EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020002873 (Gene tree)
Gene ID: 112657146
Gene Symbol: IPO4
Alias: FLJ23338|Imp4
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11678 bases
Position: chrQKWQ01001014.1:70255534-70267211
Accession: 19426
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020004244	IBN_N	PF03810.19	3.8e-09	1	1
ENSCAFP00020004218	IBN_N	PF03810.19	4.8e-09	1	1
ENSCAFP00020004354	IBN_N	PF03810.19	5.3e-09	1	1
ENSCAFP00020004365	IBN_N	PF03810.19	5.8e-09	1	1
ENSCAFP00020004329	IBN_N	PF03810.19	2.4e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020005000	IPO4-203	3159	-	ENSCAFP00020004329	1052 (aa)	-	-
ENSCAFT00020004908	IPO4-202	2733	-	ENSCAFP00020004244	910 (aa)	-	-
ENSCAFT00020005030	IPO4-204	3348	-	ENSCAFP00020004354	1115 (aa)	-	-
ENSCAFT00020005045	IPO4-205	3336	-	ENSCAFP00020004365	1111 (aa)	-	-
ENSCAFT00020005150	IPO4-207	2832	-	ENSCAFP00020004451	943 (aa)	-	-
ENSCAFT00020004880	IPO4-201	3189	-	ENSCAFP00020004218	1062 (aa)	-	-
ENSCAFT00020005114	IPO4-206	3201	-	ENSCAFP00020004419	1066 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSCAFG00020002873's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCAFG00020002873's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	89.257	ENSG00000196497	IPO4	99	91.575	Homo_sapiens
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.709	ENSAPOG00000019018	ipo4	98	44.641	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	86.034	ENSAMEG00000016271	IPO4	83	86.879	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.229	ENSACIG00000004246	ipo4	98	44.907	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.208	ENSAOCG00000004773	ipo4	98	45.320	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.208	ENSAPEG00000002112	ipo4	98	45.227	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020002873	IPO4	91	45.921	ENSATEG00000017082	ipo4	97	46.928	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020002873	IPO4	88	52.334	ENSACAG00000003973	-	98	54.420	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	88.743	ENSANAG00000037973	IPO4	98	89.962	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020002873	IPO4	97	43.650	ENSACLG00000019742	ipo4	94	46.238	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.693	ENSAMXG00000037878	ipo4	98	45.065	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	89.691	ENSBTAG00000002707	IPO4	98	91.003	Bos_taurus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	90.571	ENSCJAG00000006937	IPO4	98	90.381	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	96.592	ENSCAFG00000012049	IPO4	100	96.592	Canis_familiaris
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	89.587	ENSCHIG00000009413	IPO4	94	90.901	Capra_hircus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	88.720	ENSTSYG00000002643	IPO4	98	90.815	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	87.324	ENSCPOG00000014783	IPO4	98	88.263	Cavia_porcellus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	88.620	ENSCCAG00000037929	IPO4	98	90.807	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	89.167	ENSCATG00000040395	IPO4	98	91.471	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	87.623	ENSCLAG00000012817	IPO4	98	89.671	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020002873	IPO4	90	56.235	ENSCPBG00000025757	IPO4	92	56.276	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00020002873	IPO4	91	35.913	ENSCING00000008639	-	97	36.246	Ciona_intestinalis
ENSCAFG00020002873	IPO4	95	34.895	ENSCSAVG00000011482	-	99	35.536	Ciona_savignyi
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	88.720	ENSCANG00000029513	IPO4	98	90.909	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	82.099	ENSCGRG00001001217	Ipo4	98	83.130	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	82.099	ENSCGRG00000014404	Ipo4	98	83.130	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	42.870	ENSCSEG00000009606	ipo4	98	44.197	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00020002873	IPO4	98	44.126	ENSCVAG00000002281	ipo4	98	44.681	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00020002873	IPO4	98	46.642	ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.481	Danio_rerio
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	89.296	ENSDNOG00000000366	IPO4	98	89.390	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	88.075	ENSDORG00000009274	Ipo4	98	89.108	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	85.407	ENSETEG00000018381	IPO4	98	86.436	Echinops_telfairi
ENSCAFG00020002873	IPO4	91	90.659	ENSEASG00005011954	IPO4	94	92.746	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	90.762	ENSECAG00000009909	IPO4	98	92.864	Equus_caballus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	47.037	ENSELUG00000020628	ipo4	98	47.593	Esox_lucius
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	92.556	ENSFCAG00000005587	IPO4	98	93.615	Felis_catus
