twistnb	57	53.302	Stegastes_partitus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	80.523	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	79.070	Sus_scrofa
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	85	43.653	ENSTNIG00000017778	twistnb	89	42.581	Tetraodon_nigroviridis
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	78.947	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	99	78.134	Tupaia_belangeri
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	88.012	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	86.257	Ursus_americanus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	87.719	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	100	85.965	Ursus_maritimus
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	98.516	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	100	98.516	Vulpes_vulpes
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	53	64.433	ENSXETG00000013443	twistnb	52	54.724	Xenopus_tropicalis
ENSCAFG00020002140	TWISTNB	52	57.368	ENSXCOG00000020199	twistnb	53	57.368	Xiphophorus_couchianus