EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCAFG00020005115 (Gene tree)
Gene ID: 112666562
Gene Symbol: TNPO2
Alias: FLJ12155|IPO3|KPNB2B|TRN2
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Canis_lupus_dingo
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14533 bases
Position: chrQKWQ01000751.1:8882393-8896925
Accession: 112666562
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCAFP00020006291	IBN_N	PF03810.19	7.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCAFT00020007276	TNPO2-201	3061	-	ENSCAFP00020006291	887 (aa)	XP_025313462	UPI00004A63A2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCAFG00020005115	TNPO2	99	83.089	ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	83.089

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	ENSG00000105576	TNPO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCAFG00020005115	TNPO2	82	90.897	ENSAPOG00000013185	-	96	90.897	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.138	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	93.138	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	97.101	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	97.101	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCAFG00020005115	TNPO2	87	92.358	ENSACIG00000009586	-	100	92.358	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	87	93.126	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	92.765	Amphilophus_citrinellus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.913	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	92.913	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.138	ENSAOCG00000010152	-	100	93.138	Amphiprion_ocellaris
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.138	ENSAPEG00000013268	-	100	93.138	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.913	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	92.913	Amphiprion_percula
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.801	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	92.801	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.913	ENSATEG00000019171	-	100	92.913	Anabas_testudineus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	96.734	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	96.734	Anolis_carolinensis
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.775	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	99.775	Aotus_nancymaae
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	93.026	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	86.839	ENSACLG00000020672	-	100	86.952	Astatotilapia_calliptera
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	91.574	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	91.463	Astyanax_mexicanus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.775	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	99.775	Bos_taurus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	98.774	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.774	Callithrix_jacchus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	100.000	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	100.000	Canis_familiaris
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	95.095	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	95.095	Capra_hircus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.887	Carlito_syrichta
ENSCAFG00020005115	TNPO2	93	97.020	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	97.020	Cavia_aperea
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.549	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	99.549	Cavia_porcellus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	99.887	Cebus_capucinus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	98.774	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	98.774	Cercocebus_atys
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.549	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.549	Chinchilla_lanigera
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	99.887	Chlorocebus_sabaeus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	96.959	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	96.959	Chrysemys_picta_bellii
ENSCAFG00020005115	TNPO2	96	99.883	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	99.883	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	98.885	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	98.885	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	100.000	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCAFG00020005115	TNPO2	87	90.698	ENSCSEG00000011477	-	100	90.827	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	88.876	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	88.764	Cynoglossus_semilaevis
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	91.461	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	91.461	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	93.026	Cyprinodon_variegatus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	89.764	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	89.989	Danio_rerio
ENSCAFG00020005115	TNPO2	88	89.359	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	89.359	Dasypus_novemcinctus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.096	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	72.595	FBgn0024921	Tnpo	100	72.483	Drosophila_melanogaster
ENSCAFG00020005115	TNPO2	91	91.509	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	91.509	Echinops_telfairi
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.775	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	99.775	Equus_asinus_asinus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	99.887	Equus_caballus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.453	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	92.453	Esox_lucius
ENSCAFG00020005115	TNPO2	80	90.237	ENSELUG00000016542	-	99	83.077	Esox_lucius
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	98.774	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	98.774	Felis_catus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.662	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	99.662	Fukomys_damarensis
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	91.685	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	91.685	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	97	92.442	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	92.442	Fundulus_heteroclitus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	85.202	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	85.202	Gadus_morhua
ENSCAFG00020005115	TNPO2	80	90.865	ENSGMOG00000014237	-	90	90.865	Gadus_morhua
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	93.026	Gambusia_affinis
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.022	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	92.022	Gambusia_affinis
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	97.072	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	97.072	Gopherus_agassizii
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	93.026	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSHBUG00000018317	-	100	93.026	Haplochromis_burtoni
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.549	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	99.549	Heterocephalus_glaber_female
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	97.882	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	97.882	Heterocephalus_glaber_male
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSHCOG00000020440	-	100	93.026	Hippocampus_comes
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	91.676	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	91.451	Hippocampus_comes
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.688	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	92.688	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.351	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	92.351	Ictalurus_punctatus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	99.887	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	98.774	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	98.774	Jaculus_jaculus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.913	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	92.913	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	90.755	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	90.755	Kryptolebias_marmoratus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	93.026	Labrus_bergylta
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.363	ENSLBEG00000005301	-	100	93.363	Labrus_bergylta
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	91.319	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	91.319	Latimeria_chalumnae
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	94.263	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	Lepisosteus_oculatus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	98.662	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.662	Loxodonta_africana
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	98.774	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	98.774	Macaca_fascicularis
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	99.887	Macaca_mulatta
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	99.887	Macaca_nemestrina
ENSCAFG00020005115	TNPO2	98	97.809	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	98.727	Mandrillus_leucophaeus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.138	ENSMAMG00000011862	-	100	93.138	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	91.232	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	91.232	Mastacembelus_armatus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	88.764	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	Maylandia_zebra
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	93.026	Maylandia_zebra
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSMZEG00005007408	-	100	93.026	Maylandia_zebra
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	99.887	Microcebus_murinus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	100.000	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSCAFG00020005115	TNPO2	87	87.678	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	87.419	Mola_mola
ENSCAFG00020005115	TNPO2	88	91.549	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	92.238	Mola_mola
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	96.885	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	96.885	Monodelphis_domestica
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	91.451	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	91.789	Monopterus_albus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	93.026	Monopterus_albus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.775	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	99.775	Mus_caroli
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.775	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	100.000	Mus_musculus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.549	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	99.549	Mus_pahari
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.775	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	99.775	Mus_spretus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	100.000	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCAFG00020005115	TNPO2	96	99.883	ENSMLUG00000012669	TNPO2	99	99.883	Myotis_lucifugus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	100.000	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	93.026	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	93.026	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	87.852	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	87.852	Neolamprologus_brichardi
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	89.409	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	89.409	Nomascus_leucogenys
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	89.989	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	90.323	Notamacropus_eugenii
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.662	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	99.662	Octodon_degus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.094	ENSONIG00000017706	-	100	92.094	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.913	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	92.913	Oreochromis_niloticus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	96.284	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	96.284	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	81.306	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	81.306	Oryctolagus_cuniculus
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.688	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	92.688	Oryzias_latipes
ENSCAFG00020005115	TNPO2	56	91.000	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	Oryzias_latipes
ENSCAFG00020005115	TNPO2	56	90.800	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	Oryzias_latipes_hni
ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	92.688	ENSORLG00020015785	tnpo2	100	92.688	Oryzias_latipes_hni
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