ENSCAFG00020002873	IPO4	98	82.812	ENSFDAG00000000725	IPO4	98	82.589	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00020002873	IPO4	97	40.520	ENSFHEG00000009351	ipo4	97	40.688	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	45.455	ENSGMOG00000001801	ipo4	98	46.197	Gadus_morhua
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.281	ENSGAFG00000005601	ipo4	98	44.434	Gambusia_affinis
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	45.227	ENSGACG00000002276	ipo4	98	46.289	Gasterosteus_aculeatus
ENSCAFG00020002873	IPO4	54	46.327	ENSGAGG00000003383	-	98	45.875	Gopherus_agassizii
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	89.167	ENSGGOG00000016062	IPO4	98	91.284	Gorilla_gorilla
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.465	ENSHBUG00000023269	ipo4	98	45.116	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	87.981	ENSHGLG00000002923	IPO4	98	88.826	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	87.700	ENSHGLG00100003725	IPO4	98	88.545	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.824	ENSHCOG00000016854	ipo4	98	44.190	Hippocampus_comes
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	46.175	ENSIPUG00000001185	ipo4	98	47.344	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	88.441	ENSSTOG00000002288	IPO4	98	90.713	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	86.236	ENSJJAG00000019002	Ipo4	98	86.985	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.226	ENSKMAG00000004627	ipo4	98	44.393	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.022	ENSLBEG00000024952	ipo4	98	44.940	Labrus_bergylta
ENSCAFG00020002873	IPO4	98	49.954	ENSLACG00000001428	IPO4	98	50.416	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00020002873	IPO4	73	48.518	ENSLOCG00000001149	ipo4	80	48.518	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	85.394	ENSLAFG00000015852	IPO4	98	87.148	Loxodonta_africana
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	89.167	ENSMFAG00000000743	IPO4	98	91.471	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	89.167	ENSMMUG00000012481	IPO4	98	91.471	Macaca_mulatta
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	89.257	ENSMNEG00000043531	IPO4	98	91.565	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	89.167	ENSMLEG00000042067	IPO4	98	91.471	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.372	ENSMAMG00000021976	ipo4	98	45.209	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.197	ENSMZEG00005017273	ipo4	98	45.116	Maylandia_zebra
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	80.411	ENSMAUG00000017565	Ipo4	98	82.397	Mesocricetus_auratus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	87.276	ENSMICG00000001719	IPO4	98	89.400	Microcebus_murinus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	80.056	ENSMOCG00000020462	Ipo4	98	81.367	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.270	ENSMMOG00000005264	ipo4	98	45.194	Mola_mola
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	71.005	ENSMODG00000003337	IPO4	95	72.813	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	42.593	ENSMALG00000001587	ipo4	98	43.340	Monopterus_albus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	79.569	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	81.068	Mus_caroli
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	79.213	ENSMUSG00000002319	Ipo4	98	80.712	Mus_musculus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	79.288	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	80.787	Mus_pahari
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	78.712	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	98	80.618	Mus_spretus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	93.333	ENSMPUG00000005916	IPO4	98	94.272	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	87.124	ENSMLUG00000025277	IPO4	84	88.346	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	86.773	ENSNGAG00000019340	Ipo4	98	87.805	Nannospalax_galili
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	45.023	ENSNBRG00000005870	ipo4	98	45.946	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	86.225	ENSOPRG00000016615	IPO4	98	88.202	Ochotona_princeps
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	87.606	ENSODEG00000002609	IPO4	98	88.545	Octodon_degus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.930	ENSONIG00000014574	ipo4	98	45.674	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	88.307	ENSOCUG00000002881	IPO4	98	88.868	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.734	ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.294	Oryzias_latipes
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.641	ENSORLG00020004286	ipo4	98	45.167	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.828	ENSORLG00015021856	ipo4	99	45.387	Oryzias_latipes_hsok
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.475	ENSOMEG00000016203	ipo4	98	45.218	Oryzias_melastigma
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	87.700	ENSOGAG00000010642	IPO4	98	88.545	Otolemur_garnettii
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	88.483	ENSOARG00000019188	IPO4	99	89.794	Ovis_aries
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	87.735	ENSPPAG00000035476	IPO4	98	89.972	Pan_paniscus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	92.466	ENSPPRG00000023607	IPO4	98	93.521	Panthera_pardus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	93.615	ENSPTIG00000008720	IPO4	98	93.709	Panthera_tigris_altaica
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	88.988	ENSPTRG00000006200	IPO4	98	91.190	Pan_troglodytes
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	89.167	ENSPANG00000026278	IPO4	98	91.471	Papio_anubis
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	45.709	ENSPKIG00000007683	-	98	46.269	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	48.234	ENSPKIG00000007830	ipo4	98	48.792	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.426	ENSPMGG00000020871	ipo4	98	44.582	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	80.287	ENSPEMG00000016160	Ipo4	98	82.176	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCAFG00020002873	IPO4	94	73.979	ENSPCIG00000010718	IPO4	95	75.872	Phascolarctos_cinereus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.085	ENSPFOG00000009255	ipo4	98	45.134	Poecilia_formosa
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.177	ENSPLAG00000020556	ipo4	98	45.227	Poecilia_latipinna
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.085	ENSPMEG00000013102	ipo4	98	45.227	Poecilia_mexicana
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.993	ENSPREG00000017605	ipo4	98	45.134	Poecilia_reticulata
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	88.799	ENSPPYG00000005688	IPO4	98	91.182	Pongo_abelii
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	86.673	ENSPCAG00000015669	IPO4	98	88.858	Procavia_capensis
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	87.992	ENSPCOG00000015319	IPO4	98	89.212	Propithecus_coquereli
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	90.432	ENSPVAG00000010755	IPO4	98	91.745	Pteropus_vampyrus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.011	ENSPNYG00000021414	ipo4	98	45.023	Pundamilia_nyererei
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	46.741	ENSPNAG00000027964	ipo4	98	47.486	Pygocentrus_nattereri
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	81.724	ENSRNOG00000019553	Ipo4	100	80.304	Rattus_norvegicus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	89.972	ENSRBIG00000027704	IPO4	98	91.190	Rhinopithecus_bieti
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	89.784	ENSRROG00000011492	IPO4	98	91.003	Rhinopithecus_roxellana
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	87.007	ENSSBOG00000020162	IPO4	98	89.118	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCAFG00020002873	IPO4	100	71.671	ENSSHAG00000002619	IPO4	95	73.433	Sarcophilus_harrisii
ENSCAFG00020002873	IPO4	98	48.423	ENSSFOG00015012267	ipo4	98	49.351	Scleropages_formosus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	46.419	ENSSFOG00015014437	IPO4	98	47.070	Scleropages_formosus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.022	ENSSMAG00000019912	ipo4	98	45.042	Scophthalmus_maximus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	42.711	ENSSDUG00000017513	ipo4	98	43.361	Seriola_dumerili
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.959	ENSSLDG00000003869	ipo4	98	44.796	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCAFG00020002873	IPO4	82	81.852	ENSSARG00000010701	IPO4	79	81.852	Sorex_araneus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.424	ENSSPAG00000008486	ipo4	98	45.353	Stegastes_partitus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	89.850	ENSSSCG00000002000	IPO4	98	90.704	Sus_scrofa
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.208	ENSTRUG00000012832	ipo4	98	44.991	Takifugu_rubripes
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.669	ENSTNIG00000005191	ipo4	98	44.227	Tetraodon_nigroviridis
ENSCAFG00020002873	IPO4	95	90.942	ENSTBEG00000009781	IPO4	98	85.741	Tupaia_belangeri
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	88.158	ENSTTRG00000008626	IPO4	98	89.108	Tursiops_truncatus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	91.182	ENSUAMG00000024037	IPO4	98	92.308	Ursus_americanus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	45.656	ENSXETG00000014621	ipo4	98	46.629	Xenopus_tropicalis
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	42.368	ENSXCOG00000005208	ipo4	98	43.616	Xiphophorus_couchianus
ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.848	ENSXMAG00000006041	ipo4	98	44.671	Xiphophorus_maculatus